MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017459	TGA	2	6	611640	611645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802879
10002	NC_017459	ATT	2	6	611932	611937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802880
10003	NC_017459	GAA	2	6	611978	611983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802880
10004	NC_017459	ATG	2	6	612082	612087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802880
10005	NC_017459	ATAA	2	8	612117	612124	75 %	25 %	0 %	0 %	385802880
10006	NC_017459	GTG	3	9	612130	612138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802880
10007	NC_017459	CCT	2	6	612142	612147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802880
10008	NC_017459	CGG	2	6	612227	612232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802880
10009	NC_017459	ACA	2	6	612270	612275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802880
10010	NC_017459	G	6	6	612311	612316	0 %	0 %	100 %	0 %	385802880
10011	NC_017459	ATA	2	6	612321	612326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802880
10012	NC_017459	CAC	2	6	612349	612354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802880
10013	NC_017459	TATT	2	8	612367	612374	25 %	75 %	0 %	0 %	385802880
10014	NC_017459	ATC	2	6	612380	612385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802880
10015	NC_017459	CAG	2	6	612412	612417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802880
10016	NC_017459	ATC	2	6	612455	612460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802880
10017	NC_017459	TTG	2	6	612484	612489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802880
10018	NC_017459	TCCA	2	8	612493	612500	25 %	25 %	0 %	50 %	385802880
10019	NC_017459	GCA	2	6	612519	612524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802880
10020	NC_017459	CCTG	2	8	612627	612634	0 %	25 %	25 %	50 %	385802880
10021	NC_017459	CAAGGA	2	12	612761	612772	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385802881
10022	NC_017459	TCGT	2	8	612807	612814	0 %	50 %	25 %	25 %	385802881
10023	NC_017459	TGG	2	6	612840	612845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802881
10024	NC_017459	GT	3	6	612921	612926	0 %	50 %	50 %	0 %	385802881
10025	NC_017459	TGA	2	6	612933	612938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802881
10026	NC_017459	ACG	3	9	612969	612977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802881
10027	NC_017459	T	6	6	613045	613050	0 %	100 %	0 %	0 %	385802881
10028	NC_017459	ATT	2	6	613177	613182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802881
10029	NC_017459	TCG	2	6	613259	613264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802882
10030	NC_017459	TGACAG	2	12	613288	613299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385802882
10031	NC_017459	GTC	2	6	613312	613317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802882
10032	NC_017459	CTG	2	6	613487	613492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802882
10033	NC_017459	ATC	2	6	613542	613547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802882
10034	NC_017459	ACGA	2	8	613617	613624	50 %	0 %	25 %	25 %	385802882
10035	NC_017459	GTT	2	6	613654	613659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802882
10036	NC_017459	GAT	2	6	613667	613672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802882
10037	NC_017459	TGG	2	6	613746	613751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802882
10038	NC_017459	ATT	2	6	613876	613881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802882
10039	NC_017459	ATA	2	6	613892	613897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802882
10040	NC_017459	AT	3	6	613913	613918	50 %	50 %	0 %	0 %	385802882
10041	NC_017459	ACT	2	6	613924	613929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802882
10042	NC_017459	TCA	2	6	613981	613986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802882
10043	NC_017459	TCA	2	6	614038	614043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802882
10044	NC_017459	ACC	2	6	614103	614108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802882
10045	NC_017459	AGT	2	6	614164	614169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802882
10046	NC_017459	ACG	2	6	614184	614189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802882
10047	NC_017459	GAT	2	6	614232	614237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802882
10048	NC_017459	GACTC	2	10	614264	614273	20 %	20 %	20 %	40 %	385802882
10049	NC_017459	TCAG	2	8	614311	614318	25 %	25 %	25 %	25 %	385802882
10050	NC_017459	CTG	2	6	614369	614374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802882
10051	NC_017459	CAA	2	6	614435	614440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802882
10052	NC_017459	CAC	2	6	614453	614458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802882
10053	NC_017459	TGG	2	6	614496	614501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802882
10054	NC_017459	CCA	2	6	614521	614526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802882
10055	NC_017459	TCTGTC	2	12	614663	614674	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385802883
10056	NC_017459	ACG	3	9	614680	614688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802883
10057	NC_017459	CG	3	6	614700	614705	0 %	0 %	50 %	50 %	385802883
10058	NC_017459	TTC	2	6	614710	614715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802883
10059	NC_017459	AGA	2	6	614732	614737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802883
10060	NC_017459	ATC	2	6	614761	614766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802883
10061	NC_017459	TGT	2	6	614777	614782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802883
10062	NC_017459	GGC	2	6	614783	614788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802883
10063	NC_017459	CAT	2	6	614892	614897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802883
10064	NC_017459	CCG	2	6	614905	614910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802883
10065	NC_017459	AGC	2	6	614927	614932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802883
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10068	NC_017459	TGT	2	6	615086	615091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802883
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10070	NC_017459	GTT	2	6	615143	615148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802883
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10072	NC_017459	CAT	2	6	615187	615192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802883
10073	NC_017459	CGGG	2	8	615254	615261	0 %	0 %	75 %	25 %	385802883
10074	NC_017459	CCT	2	6	615309	615314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802883
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10082	NC_017459	CGT	2	6	615658	615663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802883
10083	NC_017459	AGAA	2	8	615676	615683	75 %	0 %	25 %	0 %	385802883
10084	NC_017459	CAT	3	9	615687	615695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802883
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10086	NC_017459	CAC	2	6	615779	615784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802884
10087	NC_017459	AAG	2	6	615876	615881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802884
10088	NC_017459	ATC	2	6	615886	615891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
10089	NC_017459	CCGC	2	8	615953	615960	0 %	0 %	25 %	75 %	385802884
10090	NC_017459	TGG	2	6	615975	615980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802884
10091	NC_017459	GGC	2	6	616014	616019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802884
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10098	NC_017459	AAT	3	9	616297	616305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
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10100	NC_017459	CAT	2	6	616380	616385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
10101	NC_017459	GCA	2	6	616396	616401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802884
10102	NC_017459	ACT	2	6	616407	616412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
10103	NC_017459	CAT	2	6	616461	616466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
10104	NC_017459	TCA	2	6	616525	616530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
10105	NC_017459	CAG	2	6	616595	616600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802884
10106	NC_017459	ATA	2	6	616663	616668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
10107	NC_017459	TGGT	2	8	616682	616689	0 %	50 %	50 %	0 %	385802884
10108	NC_017459	ATA	4	12	616732	616743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
10109	NC_017459	AG	3	6	616767	616772	50 %	0 %	50 %	0 %	385802884
10110	NC_017459	ATC	2	6	616785	616790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
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10114	NC_017459	AAT	2	6	616885	616890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
10115	NC_017459	TC	3	6	616985	616990	0 %	50 %	0 %	50 %	385802884
10116	NC_017459	CAA	2	6	617066	617071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802884
10117	NC_017459	ACA	2	6	617137	617142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802884
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10119	NC_017459	GCAA	2	8	617191	617198	50 %	0 %	25 %	25 %	385802884
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10124	NC_017459	CAA	2	6	617514	617519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802885
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10150	NC_017459	TTA	2	6	618694	618699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802886
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10224	NC_017459	GGAC	2	8	622684	622691	25 %	0 %	50 %	25 %	385802888
10225	NC_017459	CGA	2	6	622708	622713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802888
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10236	NC_017459	ACA	2	6	623083	623088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802888
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