MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021521	ATTG	2	8	432830	432837	25 %	50 %	25 %	0 %	514059179
6502	NC_021521	GGC	2	6	432882	432887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059179
6503	NC_021521	TGA	2	6	432901	432906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059179
6504	NC_021521	TTC	2	6	432969	432974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059179
6505	NC_021521	A	6	6	433064	433069	100 %	0 %	0 %	0 %	514059179
6506	NC_021521	GCG	2	6	433086	433091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059179
6507	NC_021521	ATC	2	6	433119	433124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059179
6508	NC_021521	ATT	2	6	433134	433139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059179
6509	NC_021521	GTG	2	6	433158	433163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059179
6510	NC_021521	TTAGGT	2	12	433221	433232	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	514059179
6511	NC_021521	G	6	6	433255	433260	0 %	0 %	100 %	0 %	514059179
6512	NC_021521	TTA	2	6	433263	433268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059179
6513	NC_021521	ATT	2	6	433420	433425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059180
6514	NC_021521	AAT	2	6	433433	433438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059180
6515	NC_021521	TTTC	2	8	433491	433498	0 %	75 %	0 %	25 %	514059180
6516	NC_021521	TTG	2	6	433580	433585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059180
6517	NC_021521	TTC	2	6	433615	433620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059180
6518	NC_021521	ATT	2	6	433622	433627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059180
6519	NC_021521	CAG	2	6	433796	433801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059180
6520	NC_021521	A	7	7	433856	433862	100 %	0 %	0 %	0 %	514059180
6521	NC_021521	ATTG	2	8	433945	433952	25 %	50 %	25 %	0 %	514059180
6522	NC_021521	CAA	2	6	433962	433967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059180
6523	NC_021521	ATGT	2	8	434091	434098	25 %	50 %	25 %	0 %	514059180
6524	NC_021521	AGA	2	6	434137	434142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059180
6525	NC_021521	GTCGGG	2	12	434374	434385	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	514059180
6526	NC_021521	GCGA	2	8	434401	434408	25 %	0 %	50 %	25 %	514059180
6527	NC_021521	CGC	2	6	434461	434466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059180
6528	NC_021521	GAA	2	6	434494	434499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059180
6529	NC_021521	ACTC	2	8	434532	434539	25 %	25 %	0 %	50 %	514059180
6530	NC_021521	TC	3	6	434538	434543	0 %	50 %	0 %	50 %	514059180
6531	NC_021521	ATC	2	6	434564	434569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059180
6532	NC_021521	AGA	2	6	434608	434613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059180
6533	NC_021521	TGA	2	6	434628	434633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059180
6534	NC_021521	GAA	2	6	434642	434647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059180
6535	NC_021521	GATTGC	2	12	434713	434724	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	514059180
6536	NC_021521	ATT	2	6	434732	434737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059180
6537	NC_021521	TGA	2	6	434761	434766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059180
6538	NC_021521	GGT	2	6	434803	434808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059180
6539	NC_021521	AAT	2	6	434819	434824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059180
6540	NC_021521	TGA	2	6	434907	434912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059180
6541	NC_021521	T	6	6	435264	435269	0 %	100 %	0 %	0 %	514059181
6542	NC_021521	CAGG	2	8	435270	435277	25 %	0 %	50 %	25 %	514059181
6543	NC_021521	GCT	2	6	435291	435296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059181
6544	NC_021521	CTT	2	6	435316	435321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059181
6545	NC_021521	GAG	2	6	435341	435346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059181
6546	NC_021521	CAA	2	6	435381	435386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059181
6547	NC_021521	T	7	7	435404	435410	0 %	100 %	0 %	0 %	514059181
6548	NC_021521	G	6	6	435441	435446	0 %	0 %	100 %	0 %	514059181
6549	NC_021521	AAT	2	6	435483	435488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059181
6550	NC_021521	TGT	2	6	435494	435499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059181
6551	NC_021521	CCA	2	6	435518	435523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059181
6552	NC_021521	AT	3	6	435524	435529	50 %	50 %	0 %	0 %	514059181
6553	NC_021521	AAT	2	6	435607	435612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059181
6554	NC_021521	TGG	2	6	435678	435683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059181
6555	NC_021521	AAT	2	6	435719	435724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059181
6556	NC_021521	TAA	2	6	435730	435735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059181
6557	NC_021521	TGG	2	6	435790	435795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059181
6558	NC_021521	T	6	6	435888	435893	0 %	100 %	0 %	0 %	514059181
6559	NC_021521	GGT	2	6	436003	436008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059181
6560	NC_021521	CTT	3	9	436281	436289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059181
6561	NC_021521	GA	3	6	436452	436457	50 %	0 %	50 %	0 %	514059181
6562	NC_021521	ATA	2	6	436463	436468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059181
6563	NC_021521	AAC	2	6	436484	436489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059181
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6565	NC_021521	CCA	2	6	436566	436571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059181
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6570	NC_021521	GCCA	2	8	436930	436937	25 %	0 %	25 %	50 %	514059181
6571	NC_021521	TGCC	2	8	436959	436966	0 %	25 %	25 %	50 %	514059181
6572	NC_021521	AGAC	2	8	436982	436989	50 %	0 %	25 %	25 %	514059181
6573	NC_021521	AGT	2	6	437027	437032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059181
6574	NC_021521	GAT	2	6	437034	437039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059181
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6576	NC_021521	GTT	2	6	437340	437345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059182
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6578	NC_021521	A	7	7	437435	437441	100 %	0 %	0 %	0 %	514059182
6579	NC_021521	CTG	2	6	437485	437490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059182
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6581	NC_021521	ATA	2	6	437581	437586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059182
6582	NC_021521	ACT	2	6	437605	437610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059182
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6588	NC_021521	TGA	2	6	438031	438036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059182
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6593	NC_021521	GAT	2	6	438300	438305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059182
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6595	NC_021521	TGG	2	6	438315	438320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059182
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6604	NC_021521	CAAT	2	8	438736	438743	50 %	25 %	0 %	25 %	514059182
6605	NC_021521	CGA	2	6	438749	438754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059182
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6609	NC_021521	CAA	2	6	438894	438899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059182
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6617	NC_021521	GCCTT	2	10	439180	439189	0 %	40 %	20 %	40 %	514059182
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6621	NC_021521	GGCT	3	12	439359	439370	0 %	25 %	50 %	25 %	514059182
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6992	NC_021521	AT	3	6	464261	464266	50 %	50 %	0 %	0 %	514059201
6993	NC_021521	TAT	2	6	464274	464279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059201
6994	NC_021521	T	6	6	464580	464585	0 %	100 %	0 %	0 %	514059202
6995	NC_021521	ATT	2	6	464587	464592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059202
6996	NC_021521	TCT	2	6	464604	464609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059202
6997	NC_021521	ATT	2	6	464790	464795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059202
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6999	NC_021521	AAATA	2	10	464861	464870	80 %	20 %	0 %	0 %	514059202
7000	NC_021521	ATGA	2	8	464877	464884	50 %	25 %	25 %	0 %	514059202

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