MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori UM032

Total Repeats: 25551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021215	GAAT	2	8	72	79	50 %	25 %	25 %	0 %	529973486
2	NC_021215	T	6	6	79	84	0 %	100 %	0 %	0 %	529973486
3	NC_021215	CTT	2	6	111	116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529973486
4	NC_021215	CAAT	2	8	223	230	50 %	25 %	0 %	25 %	529973486
5	NC_021215	GAA	2	6	236	241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973486
6	NC_021215	TTA	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973486
7	NC_021215	GGT	2	6	293	298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973487
8	NC_021215	AGA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
9	NC_021215	GAA	2	6	351	356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
10	NC_021215	TAT	2	6	366	371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973487
11	NC_021215	A	7	7	420	426	100 %	0 %	0 %	0 %	529973487
12	NC_021215	AGA	2	6	459	464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
13	NC_021215	TCT	2	6	487	492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529973487
14	NC_021215	A	6	6	494	499	100 %	0 %	0 %	0 %	529973487
15	NC_021215	AGA	3	9	560	568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
16	NC_021215	CAT	2	6	698	703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529973488
17	NC_021215	T	6	6	706	711	0 %	100 %	0 %	0 %	529973488
18	NC_021215	AGA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973488
19	NC_021215	T	6	6	815	820	0 %	100 %	0 %	0 %	529973488
20	NC_021215	CAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529973489
21	NC_021215	C	7	7	968	974	0 %	0 %	0 %	100 %	529973489
22	NC_021215	ACG	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081269
23	NC_021215	GTT	2	6	2475	2480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081269
24	NC_021215	T	6	6	2486	2491	0 %	100 %	0 %	0 %	499081269
25	NC_021215	T	6	6	2493	2498	0 %	100 %	0 %	0 %	499081269
26	NC_021215	CAA	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081269
27	NC_021215	A	7	7	2525	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	499081269
28	NC_021215	T	7	7	2622	2628	0 %	100 %	0 %	0 %	499081269
29	NC_021215	ACC	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081269
30	NC_021215	TA	3	6	2674	2679	50 %	50 %	0 %	0 %	499081269
31	NC_021215	GAA	2	6	2695	2700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081269
32	NC_021215	GTG	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081269
33	NC_021215	AAC	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081269
34	NC_021215	ATT	2	6	4313	4318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973390
35	NC_021215	CAAA	2	8	4319	4326	75 %	0 %	0 %	25 %	529973390
36	NC_021215	T	6	6	4410	4415	0 %	100 %	0 %	0 %	529973390
37	NC_021215	GATT	2	8	4433	4440	25 %	50 %	25 %	0 %	529973390
38	NC_021215	G	7	7	4445	4451	0 %	0 %	100 %	0 %	529973390
39	NC_021215	AAG	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973390
40	NC_021215	AAG	2	6	4516	4521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973390
41	NC_021215	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973390
42	NC_021215	GCG	2	6	4648	4653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529973390
43	NC_021215	GAAA	2	8	4706	4713	75 %	0 %	25 %	0 %	529973390
44	NC_021215	AGCG	2	8	4793	4800	25 %	0 %	50 %	25 %	529973390
45	NC_021215	ATG	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529973390
46	NC_021215	ATT	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973390
47	NC_021215	AGAGA	2	10	4944	4953	60 %	0 %	40 %	0 %	529973390
48	NC_021215	CT	3	6	4956	4961	0 %	50 %	0 %	50 %	529973390
49	NC_021215	A	6	6	4963	4968	100 %	0 %	0 %	0 %	529973390
50	NC_021215	CTT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529973390
51	NC_021215	T	6	6	5046	5051	0 %	100 %	0 %	0 %	529973390
52	NC_021215	GTG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973390
53	NC_021215	ATT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973390
54	NC_021215	TTG	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529973390
55	NC_021215	A	6	6	5223	5228	100 %	0 %	0 %	0 %	529973390
56	NC_021215	AGAA	2	8	5236	5243	75 %	0 %	25 %	0 %	529973390
57	NC_021215	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	529973390
58	NC_021215	GGGTC	2	10	5297	5306	0 %	20 %	60 %	20 %	499081265
59	NC_021215	ACC	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081265
60	NC_021215	GGT	2	6	5372	5377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081265
61	NC_021215	GTT	2	6	5378	5383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081265
62	NC_021215	GT	3	6	5430	5435	0 %	50 %	50 %	0 %	499081265
63	NC_021215	AAT	2	6	5520	5525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081265
64	NC_021215	GTTG	2	8	5591	5598	0 %	50 %	50 %	0 %	499081265
65	NC_021215	T	8	8	8068	8075	0 %	100 %	0 %	0 %	499081263
66	NC_021215	TGC	2	6	8080	8085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499081263
67	NC_021215	CGC	2	6	8117	8122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499081263
68	NC_021215	TA	3	6	8150	8155	50 %	50 %	0 %	0 %	499081263
69	NC_021215	TGA	2	6	8212	8217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081263
70	NC_021215	ATT	2	6	8280	8285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081263
71	NC_021215	AAG	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081263
72	NC_021215	ATA	2	6	8383	8388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081263
73	NC_021215	CA	3	6	8396	8401	50 %	0 %	0 %	50 %	499081263
74	NC_021215	TAT	2	6	8424	8429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081263
75	NC_021215	TACC	2	8	8462	8469	25 %	25 %	0 %	50 %	499081263
76	NC_021215	ATCA	2	8	8487	8494	50 %	25 %	0 %	25 %	499081263
77	NC_021215	AAT	2	6	8553	8558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081263
78	NC_021215	TTCA	2	8	8638	8645	25 %	50 %	0 %	25 %	499081262
79	NC_021215	T	7	7	8670	8676	0 %	100 %	0 %	0 %	499081262
80	NC_021215	TCAT	2	8	8693	8700	25 %	50 %	0 %	25 %	499081262
81	NC_021215	GCA	2	6	8723	8728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081262
82	NC_021215	TTA	2	6	8749	8754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081262
83	NC_021215	T	8	8	8818	8825	0 %	100 %	0 %	0 %	499081262
84	NC_021215	TTG	2	6	8837	8842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081262
85	NC_021215	CAG	2	6	8892	8897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081262
86	NC_021215	TGCT	2	8	8898	8905	0 %	50 %	25 %	25 %	499081262
87	NC_021215	ATT	2	6	8957	8962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081262
88	NC_021215	G	7	7	8983	8989	0 %	0 %	100 %	0 %	499081262
89	NC_021215	A	6	6	9014	9019	100 %	0 %	0 %	0 %	499081262
90	NC_021215	ATC	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081262
91	NC_021215	CAA	2	6	9136	9141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081262
92	NC_021215	A	6	6	9164	9169	100 %	0 %	0 %	0 %	499081262
93	NC_021215	CCA	2	6	9246	9251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081262
94	NC_021215	T	6	6	9261	9266	0 %	100 %	0 %	0 %	499081262
95	NC_021215	AAG	2	6	9326	9331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081262
96	NC_021215	A	6	6	9336	9341	100 %	0 %	0 %	0 %	499081262
97	NC_021215	AGA	2	6	9438	9443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081262
98	NC_021215	T	6	6	9507	9512	0 %	100 %	0 %	0 %	499081262
99	NC_021215	GAA	2	6	9568	9573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081262
100	NC_021215	TTTG	2	8	9633	9640	0 %	75 %	25 %	0 %	499081262
101	NC_021215	GAAA	2	8	9648	9655	75 %	0 %	25 %	0 %	499081262
102	NC_021215	ATT	2	6	9662	9667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081262
103	NC_021215	TAG	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081262
104	NC_021215	AGA	2	6	9719	9724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081262
105	NC_021215	CAT	2	6	9758	9763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081261
106	NC_021215	TGA	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081261
107	NC_021215	TCA	2	6	9817	9822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081261
108	NC_021215	GTT	2	6	9828	9833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081261
109	NC_021215	T	7	7	9835	9841	0 %	100 %	0 %	0 %	499081261
110	NC_021215	T	6	6	9866	9871	0 %	100 %	0 %	0 %	499081261
111	NC_021215	A	7	7	9949	9955	100 %	0 %	0 %	0 %	499081261
112	NC_021215	TTGA	2	8	10035	10042	25 %	50 %	25 %	0 %	499081261
113	NC_021215	ATG	2	6	10078	10083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081261
114	NC_021215	GCTCAT	2	12	10127	10138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	499081261
115	NC_021215	AAAG	2	8	10185	10192	75 %	0 %	25 %	0 %	499081261
116	NC_021215	ACC	2	6	10195	10200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081261
117	NC_021215	A	7	7	10206	10212	100 %	0 %	0 %	0 %	499081261
118	NC_021215	GATT	2	8	10232	10239	25 %	50 %	25 %	0 %	499081261
119	NC_021215	AGA	2	6	10556	10561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081261
120	NC_021215	AAAT	2	8	10562	10569	75 %	25 %	0 %	0 %	499081261
121	NC_021215	GAA	2	6	10580	10585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081261
122	NC_021215	AGA	2	6	10601	10606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081261
123	NC_021215	GTG	2	6	11657	11662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973490
124	NC_021215	GGT	2	6	11677	11682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973490
125	NC_021215	TAA	2	6	11722	11727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529973490
126	NC_021215	TGG	2	6	11829	11834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973490
127	NC_021215	AAAG	2	8	11835	11842	75 %	0 %	25 %	0 %	529973490
128	NC_021215	G	7	7	11882	11888	0 %	0 %	100 %	0 %	529973490
129	NC_021215	GTT	2	6	11890	11895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529973490
130	NC_021215	AAGAA	2	10	11907	11916	80 %	0 %	20 %	0 %	529973490
131	NC_021215	AAAT	2	8	11923	11930	75 %	25 %	0 %	0 %	529973490
132	NC_021215	T	6	6	15085	15090	0 %	100 %	0 %	0 %	499081257
133	NC_021215	TAG	2	6	15138	15143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081257
134	NC_021215	GTT	2	6	15176	15181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081257
135	NC_021215	AAG	2	6	15219	15224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081257
136	NC_021215	A	6	6	15281	15286	100 %	0 %	0 %	0 %	499081257
137	NC_021215	GAA	2	6	15389	15394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081257
138	NC_021215	G	6	6	15419	15424	0 %	0 %	100 %	0 %	499081257
139	NC_021215	ATG	2	6	15548	15553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081257
140	NC_021215	A	7	7	15587	15593	100 %	0 %	0 %	0 %	499081256
141	NC_021215	GAA	2	6	15596	15601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081256
142	NC_021215	CAT	2	6	15812	15817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081256
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144	NC_021215	TGGC	2	8	15833	15840	0 %	25 %	50 %	25 %	499081256
145	NC_021215	CATG	2	8	15851	15858	25 %	25 %	25 %	25 %	499081256
146	NC_021215	TCA	2	6	15883	15888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081256
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150	NC_021215	TTTG	2	8	15968	15975	0 %	75 %	25 %	0 %	499081256
151	NC_021215	GGC	2	6	16037	16042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499081256
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153	NC_021215	ATTT	2	8	16057	16064	25 %	75 %	0 %	0 %	499081256
154	NC_021215	TGG	2	6	16093	16098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081256
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168	NC_021215	GCAA	2	8	17060	17067	50 %	0 %	25 %	25 %	499081255
169	NC_021215	GCC	2	6	17083	17088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499081255
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181	NC_021215	TAT	2	6	17992	17997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081254
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259	NC_021215	GTTAGC	2	12	22479	22490	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529973391
260	NC_021215	AGA	2	6	22497	22502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973391
261	NC_021215	AGA	2	6	22557	22562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973391
262	NC_021215	T	6	6	22633	22638	0 %	100 %	0 %	0 %	499081250
263	NC_021215	CAT	2	6	22718	22723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081250
264	NC_021215	A	8	8	22746	22753	100 %	0 %	0 %	0 %	499081250
265	NC_021215	T	6	6	22854	22859	0 %	100 %	0 %	0 %	499081250
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