MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021521	GCT	2	6	652350	652355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059387
10002	NC_021521	AGC	2	6	652388	652393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059387
10003	NC_021521	GCA	2	6	652413	652418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059387
10004	NC_021521	TCG	2	6	652505	652510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059387
10005	NC_021521	AGA	2	6	652580	652585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059387
10006	NC_021521	CGGCAG	2	12	652648	652659	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	514059387
10007	NC_021521	TTA	2	6	652692	652697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059387
10008	NC_021521	GAA	2	6	652737	652742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059387
10009	NC_021521	TGA	2	6	652798	652803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059387
10010	NC_021521	AC	3	6	652815	652820	50 %	0 %	0 %	50 %	514059387
10011	NC_021521	AACAA	2	10	652864	652873	80 %	0 %	0 %	20 %	514059387
10012	NC_021521	GTG	2	6	652914	652919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059387
10013	NC_021521	AT	3	6	653012	653017	50 %	50 %	0 %	0 %	514059387
10014	NC_021521	GTT	2	6	653055	653060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059387
10015	NC_021521	TTG	2	6	653092	653097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059387
10016	NC_021521	GCA	2	6	653154	653159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059387
10017	NC_021521	GTT	2	6	653173	653178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059387
10018	NC_021521	ATG	2	6	653274	653279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059387
10019	NC_021521	ACC	2	6	653341	653346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059387
10020	NC_021521	TCG	2	6	653411	653416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059387
10021	NC_021521	GTAAT	2	10	653421	653430	40 %	40 %	20 %	0 %	514059387
10022	NC_021521	AGT	2	6	653570	653575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059388
10023	NC_021521	CAG	2	6	653593	653598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059388
10024	NC_021521	TGG	2	6	653669	653674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059388
10025	NC_021521	TG	3	6	653675	653680	0 %	50 %	50 %	0 %	514059388
10026	NC_021521	ATT	2	6	653711	653716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059388
10027	NC_021521	GAA	2	6	653736	653741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059388
10028	NC_021521	AACC	2	8	653779	653786	50 %	0 %	0 %	50 %	514059388
10029	NC_021521	GTGC	2	8	653802	653809	0 %	25 %	50 %	25 %	514059388
10030	NC_021521	AAG	2	6	653815	653820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059388
10031	NC_021521	ACTG	2	8	653834	653841	25 %	25 %	25 %	25 %	514059388
10032	NC_021521	TGT	2	6	653879	653884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059388
10033	NC_021521	CAA	2	6	653947	653952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059388
10034	NC_021521	ATT	2	6	653973	653978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059388
10035	NC_021521	GCA	2	6	653979	653984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059388
10036	NC_021521	CAATT	2	10	653995	654004	40 %	40 %	0 %	20 %	514059388
10037	NC_021521	CAC	2	6	654018	654023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059388
10038	NC_021521	TTAAA	2	10	654055	654064	60 %	40 %	0 %	0 %	514059388
10039	NC_021521	A	6	6	654075	654080	100 %	0 %	0 %	0 %	514059388
10040	NC_021521	GTG	2	6	654094	654099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059388
10041	NC_021521	ATC	2	6	654102	654107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059388
10042	NC_021521	GAAGTG	2	12	654147	654158	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	514059388
10043	NC_021521	CAG	2	6	654184	654189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059388
10044	NC_021521	GAA	2	6	654230	654235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059388
10045	NC_021521	GAC	2	6	654282	654287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059388
10046	NC_021521	ATG	2	6	654337	654342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059388
10047	NC_021521	TAG	2	6	654349	654354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059388
10048	NC_021521	TGA	2	6	654413	654418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059388
10049	NC_021521	CA	3	6	654463	654468	50 %	0 %	0 %	50 %	514059388
10050	NC_021521	CA	3	6	654508	654513	50 %	0 %	0 %	50 %	514059388
10051	NC_021521	TGC	2	6	654536	654541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059388
10052	NC_021521	GGTA	2	8	654623	654630	25 %	25 %	50 %	0 %	514059388
10053	NC_021521	AAG	2	6	654652	654657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059388
10054	NC_021521	GCT	2	6	654690	654695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059388
10055	NC_021521	TGG	2	6	654773	654778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059388
10056	NC_021521	CGG	2	6	654797	654802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059388
10057	NC_021521	AGA	2	6	654851	654856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059388
10058	NC_021521	GCA	2	6	654909	654914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059388
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10060	NC_021521	GAA	2	6	654959	654964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059388
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10062	NC_021521	TGA	2	6	655191	655196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059389
10063	NC_021521	AAG	2	6	655232	655237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059389
10064	NC_021521	CCG	2	6	655311	655316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059389
10065	NC_021521	GCAAG	2	10	655344	655353	40 %	0 %	40 %	20 %	514059389
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10067	NC_021521	GAA	3	9	655702	655710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059389
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10071	NC_021521	GGA	2	6	656016	656021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059389
10072	NC_021521	ATT	2	6	656058	656063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059389
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10084	NC_021521	A	6	6	656784	656789	100 %	0 %	0 %	0 %	514059389
10085	NC_021521	TGG	2	6	656831	656836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059389
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10087	NC_021521	GCAA	2	8	656847	656854	50 %	0 %	25 %	25 %	514059389
10088	NC_021521	GTTTG	2	10	656934	656943	0 %	60 %	40 %	0 %	514059389
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10092	NC_021521	TCA	2	6	657123	657128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059389
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10103	NC_021521	T	6	6	657904	657909	0 %	100 %	0 %	0 %	514059390
10104	NC_021521	TAA	2	6	657938	657943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059390
10105	NC_021521	TAA	2	6	657968	657973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059390
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10107	NC_021521	CAGTA	2	10	657995	658004	40 %	20 %	20 %	20 %	514059390
10108	NC_021521	A	6	6	658004	658009	100 %	0 %	0 %	0 %	514059390
10109	NC_021521	CCT	2	6	658049	658054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514059391
10110	NC_021521	GTT	2	6	658098	658103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059391
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10115	NC_021521	GTT	2	6	658699	658704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059392
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10118	NC_021521	GTGG	2	8	658843	658850	0 %	25 %	75 %	0 %	514059392
10119	NC_021521	TGC	2	6	658864	658869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059392
10120	NC_021521	CT	3	6	658910	658915	0 %	50 %	0 %	50 %	514059392
10121	NC_021521	CTAT	2	8	658945	658952	25 %	50 %	0 %	25 %	514059392
10122	NC_021521	TTG	2	6	658976	658981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059392
10123	NC_021521	CAT	2	6	659022	659027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059392
10124	NC_021521	T	6	6	659060	659065	0 %	100 %	0 %	0 %	514059392
10125	NC_021521	CTT	2	6	659115	659120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059392
10126	NC_021521	TTA	2	6	659139	659144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059392
10127	NC_021521	GCC	2	6	659191	659196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059392
10128	NC_021521	GCA	2	6	659216	659221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059392
10129	NC_021521	ATT	3	9	659222	659230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059392
10130	NC_021521	CGA	2	6	659235	659240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059392
10131	NC_021521	AC	3	6	659249	659254	50 %	0 %	0 %	50 %	514059392
10132	NC_021521	CAG	2	6	659273	659278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059392
10133	NC_021521	GAT	2	6	659284	659289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059392
10134	NC_021521	AAC	2	6	659326	659331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059393
10135	NC_021521	TGA	2	6	659367	659372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059393
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10137	NC_021521	TAC	2	6	659546	659551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059393
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10139	NC_021521	TTAG	2	8	659609	659616	25 %	50 %	25 %	0 %	514059393
10140	NC_021521	ATA	2	6	659622	659627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059393
10141	NC_021521	ATG	2	6	659654	659659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059393
10142	NC_021521	ATT	2	6	659738	659743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059393
10143	NC_021521	ATC	2	6	659777	659782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059393
10144	NC_021521	CAG	2	6	659789	659794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059393
10145	NC_021521	T	6	6	659900	659905	0 %	100 %	0 %	0 %	514059393
10146	NC_021521	AGATGA	2	12	659970	659981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514059393
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10148	NC_021521	A	6	6	660906	660911	100 %	0 %	0 %	0 %	514059394
10149	NC_021521	TCA	2	6	661070	661075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059394
10150	NC_021521	ATT	2	6	661076	661081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059394
10151	NC_021521	GACA	2	8	661123	661130	50 %	0 %	25 %	25 %	514059395
10152	NC_021521	AATC	2	8	661163	661170	50 %	25 %	0 %	25 %	514059395
10153	NC_021521	ATG	3	9	661224	661232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059395
10154	NC_021521	GCT	3	9	661241	661249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059395
10155	NC_021521	TAA	2	6	661261	661266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059395
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10157	NC_021521	TAA	2	6	661327	661332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059395
10158	NC_021521	CCA	2	6	661345	661350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059395
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10160	NC_021521	ATTT	2	8	661407	661414	25 %	75 %	0 %	0 %	514059395
10161	NC_021521	GGT	2	6	661448	661453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059395
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10167	NC_021521	AG	3	6	661709	661714	50 %	0 %	50 %	0 %	514059395
10168	NC_021521	TTGAT	2	10	661737	661746	20 %	60 %	20 %	0 %	514059395
10169	NC_021521	AAAC	2	8	661760	661767	75 %	0 %	0 %	25 %	514059395
10170	NC_021521	GCA	2	6	661862	661867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059395
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10184	NC_021521	TAT	2	6	665149	665154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
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10191	NC_021521	TTAC	2	8	665526	665533	25 %	50 %	0 %	25 %	514059396
10192	NC_021521	AATG	2	8	665609	665616	50 %	25 %	25 %	0 %	514059396
10193	NC_021521	TAT	2	6	665623	665628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
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10198	NC_021521	ATT	2	6	665861	665866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
10199	NC_021521	A	6	6	665874	665879	100 %	0 %	0 %	0 %	514059396
10200	NC_021521	CGC	2	6	665888	665893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059396
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10202	NC_021521	A	7	7	665975	665981	100 %	0 %	0 %	0 %	514059396
10203	NC_021521	GAT	2	6	666002	666007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059396
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10206	NC_021521	GATCAT	2	12	666131	666142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514059396
10207	NC_021521	AGC	2	6	666189	666194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059396
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10209	NC_021521	TGA	2	6	666364	666369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059396
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10211	NC_021521	AATA	2	8	666394	666401	75 %	25 %	0 %	0 %	514059396
10212	NC_021521	GTC	2	6	666449	666454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059396
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10215	NC_021521	TAC	2	6	666577	666582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059396
10216	NC_021521	TTA	2	6	666647	666652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
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10219	NC_021521	TGA	2	6	666772	666777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059396
10220	NC_021521	GTTG	2	8	666862	666869	0 %	50 %	50 %	0 %	514059396
10221	NC_021521	ATT	2	6	666930	666935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
10222	NC_021521	ATT	2	6	666951	666956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
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10225	NC_021521	ATT	2	6	667132	667137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
10226	NC_021521	AT	3	6	667445	667450	50 %	50 %	0 %	0 %	514059397
10227	NC_021521	AAG	2	6	667471	667476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059397
10228	NC_021521	T	6	6	667488	667493	0 %	100 %	0 %	0 %	514059397
10229	NC_021521	A	6	6	667534	667539	100 %	0 %	0 %	0 %	514059397
10230	NC_021521	TCGGT	2	10	667549	667558	0 %	40 %	40 %	20 %	514059397
10231	NC_021521	TGG	2	6	667606	667611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059397
10232	NC_021521	TTG	2	6	667678	667683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059397
10233	NC_021521	CCA	2	6	670592	670597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059398
10234	NC_021521	GGTGT	2	10	670666	670675	0 %	40 %	60 %	0 %	514059398
10235	NC_021521	TAT	2	6	670692	670697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059398
10236	NC_021521	CT	3	6	670785	670790	0 %	50 %	0 %	50 %	514059398
10237	NC_021521	TGA	3	9	670980	670988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059398
10238	NC_021521	TGA	2	6	671079	671084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059398
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