MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 64141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017941	TCA	2	6	61767	61772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845550
1502	NC_017941	TG	5	10	61789	61798	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
1503	NC_017941	CT	3	6	61814	61819	0 %	50 %	0 %	50 %	389845551
1504	NC_017941	TGC	2	6	61878	61883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845551
1505	NC_017941	GTC	2	6	61890	61895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845551
1506	NC_017941	CTC	2	6	61941	61946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845551
1507	NC_017941	TTCG	2	8	61992	61999	0 %	50 %	25 %	25 %	389845551
1508	NC_017941	GAG	2	6	62067	62072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845551
1509	NC_017941	AAC	2	6	62104	62109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389845551
1510	NC_017941	CGA	2	6	62129	62134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845551
1511	NC_017941	CGTG	2	8	62192	62199	0 %	25 %	50 %	25 %	389845551
1512	NC_017941	CTT	2	6	62225	62230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845551
1513	NC_017941	CGT	2	6	62283	62288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845551
1514	NC_017941	CGT	2	6	62395	62400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845551
1515	NC_017941	CAG	2	6	62424	62429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845551
1516	NC_017941	CTT	2	6	62486	62491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845551
1517	NC_017941	GTC	2	6	62607	62612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845551
1518	NC_017941	ATTCG	2	10	62621	62630	20 %	40 %	20 %	20 %	389845551
1519	NC_017941	GCC	2	6	62631	62636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845551
1520	NC_017941	CGA	2	6	62657	62662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845551
1521	NC_017941	CGA	2	6	62711	62716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845551
1522	NC_017941	ACCG	2	8	62718	62725	25 %	0 %	25 %	50 %	389845551
1523	NC_017941	CGC	2	6	62729	62734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845551
1524	NC_017941	CCT	2	6	62774	62779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845551
1525	NC_017941	AGG	2	6	62792	62797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845551
1526	NC_017941	C	6	6	62861	62866	0 %	0 %	0 %	100 %	389845552
1527	NC_017941	TGC	2	6	62867	62872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845552
1528	NC_017941	AGC	2	6	62873	62878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845552
1529	NC_017941	ACG	2	6	62955	62960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845552
1530	NC_017941	TGA	3	9	62965	62973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845552
1531	NC_017941	GCC	2	6	63037	63042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845552
1532	NC_017941	GGCGAT	2	12	63092	63103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389845552
1533	NC_017941	ATG	2	6	63105	63110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845552
1534	NC_017941	CGA	2	6	63125	63130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845552
1535	NC_017941	ATG	2	6	63177	63182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845552
1536	NC_017941	GAA	2	6	63290	63295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845552
1537	NC_017941	GAT	2	6	63365	63370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845552
1538	NC_017941	AACATG	2	12	63375	63386	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389845552
1539	NC_017941	CGG	2	6	63418	63423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845552
1540	NC_017941	GTA	2	6	63443	63448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845552
1541	NC_017941	GAG	2	6	63464	63469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845552
1542	NC_017941	GCA	2	6	63483	63488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845552
1543	NC_017941	GAG	2	6	63500	63505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845552
1544	NC_017941	CGA	2	6	63538	63543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845552
1545	NC_017941	GTT	2	6	63570	63575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845552
1546	NC_017941	ATGG	2	8	63580	63587	25 %	25 %	50 %	0 %	389845552
1547	NC_017941	TCGAT	2	10	63679	63688	20 %	40 %	20 %	20 %	389845552
1548	NC_017941	ACG	3	9	63807	63815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845552
1549	NC_017941	GGC	2	6	63838	63843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845552
1550	NC_017941	GTC	2	6	63860	63865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845552
1551	NC_017941	TGA	2	6	63919	63924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845552
1552	NC_017941	GTC	2	6	64020	64025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845552
1553	NC_017941	GAG	2	6	64064	64069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845552
1554	NC_017941	CGC	2	6	64103	64108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845552
1555	NC_017941	GCACT	2	10	64135	64144	20 %	20 %	20 %	40 %	389845552
1556	NC_017941	CCA	2	6	64152	64157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845552
1557	NC_017941	GGA	2	6	64186	64191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845552
1558	NC_017941	GCGGG	2	10	64224	64233	0 %	0 %	80 %	20 %	389845552
1559	NC_017941	TGCGA	2	10	64241	64250	20 %	20 %	40 %	20 %	389845552
1560	NC_017941	TTGGTT	2	12	64268	64279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845552
1561	NC_017941	ACG	2	6	64326	64331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845553
1562	NC_017941	GGA	2	6	64348	64353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845553
1563	NC_017941	CGA	2	6	64474	64479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845553
1564	NC_017941	GGAC	2	8	64480	64487	25 %	0 %	50 %	25 %	389845553
1565	NC_017941	TGA	2	6	64492	64497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845553
1566	NC_017941	CTCG	2	8	64508	64515	0 %	25 %	25 %	50 %	389845553
1567	NC_017941	TGA	2	6	64516	64521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845553
1568	NC_017941	GA	3	6	64581	64586	50 %	0 %	50 %	0 %	389845553
1569	NC_017941	GAC	2	6	64671	64676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845553
1570	NC_017941	CGAG	2	8	64783	64790	25 %	0 %	50 %	25 %	389845553
1571	NC_017941	CGA	2	6	64823	64828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845553
1572	NC_017941	GC	3	6	64905	64910	0 %	0 %	50 %	50 %	389845553
1573	NC_017941	CGAA	2	8	64924	64931	50 %	0 %	25 %	25 %	389845553
1574	NC_017941	CGGA	2	8	64955	64962	25 %	0 %	50 %	25 %	389845553
1575	NC_017941	CGA	2	6	64990	64995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845553
1576	NC_017941	CTG	2	6	65141	65146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845553
1577	NC_017941	TGC	2	6	65172	65177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845553
1578	NC_017941	GAA	2	6	65261	65266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845553
1579	NC_017941	ACT	2	6	65289	65294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845553
1580	NC_017941	TAG	2	6	65303	65308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845553
1581	NC_017941	TTAC	2	8	65498	65505	25 %	50 %	0 %	25 %	389845554
1582	NC_017941	GCA	2	6	65541	65546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1583	NC_017941	CGG	2	6	65558	65563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845554
1584	NC_017941	GGT	2	6	65605	65610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845554
1585	NC_017941	TGA	2	6	65617	65622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845554
1586	NC_017941	TCC	2	6	65631	65636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845554
1587	NC_017941	TCG	2	6	65667	65672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1588	NC_017941	GCG	2	6	65676	65681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845554
1589	NC_017941	CCT	2	6	65686	65691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845554
1590	NC_017941	GTC	2	6	65694	65699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1591	NC_017941	TTC	2	6	65759	65764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845554
1592	NC_017941	GAT	2	6	65804	65809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845554
1593	NC_017941	GGA	2	6	65833	65838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845554
1594	NC_017941	GAC	2	6	65899	65904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1595	NC_017941	TTG	2	6	66039	66044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845554
1596	NC_017941	TTG	2	6	66048	66053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845554
1597	NC_017941	TTC	2	6	66122	66127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845554
1598	NC_017941	GTA	2	6	66299	66304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845554
1599	NC_017941	AGT	2	6	66328	66333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845554
1600	NC_017941	TCG	2	6	66387	66392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1601	NC_017941	TTC	2	6	66456	66461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845554
1602	NC_017941	GAT	2	6	66497	66502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845554
1603	NC_017941	CGT	2	6	66517	66522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1604	NC_017941	CGC	2	6	66532	66537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845554
1605	NC_017941	AGT	2	6	66541	66546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845554
1606	NC_017941	CGT	2	6	66547	66552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1607	NC_017941	ACCG	2	8	66611	66618	25 %	0 %	25 %	50 %	389845554
1608	NC_017941	CGT	2	6	66655	66660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1609	NC_017941	CGA	2	6	66676	66681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1610	NC_017941	AG	3	6	66746	66751	50 %	0 %	50 %	0 %	389845554
1611	NC_017941	TCG	2	6	66771	66776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1612	NC_017941	CTT	2	6	66817	66822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845554
1613	NC_017941	GTC	3	9	66837	66845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1614	NC_017941	GAC	2	6	66857	66862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845554
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1616	NC_017941	CGT	2	6	66961	66966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1617	NC_017941	AGT	2	6	67021	67026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845554
1618	NC_017941	GAG	2	6	67034	67039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845554
1619	NC_017941	GC	3	6	67049	67054	0 %	0 %	50 %	50 %	389845554
1620	NC_017941	TGG	2	6	67083	67088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845554
1621	NC_017941	GAC	2	6	67097	67102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845554
1622	NC_017941	CGTC	2	8	67117	67124	0 %	25 %	25 %	50 %	389845554
1623	NC_017941	GTTCC	2	10	67204	67213	0 %	40 %	20 %	40 %	389845554
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1875	NC_017941	CT	3	6	81774	81779	0 %	50 %	0 %	50 %	389845564
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1993	NC_017941	CGC	2	6	88343	88348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845573
1994	NC_017941	GCG	2	6	88495	88500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845573
1995	NC_017941	CGT	2	6	88523	88528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845573
1996	NC_017941	CTG	2	6	88598	88603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845573
1997	NC_017941	CGA	2	6	88777	88782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845574
1998	NC_017941	CGC	2	6	88805	88810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845574
1999	NC_017941	TCG	2	6	88828	88833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845574
2000	NC_017941	CGT	2	6	88846	88851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845574

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