MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017459	CTC	2	6	324475	324480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802640
5503	NC_017459	ACG	2	6	324502	324507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802640
5504	NC_017459	TTC	2	6	324526	324531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802640
5505	NC_017459	GTT	2	6	324552	324557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802640
5506	NC_017459	CTG	2	6	324582	324587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802640
5507	NC_017459	CAG	2	6	324603	324608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802640
5508	NC_017459	GA	3	6	324615	324620	50 %	0 %	50 %	0 %	385802640
5509	NC_017459	GA	3	6	324636	324641	50 %	0 %	50 %	0 %	385802640
5510	NC_017459	CTG	2	6	324729	324734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802640
5511	NC_017459	CTC	2	6	324745	324750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802640
5512	NC_017459	TCA	2	6	324764	324769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802640
5513	NC_017459	CTT	2	6	324855	324860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802640
5514	NC_017459	CAT	2	6	324897	324902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802640
5515	NC_017459	TCA	2	6	324938	324943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802640
5516	NC_017459	ATA	2	6	324944	324949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802640
5517	NC_017459	GCT	2	6	324957	324962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802640
5518	NC_017459	TAA	2	6	324975	324980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802640
5519	NC_017459	AAG	2	6	325042	325047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802640
5520	NC_017459	GACC	2	8	325073	325080	25 %	0 %	25 %	50 %	385802640
5521	NC_017459	TAG	2	6	325088	325093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802640
5522	NC_017459	TAA	2	6	325100	325105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802640
5523	NC_017459	GTTT	2	8	325115	325122	0 %	75 %	25 %	0 %	385802640
5524	NC_017459	ACG	2	6	325126	325131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802640
5525	NC_017459	TCA	2	6	325145	325150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802640
5526	NC_017459	CAG	2	6	325173	325178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802640
5527	NC_017459	TAA	2	6	325182	325187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802640
5528	NC_017459	TG	3	6	325190	325195	0 %	50 %	50 %	0 %	385802640
5529	NC_017459	CGAT	2	8	325196	325203	25 %	25 %	25 %	25 %	385802640
5530	NC_017459	TAT	2	6	325215	325220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802640
5531	NC_017459	TGA	2	6	325258	325263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802640
5532	NC_017459	CG	3	6	325327	325332	0 %	0 %	50 %	50 %	385802640
5533	NC_017459	AAT	2	6	325378	325383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802640
5534	NC_017459	AAC	2	6	325414	325419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802640
5535	NC_017459	ATG	3	9	325637	325645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802641
5536	NC_017459	CGTC	2	8	325653	325660	0 %	25 %	25 %	50 %	385802641
5537	NC_017459	TGC	2	6	325690	325695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802641
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5539	NC_017459	GA	3	6	325820	325825	50 %	0 %	50 %	0 %	385802641
5540	NC_017459	CGA	2	6	325872	325877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802641
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5543	NC_017459	ATA	2	6	326440	326445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802642
5544	NC_017459	CCGAA	2	10	326449	326458	40 %	0 %	20 %	40 %	385802642
5545	NC_017459	GCA	2	6	326529	326534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802642
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5547	NC_017459	A	6	6	326591	326596	100 %	0 %	0 %	0 %	385802642
5548	NC_017459	TAT	3	9	326598	326606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802642
5549	NC_017459	TCG	2	6	326693	326698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802642
5550	NC_017459	CGA	2	6	326712	326717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802642
5551	NC_017459	CACC	2	8	326747	326754	25 %	0 %	0 %	75 %	385802642
5552	NC_017459	AC	3	6	326782	326787	50 %	0 %	0 %	50 %	385802642
5553	NC_017459	CAG	2	6	326854	326859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802642
5554	NC_017459	TAA	2	6	326876	326881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802642
5555	NC_017459	AAG	2	6	327184	327189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802642
5556	NC_017459	CGT	2	6	327288	327293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802642
5557	NC_017459	AGC	2	6	327407	327412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802642
5558	NC_017459	TCT	2	6	327431	327436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802642
5559	NC_017459	TGA	2	6	327476	327481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802642
5560	NC_017459	CGA	2	6	327488	327493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802642
5561	NC_017459	CA	3	6	327497	327502	50 %	0 %	0 %	50 %	385802642
5562	NC_017459	TTGA	2	8	327504	327511	25 %	50 %	25 %	0 %	385802642
5563	NC_017459	GAT	2	6	327519	327524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802642
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5566	NC_017459	TCC	2	6	327559	327564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802642
5567	NC_017459	TGA	3	9	327575	327583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802642
5568	NC_017459	AGATGA	2	12	327629	327640	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385802642
5569	NC_017459	TGA	2	6	327668	327673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802642
5570	NC_017459	GTG	2	6	327712	327717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802642
5571	NC_017459	TTG	2	6	327730	327735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802642
5572	NC_017459	A	6	6	327748	327753	100 %	0 %	0 %	0 %	385802642
5573	NC_017459	A	6	6	327813	327818	100 %	0 %	0 %	0 %	385802642
5574	NC_017459	CGC	2	6	328163	328168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802643
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5579	NC_017459	GAC	2	6	328385	328390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802643
5580	NC_017459	A	6	6	328395	328400	100 %	0 %	0 %	0 %	385802643
5581	NC_017459	CTCG	2	8	328401	328408	0 %	25 %	25 %	50 %	385802643
5582	NC_017459	ATT	2	6	328425	328430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802643
5583	NC_017459	AAG	2	6	328468	328473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802643
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5585	NC_017459	GAC	2	6	328575	328580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802643
5586	NC_017459	GCA	3	9	328596	328604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802643
5587	NC_017459	CAG	2	6	328669	328674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802643
5588	NC_017459	GTCG	2	8	328701	328708	0 %	25 %	50 %	25 %	385802643
5589	NC_017459	ATTG	2	8	328730	328737	25 %	50 %	25 %	0 %	385802643
5590	NC_017459	ACT	2	6	328777	328782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802643
5591	NC_017459	TTGT	2	8	328788	328795	0 %	75 %	25 %	0 %	385802643
5592	NC_017459	TAC	2	6	328841	328846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802643
5593	NC_017459	GAT	2	6	328881	328886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802643
5594	NC_017459	CCGC	2	8	329004	329011	0 %	0 %	25 %	75 %	385802643
5595	NC_017459	ACA	2	6	329022	329027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802643
5596	NC_017459	TCA	2	6	329032	329037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802643
5597	NC_017459	GCA	2	6	329040	329045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802643
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5599	NC_017459	CGA	2	6	329245	329250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802643
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5601	NC_017459	GAC	2	6	329264	329269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802643
5602	NC_017459	CACC	2	8	329274	329281	25 %	0 %	0 %	75 %	385802643
5603	NC_017459	ATCC	2	8	329283	329290	25 %	25 %	0 %	50 %	385802643
5604	NC_017459	GAT	2	6	329325	329330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802643
5605	NC_017459	GAC	2	6	329452	329457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802643
5606	NC_017459	GATT	3	12	329548	329559	25 %	50 %	25 %	0 %	385802643
5607	NC_017459	GCAAA	2	10	329571	329580	60 %	0 %	20 %	20 %	385802643
5608	NC_017459	CCG	2	6	329586	329591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802643
5609	NC_017459	CGAC	2	8	329715	329722	25 %	0 %	25 %	50 %	385802643
5610	NC_017459	GTT	2	6	329739	329744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802643
5611	NC_017459	GCT	2	6	329748	329753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802643
5612	NC_017459	A	6	6	329889	329894	100 %	0 %	0 %	0 %	385802643
5613	NC_017459	ATC	2	6	329923	329928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802643
5614	NC_017459	TTA	2	6	329989	329994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802643
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5616	NC_017459	GT	3	6	330102	330107	0 %	50 %	50 %	0 %	385802643
5617	NC_017459	CAG	2	6	330123	330128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802643
5618	NC_017459	TGCT	2	8	330136	330143	0 %	50 %	25 %	25 %	385802643
5619	NC_017459	TG	3	6	330175	330180	0 %	50 %	50 %	0 %	385802643
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5621	NC_017459	TTG	2	6	330292	330297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802643
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