MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halovivax ruber XH-70

Total Repeats: 73713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019964	CGTT	2	8	219924	219931	0 %	50 %	25 %	25 %	433637214
5002	NC_019964	CCAG	2	8	219935	219942	25 %	0 %	25 %	50 %	433637214
5003	NC_019964	TCG	3	9	219955	219963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637214
5004	NC_019964	CGG	2	6	219978	219983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637214
5005	NC_019964	GCCA	2	8	219987	219994	25 %	0 %	25 %	50 %	433637214
5006	NC_019964	GTG	2	6	219997	220002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637214
5007	NC_019964	TCGCG	2	10	220174	220183	0 %	20 %	40 %	40 %	433637215
5008	NC_019964	CTG	2	6	220190	220195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637215
5009	NC_019964	CGA	2	6	220228	220233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637215
5010	NC_019964	TCG	2	6	220242	220247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637215
5011	NC_019964	CGAC	2	8	220312	220319	25 %	0 %	25 %	50 %	433637215
5012	NC_019964	CTG	2	6	220382	220387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637215
5013	NC_019964	TCG	2	6	220404	220409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637215
5014	NC_019964	TCG	2	6	220413	220418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637215
5015	NC_019964	CCT	2	6	220534	220539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637215
5016	NC_019964	TCG	2	6	220554	220559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637215
5017	NC_019964	CCT	2	6	220561	220566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637215
5018	NC_019964	CGG	2	6	220567	220572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637215
5019	NC_019964	CGC	2	6	220576	220581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637215
5020	NC_019964	CGC	2	6	220604	220609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637215
5021	NC_019964	TCG	3	9	220617	220625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637215
5022	NC_019964	TC	3	6	220645	220650	0 %	50 %	0 %	50 %	433637215
5023	NC_019964	GGCCG	2	10	220708	220717	0 %	0 %	60 %	40 %	433637215
5024	NC_019964	GAATCG	2	12	220760	220771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433637215
5025	NC_019964	CGG	2	6	220774	220779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637215
5026	NC_019964	CGTC	2	8	220797	220804	0 %	25 %	25 %	50 %	433637215
5027	NC_019964	GTG	2	6	220818	220823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637215
5028	NC_019964	GAGC	2	8	220945	220952	25 %	0 %	50 %	25 %	433637216
5029	NC_019964	CCGA	2	8	220963	220970	25 %	0 %	25 %	50 %	433637216
5030	NC_019964	GAC	2	6	221001	221006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5031	NC_019964	GC	3	6	221069	221074	0 %	0 %	50 %	50 %	433637216
5032	NC_019964	CG	3	6	221079	221084	0 %	0 %	50 %	50 %	433637216
5033	NC_019964	CACGGA	2	12	221121	221132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5034	NC_019964	TCA	2	6	221162	221167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637216
5035	NC_019964	CCA	2	6	221172	221177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433637216
5036	NC_019964	GAC	2	6	221203	221208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5037	NC_019964	ACG	2	6	221240	221245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5038	NC_019964	GA	3	6	221265	221270	50 %	0 %	50 %	0 %	433637216
5039	NC_019964	CGA	2	6	221274	221279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5040	NC_019964	AAG	2	6	221308	221313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637216
5041	NC_019964	CCTG	2	8	221402	221409	0 %	25 %	25 %	50 %	433637216
5042	NC_019964	CCG	2	6	221490	221495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637216
5043	NC_019964	AGG	2	6	221549	221554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637216
5044	NC_019964	GCG	2	6	221560	221565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637216
5045	NC_019964	GCC	2	6	221605	221610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637216
5046	NC_019964	GCG	2	6	221633	221638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637216
5047	NC_019964	ACG	3	9	221654	221662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5048	NC_019964	GGC	2	6	221734	221739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637216
5049	NC_019964	TCG	2	6	221744	221749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5050	NC_019964	GGC	2	6	221769	221774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637216
5051	NC_019964	CGC	2	6	221811	221816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637216
5052	NC_019964	GTC	2	6	221821	221826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5053	NC_019964	ACG	3	9	221879	221887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5054	NC_019964	AGG	2	6	221888	221893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637216
5055	NC_019964	CGC	2	6	221895	221900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637216
5056	NC_019964	GATC	2	8	221961	221968	25 %	25 %	25 %	25 %	433637216
5057	NC_019964	CGG	2	6	221997	222002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637216
5058	NC_019964	CGC	2	6	222045	222050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637216
5059	NC_019964	GC	3	6	222049	222054	0 %	0 %	50 %	50 %	433637216
5060	NC_019964	TCG	2	6	222119	222124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5061	NC_019964	GAC	2	6	222166	222171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5062	NC_019964	ACG	2	6	222176	222181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5063	NC_019964	GAC	2	6	222241	222246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5064	NC_019964	CCT	3	9	222261	222269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637216
5065	NC_019964	CGG	2	6	222276	222281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637216
5066	NC_019964	GCG	2	6	222298	222303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637216
5067	NC_019964	CG	3	6	222302	222307	0 %	0 %	50 %	50 %	433637216
5068	NC_019964	CGGT	2	8	222341	222348	0 %	25 %	50 %	25 %	433637216
5069	NC_019964	CGC	2	6	222410	222415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637216
5070	NC_019964	ACCTCC	2	12	222416	222427	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	433637216
5071	NC_019964	CGA	2	6	222441	222446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5072	NC_019964	ACC	2	6	222470	222475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433637216
5073	NC_019964	CGA	2	6	222486	222491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5074	NC_019964	CGA	2	6	222507	222512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
5075	NC_019964	TCGG	2	8	222551	222558	0 %	25 %	50 %	25 %	433637216
5076	NC_019964	CGA	2	6	222594	222599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637216
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5078	NC_019964	CGA	2	6	222801	222806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637217
5079	NC_019964	GAG	2	6	222814	222819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637217
5080	NC_019964	CGGC	2	8	222834	222841	0 %	0 %	50 %	50 %	433637217
5081	NC_019964	TCC	2	6	222842	222847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637217
5082	NC_019964	CGAC	2	8	222876	222883	25 %	0 %	25 %	50 %	433637217
5083	NC_019964	GCGA	2	8	222890	222897	25 %	0 %	50 %	25 %	433637217
5084	NC_019964	CCA	2	6	222912	222917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433637217
5085	NC_019964	TCG	2	6	222942	222947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637217
5086	NC_019964	CGT	2	6	222973	222978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637217
5087	NC_019964	GAC	2	6	223012	223017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637217
5088	NC_019964	CGAAGA	2	12	223041	223052	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	433637217
5089	NC_019964	TCG	2	6	223089	223094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637217
5090	NC_019964	GC	3	6	223096	223101	0 %	0 %	50 %	50 %	433637217
5091	NC_019964	AGC	2	6	223145	223150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637217
5092	NC_019964	CGG	2	6	223164	223169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637217
5093	NC_019964	GCC	2	6	223223	223228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637217
5094	NC_019964	AGC	2	6	223229	223234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637217
5095	NC_019964	GAG	2	6	223273	223278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637217
5096	NC_019964	GAC	2	6	223288	223293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637217
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5099	NC_019964	CGA	2	6	223497	223502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637217
5100	NC_019964	GT	3	6	223523	223528	0 %	50 %	50 %	0 %	433637217
5101	NC_019964	CGT	2	6	223541	223546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637217
5102	NC_019964	CG	4	8	223563	223570	0 %	0 %	50 %	50 %	433637217
5103	NC_019964	CGA	2	6	223596	223601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637217
5104	NC_019964	TCG	2	6	223697	223702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637218
5105	NC_019964	CGC	2	6	223707	223712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637218
5106	NC_019964	GAC	3	9	223737	223745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637218
5107	NC_019964	TCC	2	6	223860	223865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637218
5108	NC_019964	CTG	2	6	223880	223885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637218
5109	NC_019964	CCTG	2	8	223895	223902	0 %	25 %	25 %	50 %	433637218
5110	NC_019964	CAT	2	6	223910	223915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637218
5111	NC_019964	GAC	2	6	223941	223946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637218
5112	NC_019964	CGC	2	6	223974	223979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637218
5113	NC_019964	TCG	2	6	223981	223986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637218
5114	NC_019964	CGCGAG	2	12	223992	224003	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433637218
5115	NC_019964	GCC	2	6	224019	224024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637218
5116	NC_019964	GC	3	6	224026	224031	0 %	0 %	50 %	50 %	433637218
5117	NC_019964	CGC	2	6	224069	224074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637218
5118	NC_019964	GAA	2	6	224133	224138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637218
5119	NC_019964	CGC	2	6	224147	224152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637218
5120	NC_019964	GAT	2	6	224169	224174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637218
5121	NC_019964	TCG	2	6	224221	224226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637218
5122	NC_019964	CCA	2	6	224249	224254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433637218
5123	NC_019964	CTC	2	6	224313	224318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637218
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5225	NC_019964	GAC	2	6	229181	229186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637223
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5229	NC_019964	CCCA	2	8	229233	229240	25 %	0 %	0 %	75 %	433637223
5230	NC_019964	GGCC	2	8	229277	229284	0 %	0 %	50 %	50 %	433637223
5231	NC_019964	CGC	2	6	229322	229327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637223
5232	NC_019964	TGG	2	6	229338	229343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637223
5233	NC_019964	CCT	2	6	229382	229387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637223
5234	NC_019964	CGG	2	6	229391	229396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637223
5235	NC_019964	GTCG	2	8	229412	229419	0 %	25 %	50 %	25 %	433637223
5236	NC_019964	GCG	2	6	229462	229467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637223
5237	NC_019964	CGCCCG	2	12	229523	229534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637223
5238	NC_019964	TCG	2	6	229609	229614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637223
5239	NC_019964	GTG	2	6	229635	229640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637223
5240	NC_019964	CGC	2	6	229661	229666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637223
5241	NC_019964	CGC	2	6	229670	229675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637223
5242	NC_019964	CGG	2	6	229678	229683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637223
5243	NC_019964	CGG	2	6	229700	229705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637223
5244	NC_019964	GCT	2	6	229835	229840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637223
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5341	NC_019964	ATCGAG	2	12	234096	234107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433637227
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5343	NC_019964	AGC	2	6	234172	234177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637227
5344	NC_019964	GA	3	6	234217	234222	50 %	0 %	50 %	0 %	433637227
5345	NC_019964	CGA	2	6	234236	234241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637227
5346	NC_019964	CGCGAG	2	12	234264	234275	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433637227
5347	NC_019964	CGGT	2	8	234301	234308	0 %	25 %	50 %	25 %	433637227
5348	NC_019964	CGAC	2	8	234330	234337	25 %	0 %	25 %	50 %	433637227
5349	NC_019964	CTCA	2	8	234481	234488	25 %	25 %	0 %	50 %	433637228
5350	NC_019964	CCT	2	6	234489	234494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637228
5351	NC_019964	CGT	2	6	234500	234505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637228
5352	NC_019964	TCTCGT	2	12	234522	234533	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	433637228
5353	NC_019964	CAG	3	9	234575	234583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
5354	NC_019964	GAG	2	6	234596	234601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637228
5355	NC_019964	CGA	2	6	234607	234612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
5356	NC_019964	GCC	2	6	234635	234640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637228
5357	NC_019964	CGA	3	9	234649	234657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
5358	NC_019964	CGC	2	6	234679	234684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637228
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5360	NC_019964	CGAG	2	8	234727	234734	25 %	0 %	50 %	25 %	433637228
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5363	NC_019964	CGA	2	6	234808	234813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
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5367	NC_019964	GACGC	2	10	234890	234899	20 %	0 %	40 %	40 %	433637228
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5397	NC_019964	GGTC	2	8	236766	236773	0 %	25 %	50 %	25 %	433637230
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5452	NC_019964	ACG	3	9	238974	238982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637231
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5455	NC_019964	ACA	2	6	239059	239064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637231
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5457	NC_019964	GCA	2	6	239080	239085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637231
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5460	NC_019964	G	6	6	239225	239230	0 %	0 %	100 %	0 %	433637231
5461	NC_019964	TCG	2	6	239234	239239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637231
5462	NC_019964	CA	4	8	239252	239259	50 %	0 %	0 %	50 %	433637231
5463	NC_019964	GTGG	2	8	239511	239518	0 %	25 %	75 %	0 %	433637232
5464	NC_019964	GGA	2	6	239525	239530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637232
5465	NC_019964	TCT	2	6	239635	239640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433637233
5466	NC_019964	TTG	2	6	239655	239660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433637233
5467	NC_019964	CGG	2	6	239688	239693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637233
5468	NC_019964	ACGT	2	8	239726	239733	25 %	25 %	25 %	25 %	433637233
5469	NC_019964	AAG	2	6	239777	239782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637233
5470	NC_019964	CA	3	6	239803	239808	50 %	0 %	0 %	50 %	433637233
5471	NC_019964	AGG	2	6	239886	239891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637233
5472	NC_019964	GATG	2	8	239908	239915	25 %	25 %	50 %	0 %	433637233
5473	NC_019964	CGG	2	6	239934	239939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637233
5474	NC_019964	GCC	2	6	240210	240215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637234
5475	NC_019964	GTC	2	6	240232	240237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5476	NC_019964	CG	3	6	240289	240294	0 %	0 %	50 %	50 %	433637234
5477	NC_019964	TCG	2	6	240307	240312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5478	NC_019964	CGA	2	6	240323	240328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5479	NC_019964	CGAG	3	12	240342	240353	25 %	0 %	50 %	25 %	433637234
5480	NC_019964	CGT	2	6	240431	240436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5481	NC_019964	TCG	2	6	240457	240462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5482	NC_019964	GAT	2	6	240525	240530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637234
5483	NC_019964	TCG	2	6	240568	240573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5484	NC_019964	GCC	2	6	240585	240590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637234
5485	NC_019964	CGG	2	6	240713	240718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637234
5486	NC_019964	TG	3	6	240734	240739	0 %	50 %	50 %	0 %	433637234
5487	NC_019964	GAC	2	6	240744	240749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5488	NC_019964	CGC	2	6	240785	240790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637234
5489	NC_019964	G	6	6	240852	240857	0 %	0 %	100 %	0 %	433637234
5490	NC_019964	CTC	2	6	240936	240941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637234
5491	NC_019964	GTC	2	6	240942	240947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5492	NC_019964	CGG	2	6	240980	240985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637234
5493	NC_019964	CGG	2	6	241027	241032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637234
5494	NC_019964	GCG	2	6	241101	241106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637234
5495	NC_019964	TCG	2	6	241180	241185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5496	NC_019964	GGC	2	6	241197	241202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637234
5497	NC_019964	CGT	2	6	241217	241222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5498	NC_019964	CGA	2	6	241238	241243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5499	NC_019964	CGT	3	9	241268	241276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
5500	NC_019964	CG	3	6	241292	241297	0 %	0 %	50 %	50 %	433637234

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