MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021521	AATG	2	8	848318	848325	50 %	25 %	25 %	0 %	514059606
13002	NC_021521	TTA	2	6	848355	848360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059606
13003	NC_021521	CAA	2	6	848428	848433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059606
13004	NC_021521	AAC	2	6	848462	848467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059606
13005	NC_021521	GTT	2	6	848479	848484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059606
13006	NC_021521	CCA	2	6	848494	848499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059606
13007	NC_021521	CAC	2	6	848516	848521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059606
13008	NC_021521	TTG	2	6	848522	848527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059606
13009	NC_021521	CTT	2	6	848557	848562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059606
13010	NC_021521	GCA	2	6	848580	848585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059606
13011	NC_021521	T	6	6	848639	848644	0 %	100 %	0 %	0 %	514059606
13012	NC_021521	TTC	2	6	848651	848656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059606
13013	NC_021521	ACC	2	6	848681	848686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059606
13014	NC_021521	TGT	2	6	848711	848716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059606
13015	NC_021521	GTT	2	6	848718	848723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059606
13016	NC_021521	CTG	2	6	848761	848766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059606
13017	NC_021521	CGA	2	6	848794	848799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059606
13018	NC_021521	ATAA	2	8	848800	848807	75 %	25 %	0 %	0 %	514059606
13019	NC_021521	CAA	2	6	848848	848853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059606
13020	NC_021521	CAT	2	6	848923	848928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059606
13021	NC_021521	CAG	2	6	848944	848949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059606
13022	NC_021521	AACT	2	8	848989	848996	50 %	25 %	0 %	25 %	514059606
13023	NC_021521	AAT	2	6	849063	849068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059606
13024	NC_021521	GCC	2	6	849191	849196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059606
13025	NC_021521	ATA	2	6	849197	849202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059606
13026	NC_021521	TTG	2	6	849231	849236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059606
13027	NC_021521	CTT	2	6	849310	849315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059606
13028	NC_021521	GAC	2	6	849316	849321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059606
13029	NC_021521	CCA	2	6	849755	849760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059607
13030	NC_021521	TCA	2	6	849796	849801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059607
13031	NC_021521	TCA	2	6	849956	849961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059607
13032	NC_021521	TAA	2	6	850143	850148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059607
13033	NC_021521	TGTT	2	8	850149	850156	0 %	75 %	25 %	0 %	514059607
13034	NC_021521	GAA	2	6	850161	850166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059607
13035	NC_021521	CAA	2	6	850217	850222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059607
13036	NC_021521	TTGA	2	8	850272	850279	25 %	50 %	25 %	0 %	514059607
13037	NC_021521	ATC	2	6	850300	850305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059607
13038	NC_021521	AAT	2	6	850376	850381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059607
13039	NC_021521	AGC	2	6	850536	850541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059607
13040	NC_021521	T	6	6	850574	850579	0 %	100 %	0 %	0 %	514059607
13041	NC_021521	TTG	2	6	850610	850615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059607
13042	NC_021521	T	6	6	850632	850637	0 %	100 %	0 %	0 %	514059607
13043	NC_021521	A	6	6	850708	850713	100 %	0 %	0 %	0 %	514059607
13044	NC_021521	CAT	2	6	850746	850751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059607
13045	NC_021521	ATT	2	6	850898	850903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059608
13046	NC_021521	ATT	2	6	850927	850932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059608
13047	NC_021521	T	6	6	850931	850936	0 %	100 %	0 %	0 %	514059608
13048	NC_021521	AT	3	6	851228	851233	50 %	50 %	0 %	0 %	514059609
13049	NC_021521	ATT	2	6	851351	851356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059609
13050	NC_021521	AAC	2	6	851416	851421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059609
13051	NC_021521	AAC	2	6	851539	851544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059610
13052	NC_021521	GCT	2	6	851580	851585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059610
13053	NC_021521	AACAGG	2	12	851678	851689	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	514059610
13054	NC_021521	TCA	2	6	851720	851725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059610
13055	NC_021521	CCAA	2	8	851745	851752	50 %	0 %	0 %	50 %	514059610
13056	NC_021521	TGG	2	6	851867	851872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059610
13057	NC_021521	TGAT	2	8	851944	851951	25 %	50 %	25 %	0 %	514059610
13058	NC_021521	ATT	2	6	851967	851972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059610
13059	NC_021521	GTG	2	6	851994	851999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059610
13060	NC_021521	TGT	2	6	852094	852099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059610
13061	NC_021521	CT	3	6	852111	852116	0 %	50 %	0 %	50 %	514059610
13062	NC_021521	GAA	2	6	852264	852269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059610
13063	NC_021521	GAA	2	6	852318	852323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059610
13064	NC_021521	A	6	6	852387	852392	100 %	0 %	0 %	0 %	514059610
13065	NC_021521	ATT	2	6	852401	852406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059610
13066	NC_021521	TAG	2	6	852439	852444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059610
13067	NC_021521	AC	3	6	852486	852491	50 %	0 %	0 %	50 %	514059610
13068	NC_021521	GAC	2	6	852513	852518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059610
13069	NC_021521	TATC	2	8	852574	852581	25 %	50 %	0 %	25 %	514059610
13070	NC_021521	GAA	2	6	852624	852629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059610
13071	NC_021521	ATAA	2	8	852733	852740	75 %	25 %	0 %	0 %	514059610
13072	NC_021521	A	6	6	852745	852750	100 %	0 %	0 %	0 %	514059611
13073	NC_021521	CA	3	6	852766	852771	50 %	0 %	0 %	50 %	514059611
13074	NC_021521	AACAGG	2	12	852839	852850	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	514059611
13075	NC_021521	ATG	2	6	852892	852897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059611
13076	NC_021521	GTG	2	6	853003	853008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059611
13077	NC_021521	TTTC	2	8	853033	853040	0 %	75 %	0 %	25 %	514059611
13078	NC_021521	GATT	2	8	853081	853088	25 %	50 %	25 %	0 %	514059611
13079	NC_021521	GCACT	2	10	853175	853184	20 %	20 %	20 %	40 %	514059612
13080	NC_021521	CATC	2	8	853210	853217	25 %	25 %	0 %	50 %	514059612
13081	NC_021521	CAC	2	6	853220	853225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059612
13082	NC_021521	T	6	6	853282	853287	0 %	100 %	0 %	0 %	514059612
13083	NC_021521	ACC	2	6	853370	853375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059612
13084	NC_021521	GAT	2	6	853405	853410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059612
13085	NC_021521	AGT	2	6	853610	853615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059612
13086	NC_021521	A	6	6	853632	853637	100 %	0 %	0 %	0 %	514059612
13087	NC_021521	T	7	7	853645	853651	0 %	100 %	0 %	0 %	514059612
13088	NC_021521	TTGC	2	8	853674	853681	0 %	50 %	25 %	25 %	514059612
13089	NC_021521	TGG	2	6	853756	853761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059612
13090	NC_021521	AATA	2	8	853762	853769	75 %	25 %	0 %	0 %	514059612
13091	NC_021521	CCG	2	6	853830	853835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059612
13092	NC_021521	GCCC	2	8	853932	853939	0 %	0 %	25 %	75 %	514059612
13093	NC_021521	TCA	2	6	854007	854012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059612
13094	NC_021521	TAA	2	6	854015	854020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059612
13095	NC_021521	T	7	7	854082	854088	0 %	100 %	0 %	0 %	514059612
13096	NC_021521	TCT	2	6	854160	854165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059612
13097	NC_021521	TTG	2	6	854166	854171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059612
13098	NC_021521	ATAA	2	8	854174	854181	75 %	25 %	0 %	0 %	514059612
13099	NC_021521	CCG	2	6	854197	854202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059612
13100	NC_021521	TTA	2	6	854272	854277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059612
13101	NC_021521	TCTT	2	8	854334	854341	0 %	75 %	0 %	25 %	514059612
13102	NC_021521	ATC	3	9	854563	854571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059613
13103	NC_021521	GTT	2	6	854671	854676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059613
13104	NC_021521	CCA	2	6	854720	854725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059613
13105	NC_021521	CGG	2	6	854909	854914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059613
13106	NC_021521	AAT	2	6	855064	855069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059613
13107	NC_021521	TTTA	2	8	855073	855080	25 %	75 %	0 %	0 %	514059613
13108	NC_021521	A	6	6	855432	855437	100 %	0 %	0 %	0 %	514059614
13109	NC_021521	TTC	2	6	855449	855454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059614
13110	NC_021521	GA	3	6	855456	855461	50 %	0 %	50 %	0 %	514059614
13111	NC_021521	GTCAGG	2	12	855486	855497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	514059614
13112	NC_021521	CGT	2	6	855541	855546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059614
13113	NC_021521	CA	3	6	855662	855667	50 %	0 %	0 %	50 %	514059614
13114	NC_021521	ATT	2	6	855707	855712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059614
13115	NC_021521	TGT	2	6	855719	855724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059614
13116	NC_021521	TGG	2	6	855794	855799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059614
13117	NC_021521	ATT	2	6	855882	855887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059614
13118	NC_021521	A	6	6	855976	855981	100 %	0 %	0 %	0 %	514059614
13119	NC_021521	GTG	2	6	855994	855999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059614
13120	NC_021521	ATT	2	6	856087	856092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059614
13121	NC_021521	TGCT	2	8	856143	856150	0 %	50 %	25 %	25 %	514059614
13122	NC_021521	TAA	2	6	856200	856205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059614
13123	NC_021521	CCGG	2	8	856207	856214	0 %	0 %	50 %	50 %	514059614
13124	NC_021521	TGA	2	6	856257	856262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059614
13125	NC_021521	GTG	2	6	856270	856275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059614
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13134	NC_021521	CGT	2	6	856630	856635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059614
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13139	NC_021521	CT	3	6	856825	856830	0 %	50 %	0 %	50 %	514059614
13140	NC_021521	GGT	2	6	856852	856857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059614
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13142	NC_021521	ATGT	2	8	856912	856919	25 %	50 %	25 %	0 %	514059614
13143	NC_021521	TGA	2	6	856923	856928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059614
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13152	NC_021521	ATCA	2	8	857449	857456	50 %	25 %	0 %	25 %	514059614
13153	NC_021521	TTTA	2	8	857505	857512	25 %	75 %	0 %	0 %	514059614
13154	NC_021521	AAG	2	6	857543	857548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059614
13155	NC_021521	CGTG	2	8	857589	857596	0 %	25 %	50 %	25 %	514059614
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13160	NC_021521	TGCCG	2	10	857790	857799	0 %	20 %	40 %	40 %	514059614
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13229	NC_021521	ACCAAT	2	12	863112	863123	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	514059617
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13231	NC_021521	TGC	2	6	863175	863180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059617
13232	NC_021521	A	6	6	863196	863201	100 %	0 %	0 %	0 %	514059617
13233	NC_021521	AATTTA	2	12	863233	863244	50 %	50 %	0 %	0 %	514059617
13234	NC_021521	A	6	6	863260	863265	100 %	0 %	0 %	0 %	514059617
13235	NC_021521	ACA	2	6	863341	863346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059617
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13237	NC_021521	GTC	2	6	863694	863699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059618
13238	NC_021521	ATT	2	6	863748	863753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059618
13239	NC_021521	TGA	2	6	863902	863907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059618
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13241	NC_021521	A	6	6	863998	864003	100 %	0 %	0 %	0 %	514059618
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13362	NC_021521	AT	3	6	871075	871080	50 %	50 %	0 %	0 %	514059624
13363	NC_021521	TAA	2	6	871121	871126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059624
13364	NC_021521	ATC	2	6	871134	871139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059624
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13372	NC_021521	T	6	6	871585	871590	0 %	100 %	0 %	0 %	514059625
13373	NC_021521	AG	3	6	871637	871642	50 %	0 %	50 %	0 %	514059625
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13451	NC_021521	AAT	2	6	877178	877183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059629
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13482	NC_021521	ATT	2	6	878430	878435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059630
13483	NC_021521	AAG	2	6	878443	878448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059630
13484	NC_021521	AAT	2	6	878472	878477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059630
13485	NC_021521	TGT	2	6	878483	878488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059630
13486	NC_021521	A	6	6	878649	878654	100 %	0 %	0 %	0 %	514059630
13487	NC_021521	GCAA	2	8	878691	878698	50 %	0 %	25 %	25 %	514059630
13488	NC_021521	ATC	2	6	878842	878847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059630
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13491	NC_021521	AAC	2	6	879205	879210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059630
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