MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021521	TCA	2	6	1103979	1103984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059837
17002	NC_021521	ACATC	2	10	1104022	1104031	40 %	20 %	0 %	40 %	514059837
17003	NC_021521	CTG	2	6	1104076	1104081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059837
17004	NC_021521	AAT	2	6	1104170	1104175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059837
17005	NC_021521	CCA	2	6	1104225	1104230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059837
17006	NC_021521	TTG	2	6	1104248	1104253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059837
17007	NC_021521	CAA	2	6	1104274	1104279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059837
17008	NC_021521	T	6	6	1104280	1104285	0 %	100 %	0 %	0 %	514059837
17009	NC_021521	ATTG	2	8	1104308	1104315	25 %	50 %	25 %	0 %	514059837
17010	NC_021521	GCA	2	6	1104387	1104392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059837
17011	NC_021521	CGT	2	6	1104440	1104445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059837
17012	NC_021521	TG	3	6	1104545	1104550	0 %	50 %	50 %	0 %	514059837
17013	NC_021521	CAC	2	6	1104922	1104927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059838
17014	NC_021521	GAT	2	6	1104928	1104933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059838
17015	NC_021521	T	6	6	1104959	1104964	0 %	100 %	0 %	0 %	514059838
17016	NC_021521	ATT	2	6	1104966	1104971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059838
17017	NC_021521	A	6	6	1105178	1105183	100 %	0 %	0 %	0 %	514059839
17018	NC_021521	GAA	2	6	1105184	1105189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059839
17019	NC_021521	A	6	6	1105292	1105297	100 %	0 %	0 %	0 %	514059839
17020	NC_021521	CAA	2	6	1105346	1105351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059839
17021	NC_021521	TGA	2	6	1105381	1105386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059839
17022	NC_021521	CACAA	2	10	1105404	1105413	60 %	0 %	0 %	40 %	514059839
17023	NC_021521	GAA	2	6	1105433	1105438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059839
17024	NC_021521	ATA	2	6	1105485	1105490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059839
17025	NC_021521	ATT	3	9	1105499	1105507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059839
17026	NC_021521	AAG	2	6	1105536	1105541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059839
17027	NC_021521	TTAC	2	8	1105595	1105602	25 %	50 %	0 %	25 %	514059839
17028	NC_021521	GTG	2	6	1105749	1105754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059839
17029	NC_021521	GTG	2	6	1105817	1105822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059839
17030	NC_021521	AAT	2	6	1105926	1105931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059839
17031	NC_021521	CTT	2	6	1106226	1106231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059840
17032	NC_021521	ACC	2	6	1106343	1106348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059840
17033	NC_021521	ATTT	2	8	1106396	1106403	25 %	75 %	0 %	0 %	514059840
17034	NC_021521	CT	4	8	1106404	1106411	0 %	50 %	0 %	50 %	514059840
17035	NC_021521	TTTG	2	8	1106417	1106424	0 %	75 %	25 %	0 %	514059840
17036	NC_021521	ATTG	2	8	1106537	1106544	25 %	50 %	25 %	0 %	514059840
17037	NC_021521	TTCA	2	8	1106621	1106628	25 %	50 %	0 %	25 %	514059840
17038	NC_021521	GTT	2	6	1106711	1106716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059840
17039	NC_021521	G	6	6	1106773	1106778	0 %	0 %	100 %	0 %	514059840
17040	NC_021521	TTG	2	6	1106833	1106838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059840
17041	NC_021521	TAT	2	6	1106852	1106857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059840
17042	NC_021521	CGGT	2	8	1106902	1106909	0 %	25 %	50 %	25 %	514059840
17043	NC_021521	CTA	2	6	1107002	1107007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059840
17044	NC_021521	TTG	2	6	1107052	1107057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059840
17045	NC_021521	ATC	2	6	1107102	1107107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059840
17046	NC_021521	ATT	2	6	1107117	1107122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059840
17047	NC_021521	CGG	2	6	1107125	1107130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059840
17048	NC_021521	G	6	6	1107145	1107150	0 %	0 %	100 %	0 %	514059840
17049	NC_021521	T	6	6	1107153	1107158	0 %	100 %	0 %	0 %	514059840
17050	NC_021521	CCATT	2	10	1107160	1107169	20 %	40 %	0 %	40 %	514059840
17051	NC_021521	TGCCT	2	10	1107197	1107206	0 %	40 %	20 %	40 %	514059840
17052	NC_021521	AGA	2	6	1107212	1107217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059840
17053	NC_021521	TGT	2	6	1107330	1107335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059841
17054	NC_021521	ACCT	2	8	1107359	1107366	25 %	25 %	0 %	50 %	514059841
17055	NC_021521	TCGC	2	8	1107377	1107384	0 %	25 %	25 %	50 %	514059841
17056	NC_021521	CAA	2	6	1107454	1107459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059841
17057	NC_021521	GTG	2	6	1107488	1107493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059841
17058	NC_021521	TAA	2	6	1107507	1107512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059841
17059	NC_021521	TGG	2	6	1107575	1107580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059841
17060	NC_021521	TCA	2	6	1107622	1107627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059841
17061	NC_021521	TGG	2	6	1107704	1107709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059841
17062	NC_021521	GAA	2	6	1107742	1107747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059841
17063	NC_021521	GCC	2	6	1107753	1107758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059841
17064	NC_021521	ACA	2	6	1107774	1107779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059841
17065	NC_021521	ATCG	2	8	1107808	1107815	25 %	25 %	25 %	25 %	514059841
17066	NC_021521	TA	3	6	1107854	1107859	50 %	50 %	0 %	0 %	514059841
17067	NC_021521	GGCT	2	8	1107891	1107898	0 %	25 %	50 %	25 %	514059841
17068	NC_021521	ATC	2	6	1107908	1107913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059841
17069	NC_021521	GAA	2	6	1108012	1108017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059841
17070	NC_021521	CCA	2	6	1108076	1108081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059841
17071	NC_021521	GCA	2	6	1108141	1108146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059841
17072	NC_021521	AAG	2	6	1108160	1108165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059841
17073	NC_021521	ACA	2	6	1108195	1108200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059841
17074	NC_021521	TTA	2	6	1108382	1108387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059841
17075	NC_021521	AAAATG	2	12	1108391	1108402	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514059841
17076	NC_021521	AAAACG	2	12	1108422	1108433	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	514059841
17077	NC_021521	ATT	2	6	1108530	1108535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059842
17078	NC_021521	A	6	6	1108547	1108552	100 %	0 %	0 %	0 %	514059842
17079	NC_021521	ATC	2	6	1108618	1108623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059842
17080	NC_021521	CAC	2	6	1108686	1108691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059842
17081	NC_021521	TAC	2	6	1108764	1108769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059842
17082	NC_021521	CGCA	2	8	1108774	1108781	25 %	0 %	25 %	50 %	514059842
17083	NC_021521	AC	3	6	1108876	1108881	50 %	0 %	0 %	50 %	514059842
17084	NC_021521	TTC	2	6	1108897	1108902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059842
17085	NC_021521	GCC	2	6	1108967	1108972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059842
17086	NC_021521	CAA	2	6	1109020	1109025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059842
17087	NC_021521	TGA	2	6	1109195	1109200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059842
17088	NC_021521	TAA	2	6	1109254	1109259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059842
17089	NC_021521	AAT	2	6	1109298	1109303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059842
17090	NC_021521	ACA	2	6	1109379	1109384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059842
17091	NC_021521	CGG	2	6	1109386	1109391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059842
17092	NC_021521	TTG	2	6	1109413	1109418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059842
17093	NC_021521	TCT	2	6	1109423	1109428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059842
17094	NC_021521	TA	3	6	1109517	1109522	50 %	50 %	0 %	0 %	514059843
17095	NC_021521	TA	3	6	1109532	1109537	50 %	50 %	0 %	0 %	514059843
17096	NC_021521	T	6	6	1109572	1109577	0 %	100 %	0 %	0 %	514059843
17097	NC_021521	GAG	2	6	1109640	1109645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059843
17098	NC_021521	AAT	2	6	1109662	1109667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059843
17099	NC_021521	TCA	2	6	1109682	1109687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059843
17100	NC_021521	ATC	2	6	1109756	1109761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059843
17101	NC_021521	ATA	2	6	1109790	1109795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059843
17102	NC_021521	AAT	2	6	1109961	1109966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059843
17103	NC_021521	GAA	2	6	1109986	1109991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059843
17104	NC_021521	ATT	2	6	1110025	1110030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059843
17105	NC_021521	AAC	2	6	1110053	1110058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059843
17106	NC_021521	A	6	6	1110118	1110123	100 %	0 %	0 %	0 %	514059843
17107	NC_021521	AAAT	2	8	1110172	1110179	75 %	25 %	0 %	0 %	514059843
17108	NC_021521	AAAC	2	8	1110204	1110211	75 %	0 %	0 %	25 %	514059843
17109	NC_021521	TCA	2	6	1110233	1110238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059843
17110	NC_021521	ATG	2	6	1110239	1110244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059843
17111	NC_021521	CAC	2	6	1110297	1110302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059843
17112	NC_021521	GAC	2	6	1110330	1110335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059843
17113	NC_021521	AAT	2	6	1110338	1110343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059843
17114	NC_021521	TGGTGT	2	12	1110400	1110411	0 %	50 %	50 %	0 %	514059843
17115	NC_021521	CAAC	2	8	1110478	1110485	50 %	0 %	0 %	50 %	514059843
17116	NC_021521	CTT	2	6	1110486	1110491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059843
17117	NC_021521	TCT	2	6	1110563	1110568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059843
17118	NC_021521	T	6	6	1110674	1110679	0 %	100 %	0 %	0 %	514059843
17119	NC_021521	TTC	2	6	1110733	1110738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059843
17120	NC_021521	TGT	2	6	1110749	1110754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059843
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17125	NC_021521	CAA	2	6	1110892	1110897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059843
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17137	NC_021521	TTGT	2	8	1111484	1111491	0 %	75 %	25 %	0 %	514059844
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17229	NC_021521	ATC	2	6	1116980	1116985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059848
17230	NC_021521	AT	3	6	1117008	1117013	50 %	50 %	0 %	0 %	514059848
17231	NC_021521	TGT	2	6	1117022	1117027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059848
17232	NC_021521	CGC	2	6	1117158	1117163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059849
17233	NC_021521	T	6	6	1117251	1117256	0 %	100 %	0 %	0 %	514059849
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17239	NC_021521	CTG	2	6	1117764	1117769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059849
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17352	NC_021521	AGA	2	6	1126391	1126396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059856
17353	NC_021521	ATA	2	6	1126473	1126478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059857
17354	NC_021521	TTC	2	6	1126485	1126490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059857
17355	NC_021521	TGC	2	6	1126559	1126564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059857
17356	NC_021521	AT	3	6	1126566	1126571	50 %	50 %	0 %	0 %	514059857
17357	NC_021521	CA	3	6	1126650	1126655	50 %	0 %	0 %	50 %	514059858
17358	NC_021521	CTC	2	6	1126666	1126671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514059858
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17364	NC_021521	CTG	2	6	1127242	1127247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059858
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17369	NC_021521	CTG	2	6	1127449	1127454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059858
17370	NC_021521	CTG	2	6	1127485	1127490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059858
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17390	NC_021521	TGT	2	6	1128590	1128595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059859
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17403	NC_021521	TTCC	2	8	1129174	1129181	0 %	50 %	0 %	50 %	514059859
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17455	NC_021521	TCT	2	6	1133862	1133867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059863
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17461	NC_021521	TTG	2	6	1134110	1134115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059863
17462	NC_021521	TTC	2	6	1134129	1134134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059863
17463	NC_021521	CGG	2	6	1134171	1134176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059863
17464	NC_021521	TCA	3	9	1134207	1134215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059863
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