MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 74415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021172	GCGCG	2	10	130766	130775	0 %	0 %	60 %	40 %	488575168
2502	NC_021172	TCCT	2	8	130834	130841	0 %	50 %	0 %	50 %	488575168
2503	NC_021172	CGT	2	6	130858	130863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575168
2504	NC_021172	TCG	2	6	130939	130944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575168
2505	NC_021172	GCT	2	6	130955	130960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575168
2506	NC_021172	GC	3	6	130995	131000	0 %	0 %	50 %	50 %	488575168
2507	NC_021172	CTGG	2	8	131026	131033	0 %	25 %	50 %	25 %	488575168
2508	NC_021172	ACAATC	2	12	131101	131112	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	488575168
2509	NC_021172	CGA	2	6	131191	131196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575168
2510	NC_021172	CCG	2	6	131243	131248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575168
2511	NC_021172	CGG	2	6	131269	131274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575168
2512	NC_021172	TCGT	2	8	131287	131294	0 %	50 %	25 %	25 %	488575169
2513	NC_021172	CGA	2	6	131377	131382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575169
2514	NC_021172	TGC	2	6	131392	131397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575169
2515	NC_021172	TGGC	2	8	131418	131425	0 %	25 %	50 %	25 %	488575169
2516	NC_021172	GAA	2	6	131431	131436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575169
2517	NC_021172	TTG	2	6	131438	131443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575169
2518	NC_021172	GCA	2	6	131484	131489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575169
2519	NC_021172	CG	4	8	131559	131566	0 %	0 %	50 %	50 %	488575169
2520	NC_021172	GTC	2	6	131603	131608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575169
2521	NC_021172	ATC	2	6	131657	131662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575169
2522	NC_021172	CGA	2	6	131673	131678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575169
2523	NC_021172	AAAG	2	8	131756	131763	75 %	0 %	25 %	0 %	488575169
2524	NC_021172	ATTGGT	2	12	131768	131779	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	488575169
2525	NC_021172	TCG	2	6	131820	131825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575169
2526	NC_021172	TGC	2	6	131979	131984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575170
2527	NC_021172	ACT	2	6	132000	132005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575170
2528	NC_021172	GC	3	6	132022	132027	0 %	0 %	50 %	50 %	488575170
2529	NC_021172	TGA	2	6	132136	132141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575170
2530	NC_021172	CACGC	2	10	132151	132160	20 %	0 %	20 %	60 %	488575170
2531	NC_021172	CGC	2	6	132273	132278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575170
2532	NC_021172	ATC	3	9	132290	132298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575170
2533	NC_021172	CGG	2	6	132307	132312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575170
2534	NC_021172	GCCG	2	8	132316	132323	0 %	0 %	50 %	50 %	488575170
2535	NC_021172	GC	3	6	132347	132352	0 %	0 %	50 %	50 %	488575170
2536	NC_021172	GC	3	6	132398	132403	0 %	0 %	50 %	50 %	488575170
2537	NC_021172	TCGG	2	8	132416	132423	0 %	25 %	50 %	25 %	488575170
2538	NC_021172	GAC	2	6	132472	132477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575170
2539	NC_021172	GCG	2	6	132480	132485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575170
2540	NC_021172	CAC	2	6	132499	132504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575170
2541	NC_021172	CATG	2	8	132568	132575	25 %	25 %	25 %	25 %	488575170
2542	NC_021172	GGC	2	6	132649	132654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575170
2543	NC_021172	GCC	2	6	132705	132710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575170
2544	NC_021172	GCG	2	6	132731	132736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575170
2545	NC_021172	GCTG	2	8	132826	132833	0 %	25 %	50 %	25 %	488575170
2546	NC_021172	CAT	2	6	132853	132858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575170
2547	NC_021172	CGTGC	2	10	132880	132889	0 %	20 %	40 %	40 %	488575170
2548	NC_021172	TCG	2	6	132891	132896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575170
2549	NC_021172	ATCT	2	8	132911	132918	25 %	50 %	0 %	25 %	488575170
2550	NC_021172	GGC	2	6	132945	132950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575170
2551	NC_021172	GCCTT	2	10	132993	133002	0 %	40 %	20 %	40 %	488575170
2552	NC_021172	CT	3	6	133015	133020	0 %	50 %	0 %	50 %	488575170
2553	NC_021172	ATCG	2	8	133034	133041	25 %	25 %	25 %	25 %	488575170
2554	NC_021172	TG	3	6	133056	133061	0 %	50 %	50 %	0 %	488575170
2555	NC_021172	GCG	2	6	133069	133074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575170
2556	NC_021172	GGC	2	6	133075	133080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575170
2557	NC_021172	TTG	2	6	133683	133688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575171
2558	NC_021172	TTG	2	6	133733	133738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575171
2559	NC_021172	TGTGA	2	10	133764	133773	20 %	40 %	40 %	0 %	488575171
2560	NC_021172	TA	3	6	133782	133787	50 %	50 %	0 %	0 %	488575171
2561	NC_021172	TAGC	2	8	133817	133824	25 %	25 %	25 %	25 %	488575171
2562	NC_021172	AG	3	6	133871	133876	50 %	0 %	50 %	0 %	488575171
2563	NC_021172	AAT	2	6	133925	133930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575171
2564	NC_021172	CGA	2	6	133955	133960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575171
2565	NC_021172	CCGT	2	8	133966	133973	0 %	25 %	25 %	50 %	488575171
2566	NC_021172	TAC	2	6	133974	133979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575171
2567	NC_021172	AC	3	6	134035	134040	50 %	0 %	0 %	50 %	488575171
2568	NC_021172	GTCC	2	8	134071	134078	0 %	25 %	25 %	50 %	488575171
2569	NC_021172	GATA	2	8	134081	134088	50 %	25 %	25 %	0 %	488575171
2570	NC_021172	CGC	2	6	134109	134114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575171
2571	NC_021172	CCGGA	2	10	134128	134137	20 %	0 %	40 %	40 %	488575171
2572	NC_021172	ATCCT	2	10	134149	134158	20 %	40 %	0 %	40 %	488575171
2573	NC_021172	CATT	2	8	134203	134210	25 %	50 %	0 %	25 %	488575171
2574	NC_021172	CCG	2	6	134242	134247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575171
2575	NC_021172	CG	3	6	134275	134280	0 %	0 %	50 %	50 %	488575171
2576	NC_021172	TGC	3	9	134315	134323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575171
2577	NC_021172	CGA	2	6	134327	134332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575171
2578	NC_021172	ACG	2	6	134335	134340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575171
2579	NC_021172	GAT	2	6	134406	134411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575171
2580	NC_021172	CAA	2	6	134974	134979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575172
2581	NC_021172	GTCC	2	8	135078	135085	0 %	25 %	25 %	50 %	488575172
2582	NC_021172	AGCGT	2	10	135087	135096	20 %	20 %	40 %	20 %	488575172
2583	NC_021172	TCC	2	6	135100	135105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575172
2584	NC_021172	CGCC	2	8	135126	135133	0 %	0 %	25 %	75 %	488575172
2585	NC_021172	CCGA	2	8	135154	135161	25 %	0 %	25 %	50 %	488575172
2586	NC_021172	AGA	2	6	135211	135216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575172
2587	NC_021172	GCC	2	6	135351	135356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575172
2588	NC_021172	CGC	2	6	135396	135401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575172
2589	NC_021172	CGA	2	6	135426	135431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575172
2590	NC_021172	AT	3	6	135468	135473	50 %	50 %	0 %	0 %	488575172
2591	NC_021172	CGA	2	6	135528	135533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575172
2592	NC_021172	A	6	6	135535	135540	100 %	0 %	0 %	0 %	488575172
2593	NC_021172	CTC	2	6	135583	135588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575172
2594	NC_021172	T	6	6	135615	135620	0 %	100 %	0 %	0 %	488575172
2595	NC_021172	GATC	2	8	135650	135657	25 %	25 %	25 %	25 %	488575172
2596	NC_021172	CGT	2	6	135678	135683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575172
2597	NC_021172	CT	3	6	135707	135712	0 %	50 %	0 %	50 %	488575172
2598	NC_021172	ATC	2	6	135725	135730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575172
2599	NC_021172	GCT	2	6	135759	135764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575172
2600	NC_021172	CAT	2	6	135940	135945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575173
2601	NC_021172	T	7	7	136075	136081	0 %	100 %	0 %	0 %	488575173
2602	NC_021172	CGG	2	6	136093	136098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575173
2603	NC_021172	GTA	2	6	136116	136121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575173
2604	NC_021172	AG	4	8	136139	136146	50 %	0 %	50 %	0 %	488575173
2605	NC_021172	TGC	2	6	136217	136222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575173
2606	NC_021172	CTT	2	6	136223	136228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575173
2607	NC_021172	CGAG	2	8	136242	136249	25 %	0 %	50 %	25 %	488575173
2608	NC_021172	CAG	2	6	136280	136285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575173
2609	NC_021172	AAT	2	6	136323	136328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575173
2610	NC_021172	CAT	2	6	136367	136372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575173
2611	NC_021172	GTA	2	6	136382	136387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575173
2612	NC_021172	AG	3	6	136388	136393	50 %	0 %	50 %	0 %	488575173
2613	NC_021172	GGA	2	6	136414	136419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575173
2614	NC_021172	ACGGA	2	10	136422	136431	40 %	0 %	40 %	20 %	488575173
2615	NC_021172	CTTG	2	8	136498	136505	0 %	50 %	25 %	25 %	488575173
2616	NC_021172	GGC	2	6	136575	136580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575173
2617	NC_021172	GTC	2	6	136629	136634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575173
2618	NC_021172	TGC	2	6	136929	136934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575174
2619	NC_021172	GCG	2	6	136989	136994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575174
2620	NC_021172	CCACA	2	10	136998	137007	40 %	0 %	0 %	60 %	488575174
2621	NC_021172	GCG	2	6	137133	137138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575174
2622	NC_021172	AAC	2	6	137175	137180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575174
2623	NC_021172	TC	3	6	137190	137195	0 %	50 %	0 %	50 %	488575174
2624	NC_021172	CAT	2	6	137251	137256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575174
2625	NC_021172	AGC	2	6	137396	137401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575174
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2627	NC_021172	CGA	2	6	138140	138145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575175
2628	NC_021172	ATCT	2	8	138161	138168	25 %	50 %	0 %	25 %	488575175
2629	NC_021172	CGGCTT	2	12	138201	138212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575175
2630	NC_021172	GCT	2	6	138240	138245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575175
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2632	NC_021172	CT	3	6	138350	138355	0 %	50 %	0 %	50 %	488575176
2633	NC_021172	AAG	2	6	138357	138362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575176
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2636	NC_021172	ATG	2	6	138542	138547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575176
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2643	NC_021172	CTG	2	6	138930	138935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575177
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2664	NC_021172	TCG	2	6	140499	140504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575180
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2723	NC_021172	CG	3	6	144594	144599	0 %	0 %	50 %	50 %	488575186
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2727	NC_021172	TG	3	6	144904	144909	0 %	50 %	50 %	0 %	488575187
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2730	NC_021172	GGCGC	2	10	144983	144992	0 %	0 %	60 %	40 %	488575187
2731	NC_021172	TAT	2	6	145111	145116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575187
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2733	NC_021172	TCGAC	2	10	145137	145146	20 %	20 %	20 %	40 %	488575187
2734	NC_021172	GGCG	2	8	145178	145185	0 %	0 %	75 %	25 %	488575187
2735	NC_021172	TTG	2	6	145251	145256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575188
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2737	NC_021172	CAG	2	6	145295	145300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575188
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2739	NC_021172	TTGC	2	8	145421	145428	0 %	50 %	25 %	25 %	488575188
2740	NC_021172	GCG	2	6	145467	145472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575188
2741	NC_021172	CCTA	2	8	145616	145623	25 %	25 %	0 %	50 %	488575188
2742	NC_021172	ACG	2	6	145650	145655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575188
2743	NC_021172	GCT	2	6	145690	145695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575188
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2745	NC_021172	TGA	2	6	145798	145803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575188
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2987	NC_021172	ATC	2	6	162494	162499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575207
2988	NC_021172	TACG	2	8	162511	162518	25 %	25 %	25 %	25 %	488575207
2989	NC_021172	CGG	2	6	162559	162564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575207
2990	NC_021172	TGC	2	6	162583	162588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575207
2991	NC_021172	GCA	2	6	163238	163243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575208
2992	NC_021172	CGA	2	6	163311	163316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575208
2993	NC_021172	CCG	2	6	163325	163330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575208
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2995	NC_021172	CGAG	2	8	163362	163369	25 %	0 %	50 %	25 %	488575208
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2997	NC_021172	CAG	2	6	163481	163486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575208
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2999	NC_021172	GCA	2	6	163547	163552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575208
3000	NC_021172	GCC	2	6	163577	163582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575208

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