MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017459	CTG	2	6	97068	97073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802459
1502	NC_017459	TCA	2	6	97099	97104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802459
1503	NC_017459	GAA	2	6	97146	97151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802460
1504	NC_017459	CAGCC	2	10	97171	97180	20 %	0 %	20 %	60 %	385802460
1505	NC_017459	ACAA	2	8	97181	97188	75 %	0 %	0 %	25 %	385802460
1506	NC_017459	AAC	2	6	97220	97225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802460
1507	NC_017459	GCT	2	6	97238	97243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802460
1508	NC_017459	AACCCA	2	12	97269	97280	50 %	0 %	0 %	50 %	385802460
1509	NC_017459	ACA	2	6	97281	97286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802460
1510	NC_017459	GCA	2	6	97301	97306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802460
1511	NC_017459	TCA	2	6	97322	97327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802460
1512	NC_017459	TCA	2	6	97331	97336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802460
1513	NC_017459	CAA	2	6	97368	97373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802460
1514	NC_017459	ACA	2	6	97388	97393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802460
1515	NC_017459	CCA	2	6	97451	97456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802460
1516	NC_017459	ACT	2	6	97460	97465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802460
1517	NC_017459	TCG	2	6	97480	97485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802460
1518	NC_017459	GCC	2	6	97550	97555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802460
1519	NC_017459	AGC	2	6	98593	98598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802461
1520	NC_017459	AGA	2	6	98644	98649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802461
1521	NC_017459	CG	3	6	98661	98666	0 %	0 %	50 %	50 %	385802461
1522	NC_017459	CTC	2	6	98723	98728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802461
1523	NC_017459	ACCCA	2	10	98735	98744	40 %	0 %	0 %	60 %	385802461
1524	NC_017459	ATC	2	6	98876	98881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802461
1525	NC_017459	CGC	2	6	98899	98904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802461
1526	NC_017459	GAC	2	6	98985	98990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802461
1527	NC_017459	GA	3	6	99297	99302	50 %	0 %	50 %	0 %	385802462
1528	NC_017459	GTT	2	6	99354	99359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802462
1529	NC_017459	TA	3	6	99365	99370	50 %	50 %	0 %	0 %	385802462
1530	NC_017459	GAC	2	6	99533	99538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802462
1531	NC_017459	TCG	2	6	99564	99569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802462
1532	NC_017459	GAT	2	6	99620	99625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802462
1533	NC_017459	TTG	2	6	99632	99637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802462
1534	NC_017459	AGG	2	6	99700	99705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802462
1535	NC_017459	GAA	2	6	99770	99775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802462
1536	NC_017459	GGAG	2	8	99777	99784	25 %	0 %	75 %	0 %	385802462
1537	NC_017459	TTC	2	6	99785	99790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802462
1538	NC_017459	GTCG	2	8	99898	99905	0 %	25 %	50 %	25 %	385802462
1539	NC_017459	TTC	2	6	100076	100081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802463
1540	NC_017459	GGA	2	6	100185	100190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802463
1541	NC_017459	GAG	2	6	100291	100296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802463
1542	NC_017459	TGG	2	6	100319	100324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802463
1543	NC_017459	CTT	2	6	100352	100357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802463
1544	NC_017459	GAA	2	6	100411	100416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802463
1545	NC_017459	GAA	2	6	100441	100446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802463
1546	NC_017459	TTG	2	6	100447	100452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802463
1547	NC_017459	GTC	2	6	100498	100503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802463
1548	NC_017459	GAA	2	6	100528	100533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802463
1549	NC_017459	CAA	2	6	100661	100666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802463
1550	NC_017459	TTC	2	6	101604	101609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802464
1551	NC_017459	CGA	2	6	102144	102149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802465
1552	NC_017459	CTC	2	6	102160	102165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802465
1553	NC_017459	ACGA	2	8	102192	102199	50 %	0 %	25 %	25 %	385802465
1554	NC_017459	GAG	2	6	102208	102213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802465
1555	NC_017459	GCGA	2	8	102232	102239	25 %	0 %	50 %	25 %	385802465
1556	NC_017459	GAC	2	6	102245	102250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802465
1557	NC_017459	CTC	2	6	102268	102273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802466
1558	NC_017459	GAC	2	6	102284	102289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802466
1559	NC_017459	CCG	2	6	102306	102311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802466
1560	NC_017459	GAC	2	6	102455	102460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802466
1561	NC_017459	TCG	3	9	102468	102476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802466
1562	NC_017459	GCG	2	6	102495	102500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802466
1563	NC_017459	TGA	2	6	102511	102516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802466
1564	NC_017459	TCG	2	6	103742	103747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802467
1565	NC_017459	GAG	2	6	103762	103767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802467
1566	NC_017459	CCT	2	6	103788	103793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802467
1567	NC_017459	CAG	2	6	103833	103838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802467
1568	NC_017459	TCAGTT	2	12	105942	105953	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385802469
1569	NC_017459	CTC	2	6	105971	105976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802469
1570	NC_017459	CAG	2	6	106030	106035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802469
1571	NC_017459	AATCC	2	10	106062	106071	40 %	20 %	0 %	40 %	385802469
1572	NC_017459	GA	3	6	106085	106090	50 %	0 %	50 %	0 %	385802469
1573	NC_017459	CCA	2	6	106163	106168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802469
1574	NC_017459	TGAAC	2	10	106184	106193	40 %	20 %	20 %	20 %	385802469
1575	NC_017459	GGA	2	6	106300	106305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802469
1576	NC_017459	GAA	2	6	106384	106389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802469
1577	NC_017459	TAGA	2	8	106418	106425	50 %	25 %	25 %	0 %	385802469
1578	NC_017459	GAA	2	6	106429	106434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802469
1579	NC_017459	AAT	2	6	106448	106453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802469
1580	NC_017459	AAAT	2	8	106468	106475	75 %	25 %	0 %	0 %	385802469
1581	NC_017459	AAT	2	6	106568	106573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802469
1582	NC_017459	ATG	2	6	106665	106670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802469
1583	NC_017459	TGC	2	6	106682	106687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802469
1584	NC_017459	TG	3	6	106743	106748	0 %	50 %	50 %	0 %	385802469
1585	NC_017459	ATT	3	9	106774	106782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802470
1586	NC_017459	TA	3	6	106794	106799	50 %	50 %	0 %	0 %	385802470
1587	NC_017459	TTC	2	6	106819	106824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802470
1588	NC_017459	CTT	2	6	106926	106931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802470
1589	NC_017459	GAG	2	6	106949	106954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802470
1590	NC_017459	CTT	2	6	107193	107198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802470
1591	NC_017459	CAC	2	6	107250	107255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802470
1592	NC_017459	TGCC	2	8	107381	107388	0 %	25 %	25 %	50 %	385802470
1593	NC_017459	CACC	2	8	107557	107564	25 %	0 %	0 %	75 %	385802470
1594	NC_017459	CGG	2	6	107571	107576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802470
1595	NC_017459	GC	3	6	107592	107597	0 %	0 %	50 %	50 %	385802470
1596	NC_017459	GCT	2	6	107604	107609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802470
1597	NC_017459	ACT	2	6	107701	107706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802470
1598	NC_017459	TCC	2	6	107717	107722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802470
1599	NC_017459	GAG	2	6	107728	107733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802470
1600	NC_017459	GGT	2	6	107755	107760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802470
1601	NC_017459	GATTG	2	10	107774	107783	20 %	40 %	40 %	0 %	385802470
1602	NC_017459	GCG	2	6	107845	107850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802470
1603	NC_017459	TGC	2	6	107881	107886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802470
1604	NC_017459	GACAC	2	10	107894	107903	40 %	0 %	20 %	40 %	385802470
1605	NC_017459	ACC	2	6	107956	107961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802470
1606	NC_017459	GAC	2	6	107967	107972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802470
1607	NC_017459	AGCC	2	8	107978	107985	25 %	0 %	25 %	50 %	385802470
1608	NC_017459	TG	3	6	108125	108130	0 %	50 %	50 %	0 %	385802470
1609	NC_017459	CGAG	2	8	108161	108168	25 %	0 %	50 %	25 %	385802470
1610	NC_017459	GTG	2	6	108249	108254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802470
1611	NC_017459	GCG	2	6	108284	108289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802470
1612	NC_017459	GTC	2	6	108311	108316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802470
1613	NC_017459	ACC	2	6	108400	108405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802470
1614	NC_017459	GCC	2	6	108415	108420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802470
1615	NC_017459	ACT	3	9	108421	108429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802470
1616	NC_017459	ACT	3	9	108433	108441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802470
1617	NC_017459	GCC	2	6	108448	108453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802470
1618	NC_017459	GCC	2	6	108457	108462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802470
1619	NC_017459	ACT	2	6	108463	108468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802470
1620	NC_017459	CTA	2	6	108479	108484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802470
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1622	NC_017459	ACT	2	6	108499	108504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802470
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1981	NC_017459	CGA	2	6	127545	127550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802470
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1983	NC_017459	CGA	2	6	127605	127610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802470
1984	NC_017459	T	6	6	127622	127627	0 %	100 %	0 %	0 %	385802470
1985	NC_017459	GATC	2	8	127641	127648	25 %	25 %	25 %	25 %	385802470
1986	NC_017459	GCC	3	9	127669	127677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802470
1987	NC_017459	CGAG	2	8	127680	127687	25 %	0 %	50 %	25 %	385802470
1988	NC_017459	CG	3	6	127821	127826	0 %	0 %	50 %	50 %	385802470
1989	NC_017459	TGG	2	6	127827	127832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802470
1990	NC_017459	TTG	2	6	127838	127843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802470
1991	NC_017459	CGA	2	6	127857	127862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802470
1992	NC_017459	GAT	2	6	127870	127875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802470
1993	NC_017459	ACG	2	6	127947	127952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802470
1994	NC_017459	TCG	2	6	127968	127973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802470
1995	NC_017459	GTT	2	6	127984	127989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802470
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1997	NC_017459	GCG	2	6	128202	128207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802470
1998	NC_017459	GTGC	2	8	128337	128344	0 %	25 %	50 %	25 %	385802470
1999	NC_017459	ATC	2	6	128404	128409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802470
2000	NC_017459	GTC	2	6	128479	128484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802470

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