MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter heilmannii ASB1.4 main chromosome

Total Repeats: 27641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019674	AGA	2	6	72	77	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527848
2	NC_019674	ATTTTG	2	12	146	157	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480527848
3	NC_019674	A	6	6	208	213	100 %	0 %	0 %	0 %	480527848
4	NC_019674	CAA	2	6	294	299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527848
5	NC_019674	GTG	2	6	361	366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527848
6	NC_019674	AAACC	2	10	377	386	60 %	0 %	0 %	40 %	480527848
7	NC_019674	A	6	6	398	403	100 %	0 %	0 %	0 %	480527848
8	NC_019674	CCG	2	6	426	431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480527848
9	NC_019674	GCTT	2	8	470	477	0 %	50 %	25 %	25 %	480527849
10	NC_019674	G	7	7	480	486	0 %	0 %	100 %	0 %	480527849
11	NC_019674	CAAG	2	8	534	541	50 %	0 %	25 %	25 %	480527849
12	NC_019674	AGC	2	6	559	564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527849
13	NC_019674	TTG	2	6	616	621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527849
14	NC_019674	AAG	2	6	639	644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527849
15	NC_019674	CAG	2	6	760	765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527849
16	NC_019674	A	7	7	830	836	100 %	0 %	0 %	0 %	480527849
17	NC_019674	GC	3	6	870	875	0 %	0 %	50 %	50 %	480527849
18	NC_019674	CAA	2	6	904	909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527849
19	NC_019674	CAA	2	6	933	938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527849
20	NC_019674	TCG	2	6	956	961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527849
21	NC_019674	CAAGC	2	10	982	991	40 %	0 %	20 %	40 %	480527849
22	NC_019674	CA	3	6	1046	1051	50 %	0 %	0 %	50 %	480527849
23	NC_019674	TG	3	6	1095	1100	0 %	50 %	50 %	0 %	480527849
24	NC_019674	CAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527849
25	NC_019674	GAT	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527849
26	NC_019674	GGC	2	6	1224	1229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480527849
27	NC_019674	A	7	7	1381	1387	100 %	0 %	0 %	0 %	480527849
28	NC_019674	CAT	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527850
29	NC_019674	CCACG	2	10	1468	1477	20 %	0 %	20 %	60 %	480527850
30	NC_019674	ACA	2	6	1567	1572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527850
31	NC_019674	TCCC	2	8	1605	1612	0 %	25 %	0 %	75 %	480527850
32	NC_019674	AAG	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527850
33	NC_019674	AGTG	2	8	1738	1745	25 %	25 %	50 %	0 %	480527850
34	NC_019674	ACC	2	6	1785	1790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527850
35	NC_019674	TGT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527850
36	NC_019674	TAGCC	2	10	2090	2099	20 %	20 %	20 %	40 %	480527851
37	NC_019674	TTTG	2	8	2138	2145	0 %	75 %	25 %	0 %	480527851
38	NC_019674	GC	3	6	2349	2354	0 %	0 %	50 %	50 %	480527852
39	NC_019674	TTG	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527852
40	NC_019674	GGCT	2	8	2390	2397	0 %	25 %	50 %	25 %	480527852
41	NC_019674	A	6	6	2431	2436	100 %	0 %	0 %	0 %	480527852
42	NC_019674	GGGTG	2	10	2473	2482	0 %	20 %	80 %	0 %	480527852
43	NC_019674	AAG	2	6	2531	2536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527852
44	NC_019674	AAAG	2	8	2679	2686	75 %	0 %	25 %	0 %	480527852
45	NC_019674	T	6	6	2742	2747	0 %	100 %	0 %	0 %	480527852
46	NC_019674	TAA	2	6	2767	2772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480527852
47	NC_019674	CT	3	6	2900	2905	0 %	50 %	0 %	50 %	480527852
48	NC_019674	GCTT	2	8	2955	2962	0 %	50 %	25 %	25 %	480527852
49	NC_019674	C	7	7	3006	3012	0 %	0 %	0 %	100 %	480527852
50	NC_019674	AC	3	6	3022	3027	50 %	0 %	0 %	50 %	480527852
51	NC_019674	TGT	2	6	3068	3073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527852
52	NC_019674	GTGG	2	8	3106	3113	0 %	25 %	75 %	0 %	480527852
53	NC_019674	GTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527852
54	NC_019674	ACAG	2	8	3181	3188	50 %	0 %	25 %	25 %	480527852
55	NC_019674	GTGG	2	8	3238	3245	0 %	25 %	75 %	0 %	480527852
56	NC_019674	G	6	6	3244	3249	0 %	0 %	100 %	0 %	480527852
57	NC_019674	CTT	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527852
58	NC_019674	CAC	2	6	3328	3333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527852
59	NC_019674	TTG	2	6	3358	3363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527852
60	NC_019674	G	6	6	3537	3542	0 %	0 %	100 %	0 %	480527852
61	NC_019674	CTT	2	6	3654	3659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527852
62	NC_019674	CTGC	2	8	3720	3727	0 %	25 %	25 %	50 %	480527852
63	NC_019674	GCTT	2	8	3731	3738	0 %	50 %	25 %	25 %	480527852
64	NC_019674	TTC	2	6	3751	3756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527852
65	NC_019674	T	6	6	3913	3918	0 %	100 %	0 %	0 %	480527852
66	NC_019674	CACC	2	8	4014	4021	25 %	0 %	0 %	75 %	480527852
67	NC_019674	CACT	2	8	4044	4051	25 %	25 %	0 %	50 %	480527852
68	NC_019674	C	6	6	4058	4063	0 %	0 %	0 %	100 %	480527852
69	NC_019674	GTA	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527852
70	NC_019674	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527852
71	NC_019674	CCAC	2	8	4247	4254	25 %	0 %	0 %	75 %	480527852
72	NC_019674	TGGG	2	8	4259	4266	0 %	25 %	75 %	0 %	480527852
73	NC_019674	TAG	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527852
74	NC_019674	TGG	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527852
75	NC_019674	TGAT	2	8	4505	4512	25 %	50 %	25 %	0 %	480527853
76	NC_019674	AAC	2	6	4547	4552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527853
77	NC_019674	AAC	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527853
78	NC_019674	ATC	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527853
79	NC_019674	G	6	6	4675	4680	0 %	0 %	100 %	0 %	480527853
80	NC_019674	ATG	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527853
81	NC_019674	TTGA	2	8	4733	4740	25 %	50 %	25 %	0 %	480527853
82	NC_019674	CAA	2	6	4768	4773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527853
83	NC_019674	AAGCG	2	10	4789	4798	40 %	0 %	40 %	20 %	480527853
84	NC_019674	TG	3	6	4828	4833	0 %	50 %	50 %	0 %	480527853
85	NC_019674	T	6	6	4866	4871	0 %	100 %	0 %	0 %	480527853
86	NC_019674	G	6	6	4915	4920	0 %	0 %	100 %	0 %	480527853
87	NC_019674	CCA	2	6	5028	5033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527853
88	NC_019674	AGC	2	6	5348	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527853
89	NC_019674	TGA	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527853
90	NC_019674	ATT	2	6	5431	5436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480527853
91	NC_019674	A	6	6	5449	5454	100 %	0 %	0 %	0 %	480527853
92	NC_019674	TGG	2	6	6225	6230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527854
93	NC_019674	GC	3	6	6283	6288	0 %	0 %	50 %	50 %	480527854
94	NC_019674	AAG	2	6	6342	6347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527854
95	NC_019674	GGT	2	6	6391	6396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527854
96	NC_019674	AAG	2	6	6438	6443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527854
97	NC_019674	TTTG	2	8	6511	6518	0 %	75 %	25 %	0 %	480527854
98	NC_019674	CTA	2	6	6608	6613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527854
99	NC_019674	T	6	6	6788	6793	0 %	100 %	0 %	0 %	480527854
100	NC_019674	GA	3	6	6801	6806	50 %	0 %	50 %	0 %	480527854
101	NC_019674	ATTTAA	2	12	6858	6869	50 %	50 %	0 %	0 %	480527854
102	NC_019674	GTG	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527854
103	NC_019674	ACA	2	6	6981	6986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527854
104	NC_019674	G	6	6	7049	7054	0 %	0 %	100 %	0 %	480527854
105	NC_019674	AAG	2	6	7071	7076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527854
106	NC_019674	A	6	6	7085	7090	100 %	0 %	0 %	0 %	480527854
107	NC_019674	ATC	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527855
108	NC_019674	GC	3	6	7416	7421	0 %	0 %	50 %	50 %	480527855
109	NC_019674	GAGC	2	8	7528	7535	25 %	0 %	50 %	25 %	480527855
110	NC_019674	CAT	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527855
111	NC_019674	AAG	2	6	7632	7637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527855
112	NC_019674	AG	3	6	7763	7768	50 %	0 %	50 %	0 %	480527855
113	NC_019674	GAT	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527855
114	NC_019674	CAA	2	6	7816	7821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527855
115	NC_019674	AG	3	6	7849	7854	50 %	0 %	50 %	0 %	480527855
116	NC_019674	CAA	2	6	7889	7894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527855
117	NC_019674	GCA	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527855
118	NC_019674	TAAA	2	8	7979	7986	75 %	25 %	0 %	0 %	480527856
119	NC_019674	CAC	2	6	8000	8005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527856
120	NC_019674	AGCGG	2	10	8071	8080	20 %	0 %	60 %	20 %	480527856
121	NC_019674	CAT	2	6	8094	8099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527856
122	NC_019674	CGG	2	6	8168	8173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480527856
123	NC_019674	GGA	2	6	8250	8255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480527856
124	NC_019674	GATG	2	8	8265	8272	25 %	25 %	50 %	0 %	480527856
125	NC_019674	C	6	6	8344	8349	0 %	0 %	0 %	100 %	480527856
126	NC_019674	A	7	7	8359	8365	100 %	0 %	0 %	0 %	480527856
127	NC_019674	CAA	2	6	8433	8438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527856
128	NC_019674	AGA	2	6	8448	8453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527856
129	NC_019674	ACA	2	6	8480	8485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527856
130	NC_019674	ACAA	2	8	8504	8511	75 %	0 %	0 %	25 %	480527857
131	NC_019674	TCC	2	6	8524	8529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480527857
132	NC_019674	TTA	2	6	8574	8579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480527857
133	NC_019674	GC	3	6	8584	8589	0 %	0 %	50 %	50 %	480527857
134	NC_019674	A	6	6	8601	8606	100 %	0 %	0 %	0 %	480527857
135	NC_019674	CAT	2	6	8618	8623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527857
136	NC_019674	TG	3	6	8648	8653	0 %	50 %	50 %	0 %	480527857
137	NC_019674	CT	3	6	8701	8706	0 %	50 %	0 %	50 %	480527857
138	NC_019674	A	6	6	8710	8715	100 %	0 %	0 %	0 %	480527857
139	NC_019674	GTTAGA	2	12	8726	8737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527857
140	NC_019674	TAC	2	6	8763	8768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527857
141	NC_019674	CTG	2	6	8860	8865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527857
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261	NC_019674	G	7	7	19475	19481	0 %	0 %	100 %	0 %	480527866
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264	NC_019674	TGG	2	6	19620	19625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527867
265	NC_019674	AG	3	6	19666	19671	50 %	0 %	50 %	0 %	480527867
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268	NC_019674	GGT	2	6	19774	19779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527867
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271	NC_019674	CA	3	6	19853	19858	50 %	0 %	0 %	50 %	480527867
272	NC_019674	CAA	2	6	19882	19887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527867
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394	NC_019674	AG	3	6	28246	28251	50 %	0 %	50 %	0 %	480527875
395	NC_019674	AG	3	6	28281	28286	50 %	0 %	50 %	0 %	480527875
396	NC_019674	C	6	6	28289	28294	0 %	0 %	0 %	100 %	480527875
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497	NC_019674	TTGG	2	8	33430	33437	0 %	50 %	50 %	0 %	480527879
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