MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 30648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_018937	T	8	8	864504	864511	0 %	100 %	0 %	0 %	410024035
16003	NC_018937	CATG	2	8	864551	864558	25 %	25 %	25 %	25 %	410024035
16004	NC_018937	T	6	6	864586	864591	0 %	100 %	0 %	0 %	410024035
16005	NC_018937	AGG	2	6	864669	864674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410024035
16006	NC_018937	AAAT	2	8	864679	864686	75 %	25 %	0 %	0 %	410024035
16007	NC_018937	T	6	6	864703	864708	0 %	100 %	0 %	0 %	410024035
16008	NC_018937	T	6	6	864768	864773	0 %	100 %	0 %	0 %	410024035
16009	NC_018937	TTTTG	2	10	864824	864833	0 %	80 %	20 %	0 %	410024035
16010	NC_018937	A	6	6	864837	864842	100 %	0 %	0 %	0 %	410024035
16011	NC_018937	C	6	6	864857	864862	0 %	0 %	0 %	100 %	410024035
16012	NC_018937	A	6	6	864948	864953	100 %	0 %	0 %	0 %	410024035
16013	NC_018937	CT	3	6	864957	864962	0 %	50 %	0 %	50 %	410024035
16014	NC_018937	TGG	2	6	864974	864979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410024035
16015	NC_018937	C	7	7	865028	865034	0 %	0 %	0 %	100 %	410024035
16016	NC_018937	AAT	2	6	865035	865040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410024035
16017	NC_018937	T	7	7	865047	865053	0 %	100 %	0 %	0 %	410024035
16018	NC_018937	TGA	2	6	865060	865065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410024035
16019	NC_018937	TTC	2	6	865088	865093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410024035
16020	NC_018937	TTC	2	6	865133	865138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410024036
16021	NC_018937	TCT	2	6	865185	865190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410024036
16022	NC_018937	TCT	2	6	865227	865232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410024036
16023	NC_018937	TCA	2	6	865266	865271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410024036
16024	NC_018937	GA	3	6	865303	865308	50 %	0 %	50 %	0 %	410024036
16025	NC_018937	CAA	2	6	865346	865351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410024036
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16027	NC_018937	A	6	6	865377	865382	100 %	0 %	0 %	0 %	410024036
16028	NC_018937	CTT	2	6	865917	865922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410024037
16029	NC_018937	CAAA	2	8	866040	866047	75 %	0 %	0 %	25 %	410024037
16030	NC_018937	A	6	6	866045	866050	100 %	0 %	0 %	0 %	410024037
16031	NC_018937	CAT	2	6	866070	866075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410024037
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16033	NC_018937	TGG	2	6	866141	866146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410024037
16034	NC_018937	TC	3	6	866176	866181	0 %	50 %	0 %	50 %	410024037
16035	NC_018937	AAG	3	9	866217	866225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410024037
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16037	NC_018937	AAC	2	6	866270	866275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410024037
16038	NC_018937	GC	3	6	866277	866282	0 %	0 %	50 %	50 %	410024037
16039	NC_018937	AAG	2	6	866308	866313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410024037
16040	NC_018937	TCA	2	6	866327	866332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410024037
16041	NC_018937	ACA	2	6	866429	866434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410024037
16042	NC_018937	ATC	2	6	866480	866485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410024037
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16044	NC_018937	A	6	6	866621	866626	100 %	0 %	0 %	0 %	410024037
16045	NC_018937	ATG	2	6	866632	866637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410024037
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16047	NC_018937	TCT	3	9	866678	866686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410024037
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16050	NC_018937	TCA	2	6	866852	866857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410024037
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16052	NC_018937	TAT	2	6	867051	867056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410024038
16053	NC_018937	AGC	2	6	867073	867078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410024038
16054	NC_018937	CAC	2	6	867294	867299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410024038
16055	NC_018937	AC	3	6	867345	867350	50 %	0 %	0 %	50 %	410024038
16056	NC_018937	ATAGAA	2	12	867367	867378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410024038
16057	NC_018937	ATTTT	2	10	867398	867407	20 %	80 %	0 %	0 %	410024038
16058	NC_018937	T	6	6	867404	867409	0 %	100 %	0 %	0 %	410024038
16059	NC_018937	GCA	2	6	867413	867418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410024038
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16062	NC_018937	AGA	2	6	867639	867644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410024039
16063	NC_018937	CGG	2	6	867716	867721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410024039
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16065	NC_018937	GTA	2	6	867778	867783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410024039
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16072	NC_018937	GCGT	2	8	868099	868106	0 %	25 %	50 %	25 %	410024039
16073	NC_018937	AGCG	2	8	868188	868195	25 %	0 %	50 %	25 %	410024039
16074	NC_018937	T	6	6	868209	868214	0 %	100 %	0 %	0 %	410024039
16075	NC_018937	TACTT	2	10	868239	868248	20 %	60 %	0 %	20 %	410024039
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16082	NC_018937	GAA	2	6	868771	868776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410024040
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16088	NC_018937	A	6	6	869125	869130	100 %	0 %	0 %	0 %	410024040
16089	NC_018937	AAAC	2	8	869162	869169	75 %	0 %	0 %	25 %	410024040
16090	NC_018937	CCG	2	6	869182	869187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410024041
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16095	NC_018937	GCGA	2	8	869397	869404	25 %	0 %	50 %	25 %	410024041
16096	NC_018937	TCGC	2	8	869449	869456	0 %	25 %	25 %	50 %	410024041
16097	NC_018937	ATCA	2	8	869550	869557	50 %	25 %	0 %	25 %	410024041
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16104	NC_018937	ATTC	2	8	869874	869881	25 %	50 %	0 %	25 %	410024041
16105	NC_018937	GAAT	2	8	869919	869926	50 %	25 %	25 %	0 %	410024041
16106	NC_018937	TGT	2	6	869958	869963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410024042
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16108	NC_018937	AG	3	6	869981	869986	50 %	0 %	50 %	0 %	410024042
16109	NC_018937	CTT	2	6	869994	869999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410024042
16110	NC_018937	TGATT	2	10	870010	870019	20 %	60 %	20 %	0 %	410024042
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16112	NC_018937	TAG	2	6	870096	870101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410024042
16113	NC_018937	TAT	2	6	870161	870166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410024042
16114	NC_018937	ATCA	2	8	870215	870222	50 %	25 %	0 %	25 %	410024042
16115	NC_018937	GCTC	2	8	870234	870241	0 %	25 %	25 %	50 %	410024042
16116	NC_018937	AACC	2	8	870308	870315	50 %	0 %	0 %	50 %	410024042
16117	NC_018937	CAAC	2	8	870372	870379	50 %	0 %	0 %	50 %	410024042
16118	NC_018937	ATTT	2	8	870586	870593	25 %	75 %	0 %	0 %	410024043
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16494	NC_018937	ATG	2	6	890381	890386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410024065
16495	NC_018937	TAA	2	6	890419	890424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410024065
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16497	NC_018937	TAA	2	6	890476	890481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410024065
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