MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 9598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017944	ACAA	2	8	444606	444613	75 %	0 %	0 %	25 %	389849308
8502	NC_017944	GGC	2	6	444619	444624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849308
8503	NC_017944	TAC	2	6	444635	444640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849308
8504	NC_017944	GA	3	6	444663	444668	50 %	0 %	50 %	0 %	389849308
8505	NC_017944	AC	4	8	444771	444778	50 %	0 %	0 %	50 %	389849308
8506	NC_017944	AAT	2	6	444789	444794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389849308
8507	NC_017944	GCT	2	6	445229	445234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849309
8508	NC_017944	TC	3	6	445269	445274	0 %	50 %	0 %	50 %	389849309
8509	NC_017944	GAA	2	6	445317	445322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849309
8510	NC_017944	CGG	2	6	445363	445368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849309
8511	NC_017944	AGTCG	2	10	445407	445416	20 %	20 %	40 %	20 %	389849309
8512	NC_017944	GTC	2	6	445426	445431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849309
8513	NC_017944	TTC	2	6	445450	445455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849309
8514	NC_017944	CCGG	2	8	445529	445536	0 %	0 %	50 %	50 %	389849309
8515	NC_017944	GAT	2	6	445541	445546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849309
8516	NC_017944	AGTT	2	8	445657	445664	25 %	50 %	25 %	0 %	389849309
8517	NC_017944	ACC	2	6	445684	445689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849309
8518	NC_017944	AACC	2	8	445795	445802	50 %	0 %	0 %	50 %	389849309
8519	NC_017944	ATTC	2	8	445850	445857	25 %	50 %	0 %	25 %	389849309
8520	NC_017944	CG	3	6	445872	445877	0 %	0 %	50 %	50 %	389849309
8521	NC_017944	TCAA	2	8	446207	446214	50 %	25 %	0 %	25 %	389849310
8522	NC_017944	CCGG	2	8	446351	446358	0 %	0 %	50 %	50 %	389849310
8523	NC_017944	ACGG	2	8	446367	446374	25 %	0 %	50 %	25 %	389849310
8524	NC_017944	TCG	2	6	446384	446389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849310
8525	NC_017944	CGA	2	6	446412	446417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849310
8526	NC_017944	TCG	2	6	446459	446464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849310
8527	NC_017944	TGT	2	6	446549	446554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849310
8528	NC_017944	GTA	2	6	446587	446592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849310
8529	NC_017944	TCG	2	6	446615	446620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849310
8530	NC_017944	CGG	2	6	446636	446641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849310
8531	NC_017944	GA	3	6	446682	446687	50 %	0 %	50 %	0 %	389849310
8532	NC_017944	ACG	3	9	446843	446851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849310
8533	NC_017944	GAA	2	6	446863	446868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849310
8534	NC_017944	GAC	2	6	447022	447027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849310
8535	NC_017944	GTT	2	6	447045	447050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849310
8536	NC_017944	CGT	2	6	447542	447547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8537	NC_017944	GTC	2	6	447561	447566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8538	NC_017944	TCG	2	6	447583	447588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8539	NC_017944	TCG	2	6	447613	447618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8540	NC_017944	TCG	2	6	447640	447645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8541	NC_017944	CGT	3	9	447659	447667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8542	NC_017944	TCG	2	6	447679	447684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8543	NC_017944	GGTCGA	2	12	447692	447703	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389849311
8544	NC_017944	TCG	2	6	447706	447711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8545	NC_017944	CTTCGA	2	12	447713	447724	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	389849311
8546	NC_017944	TCG	2	6	447727	447732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8547	NC_017944	TCG	2	6	447775	447780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8548	NC_017944	CGT	2	6	447803	447808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8549	NC_017944	TCG	4	12	447826	447837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8550	NC_017944	TCG	2	6	447874	447879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8551	NC_017944	CGT	2	6	447902	447907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8552	NC_017944	TCA	2	6	447925	447930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849311
8553	NC_017944	TCG	2	6	447931	447936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8554	NC_017944	GTC	2	6	447975	447980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8555	NC_017944	CTT	2	6	447998	448003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849311
8556	NC_017944	TCA	2	6	448018	448023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849311
8557	NC_017944	GTC	2	6	448029	448034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8558	NC_017944	TCG	2	6	448063	448068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8559	NC_017944	TCG	2	6	448090	448095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8560	NC_017944	TCG	2	6	448108	448113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
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8562	NC_017944	GTC	2	6	448131	448136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8563	NC_017944	GTC	2	6	448146	448151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
8564	NC_017944	GAG	2	6	448158	448163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849311
8565	NC_017944	TCG	2	6	448180	448185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
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8572	NC_017944	GAG	2	6	448311	448316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849311
8573	NC_017944	TCG	2	6	448333	448338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849311
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8578	NC_017944	GGTC	2	8	448451	448458	0 %	25 %	50 %	25 %	389849311
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8587	NC_017944	GTC	2	6	449319	449324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849312
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8589	NC_017944	TCGACA	2	12	449335	449346	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389849312
8590	NC_017944	GTC	2	6	449373	449378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849312
8591	NC_017944	GTC	2	6	449421	449426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849312
8592	NC_017944	TC	3	6	449462	449467	0 %	50 %	0 %	50 %	389849312
8593	NC_017944	CAG	2	6	449486	449491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849312
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8601	NC_017944	TTG	2	6	449815	449820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849312
8602	NC_017944	TCG	2	6	449842	449847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849312
8603	NC_017944	TCGACG	2	12	449851	449862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389849312
8604	NC_017944	CGC	2	6	449867	449872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849312
8605	NC_017944	GCT	2	6	449873	449878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849312
8606	NC_017944	TCG	2	6	449887	449892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849312
8607	NC_017944	ACGTCG	2	12	449902	449913	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389849312
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8970	NC_017944	TGA	2	6	468272	468277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849325
8971	NC_017944	TCGAGT	2	12	468331	468342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389849325
8972	NC_017944	GAGTCG	2	12	468423	468434	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389849325
8973	NC_017944	CGA	2	6	468515	468520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849325
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8981	NC_017944	TCG	2	6	469945	469950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849326
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9000	NC_017944	GTG	2	6	470797	470802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849328

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