MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021521	GCA	2	6	1037325	1037330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16002	NC_021521	TC	4	8	1037355	1037362	0 %	50 %	0 %	50 %	514059767
16003	NC_021521	CAC	2	6	1037507	1037512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059767
16004	NC_021521	CCG	2	6	1037535	1037540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059767
16005	NC_021521	AC	3	6	1037554	1037559	50 %	0 %	0 %	50 %	514059767
16006	NC_021521	CTG	2	6	1037608	1037613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16007	NC_021521	GTT	2	6	1037648	1037653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059767
16008	NC_021521	TAT	2	6	1037707	1037712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059767
16009	NC_021521	GATAGA	2	12	1037804	1037815	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514059767
16010	NC_021521	CTC	2	6	1038032	1038037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514059767
16011	NC_021521	CAT	2	6	1038049	1038054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059767
16012	NC_021521	GAA	2	6	1038062	1038067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059767
16013	NC_021521	TCA	2	6	1038207	1038212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059767
16014	NC_021521	GTT	2	6	1038220	1038225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059767
16015	NC_021521	TC	3	6	1038265	1038270	0 %	50 %	0 %	50 %	514059767
16016	NC_021521	CAA	2	6	1038367	1038372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059767
16017	NC_021521	TTA	2	6	1038408	1038413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059767
16018	NC_021521	CCATT	2	10	1038429	1038438	20 %	40 %	0 %	40 %	514059767
16019	NC_021521	GTT	2	6	1038497	1038502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059767
16020	NC_021521	ATT	2	6	1038560	1038565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059767
16021	NC_021521	CAT	2	6	1038673	1038678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059767
16022	NC_021521	CAG	2	6	1038721	1038726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16023	NC_021521	CTG	2	6	1038757	1038762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16024	NC_021521	CTG	2	6	1038784	1038789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16025	NC_021521	CTG	2	6	1038856	1038861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16026	NC_021521	CTG	2	6	1039027	1039032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16027	NC_021521	TC	3	6	1039147	1039152	0 %	50 %	0 %	50 %	514059767
16028	NC_021521	CAT	2	6	1039171	1039176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059767
16029	NC_021521	CAG	2	6	1039189	1039194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16030	NC_021521	CTG	2	6	1039243	1039248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16031	NC_021521	CAC	2	6	1039294	1039299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059767
16032	NC_021521	CTG	2	6	1039414	1039419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16033	NC_021521	TAT	2	6	1039480	1039485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059767
16034	NC_021521	GTT	2	6	1039580	1039585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059767
16035	NC_021521	ATT	2	6	1039601	1039606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059767
16036	NC_021521	TGTT	2	8	1039838	1039845	0 %	75 %	25 %	0 %	514059767
16037	NC_021521	GCC	2	6	1039923	1039928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059767
16038	NC_021521	TTA	2	6	1039956	1039961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059767
16039	NC_021521	TAT	2	6	1039984	1039989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059767
16040	NC_021521	TGCT	2	8	1040032	1040039	0 %	50 %	25 %	25 %	514059767
16041	NC_021521	CCAC	2	8	1040124	1040131	25 %	0 %	0 %	75 %	514059767
16042	NC_021521	TAT	2	6	1040143	1040148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059767
16043	NC_021521	CAA	2	6	1040320	1040325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059767
16044	NC_021521	TGT	2	6	1040339	1040344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059767
16045	NC_021521	T	6	6	1040415	1040420	0 %	100 %	0 %	0 %	514059767
16046	NC_021521	CAG	2	6	1040422	1040427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16047	NC_021521	CAC	3	9	1040431	1040439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059767
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16049	NC_021521	AGAC	2	8	1040555	1040562	50 %	0 %	25 %	25 %	514059767
16050	NC_021521	GTT	2	6	1040595	1040600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059767
16051	NC_021521	GCG	2	6	1040603	1040608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059767
16052	NC_021521	ATT	2	6	1040618	1040623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059767
16053	NC_021521	ATT	2	6	1040627	1040632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059767
16054	NC_021521	ATC	2	6	1040657	1040662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059767
16055	NC_021521	CAATAG	2	12	1040710	1040721	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514059767
16056	NC_021521	AGT	2	6	1040768	1040773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059767
16057	NC_021521	ACA	2	6	1040799	1040804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059767
16058	NC_021521	TCCC	2	8	1040809	1040816	0 %	25 %	0 %	75 %	514059767
16059	NC_021521	ACTT	2	8	1040855	1040862	25 %	50 %	0 %	25 %	514059767
16060	NC_021521	TAGCTT	2	12	1040938	1040949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514059767
16061	NC_021521	ATAGCA	2	12	1040964	1040975	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514059767
16062	NC_021521	TACCAA	2	12	1040998	1041009	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	514059767
16063	NC_021521	CGT	2	6	1041016	1041021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059767
16064	NC_021521	TAG	2	6	1041040	1041045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059767
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16066	NC_021521	A	6	6	1041098	1041103	100 %	0 %	0 %	0 %	514059767
16067	NC_021521	A	6	6	1041126	1041131	100 %	0 %	0 %	0 %	514059767
16068	NC_021521	AATTTA	2	12	1041135	1041146	50 %	50 %	0 %	0 %	514059767
16069	NC_021521	A	6	6	1041162	1041167	100 %	0 %	0 %	0 %	514059767
16070	NC_021521	ACC	2	6	1041246	1041251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059767
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16103	NC_021521	GTG	2	6	1044033	1044038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059770
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16107	NC_021521	AG	3	6	1044213	1044218	50 %	0 %	50 %	0 %	514059770
16108	NC_021521	AATT	2	8	1044345	1044352	50 %	50 %	0 %	0 %	514059770
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16353	NC_021521	TTG	2	6	1059995	1060000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059795
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16468	NC_021521	CT	3	6	1067660	1067665	0 %	50 %	0 %	50 %	514059805
16469	NC_021521	CCA	2	6	1067682	1067687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059805
16470	NC_021521	ACCTCG	2	12	1067712	1067723	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	514059805
16471	NC_021521	CT	3	6	1067902	1067907	0 %	50 %	0 %	50 %	514059806
16472	NC_021521	T	6	6	1067923	1067928	0 %	100 %	0 %	0 %	514059806
16473	NC_021521	CAT	2	6	1067946	1067951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059806
16474	NC_021521	T	6	6	1067955	1067960	0 %	100 %	0 %	0 %	514059806
16475	NC_021521	CCA	2	6	1067961	1067966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059806
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16478	NC_021521	T	7	7	1068298	1068304	0 %	100 %	0 %	0 %	514059807
16479	NC_021521	TGC	2	6	1068347	1068352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059807
16480	NC_021521	TTGA	2	8	1068359	1068366	25 %	50 %	25 %	0 %	514059807
16481	NC_021521	TTG	2	6	1068376	1068381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059807
16482	NC_021521	CAT	2	6	1068392	1068397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059807
16483	NC_021521	GAGT	2	8	1068411	1068418	25 %	25 %	50 %	0 %	514059807
16484	NC_021521	CTTT	2	8	1068429	1068436	0 %	75 %	0 %	25 %	514059807
16485	NC_021521	CAA	2	6	1068467	1068472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059807
16486	NC_021521	CAT	2	6	1068547	1068552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059807
16487	NC_021521	TAC	2	6	1068626	1068631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059807
16488	NC_021521	ACG	2	6	1068702	1068707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059808
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16490	NC_021521	TTCA	2	8	1068792	1068799	25 %	50 %	0 %	25 %	514059808
16491	NC_021521	CCTTC	2	10	1068906	1068915	0 %	40 %	0 %	60 %	514059809
16492	NC_021521	CTG	2	6	1068945	1068950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059809
16493	NC_021521	GAC	3	9	1068957	1068965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059809
16494	NC_021521	TAC	2	6	1069237	1069242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059810
16495	NC_021521	TGA	2	6	1069250	1069255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059810
16496	NC_021521	AGTT	2	8	1069298	1069305	25 %	50 %	25 %	0 %	514059810
16497	NC_021521	GCC	2	6	1069374	1069379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059810
16498	NC_021521	AGA	2	6	1069385	1069390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059810
16499	NC_021521	CGT	2	6	1069442	1069447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059810
16500	NC_021521	GAA	2	6	1069470	1069475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059810

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