MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 71283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019779	TCA	2	6	299281	299286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774924
5002	NC_019779	TAT	2	6	299327	299332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774924
5003	NC_019779	ATG	2	6	299414	299419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774925
5004	NC_019779	GAA	2	6	299453	299458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774925
5005	NC_019779	AGC	2	6	299524	299529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774925
5006	NC_019779	CAT	2	6	299944	299949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774926
5007	NC_019779	GAA	2	6	299991	299996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774926
5008	NC_019779	AGC	2	6	300005	300010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774926
5009	NC_019779	TGG	2	6	300119	300124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774926
5010	NC_019779	ATT	2	6	300153	300158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774926
5011	NC_019779	AGA	2	6	300386	300391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774926
5012	NC_019779	AGA	2	6	300404	300409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774926
5013	NC_019779	GCT	2	6	300415	300420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774926
5014	NC_019779	AAC	2	6	300460	300465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774926
5015	NC_019779	AGC	3	9	300548	300556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774926
5016	NC_019779	AGC	3	9	300755	300763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774926
5017	NC_019779	TTTTGC	2	12	300767	300778	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428774926
5018	NC_019779	CCG	2	6	300806	300811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428774926
5019	NC_019779	TGG	2	6	300911	300916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774926
5020	NC_019779	GAA	2	6	300918	300923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774926
5021	NC_019779	CCAA	2	8	301068	301075	50 %	0 %	0 %	50 %	428774926
5022	NC_019779	CTTT	2	8	301083	301090	0 %	75 %	0 %	25 %	428774926
5023	NC_019779	GGGGC	2	10	301107	301116	0 %	0 %	80 %	20 %	428774926
5024	NC_019779	GTC	3	9	301126	301134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774926
5025	NC_019779	AAC	2	6	301171	301176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774926
5026	NC_019779	GAA	2	6	301227	301232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774926
5027	NC_019779	GTG	2	6	301263	301268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774926
5028	NC_019779	GTCA	2	8	301275	301282	25 %	25 %	25 %	25 %	428774926
5029	NC_019779	AGG	2	6	301339	301344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774926
5030	NC_019779	AACA	2	8	301356	301363	75 %	0 %	0 %	25 %	428774927
5031	NC_019779	CCTGCA	2	12	301710	301721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428774927
5032	NC_019779	TGA	2	6	301748	301753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774927
5033	NC_019779	AGC	2	6	301781	301786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774927
5034	NC_019779	CAA	3	9	301800	301808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774927
5035	NC_019779	AGT	2	6	301886	301891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774927
5036	NC_019779	TCT	2	6	301895	301900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774927
5037	NC_019779	TC	3	6	301945	301950	0 %	50 %	0 %	50 %	428774927
5038	NC_019779	TGA	2	6	301958	301963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774927
5039	NC_019779	CG	3	6	302112	302117	0 %	0 %	50 %	50 %	428774928
5040	NC_019779	GAT	2	6	302154	302159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774928
5041	NC_019779	GTT	2	6	302192	302197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774928
5042	NC_019779	AAC	2	6	302215	302220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774928
5043	NC_019779	CTT	2	6	302229	302234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774928
5044	NC_019779	CA	3	6	302269	302274	50 %	0 %	0 %	50 %	428774928
5045	NC_019779	TTCC	2	8	302292	302299	0 %	50 %	0 %	50 %	428774928
5046	NC_019779	TAAGGA	2	12	302302	302313	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428774928
5047	NC_019779	TCA	2	6	302381	302386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774928
5048	NC_019779	TTG	2	6	302420	302425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774928
5049	NC_019779	TAAC	2	8	302469	302476	50 %	25 %	0 %	25 %	428774928
5050	NC_019779	GCA	2	6	302514	302519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774928
5051	NC_019779	T	7	7	302531	302537	0 %	100 %	0 %	0 %	428774928
5052	NC_019779	CCG	2	6	302538	302543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428774928
5053	NC_019779	TTC	2	6	302656	302661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774928
5054	NC_019779	TAA	2	6	302680	302685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774928
5055	NC_019779	CGG	2	6	302803	302808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428774928
5056	NC_019779	CGC	2	6	302927	302932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428774928
5057	NC_019779	TAAA	2	8	302981	302988	75 %	25 %	0 %	0 %	428774928
5058	NC_019779	CCT	2	6	303000	303005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774928
5059	NC_019779	GAA	2	6	303051	303056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774928
5060	NC_019779	T	7	7	303133	303139	0 %	100 %	0 %	0 %	428774928
5061	NC_019779	TGCA	2	8	303155	303162	25 %	25 %	25 %	25 %	428774928
5062	NC_019779	TCT	2	6	303303	303308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774929
5063	NC_019779	TCC	2	6	303334	303339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774929
5064	NC_019779	GCT	2	6	303374	303379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774929
5065	NC_019779	ATT	2	6	303445	303450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774929
5066	NC_019779	TTC	2	6	303490	303495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774929
5067	NC_019779	TGG	2	6	303501	303506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774929
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5069	NC_019779	A	6	6	303535	303540	100 %	0 %	0 %	0 %	428774929
5070	NC_019779	ATA	2	6	303557	303562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774929
5071	NC_019779	A	6	6	303586	303591	100 %	0 %	0 %	0 %	428774929
5072	NC_019779	GA	4	8	303651	303658	50 %	0 %	50 %	0 %	428774929
5073	NC_019779	TGCCA	2	10	303694	303703	20 %	20 %	20 %	40 %	428774929
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5075	NC_019779	GCA	2	6	303791	303796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774929
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5078	NC_019779	T	6	6	303918	303923	0 %	100 %	0 %	0 %	428774929
5079	NC_019779	CAA	3	9	303975	303983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774929
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5089	NC_019779	AG	3	6	304367	304372	50 %	0 %	50 %	0 %	428774929
5090	NC_019779	CGG	2	6	304383	304388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428774929
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5093	NC_019779	TG	3	6	304571	304576	0 %	50 %	50 %	0 %	428774929
5094	NC_019779	TCA	2	6	304580	304585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774929
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5103	NC_019779	GGT	2	6	305163	305168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774930
5104	NC_019779	TGAC	2	8	305207	305214	25 %	25 %	25 %	25 %	428774930
5105	NC_019779	CCA	2	6	305372	305377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774930
5106	NC_019779	GAG	2	6	305419	305424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774930
5107	NC_019779	T	6	6	305563	305568	0 %	100 %	0 %	0 %	428774931
5108	NC_019779	C	7	7	305731	305737	0 %	0 %	0 %	100 %	428774931
5109	NC_019779	TAA	2	6	305758	305763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774931
5110	NC_019779	AC	3	6	305783	305788	50 %	0 %	0 %	50 %	428774931
5111	NC_019779	TCT	2	6	305808	305813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774931
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5113	NC_019779	TTC	2	6	305861	305866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774931
5114	NC_019779	AGCC	2	8	305916	305923	25 %	0 %	25 %	50 %	428774931
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5118	NC_019779	ACAG	2	8	306032	306039	50 %	0 %	25 %	25 %	428774931
5119	NC_019779	ACA	2	6	306131	306136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774931
5120	NC_019779	TCT	2	6	306147	306152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774931
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5122	NC_019779	T	6	6	306245	306250	0 %	100 %	0 %	0 %	428774932
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