MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021521	CGT	2	6	558869	558874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059297
8502	NC_021521	ATTTT	2	10	558904	558913	20 %	80 %	0 %	0 %	514059297
8503	NC_021521	CGG	2	6	558929	558934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059297
8504	NC_021521	AAAC	2	8	558937	558944	75 %	0 %	0 %	25 %	514059297
8505	NC_021521	TCAA	2	8	559016	559023	50 %	25 %	0 %	25 %	514059298
8506	NC_021521	CTT	2	6	559056	559061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059298
8507	NC_021521	A	6	6	559123	559128	100 %	0 %	0 %	0 %	514059298
8508	NC_021521	ACTC	2	8	559132	559139	25 %	25 %	0 %	50 %	514059298
8509	NC_021521	GGA	2	6	559161	559166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059298
8510	NC_021521	GTA	2	6	559200	559205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059298
8511	NC_021521	GAA	2	6	559275	559280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059298
8512	NC_021521	CAG	2	6	559321	559326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059298
8513	NC_021521	AAT	2	6	559516	559521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059298
8514	NC_021521	ATG	2	6	559554	559559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059299
8515	NC_021521	TTG	2	6	559594	559599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059299
8516	NC_021521	CTA	2	6	559636	559641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059299
8517	NC_021521	CAA	2	6	559659	559664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059299
8518	NC_021521	AAGA	2	8	559713	559720	75 %	0 %	25 %	0 %	514059299
8519	NC_021521	TCGT	2	8	559741	559748	0 %	50 %	25 %	25 %	514059299
8520	NC_021521	T	6	6	559841	559846	0 %	100 %	0 %	0 %	514059299
8521	NC_021521	CAA	2	6	559908	559913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059299
8522	NC_021521	ACA	2	6	559942	559947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059299
8523	NC_021521	CAAA	2	8	560093	560100	75 %	0 %	0 %	25 %	514059299
8524	NC_021521	CAA	2	6	560124	560129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059299
8525	NC_021521	AAC	2	6	560170	560175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059299
8526	NC_021521	AAT	2	6	560188	560193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059299
8527	NC_021521	CAAA	2	8	560203	560210	75 %	0 %	0 %	25 %	514059300
8528	NC_021521	A	6	6	560208	560213	100 %	0 %	0 %	0 %	514059300
8529	NC_021521	CTT	2	6	560315	560320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059300
8530	NC_021521	T	6	6	560319	560324	0 %	100 %	0 %	0 %	514059300
8531	NC_021521	GCA	2	6	560340	560345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059300
8532	NC_021521	ACT	2	6	560409	560414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059300
8533	NC_021521	CAA	2	6	560425	560430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059300
8534	NC_021521	A	6	6	560429	560434	100 %	0 %	0 %	0 %	514059300
8535	NC_021521	TTTA	2	8	560444	560451	25 %	75 %	0 %	0 %	514059300
8536	NC_021521	CAAA	2	8	560548	560555	75 %	0 %	0 %	25 %	514059301
8537	NC_021521	GAA	2	6	560558	560563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059301
8538	NC_021521	A	6	6	560569	560574	100 %	0 %	0 %	0 %	514059301
8539	NC_021521	TGA	2	6	560587	560592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059301
8540	NC_021521	ACA	3	9	560671	560679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059301
8541	NC_021521	GAT	2	6	560680	560685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059301
8542	NC_021521	T	6	6	560705	560710	0 %	100 %	0 %	0 %	514059301
8543	NC_021521	AG	3	6	560768	560773	50 %	0 %	50 %	0 %	514059301
8544	NC_021521	GCA	2	6	560890	560895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059302
8545	NC_021521	GAA	2	6	560926	560931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059302
8546	NC_021521	AACG	2	8	560943	560950	50 %	0 %	25 %	25 %	514059302
8547	NC_021521	ACC	2	6	560974	560979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059302
8548	NC_021521	A	6	6	561215	561220	100 %	0 %	0 %	0 %	514059302
8549	NC_021521	TGA	2	6	561240	561245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059302
8550	NC_021521	TGA	2	6	561332	561337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059302
8551	NC_021521	GGC	2	6	561339	561344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059302
8552	NC_021521	TTG	2	6	561398	561403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059302
8553	NC_021521	CAA	2	6	561420	561425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059302
8554	NC_021521	GGCA	2	8	561447	561454	25 %	0 %	50 %	25 %	514059302
8555	NC_021521	TTG	2	6	561989	561994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059302
8556	NC_021521	GAA	2	6	562087	562092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059302
8557	NC_021521	ATT	2	6	562524	562529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059303
8558	NC_021521	T	6	6	562602	562607	0 %	100 %	0 %	0 %	514059303
8559	NC_021521	TAA	2	6	562624	562629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059303
8560	NC_021521	T	7	7	562752	562758	0 %	100 %	0 %	0 %	514059304
8561	NC_021521	TGG	2	6	562766	562771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059304
8562	NC_021521	TGCGT	2	10	562889	562898	0 %	40 %	40 %	20 %	514059304
8563	NC_021521	ACG	2	6	562907	562912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059304
8564	NC_021521	TG	3	6	562926	562931	0 %	50 %	50 %	0 %	514059304
8565	NC_021521	ACT	2	6	562998	563003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059304
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8571	NC_021521	AGGCT	2	10	563266	563275	20 %	20 %	40 %	20 %	514059304
8572	NC_021521	ACGCA	2	10	563300	563309	40 %	0 %	20 %	40 %	514059304
8573	NC_021521	GAT	2	6	563398	563403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059304
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8578	NC_021521	CAA	2	6	563760	563765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059305
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8581	NC_021521	TTTTAC	2	12	563883	563894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	514059305
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8583	NC_021521	GCT	2	6	563993	563998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059305
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8589	NC_021521	GACTAA	2	12	564279	564290	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514059305
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8592	NC_021521	CAT	2	6	564358	564363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059305
8593	NC_021521	ATC	2	6	564427	564432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059305
8594	NC_021521	AAT	2	6	564433	564438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059305
8595	NC_021521	T	6	6	564478	564483	0 %	100 %	0 %	0 %	514059305
8596	NC_021521	CT	4	8	564543	564550	0 %	50 %	0 %	50 %	514059305
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8603	NC_021521	AAGC	2	8	564904	564911	50 %	0 %	25 %	25 %	514059306
8604	NC_021521	GAC	2	6	564952	564957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059306
8605	NC_021521	CAA	2	6	565000	565005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059306
8606	NC_021521	GAA	2	6	565060	565065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059306
8607	NC_021521	T	6	6	565093	565098	0 %	100 %	0 %	0 %	514059306
8608	NC_021521	CAC	2	6	565099	565104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059306
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8612	NC_021521	CTT	2	6	565270	565275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059306
8613	NC_021521	GAC	2	6	565282	565287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059306
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8620	NC_021521	TGA	2	6	565776	565781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059306
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8631	NC_021521	GTT	2	6	566222	566227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059307
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