MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017459	CCT	2	6	829988	829993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385803067
14002	NC_017459	CCT	2	6	830048	830053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385803067
14003	NC_017459	AAG	2	6	830131	830136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385803067
14004	NC_017459	CCA	2	6	830187	830192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385803067
14005	NC_017459	TTC	2	6	830212	830217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385803067
14006	NC_017459	GC	3	6	830228	830233	0 %	0 %	50 %	50 %	385803067
14007	NC_017459	TGA	2	6	830288	830293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803067
14008	NC_017459	TGA	2	6	830315	830320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803067
14009	NC_017459	ATGA	2	8	830340	830347	50 %	25 %	25 %	0 %	385803067
14010	NC_017459	GAA	2	6	830421	830426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385803067
14011	NC_017459	AGA	2	6	830486	830491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385803067
14012	NC_017459	TAT	2	6	831602	831607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803068
14013	NC_017459	GGT	2	6	831669	831674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385803068
14014	NC_017459	CTC	2	6	831680	831685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385803068
14015	NC_017459	CG	3	6	831699	831704	0 %	0 %	50 %	50 %	385803068
14016	NC_017459	CA	3	6	831725	831730	50 %	0 %	0 %	50 %	385803068
14017	NC_017459	AT	3	6	831761	831766	50 %	50 %	0 %	0 %	385803068
14018	NC_017459	GAAAC	2	10	831780	831789	60 %	0 %	20 %	20 %	385803068
14019	NC_017459	GAT	2	6	831843	831848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803068
14020	NC_017459	AGG	2	6	831944	831949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385803068
14021	NC_017459	CCG	2	6	831964	831969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385803068
14022	NC_017459	CAC	2	6	832042	832047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385803068
14023	NC_017459	TGC	2	6	832088	832093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803068
14024	NC_017459	ATT	2	6	832110	832115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803068
14025	NC_017459	GC	3	6	832125	832130	0 %	0 %	50 %	50 %	385803068
14026	NC_017459	TTA	2	6	832186	832191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803068
14027	NC_017459	GTG	2	6	832231	832236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385803068
14028	NC_017459	TC	4	8	832268	832275	0 %	50 %	0 %	50 %	385803068
14029	NC_017459	GGGA	2	8	832306	832313	25 %	0 %	75 %	0 %	385803068
14030	NC_017459	TGTCTT	2	12	832362	832373	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385803069
14031	NC_017459	TCA	2	6	832443	832448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803069
14032	NC_017459	GCA	2	6	832470	832475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803069
14033	NC_017459	CAA	2	6	832522	832527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803069
14034	NC_017459	ATT	2	6	832553	832558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803069
14035	NC_017459	ATC	2	6	832589	832594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803069
14036	NC_017459	TC	3	6	832603	832608	0 %	50 %	0 %	50 %	385803069
14037	NC_017459	ATGC	2	8	832684	832691	25 %	25 %	25 %	25 %	385803069
14038	NC_017459	CCAG	2	8	832724	832731	25 %	0 %	25 %	50 %	385803069
14039	NC_017459	TCA	2	6	832734	832739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803069
14040	NC_017459	CTG	2	6	832786	832791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803069
14041	NC_017459	ATC	3	9	832865	832873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803069
14042	NC_017459	ATG	2	6	832891	832896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803069
14043	NC_017459	GTTT	2	8	832941	832948	0 %	75 %	25 %	0 %	385803069
14044	NC_017459	AAG	2	6	832956	832961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385803069
14045	NC_017459	CAA	4	12	833005	833016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803069
14046	NC_017459	ATC	2	6	833018	833023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803069
14047	NC_017459	CAA	2	6	833062	833067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803069
14048	NC_017459	TCC	2	6	833082	833087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385803069
14049	NC_017459	ATG	3	9	833125	833133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803069
14050	NC_017459	AT	3	6	833139	833144	50 %	50 %	0 %	0 %	385803069
14051	NC_017459	ATC	2	6	833153	833158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803069
14052	NC_017459	TCA	2	6	833190	833195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803069
14053	NC_017459	ATA	2	6	833226	833231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385803069
14054	NC_017459	GAA	2	6	833257	833262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385803069
14055	NC_017459	GTCT	2	8	833272	833279	0 %	50 %	25 %	25 %	385803069
14056	NC_017459	GAC	2	6	833321	833326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803069
14057	NC_017459	CCA	2	6	833454	833459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385803070
14058	NC_017459	ATT	2	6	833479	833484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803070
14059	NC_017459	GAC	2	6	833495	833500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803070
14060	NC_017459	ACA	2	6	833550	833555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803070
14061	NC_017459	ACA	2	6	833574	833579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803070
14062	NC_017459	ACA	2	6	833607	833612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803070
14063	NC_017459	CAA	2	6	833635	833640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803070
14064	NC_017459	TGA	2	6	833711	833716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803070
14065	NC_017459	TGA	2	6	833768	833773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803070
14066	NC_017459	TAT	2	6	833837	833842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803070
14067	NC_017459	AAC	2	6	833892	833897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803071
14068	NC_017459	TCCG	2	8	833901	833908	0 %	25 %	25 %	50 %	385803071
14069	NC_017459	CAT	2	6	833936	833941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803071
14070	NC_017459	TCA	2	6	833950	833955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803071
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14072	NC_017459	CAA	2	6	833996	834001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803071
14073	NC_017459	CCGC	2	8	834035	834042	0 %	0 %	25 %	75 %	385803071
14074	NC_017459	CAT	2	6	834065	834070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803071
14075	NC_017459	CTCG	2	8	834083	834090	0 %	25 %	25 %	50 %	385803071
14076	NC_017459	CAT	2	6	834101	834106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803071
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14078	NC_017459	TGA	2	6	834185	834190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803071
14079	NC_017459	TCA	2	6	834209	834214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803071
14080	NC_017459	GCT	2	6	834247	834252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803071
14081	NC_017459	AAT	2	6	834294	834299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385803071
14082	NC_017459	AAT	2	6	834390	834395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385803071
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14085	NC_017459	GTT	2	6	834891	834896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385803072
14086	NC_017459	TCA	2	6	834944	834949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803072
14087	NC_017459	AT	3	6	834950	834955	50 %	50 %	0 %	0 %	385803072
14088	NC_017459	CCA	2	6	835019	835024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385803072
14089	NC_017459	GCAA	2	8	835034	835041	50 %	0 %	25 %	25 %	385803072
14090	NC_017459	ATC	2	6	835055	835060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803072
14091	NC_017459	TGAT	2	8	835099	835106	25 %	50 %	25 %	0 %	385803072
14092	NC_017459	TAA	2	6	835321	835326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385803073
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14094	NC_017459	A	6	6	835441	835446	100 %	0 %	0 %	0 %	385803073
14095	NC_017459	TC	3	6	835478	835483	0 %	50 %	0 %	50 %	385803073
14096	NC_017459	TAA	2	6	835514	835519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385803073
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14099	NC_017459	CAG	2	6	835609	835614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803073
14100	NC_017459	TAT	2	6	835646	835651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803073
14101	NC_017459	GAC	2	6	835661	835666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803073
14102	NC_017459	GGA	2	6	835785	835790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385803073
14103	NC_017459	GAG	2	6	835845	835850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385803073
14104	NC_017459	TGA	2	6	835903	835908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803073
14105	NC_017459	ATCA	2	8	835961	835968	50 %	25 %	0 %	25 %	385803073
14106	NC_017459	TGC	2	6	836006	836011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803073
14107	NC_017459	CAC	2	6	836047	836052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385803073
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14109	NC_017459	ATC	2	6	836148	836153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803073
14110	NC_017459	TCCA	2	8	836155	836162	25 %	25 %	0 %	50 %	385803073
14111	NC_017459	G	6	6	836209	836214	0 %	0 %	100 %	0 %	385803073
14112	NC_017459	GTCA	2	8	836219	836226	25 %	25 %	25 %	25 %	385803073
14113	NC_017459	CACT	2	8	836248	836255	25 %	25 %	0 %	50 %	385803073
14114	NC_017459	GTTGAT	2	12	836271	836282	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385803073
14115	NC_017459	GAT	3	9	836280	836288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803073
14116	NC_017459	CA	3	6	836301	836306	50 %	0 %	0 %	50 %	385803073
14117	NC_017459	TGG	2	6	836339	836344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385803073
14118	NC_017459	GCC	2	6	836385	836390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385803073
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14477	NC_017459	ACA	2	6	853531	853536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803089
14478	NC_017459	TTG	2	6	853547	853552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385803089
14479	NC_017459	CAT	3	9	853573	853581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803089
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14481	NC_017459	TGA	2	6	853626	853631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803089
14482	NC_017459	CTG	2	6	853727	853732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803089
14483	NC_017459	ATG	2	6	853769	853774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803089
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