MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017459	TCC	2	6	694202	694207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802948
11502	NC_017459	TGC	2	6	694211	694216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802948
11503	NC_017459	GCT	2	6	694410	694415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802948
11504	NC_017459	GTG	2	6	694489	694494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802948
11505	NC_017459	ACA	2	6	694495	694500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802948
11506	NC_017459	TAC	2	6	694573	694578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802949
11507	NC_017459	GAT	2	6	694679	694684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802949
11508	NC_017459	GAGC	2	8	694699	694706	25 %	0 %	50 %	25 %	385802949
11509	NC_017459	A	6	6	694708	694713	100 %	0 %	0 %	0 %	385802949
11510	NC_017459	GTA	2	6	694716	694721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802949
11511	NC_017459	TCG	2	6	694762	694767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802949
11512	NC_017459	GAT	2	6	694882	694887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802949
11513	NC_017459	TCCT	2	8	694959	694966	0 %	50 %	0 %	50 %	385802949
11514	NC_017459	TTG	2	6	694994	694999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802949
11515	NC_017459	TGA	2	6	695049	695054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802949
11516	NC_017459	GTT	2	6	695099	695104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802949
11517	NC_017459	CTT	2	6	695116	695121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802949
11518	NC_017459	TCG	2	6	695137	695142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802949
11519	NC_017459	GCT	2	6	695165	695170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802949
11520	NC_017459	CGG	2	6	695179	695184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802949
11521	NC_017459	TTA	2	6	695249	695254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802949
11522	NC_017459	CCA	2	6	695369	695374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802949
11523	NC_017459	TGG	2	6	695810	695815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802950
11524	NC_017459	CCG	2	6	695841	695846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802950
11525	NC_017459	CTCA	2	8	695930	695937	25 %	25 %	0 %	50 %	385802950
11526	NC_017459	CCG	2	6	695944	695949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802950
11527	NC_017459	CAC	2	6	695965	695970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802950
11528	NC_017459	CAA	2	6	696023	696028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802950
11529	NC_017459	TTC	2	6	696062	696067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802950
11530	NC_017459	GTG	2	6	696174	696179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802950
11531	NC_017459	GTC	2	6	696200	696205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802950
11532	NC_017459	TCG	2	6	696219	696224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802950
11533	NC_017459	ATT	2	6	696266	696271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802950
11534	NC_017459	GC	4	8	696277	696284	0 %	0 %	50 %	50 %	385802950
11535	NC_017459	CCG	2	6	696316	696321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802950
11536	NC_017459	GCT	2	6	696386	696391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802950
11537	NC_017459	CAT	2	6	696418	696423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802950
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11539	NC_017459	GAT	2	6	696455	696460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802950
11540	NC_017459	GAAT	2	8	696506	696513	50 %	25 %	25 %	0 %	385802950
11541	NC_017459	GCGG	2	8	696538	696545	0 %	0 %	75 %	25 %	385802950
11542	NC_017459	ATC	2	6	696548	696553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802950
11543	NC_017459	CTG	2	6	696659	696664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802950
11544	NC_017459	GCT	2	6	696679	696684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802950
11545	NC_017459	GATT	2	8	696718	696725	25 %	50 %	25 %	0 %	385802950
11546	NC_017459	CCT	2	6	696790	696795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802950
11547	NC_017459	GGT	2	6	696824	696829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802950
11548	NC_017459	ACTC	2	8	696860	696867	25 %	25 %	0 %	50 %	385802950
11549	NC_017459	TTGCTG	2	12	696872	696883	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385802950
11550	NC_017459	AG	3	6	696893	696898	50 %	0 %	50 %	0 %	385802950
11551	NC_017459	GCAG	2	8	696968	696975	25 %	0 %	50 %	25 %	385802950
11552	NC_017459	TGCCGA	2	12	697000	697011	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385802950
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11554	NC_017459	CA	3	6	697108	697113	50 %	0 %	0 %	50 %	385802950
11555	NC_017459	GAC	2	6	697568	697573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802951
11556	NC_017459	TCG	2	6	697600	697605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802951
11557	NC_017459	GCT	2	6	697646	697651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802951
11558	NC_017459	GTG	2	6	697656	697661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802951
11559	NC_017459	AT	3	6	697753	697758	50 %	50 %	0 %	0 %	385802951
11560	NC_017459	AGC	2	6	697779	697784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802951
11561	NC_017459	ATTGG	2	10	697812	697821	20 %	40 %	40 %	0 %	385802951
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11563	NC_017459	TGA	2	6	697914	697919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802951
11564	NC_017459	TCA	2	6	697922	697927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802952
11565	NC_017459	GGAT	2	8	697960	697967	25 %	25 %	50 %	0 %	385802952
11566	NC_017459	AGC	2	6	698005	698010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802952
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11568	NC_017459	CGA	2	6	698048	698053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802952
11569	NC_017459	CTTT	2	8	698087	698094	0 %	75 %	0 %	25 %	385802952
11570	NC_017459	ATC	2	6	698104	698109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802952
11571	NC_017459	GTC	2	6	698140	698145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802952
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11579	NC_017459	TGG	2	6	698809	698814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802953
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11584	NC_017459	GTA	2	6	699610	699615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802954
11585	NC_017459	CAT	2	6	699622	699627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802954
11586	NC_017459	CAA	3	9	699628	699636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802954
11587	NC_017459	CAG	2	6	699710	699715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802954
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11590	NC_017459	TGA	2	6	699781	699786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802954
11591	NC_017459	ATG	2	6	699787	699792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802954
11592	NC_017459	TGA	2	6	699816	699821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802954
11593	NC_017459	TCCA	2	8	699840	699847	25 %	25 %	0 %	50 %	385802954
11594	NC_017459	TGT	2	6	699868	699873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802954
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11600	NC_017459	GCA	2	6	700275	700280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802954
11601	NC_017459	GCCT	2	8	700322	700329	0 %	25 %	25 %	50 %	385802954
11602	NC_017459	AT	3	6	700339	700344	50 %	50 %	0 %	0 %	385802954
11603	NC_017459	AG	3	6	700433	700438	50 %	0 %	50 %	0 %	385802954
11604	NC_017459	GCA	2	6	700452	700457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802954
11605	NC_017459	TATCA	2	10	700615	700624	40 %	40 %	0 %	20 %	385802955
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11607	NC_017459	AAT	2	6	700647	700652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802955
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11611	NC_017459	CAT	2	6	700832	700837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802955
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11617	NC_017459	GTTT	2	8	701184	701191	0 %	75 %	25 %	0 %	385802956
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