MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021521	ACAA	2	8	1003629	1003636	75 %	0 %	0 %	25 %	514059740
15502	NC_021521	CCG	2	6	1003646	1003651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059740
15503	NC_021521	ACC	2	6	1003711	1003716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059740
15504	NC_021521	CA	3	6	1003856	1003861	50 %	0 %	0 %	50 %	514059740
15505	NC_021521	GTT	2	6	1003892	1003897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059740
15506	NC_021521	ATTAA	2	10	1003928	1003937	60 %	40 %	0 %	0 %	514059740
15507	NC_021521	CTT	2	6	1004176	1004181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059741
15508	NC_021521	TTA	2	6	1004187	1004192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059741
15509	NC_021521	ATGA	2	8	1004241	1004248	50 %	25 %	25 %	0 %	514059741
15510	NC_021521	GCAC	2	8	1004288	1004295	25 %	0 %	25 %	50 %	514059741
15511	NC_021521	GGA	2	6	1004303	1004308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059741
15512	NC_021521	CTG	2	6	1004362	1004367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059741
15513	NC_021521	AAG	3	9	1004380	1004388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059741
15514	NC_021521	ACCGTG	2	12	1004410	1004421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	514059741
15515	NC_021521	TTAA	2	8	1004600	1004607	50 %	50 %	0 %	0 %	514059741
15516	NC_021521	AC	3	6	1004828	1004833	50 %	0 %	0 %	50 %	514059742
15517	NC_021521	AAG	2	6	1004838	1004843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059742
15518	NC_021521	CAA	2	6	1004859	1004864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059742
15519	NC_021521	A	6	6	1004889	1004894	100 %	0 %	0 %	0 %	514059742
15520	NC_021521	A	7	7	1004974	1004980	100 %	0 %	0 %	0 %	514059742
15521	NC_021521	TTA	2	6	1005021	1005026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059742
15522	NC_021521	AGA	2	6	1005074	1005079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059742
15523	NC_021521	A	6	6	1005085	1005090	100 %	0 %	0 %	0 %	514059742
15524	NC_021521	GAC	2	6	1005118	1005123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059742
15525	NC_021521	ATC	2	6	1005187	1005192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059742
15526	NC_021521	A	6	6	1005208	1005213	100 %	0 %	0 %	0 %	514059742
15527	NC_021521	CGT	2	6	1005285	1005290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059742
15528	NC_021521	ATG	2	6	1005316	1005321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059742
15529	NC_021521	T	6	6	1005344	1005349	0 %	100 %	0 %	0 %	514059742
15530	NC_021521	AAG	2	6	1005415	1005420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059742
15531	NC_021521	TGC	2	6	1005433	1005438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059742
15532	NC_021521	TGA	2	6	1005488	1005493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059742
15533	NC_021521	TGA	2	6	1005548	1005553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059742
15534	NC_021521	TTA	2	6	1005600	1005605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059742
15535	NC_021521	AAC	2	6	1005625	1005630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059742
15536	NC_021521	T	6	6	1005651	1005656	0 %	100 %	0 %	0 %	514059742
15537	NC_021521	TGA	2	6	1005713	1005718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059742
15538	NC_021521	TGA	2	6	1005728	1005733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059742
15539	NC_021521	GCA	2	6	1005762	1005767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059742
15540	NC_021521	GGT	2	6	1005816	1005821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059742
15541	NC_021521	ATG	2	6	1005840	1005845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059742
15542	NC_021521	AG	3	6	1005869	1005874	50 %	0 %	50 %	0 %	514059742
15543	NC_021521	TCG	2	6	1005896	1005901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059742
15544	NC_021521	GGT	2	6	1006041	1006046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059742
15545	NC_021521	GTG	2	6	1006067	1006072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059742
15546	NC_021521	GAA	2	6	1006152	1006157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059742
15547	NC_021521	A	6	6	1006164	1006169	100 %	0 %	0 %	0 %	514059742
15548	NC_021521	GAA	2	6	1006218	1006223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059742
15549	NC_021521	AGA	2	6	1006261	1006266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059743
15550	NC_021521	AAGC	2	8	1006283	1006290	50 %	0 %	25 %	25 %	514059743
15551	NC_021521	GTT	2	6	1006292	1006297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059743
15552	NC_021521	A	6	6	1006315	1006320	100 %	0 %	0 %	0 %	514059743
15553	NC_021521	CGT	2	6	1006478	1006483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059743
15554	NC_021521	ATA	2	6	1006688	1006693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059743
15555	NC_021521	TTTA	2	8	1006806	1006813	25 %	75 %	0 %	0 %	514059744
15556	NC_021521	TCA	2	6	1006852	1006857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059744
15557	NC_021521	CAA	2	6	1006865	1006870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059744
15558	NC_021521	TTTAAA	2	12	1006884	1006895	50 %	50 %	0 %	0 %	514059744
15559	NC_021521	CAT	2	6	1006916	1006921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059744
15560	NC_021521	AATT	2	8	1007025	1007032	50 %	50 %	0 %	0 %	514059744
15561	NC_021521	T	6	6	1007042	1007047	0 %	100 %	0 %	0 %	514059744
15562	NC_021521	T	6	6	1007093	1007098	0 %	100 %	0 %	0 %	514059744
15563	NC_021521	ATA	2	6	1007131	1007136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059744
15564	NC_021521	T	7	7	1007150	1007156	0 %	100 %	0 %	0 %	514059744
15565	NC_021521	TGC	2	6	1007265	1007270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059745
15566	NC_021521	T	6	6	1007463	1007468	0 %	100 %	0 %	0 %	514059745
15567	NC_021521	TTG	2	6	1007470	1007475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059745
15568	NC_021521	T	6	6	1007596	1007601	0 %	100 %	0 %	0 %	514059746
15569	NC_021521	TTCAA	2	10	1007746	1007755	40 %	40 %	0 %	20 %	514059746
15570	NC_021521	GGC	2	6	1007770	1007775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059746
15571	NC_021521	TAC	2	6	1007781	1007786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059746
15572	NC_021521	AAC	3	9	1007793	1007801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059746
15573	NC_021521	T	6	6	1007832	1007837	0 %	100 %	0 %	0 %	514059746
15574	NC_021521	T	6	6	1007843	1007848	0 %	100 %	0 %	0 %	514059746
15575	NC_021521	CCG	2	6	1007882	1007887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059746
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15578	NC_021521	TTA	2	6	1008185	1008190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059747
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15581	NC_021521	TCG	2	6	1008406	1008411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059747
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15584	NC_021521	TGA	2	6	1008646	1008651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059747
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15586	NC_021521	AGA	2	6	1008751	1008756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059747
15587	NC_021521	TTA	2	6	1008914	1008919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059747
15588	NC_021521	CAC	2	6	1008920	1008925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059747
15589	NC_021521	GCA	2	6	1008932	1008937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059747
15590	NC_021521	GTC	2	6	1009035	1009040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059747
15591	NC_021521	AAG	2	6	1009077	1009082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059747
15592	NC_021521	ACT	2	6	1009134	1009139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059747
15593	NC_021521	CAA	2	6	1009202	1009207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059747
15594	NC_021521	CAAC	2	8	1009236	1009243	50 %	0 %	0 %	50 %	514059747
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15597	NC_021521	CAGG	2	8	1009409	1009416	25 %	0 %	50 %	25 %	514059747
15598	NC_021521	AAG	2	6	1009455	1009460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059747
15599	NC_021521	ACCCA	2	10	1009581	1009590	40 %	0 %	0 %	60 %	514059747
15600	NC_021521	GGT	2	6	1009652	1009657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059747
15601	NC_021521	ATT	2	6	1009664	1009669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059747
15602	NC_021521	TCA	2	6	1009745	1009750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059747
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15605	NC_021521	GAA	2	6	1009835	1009840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059747
15606	NC_021521	GACG	2	8	1009916	1009923	25 %	0 %	50 %	25 %	514059747
15607	NC_021521	GAT	2	6	1009943	1009948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059747
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15612	NC_021521	ATCG	2	8	1010083	1010090	25 %	25 %	25 %	25 %	514059747
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15617	NC_021521	AAT	2	6	1010269	1010274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059747
15618	NC_021521	TGA	2	6	1010311	1010316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059747
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15624	NC_021521	TGG	2	6	1011014	1011019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059748
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15734	NC_021521	AG	3	6	1022100	1022105	50 %	0 %	50 %	0 %	514059753
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15852	NC_021521	ATAC	2	8	1028007	1028014	50 %	25 %	0 %	25 %	514059758
15853	NC_021521	CTG	2	6	1028027	1028032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059758
15854	NC_021521	TCA	2	6	1028151	1028156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059759
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15970	NC_021521	TTC	2	6	1035048	1035053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059764
15971	NC_021521	TGT	2	6	1035084	1035089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059764
15972	NC_021521	CTT	2	6	1035196	1035201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059764
15973	NC_021521	T	6	6	1035221	1035226	0 %	100 %	0 %	0 %	514059764
15974	NC_021521	T	6	6	1035263	1035268	0 %	100 %	0 %	0 %	514059764
15975	NC_021521	TTCACG	2	12	1035323	1035334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	514059764
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15980	NC_021521	TGTT	2	8	1035452	1035459	0 %	75 %	25 %	0 %	514059764
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15991	NC_021521	T	6	6	1036306	1036311	0 %	100 %	0 %	0 %	514059766
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15998	NC_021521	TAAAGT	2	12	1036943	1036954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514059766
15999	NC_021521	T	6	6	1036965	1036970	0 %	100 %	0 %	0 %	514059766
16000	NC_021521	GTT	2	6	1037319	1037324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059767

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