MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021521	TGCT	2	8	319292	319299	0 %	50 %	25 %	25 %	514059080
5002	NC_021521	GATATT	2	12	319321	319332	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514059080
5003	NC_021521	AGA	2	6	319383	319388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059080
5004	NC_021521	ATT	2	6	319402	319407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059080
5005	NC_021521	GAT	2	6	319458	319463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059080
5006	NC_021521	A	6	6	319465	319470	100 %	0 %	0 %	0 %	514059080
5007	NC_021521	TAT	2	6	319479	319484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059080
5008	NC_021521	TCGGT	2	10	319490	319499	0 %	40 %	40 %	20 %	514059080
5009	NC_021521	ACT	2	6	319532	319537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059080
5010	NC_021521	GCG	2	6	319540	319545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059080
5011	NC_021521	TTG	2	6	319556	319561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059080
5012	NC_021521	A	7	7	319670	319676	100 %	0 %	0 %	0 %	514059080
5013	NC_021521	CAG	2	6	319697	319702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059080
5014	NC_021521	TGA	2	6	319755	319760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059080
5015	NC_021521	GCA	2	6	319762	319767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059080
5016	NC_021521	TA	3	6	319805	319810	50 %	50 %	0 %	0 %	514059080
5017	NC_021521	AATT	2	8	319813	319820	50 %	50 %	0 %	0 %	514059080
5018	NC_021521	TTC	2	6	319979	319984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059081
5019	NC_021521	GGT	2	6	320120	320125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059081
5020	NC_021521	A	6	6	320129	320134	100 %	0 %	0 %	0 %	514059081
5021	NC_021521	TTC	2	6	320204	320209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059081
5022	NC_021521	TATT	2	8	320286	320293	25 %	75 %	0 %	0 %	514059081
5023	NC_021521	ATT	2	6	320383	320388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059081
5024	NC_021521	ATT	2	6	320396	320401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059081
5025	NC_021521	CAG	2	6	320445	320450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059081
5026	NC_021521	AGC	2	6	320518	320523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059081
5027	NC_021521	A	6	6	320563	320568	100 %	0 %	0 %	0 %	514059081
5028	NC_021521	AAAC	2	8	320594	320601	75 %	0 %	0 %	25 %	514059081
5029	NC_021521	CTT	2	6	320610	320615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059081
5030	NC_021521	TGC	2	6	320707	320712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059081
5031	NC_021521	TATT	2	8	320733	320740	25 %	75 %	0 %	0 %	514059081
5032	NC_021521	TAAA	2	8	320742	320749	75 %	25 %	0 %	0 %	514059081
5033	NC_021521	TTG	2	6	321008	321013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059081
5034	NC_021521	TAT	2	6	321015	321020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059081
5035	NC_021521	TTC	2	6	321032	321037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059081
5036	NC_021521	TTG	2	6	321171	321176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059081
5037	NC_021521	TG	3	6	321179	321184	0 %	50 %	50 %	0 %	514059081
5038	NC_021521	TGGT	2	8	321195	321202	0 %	50 %	50 %	0 %	514059081
5039	NC_021521	A	6	6	321209	321214	100 %	0 %	0 %	0 %	514059081
5040	NC_021521	AGA	2	6	321338	321343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059082
5041	NC_021521	ATT	2	6	321352	321357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059082
5042	NC_021521	CGA	2	6	321416	321421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059082
5043	NC_021521	CCG	2	6	321435	321440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059082
5044	NC_021521	ATT	2	6	321454	321459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059082
5045	NC_021521	CAGA	2	8	321460	321467	50 %	0 %	25 %	25 %	514059082
5046	NC_021521	GATA	2	8	321540	321547	50 %	25 %	25 %	0 %	514059082
5047	NC_021521	TCA	2	6	321566	321571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059082
5048	NC_021521	CAG	2	6	321647	321652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059082
5049	NC_021521	TTA	2	6	321655	321660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059082
5050	NC_021521	TTAT	2	8	321705	321712	25 %	75 %	0 %	0 %	514059082
5051	NC_021521	A	6	6	321716	321721	100 %	0 %	0 %	0 %	514059082
5052	NC_021521	GTT	2	6	321772	321777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059082
5053	NC_021521	GA	3	6	321868	321873	50 %	0 %	50 %	0 %	514059082
5054	NC_021521	TAT	2	6	322029	322034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059082
5055	NC_021521	CAAC	2	8	322378	322385	50 %	0 %	0 %	50 %	514059083
5056	NC_021521	CT	3	6	322415	322420	0 %	50 %	0 %	50 %	514059083
5057	NC_021521	TTC	2	6	322444	322449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059083
5058	NC_021521	TA	3	6	322471	322476	50 %	50 %	0 %	0 %	514059083
5059	NC_021521	ATA	2	6	322539	322544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059083
5060	NC_021521	TGT	2	6	322597	322602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059083
5061	NC_021521	TTA	2	6	322616	322621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059083
5062	NC_021521	GTC	2	6	322640	322645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059083
5063	NC_021521	A	6	6	322655	322660	100 %	0 %	0 %	0 %	514059083
5064	NC_021521	TAAT	2	8	322764	322771	50 %	50 %	0 %	0 %	514059083
5065	NC_021521	AGGG	2	8	322791	322798	25 %	0 %	75 %	0 %	514059083
5066	NC_021521	GTA	2	6	322900	322905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059084
5067	NC_021521	TTTG	2	8	323147	323154	0 %	75 %	25 %	0 %	514059084
5068	NC_021521	TAAAGA	2	12	323165	323176	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514059084
5069	NC_021521	A	6	6	323398	323403	100 %	0 %	0 %	0 %	514059085
5070	NC_021521	AGT	2	6	323449	323454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059085
5071	NC_021521	AAC	2	6	323504	323509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059085
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5075	NC_021521	AGC	2	6	323613	323618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059085
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5081	NC_021521	AGC	2	6	323775	323780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059085
5082	NC_021521	AGA	2	6	323811	323816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059085
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5089	NC_021521	GCAA	2	8	323961	323968	50 %	0 %	25 %	25 %	514059085
5090	NC_021521	AAAG	2	8	324041	324048	75 %	0 %	25 %	0 %	514059086
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5094	NC_021521	TGA	2	6	324413	324418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059086
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5097	NC_021521	ACCG	2	8	324660	324667	25 %	0 %	25 %	50 %	514059086
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5104	NC_021521	A	6	6	326352	326357	100 %	0 %	0 %	0 %	514059087
5105	NC_021521	CGA	2	6	326422	326427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059087
5106	NC_021521	ATC	2	6	326506	326511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059087
5107	NC_021521	ATC	2	6	326513	326518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059087
5108	NC_021521	CA	3	6	326555	326560	50 %	0 %	0 %	50 %	514059087
5109	NC_021521	AG	3	6	326666	326671	50 %	0 %	50 %	0 %	514059087
5110	NC_021521	GCA	2	6	326735	326740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059087
5111	NC_021521	AGA	2	6	326767	326772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059087
5112	NC_021521	CAA	2	6	326829	326834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059087
5113	NC_021521	ACGGC	2	10	326854	326863	20 %	0 %	40 %	40 %	514059087
5114	NC_021521	CAGT	2	8	326936	326943	25 %	25 %	25 %	25 %	514059087
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5117	NC_021521	TGGG	2	8	327017	327024	0 %	25 %	75 %	0 %	514059087
5118	NC_021521	A	6	6	327031	327036	100 %	0 %	0 %	0 %	514059087
5119	NC_021521	A	6	6	327041	327046	100 %	0 %	0 %	0 %	514059087
5120	NC_021521	ATC	2	6	327057	327062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059088
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5123	NC_021521	GTG	2	6	327127	327132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059088
5124	NC_021521	TGA	2	6	327146	327151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059088
5125	NC_021521	TGA	2	6	327157	327162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059088
5126	NC_021521	ACG	2	6	327163	327168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059088
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5130	NC_021521	GAAAA	2	10	327325	327334	80 %	0 %	20 %	0 %	514059088
5131	NC_021521	TTG	2	6	327402	327407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059088
5132	NC_021521	TGA	2	6	327416	327421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059088
5133	NC_021521	A	6	6	327510	327515	100 %	0 %	0 %	0 %	514059088
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5137	NC_021521	TGA	2	6	327737	327742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059088
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5143	NC_021521	GAT	2	6	328035	328040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059088
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5146	NC_021521	TGA	2	6	328127	328132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059088
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5148	NC_021521	A	6	6	328140	328145	100 %	0 %	0 %	0 %	514059088
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5154	NC_021521	CAA	2	6	328554	328559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059089
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5160	NC_021521	TGG	2	6	329025	329030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059090
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5163	NC_021521	TGATT	2	10	329458	329467	20 %	60 %	20 %	0 %	514059090
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5187	NC_021521	GGATA	2	10	331003	331012	40 %	20 %	40 %	0 %	514059094
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5204	NC_021521	GGC	2	6	332167	332172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059097
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5230	NC_021521	A	7	7	333458	333464	100 %	0 %	0 %	0 %	514059099
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5233	NC_021521	ATA	2	6	333654	333659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059100
5234	NC_021521	A	8	8	333706	333713	100 %	0 %	0 %	0 %	514059100
5235	NC_021521	TG	3	6	333787	333792	0 %	50 %	50 %	0 %	514059100
5236	NC_021521	AG	3	6	333890	333895	50 %	0 %	50 %	0 %	514059100
5237	NC_021521	TA	4	8	333900	333907	50 %	50 %	0 %	0 %	514059100
5238	NC_021521	A	6	6	333948	333953	100 %	0 %	0 %	0 %	514059100
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5242	NC_021521	AACA	2	8	336814	336821	75 %	0 %	0 %	25 %	514059101
5243	NC_021521	CGG	2	6	336923	336928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059101
5244	NC_021521	A	6	6	336933	336938	100 %	0 %	0 %	0 %	514059101
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5373	NC_021521	CAT	2	6	349082	349087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059109
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5389	NC_021521	ATCAAA	2	12	351318	351329	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	514059111
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5399	NC_021521	A	6	6	351930	351935	100 %	0 %	0 %	0 %	514059111
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5403	NC_021521	AATT	2	8	352113	352120	50 %	50 %	0 %	0 %	514059111
5404	NC_021521	TCG	2	6	352407	352412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059112
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5489	NC_021521	TAT	2	6	358374	358379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059118
5490	NC_021521	TACGCT	2	12	358406	358417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	514059118
5491	NC_021521	CCCA	2	8	358466	358473	25 %	0 %	0 %	75 %	514059118
5492	NC_021521	GTC	2	6	358499	358504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059118
5493	NC_021521	CAA	2	6	358577	358582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059118
5494	NC_021521	TGA	2	6	358641	358646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059118
5495	NC_021521	AATT	2	8	358655	358662	50 %	50 %	0 %	0 %	514059118
5496	NC_021521	ATT	2	6	358679	358684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059118
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5499	NC_021521	A	7	7	359440	359446	100 %	0 %	0 %	0 %	514059119
5500	NC_021521	ATT	2	6	359478	359483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059119

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