MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 64141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017941	AGCC	2	8	174030	174037	25 %	0 %	25 %	50 %	389845673
4002	NC_017941	GTC	2	6	174042	174047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4003	NC_017941	GAT	2	6	174071	174076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845673
4004	NC_017941	CGA	2	6	174103	174108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4005	NC_017941	GTA	2	6	174125	174130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845673
4006	NC_017941	ACC	2	6	174131	174136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845673
4007	NC_017941	GTC	2	6	174140	174145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4008	NC_017941	TCG	2	6	174147	174152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4009	NC_017941	TCG	2	6	174171	174176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4010	NC_017941	CGC	2	6	174184	174189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845673
4011	NC_017941	GTCC	2	8	174214	174221	0 %	25 %	25 %	50 %	389845673
4012	NC_017941	TTC	2	6	174224	174229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845673
4013	NC_017941	CGG	2	6	174241	174246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845673
4014	NC_017941	GTC	2	6	174266	174271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4015	NC_017941	GCGCCT	2	12	174286	174297	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	389845673
4016	NC_017941	CGT	2	6	174310	174315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4017	NC_017941	GGC	2	6	174320	174325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845673
4018	NC_017941	GCG	2	6	174376	174381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845673
4019	NC_017941	TCCG	2	8	174392	174399	0 %	25 %	25 %	50 %	389845673
4020	NC_017941	CGA	2	6	174508	174513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4021	NC_017941	CGA	2	6	174523	174528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4022	NC_017941	CGA	2	6	174589	174594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4023	NC_017941	CTCGTA	2	12	174620	174631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	389845673
4024	NC_017941	CGC	2	6	174652	174657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845673
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4027	NC_017941	GAC	3	9	174740	174748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4028	NC_017941	CG	3	6	174750	174755	0 %	0 %	50 %	50 %	389845673
4029	NC_017941	CGG	2	6	174821	174826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845673
4030	NC_017941	CGA	2	6	174856	174861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845673
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4032	NC_017941	TGGC	2	8	174942	174949	0 %	25 %	50 %	25 %	389845673
4033	NC_017941	CGAA	2	8	174955	174962	50 %	0 %	25 %	25 %	389845673
4034	NC_017941	GAA	2	6	175064	175069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845673
4035	NC_017941	TGCGT	2	10	175166	175175	0 %	40 %	40 %	20 %	389845673
4036	NC_017941	CGG	2	6	175208	175213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845673
4037	NC_017941	GAT	2	6	175223	175228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845673
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4039	NC_017941	GAT	2	6	175286	175291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845673
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4041	NC_017941	TCG	2	6	175494	175499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845673
4042	NC_017941	TACG	2	8	175513	175520	25 %	25 %	25 %	25 %	389845673
4043	NC_017941	GAG	2	6	175654	175659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845674
4044	NC_017941	TC	3	6	175671	175676	0 %	50 %	0 %	50 %	389845674
4045	NC_017941	CGA	3	9	175683	175691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845674
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4047	NC_017941	CGA	2	6	175836	175841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845674
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4050	NC_017941	CGA	2	6	175932	175937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845674
4051	NC_017941	GAC	2	6	175948	175953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845674
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4054	NC_017941	GAG	2	6	176011	176016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845674
4055	NC_017941	GTC	2	6	176035	176040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845674
4056	NC_017941	TCA	2	6	176153	176158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845674
4057	NC_017941	CGC	2	6	176187	176192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845674
4058	NC_017941	TAC	2	6	176353	176358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845674
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4101	NC_017941	TCG	2	6	178369	178374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845677
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4242	NC_017941	CGA	2	6	184593	184598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845683
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4480	NC_017941	GAC	2	6	195209	195214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845696
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