MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 9598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017944	GAA	2	6	243345	243350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849092
4502	NC_017944	CCTC	2	8	243353	243360	0 %	25 %	0 %	75 %	389849092
4503	NC_017944	TCC	2	6	243373	243378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389849092
4504	NC_017944	ACG	3	9	243415	243423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849092
4505	NC_017944	GTA	2	6	243468	243473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849092
4506	NC_017944	CGA	2	6	243503	243508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849092
4507	NC_017944	CGT	2	6	243512	243517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849092
4508	NC_017944	CGA	2	6	243539	243544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849092
4509	NC_017944	CGG	2	6	243584	243589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849092
4510	NC_017944	AGG	2	6	243605	243610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849092
4511	NC_017944	CA	3	6	243691	243696	50 %	0 %	0 %	50 %	389849092
4512	NC_017944	GGC	2	6	243708	243713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849092
4513	NC_017944	ACG	2	6	243730	243735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849092
4514	NC_017944	CTT	2	6	243789	243794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849092
4515	NC_017944	CGC	2	6	243867	243872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849092
4516	NC_017944	GCGAG	2	10	243887	243896	20 %	0 %	60 %	20 %	389849092
4517	NC_017944	TAGA	2	8	243909	243916	50 %	25 %	25 %	0 %	389849092
4518	NC_017944	TCA	2	6	243926	243931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849092
4519	NC_017944	TCG	2	6	243976	243981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849092
4520	NC_017944	TCG	3	9	243985	243993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849092
4521	NC_017944	GCG	2	6	244009	244014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849092
4522	NC_017944	CGAG	2	8	244102	244109	25 %	0 %	50 %	25 %	389849092
4523	NC_017944	GAC	2	6	244122	244127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849092
4524	NC_017944	TATC	2	8	244253	244260	25 %	50 %	0 %	25 %	389849092
4525	NC_017944	ATA	2	6	244486	244491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389849093
4526	NC_017944	CGT	2	6	244638	244643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4527	NC_017944	TCA	2	6	244670	244675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849093
4528	NC_017944	CGT	2	6	244678	244683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4529	NC_017944	CGA	2	6	244752	244757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4530	NC_017944	CTG	2	6	244807	244812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4531	NC_017944	TGC	3	9	244888	244896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4532	NC_017944	TGCT	2	8	244932	244939	0 %	50 %	25 %	25 %	389849093
4533	NC_017944	GTA	2	6	244957	244962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849093
4534	NC_017944	CGA	2	6	244977	244982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4535	NC_017944	TGG	2	6	244983	244988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849093
4536	NC_017944	ATC	2	6	244994	244999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849093
4537	NC_017944	GAA	3	9	245017	245025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849093
4538	NC_017944	CAG	2	6	245047	245052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4539	NC_017944	GAA	2	6	245059	245064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849093
4540	NC_017944	ACG	2	6	245078	245083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4541	NC_017944	CGTCAG	2	12	245092	245103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4542	NC_017944	GACC	2	8	245111	245118	25 %	0 %	25 %	50 %	389849093
4543	NC_017944	GTC	2	6	245131	245136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4544	NC_017944	CGA	2	6	245157	245162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4545	NC_017944	CCG	3	9	245231	245239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849093
4546	NC_017944	CGG	2	6	245241	245246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849093
4547	NC_017944	AAC	2	6	245324	245329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849093
4548	NC_017944	ACG	2	6	245474	245479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4549	NC_017944	GGC	2	6	245500	245505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849093
4550	NC_017944	GAT	2	6	245511	245516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849093
4551	NC_017944	ACG	2	6	245522	245527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4552	NC_017944	GTGAC	2	10	245564	245573	20 %	20 %	40 %	20 %	389849093
4553	NC_017944	GTCA	2	8	245596	245603	25 %	25 %	25 %	25 %	389849093
4554	NC_017944	GAA	2	6	245620	245625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849093
4555	NC_017944	CAC	2	6	245638	245643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849093
4556	NC_017944	ACG	2	6	245652	245657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4557	NC_017944	CGAG	2	8	245658	245665	25 %	0 %	50 %	25 %	389849093
4558	NC_017944	GAA	2	6	245671	245676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849093
4559	NC_017944	GGA	2	6	245706	245711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849093
4560	NC_017944	GAA	2	6	245809	245814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849093
4561	NC_017944	GAC	2	6	245815	245820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4562	NC_017944	CAT	2	6	245824	245829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849093
4563	NC_017944	CGG	2	6	245871	245876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849093
4564	NC_017944	GCA	2	6	245924	245929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4565	NC_017944	AGT	2	6	245979	245984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849093
4566	NC_017944	GACG	2	8	245988	245995	25 %	0 %	50 %	25 %	389849093
4567	NC_017944	CCG	2	6	246044	246049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849093
4568	NC_017944	AGA	2	6	246123	246128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849093
4569	NC_017944	CGA	2	6	246186	246191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4570	NC_017944	CGA	2	6	246219	246224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849093
4571	NC_017944	GAG	2	6	246226	246231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849093
4572	NC_017944	CGG	2	6	246588	246593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849094
4573	NC_017944	CGA	2	6	246600	246605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4574	NC_017944	GCC	2	6	246625	246630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849094
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4576	NC_017944	CGACAC	2	12	246801	246812	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	389849094
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4578	NC_017944	CGCA	2	8	246839	246846	25 %	0 %	25 %	50 %	389849094
4579	NC_017944	TCG	2	6	246908	246913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4580	NC_017944	CGA	2	6	246960	246965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4581	NC_017944	CGTTCG	2	12	246980	246991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4582	NC_017944	CAC	2	6	247011	247016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849094
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4585	NC_017944	CGA	2	6	247038	247043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4586	NC_017944	CTG	3	9	247060	247068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4587	NC_017944	CAC	2	6	247180	247185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849094
4588	NC_017944	CGA	3	9	247200	247208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4589	NC_017944	CGA	2	6	247218	247223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4590	NC_017944	CGG	2	6	247299	247304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849094
4591	NC_017944	ACG	2	6	247354	247359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4592	NC_017944	CGC	2	6	247404	247409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849094
4593	NC_017944	CT	3	6	247537	247542	0 %	50 %	0 %	50 %	389849094
4594	NC_017944	GAT	2	6	247602	247607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849094
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4596	NC_017944	CATCGA	2	12	247683	247694	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389849094
4597	NC_017944	GAC	2	6	247734	247739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4598	NC_017944	GAG	2	6	247747	247752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849094
4599	NC_017944	CTA	2	6	247800	247805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849094
4600	NC_017944	ACT	2	6	247811	247816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849094
4601	NC_017944	AG	3	6	247851	247856	50 %	0 %	50 %	0 %	389849094
4602	NC_017944	CG	3	6	247868	247873	0 %	0 %	50 %	50 %	389849094
4603	NC_017944	CCG	2	6	247967	247972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849094
4604	NC_017944	CGA	2	6	248002	248007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4605	NC_017944	ACGA	2	8	248036	248043	50 %	0 %	25 %	25 %	389849094
4606	NC_017944	CCCG	2	8	248052	248059	0 %	0 %	25 %	75 %	389849094
4607	NC_017944	CG	3	6	248058	248063	0 %	0 %	50 %	50 %	389849094
4608	NC_017944	CGC	2	6	248079	248084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849094
4609	NC_017944	TCG	2	6	248090	248095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4610	NC_017944	CGG	2	6	248151	248156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849094
4611	NC_017944	CG	3	6	248191	248196	0 %	0 %	50 %	50 %	389849094
4612	NC_017944	CGA	2	6	248211	248216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4613	NC_017944	CGA	2	6	248256	248261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849094
4614	NC_017944	CGC	2	6	248266	248271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849094
4615	NC_017944	GAA	2	6	248368	248373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849094
4616	NC_017944	CGAC	2	8	248381	248388	25 %	0 %	25 %	50 %	389849094
4617	NC_017944	GGC	2	6	248394	248399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849094
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4619	NC_017944	CTGA	2	8	248429	248436	25 %	25 %	25 %	25 %	389849094
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4979	NC_017944	CGT	2	6	266390	266395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849112
4980	NC_017944	GA	3	6	266564	266569	50 %	0 %	50 %	0 %	389849113
4981	NC_017944	TGA	2	6	266594	266599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849113
4982	NC_017944	TGG	2	6	266638	266643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849113
4983	NC_017944	AAC	2	6	266703	266708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849113
4984	NC_017944	AGT	2	6	266712	266717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849113
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