MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 64141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017941	GCC	2	6	129671	129676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845621
3002	NC_017941	GCCGAC	2	12	129701	129712	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389845621
3003	NC_017941	CGG	2	6	129718	129723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845621
3004	NC_017941	CTC	2	6	129833	129838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845621
3005	NC_017941	CGA	2	6	130059	130064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845622
3006	NC_017941	GA	3	6	130067	130072	50 %	0 %	50 %	0 %	389845622
3007	NC_017941	GAAG	2	8	130155	130162	50 %	0 %	50 %	0 %	389845622
3008	NC_017941	GAA	2	6	130168	130173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845622
3009	NC_017941	GACG	2	8	130243	130250	25 %	0 %	50 %	25 %	389845622
3010	NC_017941	TCG	2	6	130259	130264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845622
3011	NC_017941	CGA	2	6	130275	130280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845622
3012	NC_017941	CGC	2	6	130327	130332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845622
3013	NC_017941	GCG	2	6	130370	130375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845622
3014	NC_017941	AGGT	2	8	130520	130527	25 %	25 %	50 %	0 %	389845622
3015	NC_017941	TC	3	6	130765	130770	0 %	50 %	0 %	50 %	389845623
3016	NC_017941	CGA	2	6	130809	130814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3017	NC_017941	GAC	2	6	130816	130821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3018	NC_017941	CT	3	6	130858	130863	0 %	50 %	0 %	50 %	389845623
3019	NC_017941	CT	3	6	130894	130899	0 %	50 %	0 %	50 %	389845623
3020	NC_017941	GAA	2	6	130924	130929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845623
3021	NC_017941	GCC	2	6	130932	130937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845623
3022	NC_017941	GGT	2	6	130939	130944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845623
3023	NC_017941	TCG	2	6	130988	130993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3024	NC_017941	GAC	2	6	131070	131075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3025	NC_017941	GTG	2	6	131094	131099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845623
3026	NC_017941	GAA	2	6	131106	131111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845623
3027	NC_017941	CGG	2	6	131123	131128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845623
3028	NC_017941	TG	3	6	131180	131185	0 %	50 %	50 %	0 %	389845623
3029	NC_017941	GC	3	6	131187	131192	0 %	0 %	50 %	50 %	389845623
3030	NC_017941	CGA	2	6	131223	131228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3031	NC_017941	GAC	2	6	131317	131322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3032	NC_017941	GTC	2	6	131353	131358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3033	NC_017941	CAG	2	6	131422	131427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3034	NC_017941	CGA	2	6	131430	131435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3035	NC_017941	CATCGG	2	12	131439	131450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3036	NC_017941	CGT	2	6	131454	131459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3037	NC_017941	GACGG	2	10	131473	131482	20 %	0 %	60 %	20 %	389845623
3038	NC_017941	CCG	2	6	131504	131509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845623
3039	NC_017941	GAG	2	6	131692	131697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845623
3040	NC_017941	ATG	2	6	131698	131703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845623
3041	NC_017941	CGG	3	9	131799	131807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845623
3042	NC_017941	GAC	2	6	131827	131832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845623
3043	NC_017941	TCA	2	6	131873	131878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845623
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3045	NC_017941	ATG	2	6	132004	132009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845623
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3050	NC_017941	TCG	2	6	132300	132305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845624
3051	NC_017941	CGT	2	6	132322	132327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845624
3052	NC_017941	CGG	2	6	132331	132336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845624
3053	NC_017941	GC	3	6	132340	132345	0 %	0 %	50 %	50 %	389845624
3054	NC_017941	CTCGTT	2	12	132371	132382	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	389845624
3055	NC_017941	TCGCA	2	10	132430	132439	20 %	20 %	20 %	40 %	389845624
3056	NC_017941	TCG	2	6	132459	132464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845624
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3058	NC_017941	CAC	2	6	132505	132510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845624
3059	NC_017941	GCC	2	6	132512	132517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845624
3060	NC_017941	CGC	2	6	132547	132552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845624
3061	NC_017941	TCC	2	6	132567	132572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845624
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3064	NC_017941	CGT	4	12	132661	132672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845624
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3103	NC_017941	AAGC	2	8	134308	134315	50 %	0 %	25 %	25 %	389845626
3104	NC_017941	CGA	2	6	134321	134326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845626
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3117	NC_017941	CG	3	6	135083	135088	0 %	0 %	50 %	50 %	389845628
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3119	NC_017941	GC	3	6	135157	135162	0 %	0 %	50 %	50 %	389845628
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3239	NC_017941	CAT	3	9	140135	140143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845633
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3242	NC_017941	ACC	2	6	140324	140329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845633
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3245	NC_017941	CTCGTC	2	12	140467	140478	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	389845634
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3356	NC_017941	CCG	2	6	145725	145730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845639
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3478	NC_017941	TGT	2	6	151108	151113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845645
3479	NC_017941	TCTACC	2	12	151117	151128	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	389845645
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3481	NC_017941	TC	3	6	151505	151510	0 %	50 %	0 %	50 %	389845646
3482	NC_017941	TG	3	6	151535	151540	0 %	50 %	50 %	0 %	389845646
3483	NC_017941	ACC	2	6	151559	151564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845646
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3491	NC_017941	CCG	2	6	151952	151957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845647
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3498	NC_017941	TCG	2	6	152151	152156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845647
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