MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017459	GAT	2	6	355049	355054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802665
6002	NC_017459	ATC	2	6	355080	355085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802665
6003	NC_017459	TC	3	6	355488	355493	0 %	50 %	0 %	50 %	385802666
6004	NC_017459	AC	3	6	355512	355517	50 %	0 %	0 %	50 %	385802666
6005	NC_017459	GCA	2	6	355538	355543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802666
6006	NC_017459	CCG	2	6	355576	355581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802666
6007	NC_017459	AACG	2	8	355632	355639	50 %	0 %	25 %	25 %	385802666
6008	NC_017459	TGTT	2	8	355650	355657	0 %	75 %	25 %	0 %	385802666
6009	NC_017459	GAT	2	6	355688	355693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802666
6010	NC_017459	A	6	6	355700	355705	100 %	0 %	0 %	0 %	385802666
6011	NC_017459	GGAG	2	8	355744	355751	25 %	0 %	75 %	0 %	385802666
6012	NC_017459	TTG	2	6	355815	355820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802666
6013	NC_017459	GAT	2	6	355823	355828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802666
6014	NC_017459	ACGGT	2	10	356085	356094	20 %	20 %	40 %	20 %	385802667
6015	NC_017459	CTC	2	6	356099	356104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802667
6016	NC_017459	ACA	2	6	356108	356113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802667
6017	NC_017459	GA	3	6	356244	356249	50 %	0 %	50 %	0 %	385802667
6018	NC_017459	CTTGAT	2	12	356270	356281	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385802667
6019	NC_017459	GTG	2	6	356304	356309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802667
6020	NC_017459	GCG	2	6	356340	356345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802667
6021	NC_017459	GTT	2	6	356363	356368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802667
6022	NC_017459	GCGA	2	8	356372	356379	25 %	0 %	50 %	25 %	385802667
6023	NC_017459	GA	3	6	356522	356527	50 %	0 %	50 %	0 %	385802667
6024	NC_017459	GAC	2	6	356602	356607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802667
6025	NC_017459	ATG	2	6	356661	356666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802667
6026	NC_017459	TGC	2	6	356704	356709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802667
6027	NC_017459	GAA	2	6	356774	356779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802667
6028	NC_017459	CT	3	6	356839	356844	0 %	50 %	0 %	50 %	385802667
6029	NC_017459	GCG	2	6	357004	357009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802667
6030	NC_017459	GC	3	6	357034	357039	0 %	0 %	50 %	50 %	385802667
6031	NC_017459	AGC	2	6	357049	357054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802667
6032	NC_017459	TCG	2	6	357102	357107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802667
6033	NC_017459	GCGA	2	8	357189	357196	25 %	0 %	50 %	25 %	385802667
6034	NC_017459	CTT	2	6	357212	357217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802667
6035	NC_017459	CAG	2	6	357225	357230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802667
6036	NC_017459	GGA	2	6	357239	357244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802667
6037	NC_017459	TGC	2	6	357322	357327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802667
6038	NC_017459	AGC	2	6	357343	357348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802667
6039	NC_017459	CAGATG	2	12	357357	357368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385802667
6040	NC_017459	TGG	2	6	357403	357408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802667
6041	NC_017459	CG	3	6	357444	357449	0 %	0 %	50 %	50 %	385802667
6042	NC_017459	CTC	2	6	357533	357538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802667
6043	NC_017459	GGT	2	6	357551	357556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802667
6044	NC_017459	TCG	2	6	357560	357565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802667
6045	NC_017459	TGA	2	6	357595	357600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802667
6046	NC_017459	TGA	2	6	357613	357618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802667
6047	NC_017459	TTG	2	6	357763	357768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802668
6048	NC_017459	GCG	2	6	357785	357790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802668
6049	NC_017459	GTC	2	6	357832	357837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802668
6050	NC_017459	TGCAGA	2	12	357854	357865	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385802668
6051	NC_017459	AGC	2	6	357917	357922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802668
6052	NC_017459	AGAT	2	8	357932	357939	50 %	25 %	25 %	0 %	385802668
6053	NC_017459	AC	3	6	357970	357975	50 %	0 %	0 %	50 %	385802668
6054	NC_017459	TCG	2	6	357978	357983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802668
6055	NC_017459	AAT	2	6	358056	358061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802668
6056	NC_017459	ACA	2	6	358071	358076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802668
6057	NC_017459	TGAA	2	8	358112	358119	50 %	25 %	25 %	0 %	385802668
6058	NC_017459	CGC	2	6	358853	358858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802669
6059	NC_017459	CAT	2	6	358909	358914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802669
6060	NC_017459	TGT	2	6	359040	359045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802669
6061	NC_017459	TG	3	6	359073	359078	0 %	50 %	50 %	0 %	385802669
6062	NC_017459	TGAC	2	8	359123	359130	25 %	25 %	25 %	25 %	385802669
6063	NC_017459	TCA	2	6	359235	359240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802669
6064	NC_017459	AT	4	8	359274	359281	50 %	50 %	0 %	0 %	385802669
6065	NC_017459	GAT	2	6	359435	359440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802670
6066	NC_017459	TTG	2	6	359547	359552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802670
6067	NC_017459	TTC	2	6	359613	359618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802670
6068	NC_017459	GCG	2	6	359665	359670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802670
6069	NC_017459	GCG	2	6	359672	359677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802670
6070	NC_017459	GATGC	2	10	359690	359699	20 %	20 %	40 %	20 %	385802670
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6073	NC_017459	TC	3	6	359888	359893	0 %	50 %	0 %	50 %	385802670
6074	NC_017459	TTG	2	6	360096	360101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802670
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6077	NC_017459	GTA	2	6	360528	360533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802670
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6085	NC_017459	TTG	2	6	360815	360820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802671
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6087	NC_017459	CAC	2	6	360918	360923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802671
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6089	NC_017459	TTG	2	6	361004	361009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802671
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6092	NC_017459	TAT	2	6	361127	361132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802671
6093	NC_017459	CTT	2	6	361159	361164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802671
6094	NC_017459	GGC	2	6	361345	361350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802671
6095	NC_017459	TGT	2	6	361353	361358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802671
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6100	NC_017459	TGCG	2	8	361543	361550	0 %	25 %	50 %	25 %	385802672
6101	NC_017459	CAT	2	6	361624	361629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802672
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6103	NC_017459	AACC	2	8	361650	361657	50 %	0 %	0 %	50 %	385802672
6104	NC_017459	GTT	2	6	361668	361673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802672
6105	NC_017459	CTG	2	6	361678	361683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802672
6106	NC_017459	AGC	2	6	361713	361718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802672
6107	NC_017459	TGA	2	6	361787	361792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802672
6108	NC_017459	ACC	2	6	361793	361798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802672
6109	NC_017459	GCA	2	6	362111	362116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802673
6110	NC_017459	GTATAT	2	12	362144	362155	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385802673
6111	NC_017459	ACA	2	6	362188	362193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802673
6112	NC_017459	ATGC	2	8	362204	362211	25 %	25 %	25 %	25 %	385802673
6113	NC_017459	TCGT	2	8	362259	362266	0 %	50 %	25 %	25 %	385802673
6114	NC_017459	CAT	2	6	362284	362289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802673
6115	NC_017459	TTG	2	6	362433	362438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802673
6116	NC_017459	CAT	2	6	362457	362462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802673
6117	NC_017459	CAC	2	6	362526	362531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802673
6118	NC_017459	CTGTCC	2	12	362568	362579	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385802673
6119	NC_017459	GATC	2	8	362590	362597	25 %	25 %	25 %	25 %	385802673
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6121	NC_017459	GCT	2	6	362696	362701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802673
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6238	NC_017459	ATTGA	2	10	370622	370631	40 %	40 %	20 %	0 %	385802682
6239	NC_017459	TAT	2	6	370644	370649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802682
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