MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 30622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_018938	A	7	7	587906	587912	100 %	0 %	0 %	0 %	410501554
11003	NC_018938	CCT	2	6	587957	587962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410501554
11004	NC_018938	A	7	7	587997	588003	100 %	0 %	0 %	0 %	410501554
11005	NC_018938	AGA	2	6	588034	588039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501554
11006	NC_018938	A	7	7	588039	588045	100 %	0 %	0 %	0 %	410501554
11007	NC_018938	GCAA	2	8	588084	588091	50 %	0 %	25 %	25 %	410501555
11008	NC_018938	TCA	2	6	588115	588120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501555
11009	NC_018938	ATCT	2	8	588137	588144	25 %	50 %	0 %	25 %	410501555
11010	NC_018938	T	7	7	588168	588174	0 %	100 %	0 %	0 %	410501555
11011	NC_018938	A	6	6	588182	588187	100 %	0 %	0 %	0 %	410501555
11012	NC_018938	ATC	2	6	588200	588205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501555
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11014	NC_018938	A	6	6	588218	588223	100 %	0 %	0 %	0 %	410501555
11015	NC_018938	G	7	7	588241	588247	0 %	0 %	100 %	0 %	410501555
11016	NC_018938	ATC	2	6	588249	588254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501555
11017	NC_018938	A	6	6	588308	588313	100 %	0 %	0 %	0 %	410501555
11018	NC_018938	TATG	2	8	588466	588473	25 %	50 %	25 %	0 %	410501555
11019	NC_018938	A	7	7	588592	588598	100 %	0 %	0 %	0 %	410501555
11020	NC_018938	T	7	7	588606	588612	0 %	100 %	0 %	0 %	410501555
11021	NC_018938	GAGC	2	8	588616	588623	25 %	0 %	50 %	25 %	410501555
11022	NC_018938	A	7	7	588638	588644	100 %	0 %	0 %	0 %	410501555
11023	NC_018938	GCA	2	6	588716	588721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501555
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11026	NC_018938	GAA	2	6	588845	588850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501556
11027	NC_018938	AAG	2	6	588891	588896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501556
11028	NC_018938	ATTC	2	8	588944	588951	25 %	50 %	0 %	25 %	410501556
11029	NC_018938	GAA	2	6	589121	589126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501556
11030	NC_018938	A	6	6	589125	589130	100 %	0 %	0 %	0 %	410501556
11031	NC_018938	A	6	6	589132	589137	100 %	0 %	0 %	0 %	410501556
11032	NC_018938	ATCA	2	8	589166	589173	50 %	25 %	0 %	25 %	410501556
11033	NC_018938	GGT	2	6	589234	589239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501556
11034	NC_018938	CTT	2	6	589278	589283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501556
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11038	NC_018938	AGA	2	6	589393	589398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501556
11039	NC_018938	ACAAG	2	10	589411	589420	60 %	0 %	20 %	20 %	410501556
11040	NC_018938	AAG	2	6	589428	589433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501556
11041	NC_018938	AGA	2	6	589441	589446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501556
11042	NC_018938	TAT	2	6	589462	589467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501556
11043	NC_018938	A	6	6	589472	589477	100 %	0 %	0 %	0 %	410501556
11044	NC_018938	TGAT	2	8	589494	589501	25 %	50 %	25 %	0 %	410501556
11045	NC_018938	A	8	8	589511	589518	100 %	0 %	0 %	0 %	410501556
11046	NC_018938	A	8	8	589538	589545	100 %	0 %	0 %	0 %	410501556
11047	NC_018938	ACC	2	6	589566	589571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501556
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11052	NC_018938	A	8	8	590647	590654	100 %	0 %	0 %	0 %	410501557
11053	NC_018938	CA	3	6	590665	590670	50 %	0 %	0 %	50 %	410501557
11054	NC_018938	CCA	2	6	590673	590678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501557
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11056	NC_018938	AACCA	2	10	590727	590736	60 %	0 %	0 %	40 %	410501557
11057	NC_018938	A	6	6	590740	590745	100 %	0 %	0 %	0 %	410501557
11058	NC_018938	CGC	2	6	590781	590786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501557
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11060	NC_018938	ACC	2	6	590880	590885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501557
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11063	NC_018938	A	6	6	590960	590965	100 %	0 %	0 %	0 %	410501557
11064	NC_018938	T	6	6	591036	591041	0 %	100 %	0 %	0 %	410501557
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11066	NC_018938	T	6	6	591067	591072	0 %	100 %	0 %	0 %	410501557
11067	NC_018938	TTG	2	6	591595	591600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501558
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11072	NC_018938	CGC	2	6	591787	591792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501558
11073	NC_018938	CAT	2	6	591832	591837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501558
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11076	NC_018938	TAG	2	6	591906	591911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501558
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11079	NC_018938	TCT	2	6	592136	592141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501558
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11093	NC_018938	GGGGCT	2	12	592890	592901	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410501559
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11095	NC_018938	TTC	2	6	592985	592990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501559
11096	NC_018938	T	6	6	593060	593065	0 %	100 %	0 %	0 %	410501559
11097	NC_018938	ATC	2	6	593069	593074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501559
11098	NC_018938	C	6	6	593108	593113	0 %	0 %	0 %	100 %	410501559
11099	NC_018938	TGG	2	6	593131	593136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501559
11100	NC_018938	AAT	2	6	593198	593203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501559
11101	NC_018938	CTG	2	6	593215	593220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501559
11102	NC_018938	AG	3	6	593237	593242	50 %	0 %	50 %	0 %	410501559
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11104	NC_018938	TGA	2	6	593308	593313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501559
11105	NC_018938	CAAAA	2	10	593344	593353	80 %	0 %	0 %	20 %	410501559
11106	NC_018938	A	6	6	593350	593355	100 %	0 %	0 %	0 %	410501559
11107	NC_018938	CAGAGC	2	12	593392	593403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501559
11108	NC_018938	TTC	2	6	593426	593431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501559
11109	NC_018938	CT	3	6	593477	593482	0 %	50 %	0 %	50 %	410501559
11110	NC_018938	TGAA	2	8	593502	593509	50 %	25 %	25 %	0 %	410501559
11111	NC_018938	TCA	2	6	593539	593544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501559
11112	NC_018938	A	6	6	593652	593657	100 %	0 %	0 %	0 %	410501559
11113	NC_018938	TCT	2	6	593661	593666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501559
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11115	NC_018938	TAC	2	6	593705	593710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501559
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11117	NC_018938	CTAA	2	8	593788	593795	50 %	25 %	0 %	25 %	410501560
11118	NC_018938	CAC	2	6	594059	594064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501561
11119	NC_018938	TGA	2	6	594076	594081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501561
11120	NC_018938	T	6	6	594082	594087	0 %	100 %	0 %	0 %	410501561
11121	NC_018938	TCA	2	6	594096	594101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501561
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11495	NC_018938	GCA	2	6	614259	614264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501583
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11497	NC_018938	T	6	6	614450	614455	0 %	100 %	0 %	0 %	410501583
11498	NC_018938	T	6	6	614498	614503	0 %	100 %	0 %	0 %	410501583
11499	NC_018938	CTT	2	6	614560	614565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501583
11500	NC_018938	T	7	7	614578	614584	0 %	100 %	0 %	0 %	410501583

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