MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 64141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017941	ATT	2	6	42279	42284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389845531
1003	NC_017941	GTA	2	6	42285	42290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845531
1004	NC_017941	AGT	2	6	42299	42304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845531
1005	NC_017941	CCT	2	6	42308	42313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845531
1006	NC_017941	TCG	3	9	42328	42336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845531
1007	NC_017941	CCG	2	6	42374	42379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845531
1008	NC_017941	GAG	2	6	42408	42413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845531
1009	NC_017941	CGA	2	6	42458	42463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845531
1010	NC_017941	GTG	2	6	42472	42477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845531
1011	NC_017941	ACC	2	6	42544	42549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845531
1012	NC_017941	CTT	2	6	42560	42565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845531
1013	NC_017941	CGA	2	6	42590	42595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845531
1014	NC_017941	CTG	2	6	42606	42611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845531
1015	NC_017941	TCG	2	6	42620	42625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845531
1016	NC_017941	TGA	2	6	42626	42631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845531
1017	NC_017941	GAG	2	6	42714	42719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845531
1018	NC_017941	CTC	2	6	42729	42734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845531
1019	NC_017941	CGC	2	6	42762	42767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845531
1020	NC_017941	TCG	2	6	42787	42792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845531
1021	NC_017941	GAA	2	6	42798	42803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845531
1022	NC_017941	CT	3	6	42812	42817	0 %	50 %	0 %	50 %	389845531
1023	NC_017941	GTC	2	6	42828	42833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845531
1024	NC_017941	ACGA	2	8	42856	42863	50 %	0 %	25 %	25 %	389845531
1025	NC_017941	TCG	2	6	43068	43073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845532
1026	NC_017941	CGC	2	6	43084	43089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845532
1027	NC_017941	GAT	2	6	43105	43110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845532
1028	NC_017941	TGGG	2	8	43167	43174	0 %	25 %	75 %	0 %	389845532
1029	NC_017941	CCG	2	6	43176	43181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845532
1030	NC_017941	CTCG	2	8	43258	43265	0 %	25 %	25 %	50 %	389845532
1031	NC_017941	GTG	2	6	43281	43286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845532
1032	NC_017941	CGC	2	6	43371	43376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845532
1033	NC_017941	ACG	2	6	43391	43396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845532
1034	NC_017941	CGT	2	6	43411	43416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845532
1035	NC_017941	GCG	2	6	43436	43441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845532
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1037	NC_017941	CGA	2	6	43513	43518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845533
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1039	NC_017941	GCAG	3	12	43617	43628	25 %	0 %	50 %	25 %	389845533
1040	NC_017941	GAC	2	6	43748	43753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845533
1041	NC_017941	GCC	2	6	43770	43775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845533
1042	NC_017941	CGT	2	6	43784	43789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845533
1043	NC_017941	TCG	2	6	43833	43838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845533
1044	NC_017941	CGG	2	6	43853	43858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845533
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1051	NC_017941	ATG	2	6	44100	44105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845533
1052	NC_017941	TCG	3	9	44295	44303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845533
1053	NC_017941	GGC	3	9	44315	44323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845533
1054	NC_017941	TCG	2	6	44361	44366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845533
1055	NC_017941	GT	3	6	44378	44383	0 %	50 %	50 %	0 %	389845533
1056	NC_017941	GTC	2	6	44436	44441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845534
1057	NC_017941	CCA	2	6	44462	44467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845534
1058	NC_017941	TCG	2	6	44491	44496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845534
1059	NC_017941	CA	3	6	44569	44574	50 %	0 %	0 %	50 %	389845534
1060	NC_017941	AAGC	2	8	44613	44620	50 %	0 %	25 %	25 %	389845534
1061	NC_017941	CG	3	6	44665	44670	0 %	0 %	50 %	50 %	389845534
1062	NC_017941	GCG	2	6	44780	44785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845534
1063	NC_017941	GTC	2	6	44866	44871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845534
1064	NC_017941	TCG	2	6	44899	44904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845534
1065	NC_017941	AAG	2	6	44905	44910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845534
1066	NC_017941	CG	3	6	44918	44923	0 %	0 %	50 %	50 %	389845534
1067	NC_017941	ACC	2	6	44924	44929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845534
1068	NC_017941	GAG	2	6	44968	44973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845534
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1070	NC_017941	TGA	2	6	45062	45067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845534
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1073	NC_017941	CGA	2	6	45131	45136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845534
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1082	NC_017941	CGTC	2	8	45509	45516	0 %	25 %	25 %	50 %	389845534
1083	NC_017941	TCTG	2	8	45538	45545	0 %	50 %	25 %	25 %	389845534
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1088	NC_017941	TCG	2	6	45642	45647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845535
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1094	NC_017941	AGT	2	6	45841	45846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845535
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1101	NC_017941	ACG	2	6	46047	46052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845535
1102	NC_017941	TCG	2	6	46107	46112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845535
1103	NC_017941	GGC	2	6	46151	46156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845535
1104	NC_017941	GCG	2	6	46173	46178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845535
1105	NC_017941	GCC	2	6	46187	46192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845535
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1108	NC_017941	CTT	2	6	46310	46315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845535
1109	NC_017941	GAGCGC	2	12	46334	46345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389845535
1110	NC_017941	GC	3	6	46368	46373	0 %	0 %	50 %	50 %	389845535
1111	NC_017941	TGG	2	6	46375	46380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845535
1112	NC_017941	CGC	2	6	46424	46429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845535
1113	NC_017941	ACG	2	6	46534	46539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845535
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1119	NC_017941	CCG	3	9	46784	46792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845536
1120	NC_017941	CGG	2	6	46845	46850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845536
1121	NC_017941	CCG	2	6	46853	46858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845536
1122	NC_017941	TTC	2	6	46886	46891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845536
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1124	NC_017941	TCC	2	6	46913	46918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845536
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1494	NC_017941	CGT	2	6	61510	61515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845550
1495	NC_017941	CGG	2	6	61529	61534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845550
1496	NC_017941	CCG	2	6	61544	61549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845550
1497	NC_017941	CCGA	2	8	61576	61583	25 %	0 %	25 %	50 %	389845550
1498	NC_017941	CGA	2	6	61611	61616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845550
1499	NC_017941	CTT	2	6	61633	61638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845550
1500	NC_017941	GTA	2	6	61702	61707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845550

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