MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 64141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017941	ATG	2	6	241356	241361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845744
5502	NC_017941	TGT	2	6	241366	241371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845744
5503	NC_017941	TGT	2	6	241396	241401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845744
5504	NC_017941	CGA	2	6	241426	241431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5505	NC_017941	GGC	2	6	241432	241437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845744
5506	NC_017941	TCG	2	6	241518	241523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5507	NC_017941	CAC	2	6	241534	241539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845744
5508	NC_017941	TCG	2	6	241557	241562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5509	NC_017941	CCT	2	6	241564	241569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845744
5510	NC_017941	TCG	2	6	241584	241589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5511	NC_017941	CGA	2	6	241606	241611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5512	NC_017941	TCG	2	6	241662	241667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5513	NC_017941	TCG	2	6	241716	241721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
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5517	NC_017941	CGT	2	6	241852	241857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5518	NC_017941	CTCG	2	8	241867	241874	0 %	25 %	25 %	50 %	389845744
5519	NC_017941	TCG	2	6	241905	241910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5520	NC_017941	CGG	2	6	241930	241935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845744
5521	NC_017941	CCT	2	6	241960	241965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845744
5522	NC_017941	TCG	2	6	241972	241977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
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5524	NC_017941	TCG	2	6	242067	242072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5525	NC_017941	ACGT	2	8	242079	242086	25 %	25 %	25 %	25 %	389845744
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5531	NC_017941	AAC	2	6	242259	242264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389845744
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5539	NC_017941	GTA	2	6	242638	242643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845744
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5551	NC_017941	ACG	2	6	243258	243263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845746
5552	NC_017941	CGA	2	6	243298	243303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845746
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5554	NC_017941	CGCGAC	2	12	243374	243385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389845746
5555	NC_017941	TCG	2	6	243422	243427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845746
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5559	NC_017941	TCC	2	6	243573	243578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845746
5560	NC_017941	GAG	2	6	243584	243589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845746
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5619	NC_017941	CA	4	8	245965	245972	50 %	0 %	0 %	50 %	389845749
5620	NC_017941	CGT	2	6	246092	246097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845749
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5979	NC_017941	CGA	2	6	261923	261928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845768
5980	NC_017941	GAC	2	6	261951	261956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845768
5981	NC_017941	TCG	2	6	261964	261969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845768
5982	NC_017941	CGC	2	6	261971	261976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845768
5983	NC_017941	CGT	2	6	261983	261988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845768
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