MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 64141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017941	CGC	2	6	218231	218236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845716
5002	NC_017941	GGT	2	6	218237	218242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845716
5003	NC_017941	CGA	2	6	218273	218278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845716
5004	NC_017941	CGC	2	6	218291	218296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845716
5005	NC_017941	CGAC	2	8	218345	218352	25 %	0 %	25 %	50 %	389845716
5006	NC_017941	CAC	2	6	218377	218382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845716
5007	NC_017941	CTC	2	6	218397	218402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845716
5008	NC_017941	GAC	2	6	218442	218447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845716
5009	NC_017941	GAC	2	6	218499	218504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845716
5010	NC_017941	GC	3	6	218547	218552	0 %	0 %	50 %	50 %	389845716
5011	NC_017941	CGC	3	9	218561	218569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845716
5012	NC_017941	GAC	2	6	218574	218579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845716
5013	NC_017941	GAC	2	6	218646	218651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845716
5014	NC_017941	GC	3	6	218768	218773	0 %	0 %	50 %	50 %	389845716
5015	NC_017941	GACG	2	8	218778	218785	25 %	0 %	50 %	25 %	389845716
5016	NC_017941	AGA	2	6	218786	218791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845716
5017	NC_017941	CGG	2	6	218823	218828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845716
5018	NC_017941	GAG	2	6	218865	218870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845716
5019	NC_017941	GAT	2	6	218874	218879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845716
5020	NC_017941	TTC	2	6	218904	218909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845716
5021	NC_017941	TGC	2	6	218921	218926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845716
5022	NC_017941	CGAACC	2	12	218959	218970	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	389845716
5023	NC_017941	CCGT	2	8	218998	219005	0 %	25 %	25 %	50 %	389845716
5024	NC_017941	GTC	2	6	219027	219032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845716
5025	NC_017941	TTC	2	6	219045	219050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845716
5026	NC_017941	CCG	2	6	219064	219069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845716
5027	NC_017941	GTC	2	6	219105	219110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845717
5028	NC_017941	CGT	2	6	219208	219213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845718
5029	NC_017941	GAC	2	6	219215	219220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845718
5030	NC_017941	CGC	2	6	219250	219255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845718
5031	NC_017941	TCG	2	6	219313	219318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845718
5032	NC_017941	GAC	3	9	219344	219352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845718
5033	NC_017941	CGT	2	6	219364	219369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845718
5034	NC_017941	CCG	2	6	219372	219377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845718
5035	NC_017941	GTC	2	6	219458	219463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845718
5036	NC_017941	CTG	2	6	219516	219521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845718
5037	NC_017941	CGCC	2	8	219551	219558	0 %	0 %	25 %	75 %	389845718
5038	NC_017941	CCGACG	2	12	219651	219662	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389845718
5039	NC_017941	CGG	2	6	219666	219671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845718
5040	NC_017941	TTC	2	6	219838	219843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845718
5041	NC_017941	GCT	2	6	219851	219856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845718
5042	NC_017941	GC	3	6	219860	219865	0 %	0 %	50 %	50 %	389845718
5043	NC_017941	AAC	2	6	219882	219887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389845718
5044	NC_017941	CGG	2	6	219909	219914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845718
5045	NC_017941	GCG	2	6	219985	219990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845718
5046	NC_017941	CGA	2	6	220005	220010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845718
5047	NC_017941	CCGA	2	8	220017	220024	25 %	0 %	25 %	50 %	389845718
5048	NC_017941	GCCGAC	2	12	220028	220039	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389845718
5049	NC_017941	CGT	2	6	220080	220085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845719
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5051	NC_017941	GTC	2	6	220150	220155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845719
5052	NC_017941	CCCGG	2	10	220195	220204	0 %	0 %	40 %	60 %	389845719
5053	NC_017941	ACG	2	6	220211	220216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845719
5054	NC_017941	CCGAC	2	10	220232	220241	20 %	0 %	20 %	60 %	389845719
5055	NC_017941	CGGA	2	8	220284	220291	25 %	0 %	50 %	25 %	389845719
5056	NC_017941	CG	3	6	220306	220311	0 %	0 %	50 %	50 %	389845719
5057	NC_017941	GCC	2	6	220322	220327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845719
5058	NC_017941	GAT	2	6	220330	220335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845719
5059	NC_017941	GTC	2	6	220369	220374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845719
5060	NC_017941	GC	3	6	220395	220400	0 %	0 %	50 %	50 %	389845719
5061	NC_017941	CGCT	2	8	220415	220422	0 %	25 %	25 %	50 %	389845719
5062	NC_017941	GTC	3	9	220438	220446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845719
5063	NC_017941	CTCG	2	8	220495	220502	0 %	25 %	25 %	50 %	389845719
5064	NC_017941	GCT	2	6	220522	220527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845719
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5069	NC_017941	ACGT	2	8	220831	220838	25 %	25 %	25 %	25 %	389845720
5070	NC_017941	CGG	2	6	220874	220879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845720
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5074	NC_017941	CG	3	6	221000	221005	0 %	0 %	50 %	50 %	389845720
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5077	NC_017941	TCGG	2	8	221062	221069	0 %	25 %	50 %	25 %	389845720
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5084	NC_017941	CGGG	2	8	221515	221522	0 %	0 %	75 %	25 %	389845720
5085	NC_017941	GTC	3	9	221529	221537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845720
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5088	NC_017941	TCA	2	6	221678	221683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845720
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5092	NC_017941	AGCGG	2	10	221990	221999	20 %	0 %	60 %	20 %	389845721
5093	NC_017941	GC	4	8	222040	222047	0 %	0 %	50 %	50 %	389845721
5094	NC_017941	C	6	6	222112	222117	0 %	0 %	0 %	100 %	389845721
5095	NC_017941	CG	3	6	222169	222174	0 %	0 %	50 %	50 %	389845721
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5103	NC_017941	GCATCG	2	12	222636	222647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389845722
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5105	NC_017941	CCGA	2	8	222716	222723	25 %	0 %	25 %	50 %	389845722
5106	NC_017941	CTC	2	6	222733	222738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845722
5107	NC_017941	CGA	2	6	222754	222759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845722
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5109	NC_017941	CGA	2	6	222823	222828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845722
5110	NC_017941	TCG	2	6	222855	222860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845722
5111	NC_017941	CCG	2	6	222982	222987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845722
5112	NC_017941	TCG	2	6	222996	223001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845722
5113	NC_017941	CGTCG	2	10	223022	223031	0 %	20 %	40 %	40 %	389845722
5114	NC_017941	CGTC	2	8	223104	223111	0 %	25 %	25 %	50 %	389845722
5115	NC_017941	GTCGC	2	10	223144	223153	0 %	20 %	40 %	40 %	389845722
5116	NC_017941	CGC	2	6	223159	223164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845722
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5118	NC_017941	GTG	2	6	223185	223190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845722
5119	NC_017941	GCC	2	6	223388	223393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845723
5120	NC_017941	GTC	2	6	223394	223399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845723
5121	NC_017941	GAT	2	6	223412	223417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845723
5122	NC_017941	CGG	2	6	223450	223455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845723
5123	NC_017941	GTT	2	6	223460	223465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845723
5124	NC_017941	TCG	2	6	223477	223482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845723
5125	NC_017941	TCG	2	6	223521	223526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845723
5126	NC_017941	GTC	2	6	223565	223570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845723
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5233	NC_017941	TTC	2	6	229167	229172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845730
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5239	NC_017941	GCG	2	6	229304	229309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845730
5240	NC_017941	GTC	2	6	229363	229368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845730
5241	NC_017941	GC	3	6	229377	229382	0 %	0 %	50 %	50 %	389845730
5242	NC_017941	CTC	2	6	229397	229402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845730
5243	NC_017941	TCC	2	6	229431	229436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845730
5244	NC_017941	TCA	2	6	229449	229454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845730
5245	NC_017941	CCG	2	6	229464	229469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845730
5246	NC_017941	GGT	2	6	229471	229476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845730
5247	NC_017941	CGA	2	6	229584	229589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845731
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5249	NC_017941	CGA	2	6	229620	229625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845731
5250	NC_017941	CGA	3	9	229629	229637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845731
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5252	NC_017941	GAG	2	6	229684	229689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845731
5253	NC_017941	ACCG	2	8	229747	229754	25 %	0 %	25 %	50 %	389845731
5254	NC_017941	CCG	2	6	229800	229805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845731
5255	NC_017941	CGT	2	6	229863	229868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845731
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5261	NC_017941	TCGT	2	8	230231	230238	0 %	50 %	25 %	25 %	389845732
5262	NC_017941	TCTCGC	2	12	230253	230264	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	389845732
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5264	NC_017941	GCCC	2	8	230338	230345	0 %	0 %	25 %	75 %	389845732
5265	NC_017941	CGAC	2	8	230373	230380	25 %	0 %	25 %	50 %	389845732
5266	NC_017941	GTC	2	6	230423	230428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845732
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5269	NC_017941	GTC	3	9	230552	230560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845732
5270	NC_017941	CTC	2	6	230567	230572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845732
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5272	NC_017941	CGC	2	6	230709	230714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845732
5273	NC_017941	GCC	2	6	230735	230740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845732
5274	NC_017941	CGG	2	6	230743	230748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845732
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5314	NC_017941	GAC	2	6	232530	232535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845734
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5319	NC_017941	GTC	2	6	232741	232746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845734
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5334	NC_017941	CG	3	6	233503	233508	0 %	0 %	50 %	50 %	389845735
5335	NC_017941	ACG	2	6	233515	233520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845735
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5341	NC_017941	GTC	2	6	234448	234453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845736
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5345	NC_017941	CTC	2	6	234568	234573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845736
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5348	NC_017941	TCG	2	6	234713	234718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845736
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5357	NC_017941	TCG	2	6	235203	235208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845736
5358	NC_017941	TGA	2	6	235257	235262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845736
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5479	NC_017941	CGT	2	6	240554	240559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845743
5480	NC_017941	TCG	2	6	240583	240588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845743
5481	NC_017941	TCG	2	6	240610	240615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845743
5482	NC_017941	TCG	2	6	240625	240630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845743
5483	NC_017941	ACCA	2	8	240645	240652	50 %	0 %	0 %	50 %	389845743
5484	NC_017941	CGG	2	6	240686	240691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845743
5485	NC_017941	TCG	2	6	240694	240699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845743
5486	NC_017941	CCG	2	6	240706	240711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845743
5487	NC_017941	GGTC	2	8	240722	240729	0 %	25 %	50 %	25 %	389845743
5488	NC_017941	CTC	2	6	240753	240758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845743
5489	NC_017941	TCG	2	6	240790	240795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845743
5490	NC_017941	GC	3	6	240832	240837	0 %	0 %	50 %	50 %	389845743
5491	NC_017941	ACT	2	6	240865	240870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845743
5492	NC_017941	CGC	2	6	240885	240890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845743
5493	NC_017941	GAT	2	6	240902	240907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845743
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5497	NC_017941	CTT	2	6	241285	241290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845744
5498	NC_017941	CGT	2	6	241291	241296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5499	NC_017941	CGT	2	6	241306	241311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845744
5500	NC_017941	GC	3	6	241346	241351	0 %	0 %	50 %	50 %	389845744

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