MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 9598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017944	CGGT	2	8	59262	59269	0 %	25 %	50 %	25 %	389848929
1003	NC_017944	CGT	2	6	59272	59277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848929
1004	NC_017944	CGA	2	6	59311	59316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848929
1005	NC_017944	CTG	2	6	59326	59331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848929
1006	NC_017944	CGGGG	2	10	59408	59417	0 %	0 %	80 %	20 %	389848929
1007	NC_017944	CGG	2	6	59463	59468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848929
1008	NC_017944	GCG	3	9	59532	59540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848929
1009	NC_017944	CGT	2	6	59558	59563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848929
1010	NC_017944	ACC	2	6	59569	59574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848929
1011	NC_017944	TCT	2	6	59782	59787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848930
1012	NC_017944	TAGT	2	8	59813	59820	25 %	50 %	25 %	0 %	389848930
1013	NC_017944	GT	3	6	59819	59824	0 %	50 %	50 %	0 %	389848930
1014	NC_017944	CGA	2	6	59831	59836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848930
1015	NC_017944	AC	3	6	59849	59854	50 %	0 %	0 %	50 %	389848930
1016	NC_017944	GCCC	2	8	59867	59874	0 %	0 %	25 %	75 %	389848930
1017	NC_017944	ATCC	2	8	59878	59885	25 %	25 %	0 %	50 %	389848930
1018	NC_017944	CGA	2	6	59915	59920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848930
1019	NC_017944	CCAA	2	8	59983	59990	50 %	0 %	0 %	50 %	389848930
1020	NC_017944	CCG	2	6	60004	60009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848930
1021	NC_017944	AGG	2	6	60010	60015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848930
1022	NC_017944	A	7	7	60019	60025	100 %	0 %	0 %	0 %	389848930
1023	NC_017944	AG	3	6	60045	60050	50 %	0 %	50 %	0 %	389848930
1024	NC_017944	CGA	2	6	60056	60061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848930
1025	NC_017944	GGT	2	6	60069	60074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848930
1026	NC_017944	GCCG	2	8	60147	60154	0 %	0 %	50 %	50 %	389848930
1027	NC_017944	CGT	2	6	60209	60214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848930
1028	NC_017944	CGA	2	6	60230	60235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848930
1029	NC_017944	GCC	2	6	60268	60273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848930
1030	NC_017944	ACG	2	6	60286	60291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848930
1031	NC_017944	CGA	2	6	60299	60304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848930
1032	NC_017944	ACC	2	6	60345	60350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848930
1033	NC_017944	GGC	2	6	60438	60443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848930
1034	NC_017944	ACG	2	6	60481	60486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848930
1035	NC_017944	C	6	6	60501	60506	0 %	0 %	0 %	100 %	389848930
1036	NC_017944	GCGG	2	8	60585	60592	0 %	0 %	75 %	25 %	389848930
1037	NC_017944	GCC	2	6	60600	60605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848930
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1039	NC_017944	AAC	2	6	60688	60693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848930
1040	NC_017944	GGC	2	6	60699	60704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848930
1041	NC_017944	AC	3	6	60779	60784	50 %	0 %	0 %	50 %	389848930
1042	NC_017944	TTG	2	6	60838	60843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848930
1043	NC_017944	GAAA	2	8	60857	60864	75 %	0 %	25 %	0 %	389848930
1044	NC_017944	GGAG	2	8	61020	61027	25 %	0 %	75 %	0 %	389848931
1045	NC_017944	CA	3	6	61073	61078	50 %	0 %	0 %	50 %	389848931
1046	NC_017944	CGA	2	6	61089	61094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848931
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1048	NC_017944	CGA	2	6	61117	61122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848931
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1050	NC_017944	ACC	2	6	61163	61168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848931
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1052	NC_017944	TCG	2	6	61196	61201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848931
1053	NC_017944	ACT	2	6	61255	61260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848931
1054	NC_017944	TGG	2	6	61271	61276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848931
1055	NC_017944	AG	3	6	61349	61354	50 %	0 %	50 %	0 %	389848931
1056	NC_017944	TCC	2	6	61385	61390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848931
1057	NC_017944	CGC	2	6	61428	61433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848931
1058	NC_017944	TC	3	6	61499	61504	0 %	50 %	0 %	50 %	389848931
1059	NC_017944	CCGT	2	8	61550	61557	0 %	25 %	25 %	50 %	389848931
1060	NC_017944	CTA	2	6	61668	61673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848931
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1062	NC_017944	TCG	2	6	61771	61776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848931
1063	NC_017944	CCG	2	6	61799	61804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848931
1064	NC_017944	GTC	2	6	61813	61818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848931
1065	NC_017944	ACGA	2	8	61876	61883	50 %	0 %	25 %	25 %	389848931
1066	NC_017944	ACG	2	6	61912	61917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848931
1067	NC_017944	TACG	2	8	61923	61930	25 %	25 %	25 %	25 %	389848931
1068	NC_017944	GCG	2	6	61939	61944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848931
1069	NC_017944	GAA	2	6	62065	62070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848931
1070	NC_017944	TCGCT	2	10	62124	62133	0 %	40 %	20 %	40 %	389848932
1071	NC_017944	TCG	2	6	62139	62144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848932
1072	NC_017944	GAC	2	6	62174	62179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848932
1073	NC_017944	GTTCG	2	10	62189	62198	0 %	40 %	40 %	20 %	389848932
1074	NC_017944	TCG	3	9	62196	62204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848932
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1082	NC_017944	GGTGAT	2	12	62763	62774	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	389848933
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1084	NC_017944	CCA	2	6	62940	62945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848933
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1088	NC_017944	CCCTC	2	10	63799	63808	0 %	20 %	0 %	80 %	389848934
1089	NC_017944	GCC	2	6	63834	63839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848934
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1091	NC_017944	CA	3	6	63947	63952	50 %	0 %	0 %	50 %	389848934
1092	NC_017944	CGA	2	6	63960	63965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848934
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1099	NC_017944	CTGTCG	2	12	64200	64211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848934
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1101	NC_017944	CTC	2	6	64265	64270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848934
1102	NC_017944	CTTA	2	8	64282	64289	25 %	50 %	0 %	25 %	389848934
1103	NC_017944	AG	3	6	64299	64304	50 %	0 %	50 %	0 %	389848934
1104	NC_017944	CTG	2	6	64350	64355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848934
1105	NC_017944	C	6	6	64396	64401	0 %	0 %	0 %	100 %	389848934
1106	NC_017944	TCGGGG	2	12	64414	64425	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	389848934
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1108	NC_017944	CTC	2	6	64452	64457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848934
1109	NC_017944	CGG	2	6	64484	64489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848934
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1111	NC_017944	CTG	2	6	64551	64556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848934
1112	NC_017944	TTC	2	6	64563	64568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848934
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1122	NC_017944	CGAC	2	8	65119	65126	25 %	0 %	25 %	50 %	389848934
1123	NC_017944	GTG	2	6	65170	65175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848934
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1125	NC_017944	ACG	2	6	65197	65202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848934
1126	NC_017944	CGG	2	6	65207	65212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848934
1127	NC_017944	CTCGA	2	10	65220	65229	20 %	20 %	20 %	40 %	389848934
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1498	NC_017944	TGG	2	6	86213	86218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848947
1499	NC_017944	CGTC	2	8	86219	86226	0 %	25 %	25 %	50 %	389848947
1500	NC_017944	GGT	2	6	86273	86278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848947

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