MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017459	TGT	2	6	244720	244725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802572
4002	NC_017459	TGGA	2	8	244748	244755	25 %	25 %	50 %	0 %	385802572
4003	NC_017459	ATA	2	6	244759	244764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802572
4004	NC_017459	ATTG	2	8	244772	244779	25 %	50 %	25 %	0 %	385802572
4005	NC_017459	ATC	2	6	244792	244797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802572
4006	NC_017459	GT	3	6	244805	244810	0 %	50 %	50 %	0 %	385802572
4007	NC_017459	CAA	2	6	244847	244852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802572
4008	NC_017459	CGT	2	6	244868	244873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802572
4009	NC_017459	CAA	2	6	244895	244900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802572
4010	NC_017459	CTC	2	6	244929	244934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802572
4011	NC_017459	TGA	2	6	245169	245174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802573
4012	NC_017459	ATC	2	6	245181	245186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802573
4013	NC_017459	CAA	2	6	245234	245239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802573
4014	NC_017459	CAG	2	6	245240	245245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802573
4015	NC_017459	AAG	2	6	245394	245399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802573
4016	NC_017459	TTGCT	2	10	245400	245409	0 %	60 %	20 %	20 %	385802573
4017	NC_017459	TGT	2	6	245458	245463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802573
4018	NC_017459	CAG	2	6	245588	245593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802573
4019	NC_017459	ACGA	2	8	245633	245640	50 %	0 %	25 %	25 %	385802573
4020	NC_017459	GCG	2	6	245674	245679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802573
4021	NC_017459	ATG	2	6	245726	245731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802573
4022	NC_017459	AAT	2	6	245773	245778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802573
4023	NC_017459	AAT	2	6	245782	245787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802573
4024	NC_017459	ACG	2	6	245914	245919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802573
4025	NC_017459	TTC	3	9	245925	245933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802573
4026	NC_017459	CA	3	6	245956	245961	50 %	0 %	0 %	50 %	385802573
4027	NC_017459	TGG	2	6	246096	246101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802573
4028	NC_017459	CTGG	2	8	246124	246131	0 %	25 %	50 %	25 %	385802573
4029	NC_017459	AAC	2	6	246201	246206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802573
4030	NC_017459	ATC	2	6	246243	246248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802573
4031	NC_017459	TGA	2	6	246270	246275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802573
4032	NC_017459	CAA	2	6	247374	247379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802574
4033	NC_017459	GTG	2	6	247385	247390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802574
4034	NC_017459	AATT	2	8	247413	247420	50 %	50 %	0 %	0 %	385802574
4035	NC_017459	GC	3	6	247554	247559	0 %	0 %	50 %	50 %	385802574
4036	NC_017459	GTC	2	6	247571	247576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802574
4037	NC_017459	GTA	2	6	247631	247636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802574
4038	NC_017459	GTA	2	6	247688	247693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802574
4039	NC_017459	CAG	2	6	247767	247772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802574
4040	NC_017459	CAA	2	6	247788	247793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802574
4041	NC_017459	GA	3	6	247827	247832	50 %	0 %	50 %	0 %	385802574
4042	NC_017459	GAAC	2	8	247943	247950	50 %	0 %	25 %	25 %	385802574
4043	NC_017459	ATA	2	6	247978	247983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802574
4044	NC_017459	CAAT	2	8	247985	247992	50 %	25 %	0 %	25 %	385802574
4045	NC_017459	GTC	2	6	247993	247998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802574
4046	NC_017459	AGC	2	6	248080	248085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802574
4047	NC_017459	CTG	2	6	248136	248141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802574
4048	NC_017459	TTG	2	6	248175	248180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802574
4049	NC_017459	ATCGC	2	10	248189	248198	20 %	20 %	20 %	40 %	385802574
4050	NC_017459	ATTG	2	8	248260	248267	25 %	50 %	25 %	0 %	385802574
4051	NC_017459	GAT	2	6	248277	248282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802574
4052	NC_017459	GTA	2	6	248317	248322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802574
4053	NC_017459	CAT	2	6	248334	248339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802574
4054	NC_017459	TGC	2	6	248344	248349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802574
4055	NC_017459	CGG	2	6	248399	248404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802574
4056	NC_017459	CTC	2	6	248422	248427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802574
4057	NC_017459	TCG	2	6	248463	248468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802574
4058	NC_017459	AG	3	6	248871	248876	50 %	0 %	50 %	0 %	385802575
4059	NC_017459	TGGG	2	8	248912	248919	0 %	25 %	75 %	0 %	385802575
4060	NC_017459	CAATC	2	10	248942	248951	40 %	20 %	0 %	40 %	385802575
4061	NC_017459	TCA	2	6	248977	248982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802575
4062	NC_017459	AGTA	2	8	249021	249028	50 %	25 %	25 %	0 %	385802575
4063	NC_017459	CAT	2	6	249050	249055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802575
4064	NC_017459	ATCGAT	2	12	249113	249124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802575
4065	NC_017459	GATT	2	8	249195	249202	25 %	50 %	25 %	0 %	385802575
4066	NC_017459	CTG	2	6	249203	249208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802575
4067	NC_017459	GTT	2	6	249232	249237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802575
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4069	NC_017459	TCG	2	6	249378	249383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802575
4070	NC_017459	ACC	2	6	249402	249407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802575
4071	NC_017459	GGC	2	6	249414	249419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802575
4072	NC_017459	CTG	2	6	249480	249485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802575
4073	NC_017459	CTG	2	6	249497	249502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802575
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4085	NC_017459	GTCT	2	8	249953	249960	0 %	50 %	25 %	25 %	385802576
4086	NC_017459	TGA	2	6	249991	249996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802576
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4089	NC_017459	CAT	2	6	250066	250071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802576
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4091	NC_017459	GAC	2	6	250372	250377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802577
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4093	NC_017459	CTG	2	6	250467	250472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802577
4094	NC_017459	TTG	2	6	250614	250619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802577
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4101	NC_017459	ACC	2	6	250912	250917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802577
4102	NC_017459	ATC	2	6	250936	250941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802577
4103	NC_017459	GCT	2	6	250946	250951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802577
4104	NC_017459	GA	3	6	250967	250972	50 %	0 %	50 %	0 %	385802577
4105	NC_017459	TTG	2	6	251002	251007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802577
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4107	NC_017459	TGC	2	6	251221	251226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802577
4108	NC_017459	TCA	2	6	251246	251251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802577
4109	NC_017459	GAT	2	6	251317	251322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802577
4110	NC_017459	GTTT	2	8	251400	251407	0 %	75 %	25 %	0 %	385802577
4111	NC_017459	TC	3	6	251440	251445	0 %	50 %	0 %	50 %	385802577
4112	NC_017459	TTGTT	2	10	251456	251465	0 %	80 %	20 %	0 %	385802577
4113	NC_017459	CAT	2	6	251556	251561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802577
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4116	NC_017459	GA	3	6	251695	251700	50 %	0 %	50 %	0 %	385802577
4117	NC_017459	AT	3	6	251713	251718	50 %	50 %	0 %	0 %	385802577
4118	NC_017459	TCG	2	6	251791	251796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802577
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4120	NC_017459	T	6	6	251822	251827	0 %	100 %	0 %	0 %	385802577
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4126	NC_017459	CTGA	2	8	252265	252272	25 %	25 %	25 %	25 %	385802577
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4243	NC_017459	TGT	2	6	257293	257298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802582
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4344	NC_017459	CGGA	2	8	262523	262530	25 %	0 %	50 %	25 %	385802585
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4359	NC_017459	CG	3	6	263094	263099	0 %	0 %	50 %	50 %	385802585
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4482	NC_017459	TTA	2	6	269087	269092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802588
4483	NC_017459	G	6	6	269118	269123	0 %	0 %	100 %	0 %	385802588
4484	NC_017459	CGA	2	6	269124	269129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802588
4485	NC_017459	CGA	2	6	269131	269136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802588
4486	NC_017459	ATT	2	6	269162	269167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802588
4487	NC_017459	ATT	3	9	269183	269191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802588
4488	NC_017459	AATAT	2	10	269209	269218	60 %	40 %	0 %	0 %	385802588
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4490	NC_017459	GTT	2	6	269411	269416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802589
4491	NC_017459	TTG	3	9	269430	269438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802589
4492	NC_017459	GCT	2	6	269462	269467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802589
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4495	NC_017459	TCT	2	6	269994	269999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802589
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