MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017459	AAT	2	6	186882	186887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802518
3002	NC_017459	CA	5	10	186917	186926	50 %	0 %	0 %	50 %	385802519
3003	NC_017459	ATC	2	6	186944	186949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802519
3004	NC_017459	AGA	2	6	186969	186974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802519
3005	NC_017459	CAT	2	6	187019	187024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802519
3006	NC_017459	TGC	2	6	187059	187064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802519
3007	NC_017459	AGTG	2	8	187162	187169	25 %	25 %	50 %	0 %	385802519
3008	NC_017459	CAGA	2	8	187249	187256	50 %	0 %	25 %	25 %	385802519
3009	NC_017459	GGC	2	6	187263	187268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802519
3010	NC_017459	GCA	2	6	187366	187371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802519
3011	NC_017459	AGG	2	6	187379	187384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802519
3012	NC_017459	TGA	2	6	187386	187391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802519
3013	NC_017459	TGA	2	6	187419	187424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802519
3014	NC_017459	TGA	2	6	187437	187442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802519
3015	NC_017459	TCA	2	6	187444	187449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802519
3016	NC_017459	GGATT	2	10	187565	187574	20 %	40 %	40 %	0 %	385802519
3017	NC_017459	CAA	2	6	187589	187594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802519
3018	NC_017459	A	7	7	187771	187777	100 %	0 %	0 %	0 %	385802519
3019	NC_017459	ACGCGA	2	12	187799	187810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802519
3020	NC_017459	TGG	2	6	187830	187835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802519
3021	NC_017459	GAT	2	6	187897	187902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802519
3022	NC_017459	CTGG	2	8	187904	187911	0 %	25 %	50 %	25 %	385802519
3023	NC_017459	GTG	2	6	187925	187930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802519
3024	NC_017459	AGCA	2	8	187993	188000	50 %	0 %	25 %	25 %	385802520
3025	NC_017459	GAA	2	6	188100	188105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802520
3026	NC_017459	GCT	2	6	188187	188192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802520
3027	NC_017459	CCGA	2	8	188196	188203	25 %	0 %	25 %	50 %	385802520
3028	NC_017459	GAAAG	2	10	188243	188252	60 %	0 %	40 %	0 %	385802520
3029	NC_017459	TCA	2	6	188266	188271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802520
3030	NC_017459	TGA	2	6	188276	188281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802520
3031	NC_017459	CGC	2	6	188293	188298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802520
3032	NC_017459	TGA	2	6	188306	188311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802520
3033	NC_017459	CAA	2	6	188431	188436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802520
3034	NC_017459	CTC	2	6	188519	188524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802520
3035	NC_017459	TGC	2	6	188531	188536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802520
3036	NC_017459	GCA	2	6	188562	188567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802520
3037	NC_017459	TGA	2	6	188579	188584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802520
3038	NC_017459	ATG	2	6	188761	188766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802520
3039	NC_017459	ATC	2	6	188796	188801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802520
3040	NC_017459	ATG	2	6	188815	188820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802520
3041	NC_017459	CGTT	2	8	188824	188831	0 %	50 %	25 %	25 %	385802520
3042	NC_017459	GCAGA	2	10	188832	188841	40 %	0 %	40 %	20 %	385802520
3043	NC_017459	GCA	2	6	189042	189047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802520
3044	NC_017459	TC	3	6	189082	189087	0 %	50 %	0 %	50 %	385802520
3045	NC_017459	GGC	2	6	189114	189119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802520
3046	NC_017459	GGT	2	6	189120	189125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802520
3047	NC_017459	GAT	3	9	189174	189182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802520
3048	NC_017459	CTA	2	6	189236	189241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802520
3049	NC_017459	AGA	2	6	189269	189274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802520
3050	NC_017459	GTT	2	6	189372	189377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802520
3051	NC_017459	TCA	2	6	189432	189437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802520
3052	NC_017459	AAAT	2	8	189607	189614	75 %	25 %	0 %	0 %	385802520
3053	NC_017459	GGT	2	6	189633	189638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802520
3054	NC_017459	TC	3	6	189640	189645	0 %	50 %	0 %	50 %	385802520
3055	NC_017459	ACGA	2	8	189646	189653	50 %	0 %	25 %	25 %	385802520
3056	NC_017459	CACTGA	2	12	189811	189822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385802520
3057	NC_017459	GTATCA	2	12	189839	189850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802520
3058	NC_017459	CAT	2	6	189881	189886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802520
3059	NC_017459	TTG	2	6	189907	189912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802520
3060	NC_017459	CAG	3	9	189928	189936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802520
3061	NC_017459	GTG	2	6	189982	189987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802520
3062	NC_017459	GTT	2	6	189993	189998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802520
3063	NC_017459	TTCAC	2	10	190048	190057	20 %	40 %	0 %	40 %	385802520
3064	NC_017459	CAG	2	6	190105	190110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802520
3065	NC_017459	CAG	2	6	190150	190155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802520
3066	NC_017459	AGG	2	6	190192	190197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802520
3067	NC_017459	GAC	2	6	190248	190253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802520
3068	NC_017459	CGA	2	6	190273	190278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
3069	NC_017459	CA	3	6	190303	190308	50 %	0 %	0 %	50 %	385802521
3070	NC_017459	GAT	3	9	190346	190354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
3071	NC_017459	AGC	2	6	190358	190363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
3072	NC_017459	AGG	2	6	190365	190370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802521
3073	NC_017459	GCA	3	9	190388	190396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
3074	NC_017459	TGA	2	6	190453	190458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
3075	NC_017459	ATG	2	6	190464	190469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
3076	NC_017459	AAT	2	6	190483	190488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802521
3077	NC_017459	TGA	2	6	190504	190509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
3078	NC_017459	AGA	2	6	190510	190515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802521
3079	NC_017459	GCA	2	6	190586	190591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
3080	NC_017459	GAC	2	6	190619	190624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
3081	NC_017459	TGA	2	6	190675	190680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
3082	NC_017459	GAT	2	6	190687	190692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
3083	NC_017459	ATC	2	6	190717	190722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802521
3084	NC_017459	TGA	2	6	190867	190872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
3085	NC_017459	ATT	2	6	190945	190950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802521
3086	NC_017459	TCA	2	6	191004	191009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802521
3087	NC_017459	GAC	3	9	191028	191036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
3088	NC_017459	GCG	2	6	191204	191209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802522
3089	NC_017459	CCG	2	6	191223	191228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802522
3090	NC_017459	TGA	2	6	191334	191339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
3091	NC_017459	CAG	2	6	191348	191353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802522
3092	NC_017459	ACTCA	2	10	191441	191450	40 %	20 %	0 %	40 %	385802522
3093	NC_017459	ATT	2	6	191576	191581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802522
3094	NC_017459	AAT	2	6	191614	191619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802522
3095	NC_017459	ACA	2	6	191653	191658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802522
3096	NC_017459	CGGC	2	8	191791	191798	0 %	0 %	50 %	50 %	385802522
3097	NC_017459	ACA	2	6	191812	191817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802522
3098	NC_017459	TCAT	2	8	191819	191826	25 %	50 %	0 %	25 %	385802522
3099	NC_017459	CGACT	2	10	191849	191858	20 %	20 %	20 %	40 %	385802522
3100	NC_017459	CTC	2	6	191876	191881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802522
3101	NC_017459	ATG	2	6	191891	191896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
3102	NC_017459	CTG	2	6	191897	191902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802522
3103	NC_017459	ATA	2	6	191923	191928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802522
3104	NC_017459	TGA	2	6	191946	191951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
3105	NC_017459	TTTC	2	8	191956	191963	0 %	75 %	0 %	25 %	385802522
3106	NC_017459	TGA	2	6	192002	192007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
3107	NC_017459	TGA	2	6	192018	192023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
3108	NC_017459	ATT	2	6	192079	192084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802522
3109	NC_017459	ACCA	2	8	192145	192152	50 %	0 %	0 %	50 %	385802522
3110	NC_017459	CAG	2	6	192170	192175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802522
3111	NC_017459	TCT	2	6	192186	192191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802522
3112	NC_017459	TCC	2	6	192236	192241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802522
3113	NC_017459	TG	3	6	192280	192285	0 %	50 %	50 %	0 %	385802522
3114	NC_017459	CAAT	2	8	192307	192314	50 %	25 %	0 %	25 %	385802522
3115	NC_017459	C	6	6	192363	192368	0 %	0 %	0 %	100 %	385802522
3116	NC_017459	GCA	2	6	192427	192432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802522
3117	NC_017459	GTC	2	6	192436	192441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802522
3118	NC_017459	GTT	2	6	192514	192519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802522
3119	NC_017459	CAG	2	6	192569	192574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802522
3120	NC_017459	CGC	2	6	192616	192621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802522
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3238	NC_017459	GATC	2	8	198854	198861	25 %	25 %	25 %	25 %	385802529
3239	NC_017459	AGATC	2	10	198874	198883	40 %	20 %	20 %	20 %	385802529
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3241	NC_017459	CA	3	6	198969	198974	50 %	0 %	0 %	50 %	385802529
3242	NC_017459	TGT	2	6	199088	199093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802529
3243	NC_017459	TAT	2	6	199124	199129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802529
3244	NC_017459	ATTG	2	8	199144	199151	25 %	50 %	25 %	0 %	385802529
3245	NC_017459	TCC	2	6	199155	199160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802529
3246	NC_017459	GT	3	6	199164	199169	0 %	50 %	50 %	0 %	385802529
3247	NC_017459	CCT	2	6	199178	199183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802529
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3253	NC_017459	GCG	2	6	199845	199850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802530
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3272	NC_017459	TTG	3	9	201123	201131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802532
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3300	NC_017459	TGA	2	6	202691	202696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802533
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3312	NC_017459	TCCAAG	2	12	203102	203113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385802534
3313	NC_017459	CGA	2	6	203118	203123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802534
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3322	NC_017459	CTG	2	6	203673	203678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802535
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3332	NC_017459	TTG	2	6	204153	204158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802535
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3334	NC_017459	AAT	2	6	204181	204186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802535
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3338	NC_017459	ACCC	2	8	204343	204350	25 %	0 %	0 %	75 %	385802535
3339	NC_017459	ATC	2	6	204379	204384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802535
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3346	NC_017459	TGA	2	6	205116	205121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802536
3347	NC_017459	CTG	2	6	205130	205135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802536
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3349	NC_017459	CTG	2	6	205187	205192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802536
3350	NC_017459	TTGGTG	2	12	205223	205234	0 %	50 %	50 %	0 %	385802536
3351	NC_017459	GGC	2	6	205311	205316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802536
3352	NC_017459	CAT	2	6	205328	205333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802536
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3354	NC_017459	CCA	2	6	205391	205396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802536
3355	NC_017459	CTC	2	6	205462	205467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802536
3356	NC_017459	GCA	2	6	205468	205473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802536
3357	NC_017459	CTG	2	6	205484	205489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802536
3358	NC_017459	ATA	2	6	205493	205498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802536
3359	NC_017459	ATA	2	6	205614	205619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802536
3360	NC_017459	TAT	3	9	205913	205921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802537
3361	NC_017459	GAC	2	6	205940	205945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802537
3362	NC_017459	ACG	4	12	205957	205968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802537
3363	NC_017459	CTG	2	6	206000	206005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802537
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3367	NC_017459	CAA	3	9	206231	206239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802537
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3477	NC_017459	AC	3	6	212285	212290	50 %	0 %	0 %	50 %	385802544
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3481	NC_017459	CTCA	2	8	212501	212508	25 %	25 %	0 %	50 %	385802544
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3483	NC_017459	GTT	2	6	212759	212764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802545
3484	NC_017459	GAT	2	6	212831	212836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802545
3485	NC_017459	CA	3	6	212855	212860	50 %	0 %	0 %	50 %	385802545
3486	NC_017459	GTGG	2	8	212868	212875	0 %	25 %	75 %	0 %	385802545
3487	NC_017459	GCC	2	6	212904	212909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802545
3488	NC_017459	ACG	2	6	212991	212996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802545
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3490	NC_017459	CGT	2	6	213067	213072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802545
3491	NC_017459	ACGT	2	8	213104	213111	25 %	25 %	25 %	25 %	385802545
3492	NC_017459	ACG	2	6	213117	213122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802545
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