MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 71283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019779	TCAAAA	2	12	214903	214914	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428774849
3502	NC_019779	TCA	2	6	214915	214920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774849
3503	NC_019779	C	7	7	214926	214932	0 %	0 %	0 %	100 %	428774849
3504	NC_019779	ATT	2	6	214955	214960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774849
3505	NC_019779	ATG	2	6	215023	215028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774850
3506	NC_019779	CTT	2	6	215063	215068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774850
3507	NC_019779	TCC	2	6	215092	215097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774850
3508	NC_019779	CTC	2	6	215133	215138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774850
3509	NC_019779	AG	3	6	215263	215268	50 %	0 %	50 %	0 %	428774850
3510	NC_019779	TG	3	6	215275	215280	0 %	50 %	50 %	0 %	428774850
3511	NC_019779	GTTG	2	8	215325	215332	0 %	50 %	50 %	0 %	428774850
3512	NC_019779	AG	4	8	215393	215400	50 %	0 %	50 %	0 %	428774850
3513	NC_019779	CTAT	2	8	215453	215460	25 %	50 %	0 %	25 %	428774850
3514	NC_019779	GCA	2	6	215617	215622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774851
3515	NC_019779	GAA	2	6	215671	215676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774851
3516	NC_019779	TCAT	2	8	215741	215748	25 %	50 %	0 %	25 %	428774851
3517	NC_019779	GA	3	6	215750	215755	50 %	0 %	50 %	0 %	428774851
3518	NC_019779	TTGC	2	8	215760	215767	0 %	50 %	25 %	25 %	428774851
3519	NC_019779	TTGG	2	8	215774	215781	0 %	50 %	50 %	0 %	428774851
3520	NC_019779	GATTT	2	10	215785	215794	20 %	60 %	20 %	0 %	428774851
3521	NC_019779	TTTC	2	8	215815	215822	0 %	75 %	0 %	25 %	428774851
3522	NC_019779	ATT	2	6	215832	215837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774851
3523	NC_019779	CAG	2	6	215855	215860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774851
3524	NC_019779	GAA	2	6	216156	216161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774852
3525	NC_019779	G	6	6	216279	216284	0 %	0 %	100 %	0 %	428774852
3526	NC_019779	CCGC	2	8	216299	216306	0 %	0 %	25 %	75 %	428774852
3527	NC_019779	AGAC	2	8	216318	216325	50 %	0 %	25 %	25 %	428774852
3528	NC_019779	CG	3	6	216361	216366	0 %	0 %	50 %	50 %	428774852
3529	NC_019779	AAT	2	6	216449	216454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774852
3530	NC_019779	CTG	2	6	216456	216461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774852
3531	NC_019779	TCT	2	6	216548	216553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774852
3532	NC_019779	GAA	2	6	216582	216587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774852
3533	NC_019779	ATCTAA	2	12	216667	216678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428774852
3534	NC_019779	TCAC	2	8	216728	216735	25 %	25 %	0 %	50 %	428774852
3535	NC_019779	TTG	2	6	216826	216831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774852
3536	NC_019779	AATT	2	8	216889	216896	50 %	50 %	0 %	0 %	428774852
3537	NC_019779	T	6	6	217143	217148	0 %	100 %	0 %	0 %	428774853
3538	NC_019779	TCC	2	6	217212	217217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774853
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3540	NC_019779	TTG	2	6	217331	217336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774853
3541	NC_019779	T	6	6	217351	217356	0 %	100 %	0 %	0 %	428774853
3542	NC_019779	TAAA	2	8	217394	217401	75 %	25 %	0 %	0 %	428774853
3543	NC_019779	AATC	2	8	217465	217472	50 %	25 %	0 %	25 %	428774853
3544	NC_019779	ACTC	2	8	217537	217544	25 %	25 %	0 %	50 %	428774853
3545	NC_019779	TTC	2	6	217546	217551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774853
3546	NC_019779	TCA	2	6	217792	217797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774854
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3548	NC_019779	TCT	2	6	217900	217905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774854
3549	NC_019779	TTG	2	6	217953	217958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774854
3550	NC_019779	TTCGGT	2	12	218129	218140	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428774855
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3552	NC_019779	GAA	2	6	218165	218170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774855
3553	NC_019779	CCG	2	6	218337	218342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428774855
3554	NC_019779	TGC	2	6	218350	218355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774855
3555	NC_019779	AAG	2	6	218382	218387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774855
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3558	NC_019779	ATG	2	6	218559	218564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774855
3559	NC_019779	AAC	2	6	218565	218570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774855
3560	NC_019779	CAC	2	6	218638	218643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774855
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3571	NC_019779	AACCAC	2	12	219256	219267	50 %	0 %	0 %	50 %	428774857
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3594	NC_019779	CCAT	2	8	220757	220764	25 %	25 %	0 %	50 %	428774859
3595	NC_019779	T	6	6	220803	220808	0 %	100 %	0 %	0 %	428774859
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3605	NC_019779	TGG	2	6	221696	221701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774860
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3607	NC_019779	AAG	2	6	221765	221770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774860
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3613	NC_019779	GAATT	2	10	222011	222020	40 %	40 %	20 %	0 %	428774860
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3621	NC_019779	TTA	2	6	222595	222600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774860
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3989	NC_019779	CTT	2	6	243367	243372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774876
3990	NC_019779	CTT	2	6	243410	243415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774876
3991	NC_019779	CGA	2	6	243424	243429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774876
3992	NC_019779	CTT	2	6	243499	243504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774876
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3994	NC_019779	GTCG	2	8	243536	243543	0 %	25 %	50 %	25 %	428774876
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