MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 70623

< Previous12...130131132133134135136137138139140141142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70501	NC_017668	T	7	7	4142894	4142900	0 %	100 %	0 %	0 %	386716447
70502	NC_017668	GGT	2	6	4143016	4143021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386716447
70503	NC_017668	CTTC	2	8	4143047	4143054	0 %	50 %	0 %	50 %	386716447
70504	NC_017668	ACA	2	6	4143160	4143165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386716447
70505	NC_017668	TCA	2	6	4143170	4143175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716447
70506	NC_017668	TTTC	2	8	4143354	4143361	0 %	75 %	0 %	25 %	386716448
70507	NC_017668	CTC	2	6	4143406	4143411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386716448
70508	NC_017668	GCTCCG	2	12	4143747	4143758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386716448
70509	NC_017668	ATA	2	6	4143791	4143796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386716448
70510	NC_017668	CCTT	2	8	4143840	4143847	0 %	50 %	0 %	50 %	386716448
70511	NC_017668	T	6	6	4143871	4143876	0 %	100 %	0 %	0 %	386716448
70512	NC_017668	CATTC	2	10	4143877	4143886	20 %	40 %	0 %	40 %	386716448
70513	NC_017668	TGC	3	9	4143918	4143926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716448
70514	NC_017668	CCG	2	6	4144065	4144070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716449
70515	NC_017668	CTT	2	6	4144119	4144124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716449
70516	NC_017668	TCT	2	6	4144188	4144193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716449
70517	NC_017668	TCT	2	6	4144203	4144208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716449
70518	NC_017668	T	6	6	4144234	4144239	0 %	100 %	0 %	0 %	386716449
70519	NC_017668	ATTTC	2	10	4144335	4144344	20 %	60 %	0 %	20 %	386716449
70520	NC_017668	CTTC	2	8	4144377	4144384	0 %	50 %	0 %	50 %	386716449
70521	NC_017668	CTT	2	6	4144401	4144406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716449
70522	NC_017668	CTT	2	6	4144422	4144427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716449
70523	NC_017668	TTC	2	6	4144465	4144470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716449
70524	NC_017668	GCT	2	6	4144479	4144484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716449
70525	NC_017668	TTC	2	6	4144510	4144515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716449
70526	NC_017668	TCA	2	6	4144646	4144651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716449
70527	NC_017668	CTT	2	6	4144755	4144760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716449
70528	NC_017668	CGG	2	6	4144788	4144793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716449
70529	NC_017668	TCA	2	6	4144917	4144922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716449
70530	NC_017668	TA	3	6	4144933	4144938	50 %	50 %	0 %	0 %	386716449
70531	NC_017668	CAGG	2	8	4144941	4144948	25 %	0 %	50 %	25 %	386716449
70532	NC_017668	TACA	2	8	4144966	4144973	50 %	25 %	0 %	25 %	386716449
70533	NC_017668	CTT	2	6	4144974	4144979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716449
70534	NC_017668	ATC	2	6	4145122	4145127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716449
70535	NC_017668	AAT	2	6	4145128	4145133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386716449
70536	NC_017668	CAGC	2	8	4145161	4145168	25 %	0 %	25 %	50 %	386716449
70537	NC_017668	AAT	2	6	4145253	4145258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386716449
70538	NC_017668	TCC	2	6	4145324	4145329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386716449
70539	NC_017668	GCT	2	6	4145331	4145336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716449
70540	NC_017668	TTA	2	6	4145363	4145368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386716449
70541	NC_017668	CGT	2	6	4145425	4145430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716449
70542	NC_017668	GCT	2	6	4145456	4145461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716449
70543	NC_017668	AGC	2	6	4145504	4145509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716449
70544	NC_017668	AT	3	6	4145576	4145581	50 %	50 %	0 %	0 %	386716449
70545	NC_017668	GCC	2	6	4145686	4145691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716449
70546	NC_017668	GCT	2	6	4145813	4145818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716449
70547	NC_017668	CAT	2	6	4145880	4145885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716449
70548	NC_017668	GATC	2	8	4145949	4145956	25 %	25 %	25 %	25 %	386716450
70549	NC_017668	CAC	2	6	4146025	4146030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386716450
70550	NC_017668	TACG	2	8	4146121	4146128	25 %	25 %	25 %	25 %	386716450
70551	NC_017668	AAG	2	6	4146158	4146163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716450
70552	NC_017668	TAACAA	2	12	4146294	4146305	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386716450
70553	NC_017668	GCT	2	6	4146336	4146341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716450
70554	NC_017668	TCG	2	6	4146344	4146349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716450
70555	NC_017668	AAG	2	6	4146379	4146384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716450
70556	NC_017668	ATCAC	2	10	4146518	4146527	40 %	20 %	0 %	40 %	386716450
70557	NC_017668	GGCC	2	8	4146608	4146615	0 %	0 %	50 %	50 %	386716450
70558	NC_017668	AGA	2	6	4146671	4146676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716450
70559	NC_017668	CTT	2	6	4146696	4146701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716450
70560	NC_017668	CAT	2	6	4146715	4146720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716450
70561	NC_017668	TTC	2	6	4146733	4146738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716450
70562	NC_017668	TCA	2	6	4146743	4146748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716450
70563	NC_017668	GCT	2	6	4146810	4146815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716450
70564	NC_017668	GTC	2	6	4146831	4146836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716450
70565	NC_017668	AATC	2	8	4146918	4146925	50 %	25 %	0 %	25 %	386716450
70566	NC_017668	CG	3	6	4146940	4146945	0 %	0 %	50 %	50 %	386716450
70567	NC_017668	TCC	2	6	4146976	4146981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386716450
70568	NC_017668	CCG	2	6	4147025	4147030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716450
70569	NC_017668	CTT	2	6	4147098	4147103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716450
70570	NC_017668	CTG	2	6	4147104	4147109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716450
70571	NC_017668	TC	3	6	4147110	4147115	0 %	50 %	0 %	50 %	386716450
70572	NC_017668	TAT	2	6	4147129	4147134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386716450
70573	NC_017668	CTCG	2	8	4147735	4147742	0 %	25 %	25 %	50 %	386716451
70574	NC_017668	CAC	2	6	4147802	4147807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386716451
70575	NC_017668	AGA	2	6	4147839	4147844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716451
70576	NC_017668	TCC	2	6	4147854	4147859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386716451
70577	NC_017668	CTT	2	6	4148347	4148352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716452
70578	NC_017668	AAG	2	6	4148354	4148359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716452
70579	NC_017668	T	6	6	4148412	4148417	0 %	100 %	0 %	0 %	386716452
70580	NC_017668	GAAT	2	8	4148434	4148441	50 %	25 %	25 %	0 %	386716452
70581	NC_017668	GAGTT	2	10	4148613	4148622	20 %	40 %	40 %	0 %	386716452
70582	NC_017668	ATG	2	6	4148764	4148769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386716452
70583	NC_017668	AAT	2	6	4148770	4148775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386716452
70584	NC_017668	AACCAA	2	12	4148831	4148842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386716452
70585	NC_017668	T	6	6	4148850	4148855	0 %	100 %	0 %	0 %	386716452
70586	NC_017668	TCA	2	6	4148860	4148865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716452
70587	NC_017668	TCA	2	6	4148929	4148934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716452
70588	NC_017668	TCAC	2	8	4148963	4148970	25 %	25 %	0 %	50 %	386716452
70589	NC_017668	CTC	2	6	4148974	4148979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386716453
70590	NC_017668	TCA	2	6	4148992	4148997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716453
70591	NC_017668	GAA	2	6	4149022	4149027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716453
70592	NC_017668	GAA	3	9	4149074	4149082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716453
70593	NC_017668	ATG	2	6	4149108	4149113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386716453
70594	NC_017668	ATC	3	9	4149117	4149125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716453
70595	NC_017668	GCT	3	9	4149144	4149152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716453
70596	NC_017668	CAT	2	6	4149161	4149166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716453
70597	NC_017668	CTG	2	6	4149173	4149178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716453
70598	NC_017668	GCT	2	6	4149192	4149197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716453
70599	NC_017668	TCCA	2	8	4149234	4149241	25 %	25 %	0 %	50 %	386716453
70600	NC_017668	ATA	2	6	4149276	4149281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386716453
70601	NC_017668	CAAT	2	8	4149295	4149302	50 %	25 %	0 %	25 %	386716453
70602	NC_017668	AAT	2	6	4149317	4149322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386716453
70603	NC_017668	CTG	2	6	4149380	4149385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716453
70604	NC_017668	AGA	2	6	4149413	4149418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716453
70605	NC_017668	ATA	2	6	4149516	4149521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386716453
70606	NC_017668	AT	3	6	4149606	4149611	50 %	50 %	0 %	0 %	386716453
70607	NC_017668	GCAA	2	8	4149696	4149703	50 %	0 %	25 %	25 %	386716453
70608	NC_017668	TAT	2	6	4149707	4149712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386716453
70609	NC_017668	T	6	6	4149834	4149839	0 %	100 %	0 %	0 %	386716454
70610	NC_017668	T	7	7	4149881	4149887	0 %	100 %	0 %	0 %	386716454
70611	NC_017668	ATT	2	6	4149906	4149911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386716454
70612	NC_017668	GGTT	2	8	4149912	4149919	0 %	50 %	50 %	0 %	386716454
70613	NC_017668	AAT	2	6	4149927	4149932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386716454
70614	NC_017668	GGAT	2	8	4149949	4149956	25 %	25 %	50 %	0 %	386716454
70615	NC_017668	AG	3	6	4150041	4150046	50 %	0 %	50 %	0 %	386716454
70616	NC_017668	T	6	6	4150071	4150076	0 %	100 %	0 %	0 %	386716454
70617	NC_017668	TTC	2	6	4150143	4150148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716454
70618	NC_017668	TTCT	2	8	4150167	4150174	0 %	75 %	0 %	25 %	386716454
70619	NC_017668	TTC	2	6	4150344	4150349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716455
70620	NC_017668	ACG	4	12	4150354	4150365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716455
70621	NC_017668	GCT	2	6	4150390	4150395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716455
70622	NC_017668	T	6	6	4150420	4150425	0 %	100 %	0 %	0 %	386716455
70623	NC_017668	ATT	2	6	4150435	4150440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386716455

< Previous12...130131132133134135136137138139140141142Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.