MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 64141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017941	TCGT	2	8	583659	583666	0 %	50 %	25 %	25 %	389846089
13003	NC_017941	CGA	2	6	583878	583883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846090
13004	NC_017941	TCG	2	6	583901	583906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846090
13005	NC_017941	GCC	2	6	583907	583912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846090
13006	NC_017941	CCG	2	6	583914	583919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846090
13007	NC_017941	T	8	8	583978	583985	0 %	100 %	0 %	0 %	389846090
13008	NC_017941	TCG	2	6	583994	583999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846090
13009	NC_017941	CAT	2	6	584064	584069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389846090
13010	NC_017941	GTC	2	6	584092	584097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846090
13011	NC_017941	GA	3	6	584135	584140	50 %	0 %	50 %	0 %	389846090
13012	NC_017941	CCG	2	6	584148	584153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846090
13013	NC_017941	CGT	2	6	584173	584178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846090
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13015	NC_017941	TGA	2	6	584235	584240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389846090
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13017	NC_017941	ACGA	2	8	584266	584273	50 %	0 %	25 %	25 %	389846090
13018	NC_017941	CGA	2	6	584355	584360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846090
13019	NC_017941	CTCG	2	8	584416	584423	0 %	25 %	25 %	50 %	389846090
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13040	NC_017941	GCCA	2	8	585328	585335	25 %	0 %	25 %	50 %	389846091
13041	NC_017941	CGA	2	6	585339	585344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846091
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13050	NC_017941	TCG	2	6	585902	585907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846092
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13053	NC_017941	TCG	2	6	586040	586045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846092
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13055	NC_017941	TCG	2	6	586102	586107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846092
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13064	NC_017941	CTT	2	6	586452	586457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846092
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13103	NC_017941	GCT	2	6	588427	588432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846095
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13239	NC_017941	TCC	2	6	595190	595195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389846104
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13469	NC_017941	CGA	2	6	605134	605139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846114
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13471	NC_017941	TCC	2	6	605404	605409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389846115
13472	NC_017941	GGT	2	6	605444	605449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389846115
13473	NC_017941	CGA	2	6	605523	605528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846115
13474	NC_017941	ACG	2	6	605606	605611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846115
13475	NC_017941	TGC	2	6	605641	605646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846115
13476	NC_017941	ATT	2	6	605680	605685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389846115
13477	NC_017941	GAT	2	6	605692	605697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389846115
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13480	NC_017941	GCT	2	6	605849	605854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846115
13481	NC_017941	GAT	2	6	605879	605884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389846115
13482	NC_017941	TCG	2	6	605886	605891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846115
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13484	NC_017941	TCA	2	6	605959	605964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389846115
13485	NC_017941	GAT	2	6	605975	605980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389846115
13486	NC_017941	ACG	2	6	605995	606000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846115
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13490	NC_017941	TAG	2	6	606199	606204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389846115
13491	NC_017941	GCTC	2	8	606238	606245	0 %	25 %	25 %	50 %	389846115
13492	NC_017941	GA	3	6	606276	606281	50 %	0 %	50 %	0 %	389846115
13493	NC_017941	CGT	2	6	606369	606374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846116
13494	NC_017941	CGG	2	6	606432	606437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389846116
13495	NC_017941	CT	3	6	606461	606466	0 %	50 %	0 %	50 %	389846116
13496	NC_017941	CTG	2	6	606490	606495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846116
13497	NC_017941	CGC	2	6	606621	606626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846116
13498	NC_017941	CGA	2	6	606675	606680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846116
13499	NC_017941	CGC	2	6	606717	606722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846116
13500	NC_017941	CGG	2	6	606729	606734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389846116

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