MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi112 chromosome

Total Repeats: 30748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017741	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	386753520
2	NC_017741	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	386753520
3	NC_017741	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753520
4	NC_017741	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	386753520
5	NC_017741	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753520
6	NC_017741	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	386753520
7	NC_017741	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	386753520
8	NC_017741	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753520
9	NC_017741	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753520
10	NC_017741	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753520
11	NC_017741	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	386753520
12	NC_017741	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753521
13	NC_017741	GCATT	2	10	584	593	20 %	40 %	20 %	20 %	386753521
14	NC_017741	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	386753521
15	NC_017741	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753521
16	NC_017741	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753521
17	NC_017741	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	386753521
18	NC_017741	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753521
19	NC_017741	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386753521
20	NC_017741	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753521
21	NC_017741	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386753522
22	NC_017741	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753522
23	NC_017741	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753522
24	NC_017741	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753522
25	NC_017741	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753522
26	NC_017741	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753522
27	NC_017741	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	386753522
28	NC_017741	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	386753522
29	NC_017741	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753522
30	NC_017741	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	386753522
31	NC_017741	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	386753522
32	NC_017741	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386753522
33	NC_017741	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	386753522
34	NC_017741	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	386753522
35	NC_017741	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386753522
36	NC_017741	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753522
37	NC_017741	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753522
38	NC_017741	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753522
39	NC_017741	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753523
40	NC_017741	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	386753523
41	NC_017741	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	386753523
42	NC_017741	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	386753523
43	NC_017741	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753523
44	NC_017741	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	386753523
45	NC_017741	TCA	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753523
46	NC_017741	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	386753523
47	NC_017741	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753523
48	NC_017741	CTG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753523
49	NC_017741	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	386753523
50	NC_017741	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753523
51	NC_017741	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753523
52	NC_017741	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753523
53	NC_017741	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	386753523
54	NC_017741	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753523
55	NC_017741	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753523
56	NC_017741	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386753523
57	NC_017741	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	386753523
58	NC_017741	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386753523
59	NC_017741	A	8	8	2541	2548	100 %	0 %	0 %	0 %	386753524
60	NC_017741	TCTT	2	8	2557	2564	0 %	75 %	0 %	25 %	386753524
61	NC_017741	T	7	7	2637	2643	0 %	100 %	0 %	0 %	386753524
62	NC_017741	T	7	7	2679	2685	0 %	100 %	0 %	0 %	386753524
63	NC_017741	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386753524
64	NC_017741	GC	3	6	2790	2795	0 %	0 %	50 %	50 %	386753524
65	NC_017741	A	6	6	2828	2833	100 %	0 %	0 %	0 %	386753524
66	NC_017741	AG	3	6	2947	2952	50 %	0 %	50 %	0 %	386753524
67	NC_017741	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753524
68	NC_017741	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753524
69	NC_017741	CAAA	2	8	3100	3107	75 %	0 %	0 %	25 %	386753524
70	NC_017741	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753524
71	NC_017741	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753524
72	NC_017741	GAAA	2	8	3247	3254	75 %	0 %	25 %	0 %	386753525
73	NC_017741	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	386753525
74	NC_017741	AGTG	2	8	3343	3350	25 %	25 %	50 %	0 %	386753525
75	NC_017741	TG	3	6	3429	3434	0 %	50 %	50 %	0 %	386753525
76	NC_017741	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753525
77	NC_017741	ATC	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753525
78	NC_017741	GCGATA	2	12	3726	3737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386753525
79	NC_017741	CAAG	2	8	3823	3830	50 %	0 %	25 %	25 %	386753525
80	NC_017741	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	386753525
81	NC_017741	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753525
82	NC_017741	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386753525
83	NC_017741	CAT	2	6	7345	7350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
84	NC_017741	TCT	2	6	7412	7417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
85	NC_017741	GAAACC	2	12	7460	7471	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386753526
86	NC_017741	AAT	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753526
87	NC_017741	CTT	2	6	7518	7523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
88	NC_017741	TTCA	2	8	7588	7595	25 %	50 %	0 %	25 %	386753526
89	NC_017741	CAT	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
90	NC_017741	GC	3	6	7655	7660	0 %	0 %	50 %	50 %	386753526
91	NC_017741	ATG	2	6	7661	7666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753526
92	NC_017741	TCA	2	6	7685	7690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
93	NC_017741	CG	3	6	7720	7725	0 %	0 %	50 %	50 %	386753526
94	NC_017741	CCG	2	6	7739	7744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753526
95	NC_017741	CTT	2	6	7758	7763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
96	NC_017741	TCA	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
97	NC_017741	T	6	6	7807	7812	0 %	100 %	0 %	0 %	386753526
98	NC_017741	AG	3	6	7867	7872	50 %	0 %	50 %	0 %	386753526
99	NC_017741	TCTT	2	8	7882	7889	0 %	75 %	0 %	25 %	386753526
100	NC_017741	CAT	2	6	7962	7967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
101	NC_017741	TTC	2	6	8074	8079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
102	NC_017741	TAA	2	6	8082	8087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753526
103	NC_017741	CCG	2	6	8093	8098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753526
104	NC_017741	TTTCT	2	10	8124	8133	0 %	80 %	0 %	20 %	386753526
105	NC_017741	CAC	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753526
106	NC_017741	GAT	2	6	8236	8241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753526
107	NC_017741	T	6	6	8268	8273	0 %	100 %	0 %	0 %	386753526
108	NC_017741	TAG	2	6	8275	8280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753526
109	NC_017741	T	7	7	8307	8313	0 %	100 %	0 %	0 %	386753526
110	NC_017741	GA	3	6	8384	8389	50 %	0 %	50 %	0 %	386753526
111	NC_017741	CTT	2	6	8448	8453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
112	NC_017741	TCT	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
113	NC_017741	T	6	6	8575	8580	0 %	100 %	0 %	0 %	386753526
114	NC_017741	T	6	6	8587	8592	0 %	100 %	0 %	0 %	386753526
115	NC_017741	TAA	2	6	8601	8606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753526
116	NC_017741	AAGC	2	8	8697	8704	50 %	0 %	25 %	25 %	386753526
117	NC_017741	GCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386753526
118	NC_017741	CTT	2	6	8757	8762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
119	NC_017741	T	6	6	8859	8864	0 %	100 %	0 %	0 %	386753526
120	NC_017741	T	6	6	9001	9006	0 %	100 %	0 %	0 %	386753527
121	NC_017741	T	6	6	9011	9016	0 %	100 %	0 %	0 %	386753527
122	NC_017741	ACA	2	6	9077	9082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753527
123	NC_017741	TCT	2	6	9111	9116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753527
124	NC_017741	CTT	2	6	9193	9198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753527
125	NC_017741	GAT	3	9	9281	9289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753527
126	NC_017741	TCT	2	6	9309	9314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753527
127	NC_017741	CTA	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753527
128	NC_017741	GATA	2	8	9674	9681	50 %	25 %	25 %	0 %	386753528
129	NC_017741	TTG	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753528
130	NC_017741	GAA	2	6	9756	9761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
131	NC_017741	TCAA	2	8	9781	9788	50 %	25 %	0 %	25 %	386753528
132	NC_017741	TTA	2	6	9935	9940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753528
133	NC_017741	AGA	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
134	NC_017741	ACC	2	6	9958	9963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753528
135	NC_017741	AAG	2	6	9991	9996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
136	NC_017741	T	8	8	10014	10021	0 %	100 %	0 %	0 %	386753528
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138	NC_017741	A	6	6	10033	10038	100 %	0 %	0 %	0 %	386753528
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