MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 74415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021172	GAA	2	6	102304	102309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575140
2002	NC_021172	CTG	2	6	102323	102328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575140
2003	NC_021172	TCA	2	6	102377	102382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575140
2004	NC_021172	CGC	2	6	102411	102416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575140
2005	NC_021172	GCC	2	6	102481	102486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575140
2006	NC_021172	ACG	2	6	102496	102501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575140
2007	NC_021172	AATC	2	8	102581	102588	50 %	25 %	0 %	25 %	488575140
2008	NC_021172	TGATG	2	10	103023	103032	20 %	40 %	40 %	0 %	488575141
2009	NC_021172	CAA	2	6	103035	103040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575141
2010	NC_021172	TCG	2	6	103100	103105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575141
2011	NC_021172	GTT	2	6	103123	103128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575141
2012	NC_021172	CG	3	6	103138	103143	0 %	0 %	50 %	50 %	488575141
2013	NC_021172	GCG	2	6	103158	103163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575141
2014	NC_021172	GGC	3	9	103168	103176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575141
2015	NC_021172	ATC	2	6	103177	103182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575141
2016	NC_021172	GCT	2	6	103249	103254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575141
2017	NC_021172	CGC	2	6	103278	103283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575141
2018	NC_021172	T	6	6	103330	103335	0 %	100 %	0 %	0 %	488575141
2019	NC_021172	GC	3	6	103359	103364	0 %	0 %	50 %	50 %	488575141
2020	NC_021172	GC	3	6	103377	103382	0 %	0 %	50 %	50 %	488575141
2021	NC_021172	CCG	2	6	103389	103394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575141
2022	NC_021172	GCG	2	6	103429	103434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575141
2023	NC_021172	GAG	2	6	103456	103461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575141
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2025	NC_021172	GTT	2	6	103530	103535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575141
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2029	NC_021172	TCG	2	6	103972	103977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575142
2030	NC_021172	CCGT	2	8	104087	104094	0 %	25 %	25 %	50 %	488575142
2031	NC_021172	CCGG	2	8	104119	104126	0 %	0 %	50 %	50 %	488575142
2032	NC_021172	CAT	2	6	104214	104219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575142
2033	NC_021172	CTG	2	6	104259	104264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575142
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2036	NC_021172	CTTC	2	8	104393	104400	0 %	50 %	0 %	50 %	488575142
2037	NC_021172	CGC	2	6	104414	104419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575142
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2039	NC_021172	GGC	2	6	104588	104593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575142
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2041	NC_021172	TGCT	2	8	104628	104635	0 %	50 %	25 %	25 %	488575142
2042	NC_021172	AGC	2	6	104752	104757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575142
2043	NC_021172	AGC	2	6	104793	104798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575142
2044	NC_021172	GAG	2	6	104939	104944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575143
2045	NC_021172	A	8	8	104990	104997	100 %	0 %	0 %	0 %	488575143
2046	NC_021172	GATC	2	8	104998	105005	25 %	25 %	25 %	25 %	488575143
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2051	NC_021172	TCCG	2	8	105119	105126	0 %	25 %	25 %	50 %	488575143
2052	NC_021172	CGCA	2	8	105159	105166	25 %	0 %	25 %	50 %	488575143
2053	NC_021172	GGCGA	2	10	105170	105179	20 %	0 %	60 %	20 %	488575143
2054	NC_021172	GCG	2	6	105206	105211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575143
2055	NC_021172	GAT	2	6	105296	105301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575143
2056	NC_021172	CAGAT	2	10	105622	105631	40 %	20 %	20 %	20 %	488575144
2057	NC_021172	TGA	2	6	105653	105658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575144
2058	NC_021172	ATCG	2	8	105865	105872	25 %	25 %	25 %	25 %	488575144
2059	NC_021172	CGC	2	6	105923	105928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575144
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2064	NC_021172	ATA	2	6	106157	106162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575144
2065	NC_021172	CCGA	2	8	106188	106195	25 %	0 %	25 %	50 %	488575144
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2072	NC_021172	TGACC	2	10	106616	106625	20 %	20 %	20 %	40 %	488575144
2073	NC_021172	GCG	2	6	106628	106633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575144
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2090	NC_021172	GCA	2	6	107882	107887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575146
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2100	NC_021172	ACG	2	6	108456	108461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575146
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2121	NC_021172	CGG	2	6	109523	109528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575146
2122	NC_021172	CGG	2	6	109559	109564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575146
2123	NC_021172	CTT	2	6	109854	109859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575147
2124	NC_021172	TTG	2	6	109923	109928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575147
2125	NC_021172	TCA	2	6	109962	109967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575147
2126	NC_021172	GTC	2	6	109979	109984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575147
2127	NC_021172	CAT	2	6	110051	110056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575147
2128	NC_021172	ATC	2	6	110127	110132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575148
2129	NC_021172	CAG	2	6	110181	110186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575148
2130	NC_021172	TTGA	2	8	110824	110831	25 %	50 %	25 %	0 %	488575149
2131	NC_021172	CTTC	2	8	110870	110877	0 %	50 %	0 %	50 %	488575149
2132	NC_021172	CGT	2	6	110927	110932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575149
2133	NC_021172	CAT	2	6	110970	110975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575149
2134	NC_021172	GGC	2	6	111018	111023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575149
2135	NC_021172	GTTCG	2	10	111131	111140	0 %	40 %	40 %	20 %	488575149
2136	NC_021172	GAC	2	6	111201	111206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575149
2137	NC_021172	ATGC	2	8	111289	111296	25 %	25 %	25 %	25 %	488575149
2138	NC_021172	GAT	2	6	111474	111479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575149
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2140	NC_021172	TGGC	2	8	111582	111589	0 %	25 %	50 %	25 %	488575149
2141	NC_021172	TACGA	2	10	111616	111625	40 %	20 %	20 %	20 %	488575149
2142	NC_021172	TCT	2	6	111684	111689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575149
2143	NC_021172	CAAG	2	8	111701	111708	50 %	0 %	25 %	25 %	488575149
2144	NC_021172	GA	3	6	111797	111802	50 %	0 %	50 %	0 %	488575149
2145	NC_021172	TTTG	2	8	111887	111894	0 %	75 %	25 %	0 %	488575150
2146	NC_021172	CGTC	2	8	111925	111932	0 %	25 %	25 %	50 %	488575150
2147	NC_021172	CTG	2	6	111956	111961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575150
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2151	NC_021172	GCA	2	6	112142	112147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575150
2152	NC_021172	ATC	2	6	112183	112188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575150
2153	NC_021172	CTT	2	6	112235	112240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575150
2154	NC_021172	AATG	2	8	112262	112269	50 %	25 %	25 %	0 %	488575150
2155	NC_021172	TGC	2	6	112390	112395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575150
2156	NC_021172	GTCAT	2	10	112398	112407	20 %	40 %	20 %	20 %	488575150
2157	NC_021172	GA	3	6	112455	112460	50 %	0 %	50 %	0 %	488575150
2158	NC_021172	CGC	2	6	112482	112487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575150
2159	NC_021172	CGA	2	6	112507	112512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575150
2160	NC_021172	TGC	2	6	112513	112518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575150
2161	NC_021172	TGA	2	6	112536	112541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575150
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2163	NC_021172	GGT	2	6	112624	112629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575150
2164	NC_021172	CGC	2	6	112677	112682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575150
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2168	NC_021172	A	6	6	112939	112944	100 %	0 %	0 %	0 %	488575151
2169	NC_021172	GA	3	6	112945	112950	50 %	0 %	50 %	0 %	488575151
2170	NC_021172	ACA	2	6	112966	112971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575151
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2172	NC_021172	ATC	2	6	113040	113045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575151
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2179	NC_021172	GGC	2	6	113677	113682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575153
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2182	NC_021172	GCCG	2	8	113802	113809	0 %	0 %	50 %	50 %	488575153
2183	NC_021172	GGC	2	6	113882	113887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575153
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2186	NC_021172	CGTCA	2	10	114132	114141	20 %	20 %	20 %	40 %	488575154
2187	NC_021172	GC	3	6	114326	114331	0 %	0 %	50 %	50 %	488575154
2188	NC_021172	GAA	2	6	114393	114398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575154
2189	NC_021172	TCG	2	6	114538	114543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575154
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2192	NC_021172	GAT	2	6	114788	114793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575154
2193	NC_021172	ACC	2	6	114825	114830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575154
2194	NC_021172	CTG	2	6	114840	114845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575154
2195	NC_021172	CG	3	6	114870	114875	0 %	0 %	50 %	50 %	488575154
2196	NC_021172	TCG	2	6	114886	114891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575154
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2201	NC_021172	TGA	2	6	115040	115045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575154
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2203	NC_021172	AGG	2	6	115162	115167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575154
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2217	NC_021172	GCAA	2	8	115818	115825	50 %	0 %	25 %	25 %	488575156
2218	NC_021172	CG	3	6	115833	115838	0 %	0 %	50 %	50 %	488575156
2219	NC_021172	CCG	2	6	115847	115852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575156
2220	NC_021172	CGTT	2	8	115856	115863	0 %	50 %	25 %	25 %	488575156
2221	NC_021172	TAC	2	6	115897	115902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575156
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2225	NC_021172	GGC	2	6	115997	116002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575156
2226	NC_021172	ATT	2	6	116220	116225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575156
2227	NC_021172	CGA	2	6	116327	116332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575157
2228	NC_021172	ACG	2	6	116352	116357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575157
2229	NC_021172	AGG	2	6	116490	116495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575157
2230	NC_021172	GGTT	2	8	116553	116560	0 %	50 %	50 %	0 %	488575157
2231	NC_021172	ATG	2	6	116611	116616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575157
2232	NC_021172	GCG	2	6	116625	116630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575157
2233	NC_021172	TGA	2	6	116651	116656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575157
2234	NC_021172	CGT	2	6	116697	116702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575157
2235	NC_021172	TTC	2	6	116764	116769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575157
2236	NC_021172	GC	3	6	117150	117155	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2237	NC_021172	TTG	2	6	117164	117169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575158
2238	NC_021172	CGG	2	6	117246	117251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575158
2239	NC_021172	CAC	2	6	117285	117290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575158
2240	NC_021172	GTG	2	6	117325	117330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575158
2241	NC_021172	CAC	2	6	117354	117359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575158
2242	NC_021172	TCA	2	6	117446	117451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575158
2243	NC_021172	CG	4	8	117537	117544	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2244	NC_021172	GCC	2	6	117558	117563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575158
2245	NC_021172	GCCG	2	8	117586	117593	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2246	NC_021172	GCG	2	6	117621	117626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575158
2247	NC_021172	CG	5	10	117625	117634	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2248	NC_021172	CTC	2	6	117660	117665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575158
2249	NC_021172	CCG	2	6	117709	117714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575158
2250	NC_021172	AGC	2	6	117809	117814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2251	NC_021172	TCT	2	6	117915	117920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575158
2252	NC_021172	CCGGCG	2	12	117992	118003	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2253	NC_021172	CGC	2	6	118046	118051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575158
2254	NC_021172	TGC	2	6	118061	118066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2255	NC_021172	CGG	2	6	118133	118138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575158
2256	NC_021172	GTC	2	6	118141	118146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2257	NC_021172	CGGC	2	8	118175	118182	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2258	NC_021172	GAC	2	6	118183	118188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575158
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2262	NC_021172	CCG	2	6	118283	118288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575158
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2266	NC_021172	TGC	2	6	118433	118438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575158
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2271	NC_021172	TGC	2	6	118664	118669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575158
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2273	NC_021172	CGGA	2	8	118754	118761	25 %	0 %	50 %	25 %	488575158
2274	NC_021172	GACATC	2	12	118762	118773	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488575158
2275	NC_021172	GAG	2	6	118810	118815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575158
2276	NC_021172	CGA	2	6	118869	118874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575158
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2280	NC_021172	GAA	2	6	119410	119415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575159
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2282	NC_021172	CGT	2	6	119619	119624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575159
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2285	NC_021172	CTG	2	6	119874	119879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575159
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2290	NC_021172	CGA	2	6	120207	120212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575159
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2293	NC_021172	CAAT	2	8	120282	120289	50 %	25 %	0 %	25 %	488575159
2294	NC_021172	AC	3	6	120307	120312	50 %	0 %	0 %	50 %	488575159
2295	NC_021172	GCG	2	6	120314	120319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575159
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2299	NC_021172	GAT	2	6	120437	120442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575159
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2348	NC_021172	TCCG	2	8	123158	123165	0 %	25 %	25 %	50 %	488575161
2349	NC_021172	TGG	2	6	123215	123220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575162
2350	NC_021172	TGC	2	6	123243	123248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575162
2351	NC_021172	CATC	2	8	123312	123319	25 %	25 %	0 %	50 %	488575162
2352	NC_021172	GAC	2	6	123354	123359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575162
2353	NC_021172	T	7	7	123399	123405	0 %	100 %	0 %	0 %	488575162
2354	NC_021172	TGC	2	6	123465	123470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575162
2355	NC_021172	TC	3	6	123524	123529	0 %	50 %	0 %	50 %	488575162
2356	NC_021172	CGT	2	6	123534	123539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575162
2357	NC_021172	GAA	2	6	123576	123581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575162
2358	NC_021172	T	6	6	123604	123609	0 %	100 %	0 %	0 %	488575162
2359	NC_021172	TCT	2	6	123633	123638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575162
2360	NC_021172	AGG	2	6	123642	123647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575162
2361	NC_021172	GCA	2	6	123655	123660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575162
2362	NC_021172	GC	4	8	123682	123689	0 %	0 %	50 %	50 %	488575162
2363	NC_021172	ATT	2	6	123738	123743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575162
2364	NC_021172	CGC	2	6	123855	123860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575162
2365	NC_021172	ATT	2	6	124154	124159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575162
2366	NC_021172	TCG	2	6	124210	124215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575162
2367	NC_021172	ATC	2	6	124216	124221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575162
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2369	NC_021172	TAT	2	6	124345	124350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575162
2370	NC_021172	GC	3	6	124364	124369	0 %	0 %	50 %	50 %	488575162
2371	NC_021172	CTG	2	6	124416	124421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575162
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2375	NC_021172	GC	3	6	124663	124668	0 %	0 %	50 %	50 %	488575163
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2377	NC_021172	CG	3	6	124727	124732	0 %	0 %	50 %	50 %	488575163
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2383	NC_021172	CCTT	2	8	125033	125040	0 %	50 %	0 %	50 %	488575163
2384	NC_021172	GCTT	2	8	125056	125063	0 %	50 %	25 %	25 %	488575163
2385	NC_021172	GC	3	6	125121	125126	0 %	0 %	50 %	50 %	488575163
2386	NC_021172	TC	3	6	125136	125141	0 %	50 %	0 %	50 %	488575163
2387	NC_021172	AG	3	6	125210	125215	50 %	0 %	50 %	0 %	488575163
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2390	NC_021172	CCT	2	6	125380	125385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575163
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2392	NC_021172	TAT	2	6	125400	125405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575163
2393	NC_021172	GCTA	2	8	125414	125421	25 %	25 %	25 %	25 %	488575163
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2401	NC_021172	CTG	2	6	125758	125763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575163
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2442	NC_021172	AC	3	6	127862	127867	50 %	0 %	0 %	50 %	488575165
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2472	NC_021172	ATGG	2	8	129285	129292	25 %	25 %	50 %	0 %	488575167
2473	NC_021172	GCG	2	6	129344	129349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575167
2474	NC_021172	GGC	2	6	129409	129414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575167
2475	NC_021172	ATGT	2	8	129423	129430	25 %	50 %	25 %	0 %	488575167
2476	NC_021172	ATC	2	6	129433	129438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575167
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2479	NC_021172	GCT	2	6	129563	129568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575167
2480	NC_021172	ATC	2	6	129573	129578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575167
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2482	NC_021172	CGC	2	6	129603	129608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575167
2483	NC_021172	TGGCG	2	10	129662	129671	0 %	20 %	60 %	20 %	488575167
2484	NC_021172	A	6	6	129676	129681	100 %	0 %	0 %	0 %	488575167
2485	NC_021172	CGTGT	2	10	129684	129693	0 %	40 %	40 %	20 %	488575167
2486	NC_021172	GGA	2	6	129885	129890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575167
2487	NC_021172	CGG	2	6	129977	129982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575167
2488	NC_021172	GC	3	6	129989	129994	0 %	0 %	50 %	50 %	488575167
2489	NC_021172	TTG	2	6	130005	130010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575167
2490	NC_021172	CTG	2	6	130071	130076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575167
2491	NC_021172	GCC	2	6	130116	130121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575167
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2493	NC_021172	GTC	2	6	130149	130154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575167
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