MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 30622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_018938	ATC	2	6	540097	540102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501513
10002	NC_018938	GAA	2	6	540108	540113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501513
10003	NC_018938	AG	3	6	540149	540154	50 %	0 %	50 %	0 %	410501513
10004	NC_018938	TGAT	2	8	540238	540245	25 %	50 %	25 %	0 %	410501513
10005	NC_018938	CGAG	2	8	540262	540269	25 %	0 %	50 %	25 %	410501513
10006	NC_018938	A	7	7	540359	540365	100 %	0 %	0 %	0 %	410501513
10007	NC_018938	GAT	2	6	540402	540407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501513
10008	NC_018938	GGA	2	6	540542	540547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410501513
10009	NC_018938	GA	3	6	540546	540551	50 %	0 %	50 %	0 %	410501513
10010	NC_018938	A	7	7	540664	540670	100 %	0 %	0 %	0 %	410501513
10011	NC_018938	TTA	2	6	540690	540695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501513
10012	NC_018938	A	6	6	540741	540746	100 %	0 %	0 %	0 %	410501513
10013	NC_018938	T	6	6	540779	540784	0 %	100 %	0 %	0 %	410501513
10014	NC_018938	GATG	2	8	540797	540804	25 %	25 %	50 %	0 %	410501513
10015	NC_018938	CTA	3	9	540816	540824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501513
10016	NC_018938	TAT	2	6	540878	540883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501513
10017	NC_018938	AG	3	6	540893	540898	50 %	0 %	50 %	0 %	410501513
10018	NC_018938	GT	3	6	540918	540923	0 %	50 %	50 %	0 %	410501513
10019	NC_018938	TGTC	2	8	541016	541023	0 %	50 %	25 %	25 %	410501513
10020	NC_018938	TTA	2	6	541072	541077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501513
10021	NC_018938	A	8	8	541098	541105	100 %	0 %	0 %	0 %	410501513
10022	NC_018938	CA	3	6	541260	541265	50 %	0 %	0 %	50 %	410501513
10023	NC_018938	CAA	2	6	541307	541312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501513
10024	NC_018938	A	6	6	541324	541329	100 %	0 %	0 %	0 %	410501513
10025	NC_018938	TCAA	2	8	541369	541376	50 %	25 %	0 %	25 %	410501513
10026	NC_018938	A	6	6	541417	541422	100 %	0 %	0 %	0 %	410501513
10027	NC_018938	A	6	6	541506	541511	100 %	0 %	0 %	0 %	410501513
10028	NC_018938	AGAA	2	8	541516	541523	75 %	0 %	25 %	0 %	410501513
10029	NC_018938	AAGA	2	8	541524	541531	75 %	0 %	25 %	0 %	410501513
10030	NC_018938	AAGA	2	8	541551	541558	75 %	0 %	25 %	0 %	410501513
10031	NC_018938	A	7	7	541558	541564	100 %	0 %	0 %	0 %	410501513
10032	NC_018938	TGA	2	6	541646	541651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501513
10033	NC_018938	AT	3	6	541679	541684	50 %	50 %	0 %	0 %	410501513
10034	NC_018938	TTG	2	6	541720	541725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501513
10035	NC_018938	TGAA	2	8	541765	541772	50 %	25 %	25 %	0 %	410501513
10036	NC_018938	GTC	2	6	541825	541830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501513
10037	NC_018938	GGT	2	6	541923	541928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501513
10038	NC_018938	TAT	2	6	542017	542022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501514
10039	NC_018938	AGA	2	6	542024	542029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501514
10040	NC_018938	GT	3	6	542058	542063	0 %	50 %	50 %	0 %	410501514
10041	NC_018938	CTA	2	6	542122	542127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501514
10042	NC_018938	CAA	2	6	542138	542143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501514
10043	NC_018938	AAAG	2	8	542162	542169	75 %	0 %	25 %	0 %	410501514
10044	NC_018938	AAG	2	6	542176	542181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501514
10045	NC_018938	A	6	6	542247	542252	100 %	0 %	0 %	0 %	410501514
10046	NC_018938	AGA	2	6	542291	542296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501514
10047	NC_018938	A	6	6	542343	542348	100 %	0 %	0 %	0 %	410501514
10048	NC_018938	TGG	2	6	542443	542448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501514
10049	NC_018938	CGA	3	9	542470	542478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501514
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10051	NC_018938	AG	3	6	542675	542680	50 %	0 %	50 %	0 %	410501515
10052	NC_018938	GTG	2	6	542706	542711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501515
10053	NC_018938	GAT	3	9	542762	542770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501515
10054	NC_018938	CATTTT	2	12	542789	542800	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410501515
10055	NC_018938	GCT	2	6	542844	542849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501515
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10057	NC_018938	AGA	2	6	542930	542935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501515
10058	NC_018938	CAT	2	6	543055	543060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501516
10059	NC_018938	CTATCG	2	12	543084	543095	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410501516
10060	NC_018938	AAG	2	6	543141	543146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501516
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10062	NC_018938	A	6	6	543393	543398	100 %	0 %	0 %	0 %	410501516
10063	NC_018938	A	6	6	543404	543409	100 %	0 %	0 %	0 %	410501516
10064	NC_018938	C	6	6	543416	543421	0 %	0 %	0 %	100 %	410501516
10065	NC_018938	GAA	2	6	543440	543445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501516
10066	NC_018938	A	8	8	543444	543451	100 %	0 %	0 %	0 %	410501516
10067	NC_018938	CAA	2	6	543482	543487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501516
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10071	NC_018938	GATT	2	8	543553	543560	25 %	50 %	25 %	0 %	410501516
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10074	NC_018938	AAG	2	6	543663	543668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501516
10075	NC_018938	TGA	2	6	543763	543768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501516
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10077	NC_018938	GTG	2	6	543866	543871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501516
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10080	NC_018938	ATC	2	6	544052	544057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501516
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10085	NC_018938	TCAA	2	8	544276	544283	50 %	25 %	0 %	25 %	410501516
10086	NC_018938	TGA	2	6	544303	544308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501516
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10089	NC_018938	TTA	2	6	544405	544410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501517
10090	NC_018938	TGA	2	6	544460	544465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501517
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10092	NC_018938	AC	3	6	544523	544528	50 %	0 %	0 %	50 %	410501517
10093	NC_018938	CAT	2	6	544537	544542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501517
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10095	NC_018938	T	7	7	544613	544619	0 %	100 %	0 %	0 %	410501517
10096	NC_018938	ATG	2	6	544631	544636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501517
10097	NC_018938	CAA	2	6	544750	544755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501517
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10099	NC_018938	CAGC	2	8	544833	544840	25 %	0 %	25 %	50 %	410501517
10100	NC_018938	TGA	2	6	544877	544882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501517
10101	NC_018938	A	6	6	544889	544894	100 %	0 %	0 %	0 %	410501517
10102	NC_018938	GTTT	2	8	544928	544935	0 %	75 %	25 %	0 %	410501517
10103	NC_018938	T	6	6	544938	544943	0 %	100 %	0 %	0 %	410501517
10104	NC_018938	TGA	2	6	544973	544978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501517
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10106	NC_018938	GC	3	6	545020	545025	0 %	0 %	50 %	50 %	410501517
10107	NC_018938	A	9	9	545048	545056	100 %	0 %	0 %	0 %	410501517
10108	NC_018938	AAG	2	6	545120	545125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501517
10109	NC_018938	A	7	7	545132	545138	100 %	0 %	0 %	0 %	410501517
10110	NC_018938	T	7	7	545141	545147	0 %	100 %	0 %	0 %	410501517
10111	NC_018938	GAA	2	6	545185	545190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501517
10112	NC_018938	TTA	2	6	545256	545261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501518
10113	NC_018938	TGG	2	6	545338	545343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501518
10114	NC_018938	AGA	2	6	545387	545392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501518
10115	NC_018938	TAT	2	6	545421	545426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501518
10116	NC_018938	TAA	2	6	545453	545458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501518
10117	NC_018938	A	7	7	545505	545511	100 %	0 %	0 %	0 %	410501518
10118	NC_018938	GTATC	2	10	545591	545600	20 %	40 %	20 %	20 %	410501518
10119	NC_018938	A	6	6	545682	545687	100 %	0 %	0 %	0 %	410501518
10120	NC_018938	GGCAT	2	10	545695	545704	20 %	20 %	40 %	20 %	410501518
10121	NC_018938	GAAT	2	8	545738	545745	50 %	25 %	25 %	0 %	410501518
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10123	NC_018938	AGA	2	6	545864	545869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501518
10124	NC_018938	AAG	2	6	545905	545910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501518
10125	NC_018938	A	7	7	546006	546012	100 %	0 %	0 %	0 %	410501518
10126	NC_018938	A	6	6	546023	546028	100 %	0 %	0 %	0 %	410501518
10127	NC_018938	A	7	7	546031	546037	100 %	0 %	0 %	0 %	410501518
10128	NC_018938	CT	3	6	546147	546152	0 %	50 %	0 %	50 %	410501518
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10241	NC_018938	TGA	2	6	551350	551355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501525
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10492	NC_018938	CTT	2	6	561052	561057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501530
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