MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori XZ274 chromosome

Total Repeats: 25976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017926	TGAG	2	8	121	128	25 %	25 %	50 %	0 %	387907369
2	NC_017926	CATT	2	8	208	215	25 %	50 %	0 %	25 %	387907369
3	NC_017926	GAT	3	9	216	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387907369
4	NC_017926	T	6	6	353	358	0 %	100 %	0 %	0 %	387907369
5	NC_017926	AAGC	2	8	389	396	50 %	0 %	25 %	25 %	387907369
6	NC_017926	T	7	7	412	418	0 %	100 %	0 %	0 %	387907369
7	NC_017926	T	7	7	440	446	0 %	100 %	0 %	0 %	387907369
8	NC_017926	TTC	2	6	450	455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907369
9	NC_017926	ACA	2	6	476	481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387907369
10	NC_017926	ACC	2	6	487	492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387907369
11	NC_017926	C	6	6	494	499	0 %	0 %	0 %	100 %	387907369
12	NC_017926	AAAT	2	8	1007	1014	75 %	25 %	0 %	0 %	387907370
13	NC_017926	AAC	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387907370
14	NC_017926	CCGCAG	2	12	1138	1149	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387907370
15	NC_017926	CCA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387907370
16	NC_017926	GCT	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907370
17	NC_017926	CA	3	6	1321	1326	50 %	0 %	0 %	50 %	387907370
18	NC_017926	T	6	6	1338	1343	0 %	100 %	0 %	0 %	387907370
19	NC_017926	CTA	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907370
20	NC_017926	TC	3	6	1380	1385	0 %	50 %	0 %	50 %	387907370
21	NC_017926	T	6	6	1442	1447	0 %	100 %	0 %	0 %	387907370
22	NC_017926	ATA	2	6	1455	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907370
23	NC_017926	GGC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387907370
24	NC_017926	GCTT	2	8	1550	1557	0 %	50 %	25 %	25 %	387907370
25	NC_017926	CT	3	6	1656	1661	0 %	50 %	0 %	50 %	387907370
26	NC_017926	TAAAA	2	10	1696	1705	80 %	20 %	0 %	0 %	387907370
27	NC_017926	GTT	2	6	1718	1723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907370
28	NC_017926	TAG	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387907370
29	NC_017926	CTT	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907370
30	NC_017926	TTC	2	6	1857	1862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907371
31	NC_017926	A	7	7	1872	1878	100 %	0 %	0 %	0 %	387907371
32	NC_017926	ATTATA	2	12	1890	1901	50 %	50 %	0 %	0 %	387907371
33	NC_017926	CCTG	2	8	1905	1912	0 %	25 %	25 %	50 %	387907371
34	NC_017926	CCAA	2	8	1929	1936	50 %	0 %	0 %	50 %	387907371
35	NC_017926	TGAA	2	8	1969	1976	50 %	25 %	25 %	0 %	387907371
36	NC_017926	TTG	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907371
37	NC_017926	T	6	6	2071	2076	0 %	100 %	0 %	0 %	387907371
38	NC_017926	TTC	2	6	2079	2084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907371
39	NC_017926	CAT	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907371
40	NC_017926	AATG	2	8	2159	2166	50 %	25 %	25 %	0 %	387907371
41	NC_017926	AAT	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907371
42	NC_017926	TAG	2	6	2252	2257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387907371
43	NC_017926	G	6	6	2284	2289	0 %	0 %	100 %	0 %	387907371
44	NC_017926	GATTA	2	10	2343	2352	40 %	40 %	20 %	0 %	387907371
45	NC_017926	ATTC	2	8	2444	2451	25 %	50 %	0 %	25 %	387907371
46	NC_017926	A	8	8	2637	2644	100 %	0 %	0 %	0 %	387907372
47	NC_017926	TCTT	2	8	2653	2660	0 %	75 %	0 %	25 %	387907372
48	NC_017926	T	7	7	2733	2739	0 %	100 %	0 %	0 %	387907372
49	NC_017926	T	7	7	2775	2781	0 %	100 %	0 %	0 %	387907372
50	NC_017926	AGC	2	6	2873	2878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387907372
51	NC_017926	GC	3	6	2886	2891	0 %	0 %	50 %	50 %	387907372
52	NC_017926	A	6	6	2924	2929	100 %	0 %	0 %	0 %	387907372
53	NC_017926	ATTAA	2	10	3020	3029	60 %	40 %	0 %	0 %	387907372
54	NC_017926	AG	3	6	3043	3048	50 %	0 %	50 %	0 %	387907372
55	NC_017926	GTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387907372
56	NC_017926	AAG	2	6	3096	3101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907372
57	NC_017926	AGA	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907372
58	NC_017926	CAAA	2	8	3196	3203	75 %	0 %	0 %	25 %	387907372
59	NC_017926	GTG	2	6	3221	3226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387907372
60	NC_017926	GCC	2	6	3228	3233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387907372
61	NC_017926	GAAA	2	8	3343	3350	75 %	0 %	25 %	0 %	387907373
62	NC_017926	GAAA	2	8	3418	3425	75 %	0 %	25 %	0 %	387907373
63	NC_017926	AGTG	2	8	3439	3446	25 %	25 %	50 %	0 %	387907373
64	NC_017926	TG	3	6	3525	3530	0 %	50 %	50 %	0 %	387907373
65	NC_017926	GTT	2	6	3674	3679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907373
66	NC_017926	GCGATA	2	12	3822	3833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907373
67	NC_017926	CAAG	2	8	3919	3926	50 %	0 %	25 %	25 %	387907373
68	NC_017926	A	6	6	3962	3967	100 %	0 %	0 %	0 %	387907373
69	NC_017926	ATT	2	6	4002	4007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907373
70	NC_017926	AC	3	6	4059	4064	50 %	0 %	0 %	50 %	387907373
71	NC_017926	GGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387907373
72	NC_017926	TGC	2	6	5463	5468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907374
73	NC_017926	TCGC	2	8	5478	5485	0 %	25 %	25 %	50 %	387907374
74	NC_017926	CATT	2	8	5551	5558	25 %	50 %	0 %	25 %	387907374
75	NC_017926	ATT	2	6	5573	5578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907374
76	NC_017926	A	6	6	5783	5788	100 %	0 %	0 %	0 %	387907374
77	NC_017926	A	6	6	5825	5830	100 %	0 %	0 %	0 %	387907374
78	NC_017926	GTT	2	6	5873	5878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907374
79	NC_017926	TAA	2	6	5942	5947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907374
80	NC_017926	GTTGA	2	10	5966	5975	20 %	40 %	40 %	0 %	387907374
81	NC_017926	TTA	2	6	6000	6005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907374
82	NC_017926	GTT	2	6	6089	6094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907374
83	NC_017926	GTGC	2	8	6129	6136	0 %	25 %	50 %	25 %	387907374
84	NC_017926	TCT	2	6	6213	6218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907374
85	NC_017926	C	6	6	6235	6240	0 %	0 %	0 %	100 %	387907374
86	NC_017926	TTTGA	2	10	6341	6350	20 %	60 %	20 %	0 %	387907374
87	NC_017926	GCTTGC	2	12	6372	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907374
88	NC_017926	AGA	2	6	6419	6424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907374
89	NC_017926	ATT	2	6	6458	6463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907374
90	NC_017926	TCA	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907374
91	NC_017926	TGCT	2	8	6670	6677	0 %	50 %	25 %	25 %	387907374
92	NC_017926	T	6	6	6718	6723	0 %	100 %	0 %	0 %	387907374
93	NC_017926	TGT	2	6	6733	6738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907374
94	NC_017926	TTA	2	6	6777	6782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907374
95	NC_017926	CAC	3	9	6796	6804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387907374
96	NC_017926	TAC	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907374
97	NC_017926	GTTT	2	8	6819	6826	0 %	75 %	25 %	0 %	387907374
98	NC_017926	GTATGT	2	12	6833	6844	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907374
99	NC_017926	TTG	2	6	6905	6910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907374
100	NC_017926	TGGT	2	8	7019	7026	0 %	50 %	50 %	0 %	387907374
101	NC_017926	CCGTTC	2	12	7062	7073	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387907374
102	NC_017926	CA	3	6	7075	7080	50 %	0 %	0 %	50 %	387907374
103	NC_017926	ATCG	2	8	7202	7209	25 %	25 %	25 %	25 %	387907374
104	NC_017926	GCT	2	6	7229	7234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907374
105	NC_017926	CGTT	2	8	7237	7244	0 %	50 %	25 %	25 %	387907374
106	NC_017926	GTT	2	6	7259	7264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907374
107	NC_017926	CAT	2	6	7746	7751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907375
108	NC_017926	GCC	2	6	7752	7757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387907375
109	NC_017926	TCT	2	6	7813	7818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907375
110	NC_017926	TGAAAC	2	12	7860	7871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907375
111	NC_017926	AAT	2	6	7911	7916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907375
112	NC_017926	CTT	2	6	7919	7924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907375
113	NC_017926	TTCA	2	8	7989	7996	25 %	50 %	0 %	25 %	387907375
114	NC_017926	CAT	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907375
115	NC_017926	GC	3	6	8056	8061	0 %	0 %	50 %	50 %	387907375
116	NC_017926	ATG	2	6	8062	8067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387907375
117	NC_017926	TCA	2	6	8086	8091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907375
118	NC_017926	AAATGC	2	12	8098	8109	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907375
119	NC_017926	CCG	2	6	8140	8145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387907375
120	NC_017926	CTT	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907375
121	NC_017926	T	6	6	8208	8213	0 %	100 %	0 %	0 %	387907375
122	NC_017926	AG	3	6	8268	8273	50 %	0 %	50 %	0 %	387907375
123	NC_017926	TCTT	2	8	8283	8290	0 %	75 %	0 %	25 %	387907375
124	NC_017926	TTG	2	6	8315	8320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907375
125	NC_017926	CAT	2	6	8363	8368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907375
126	NC_017926	GTG	2	6	8395	8400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387907375
127	NC_017926	TTC	2	6	8475	8480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907375
128	NC_017926	TAA	2	6	8483	8488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907375
129	NC_017926	CCG	2	6	8494	8499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387907375
130	NC_017926	TTTCT	2	10	8525	8534	0 %	80 %	0 %	20 %	387907375
131	NC_017926	CAC	2	6	8595	8600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387907375
132	NC_017926	GAT	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387907375
133	NC_017926	T	6	6	8669	8674	0 %	100 %	0 %	0 %	387907375
134	NC_017926	TAG	2	6	8676	8681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387907375
135	NC_017926	T	7	7	8708	8714	0 %	100 %	0 %	0 %	387907375
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137	NC_017926	TCT	2	6	8959	8964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907375
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