MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017459	GCG	2	6	296976	296981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802615
5002	NC_017459	TTGGTC	2	12	296992	297003	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385802615
5003	NC_017459	CGA	2	6	297080	297085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802615
5004	NC_017459	TCGG	2	8	297118	297125	0 %	25 %	50 %	25 %	385802615
5005	NC_017459	ATT	2	6	297150	297155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802615
5006	NC_017459	GTC	2	6	297193	297198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802615
5007	NC_017459	TTG	2	6	297228	297233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802615
5008	NC_017459	TAT	2	6	297241	297246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802615
5009	NC_017459	CA	3	6	297293	297298	50 %	0 %	0 %	50 %	385802615
5010	NC_017459	TGT	2	6	297311	297316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802615
5011	NC_017459	ACA	2	6	297405	297410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802615
5012	NC_017459	CTG	2	6	297430	297435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802615
5013	NC_017459	TAT	2	6	297448	297453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802615
5014	NC_017459	TTA	2	6	297454	297459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802615
5015	NC_017459	CATA	2	8	297462	297469	50 %	25 %	0 %	25 %	385802615
5016	NC_017459	CAT	2	6	297714	297719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802616
5017	NC_017459	CAT	2	6	297729	297734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802616
5018	NC_017459	TGT	2	6	297743	297748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802616
5019	NC_017459	GAAC	2	8	297819	297826	50 %	0 %	25 %	25 %	385802616
5020	NC_017459	CAA	2	6	297903	297908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802616
5021	NC_017459	GAC	2	6	297983	297988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802616
5022	NC_017459	TGG	2	6	297998	298003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802616
5023	NC_017459	GA	4	8	298018	298025	50 %	0 %	50 %	0 %	385802616
5024	NC_017459	TAC	2	6	298026	298031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802616
5025	NC_017459	TA	3	6	298062	298067	50 %	50 %	0 %	0 %	385802616
5026	NC_017459	TGAAA	2	10	298198	298207	60 %	20 %	20 %	0 %	385802616
5027	NC_017459	CGA	2	6	298247	298252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802616
5028	NC_017459	TC	3	6	298275	298280	0 %	50 %	0 %	50 %	385802616
5029	NC_017459	AAG	2	6	298294	298299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802616
5030	NC_017459	TCA	3	9	298301	298309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802616
5031	NC_017459	GCG	2	6	298319	298324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802616
5032	NC_017459	CGA	2	6	298401	298406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802616
5033	NC_017459	TCG	2	6	298409	298414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802616
5034	NC_017459	GTC	2	6	298454	298459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802616
5035	NC_017459	TCA	2	6	299000	299005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802617
5036	NC_017459	TCAAC	2	10	299049	299058	40 %	20 %	0 %	40 %	385802617
5037	NC_017459	TTG	2	6	299124	299129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802617
5038	NC_017459	ACC	2	6	299143	299148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802617
5039	NC_017459	CG	3	6	299165	299170	0 %	0 %	50 %	50 %	385802617
5040	NC_017459	TTC	2	6	299179	299184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802617
5041	NC_017459	CTC	2	6	299275	299280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802617
5042	NC_017459	GTTC	2	8	299306	299313	0 %	50 %	25 %	25 %	385802617
5043	NC_017459	GTT	2	6	299324	299329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802617
5044	NC_017459	CA	3	6	299357	299362	50 %	0 %	0 %	50 %	385802618
5045	NC_017459	ATT	2	6	299381	299386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802618
5046	NC_017459	GA	3	6	299451	299456	50 %	0 %	50 %	0 %	385802618
5047	NC_017459	ATTC	2	8	299457	299464	25 %	50 %	0 %	25 %	385802618
5048	NC_017459	ACT	2	6	299503	299508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802618
5049	NC_017459	ATT	2	6	300000	300005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802619
5050	NC_017459	GCG	2	6	300110	300115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802619
5051	NC_017459	ATC	3	9	300259	300267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802619
5052	NC_017459	CAA	2	6	300324	300329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802619
5053	NC_017459	CCA	2	6	300362	300367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802619
5054	NC_017459	AGC	2	6	300413	300418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802619
5055	NC_017459	ATC	2	6	300485	300490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802619
5056	NC_017459	GAC	2	6	300667	300672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802619
5057	NC_017459	TCG	2	6	300727	300732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802619
5058	NC_017459	GCT	2	6	300797	300802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802619
5059	NC_017459	ACC	2	6	300835	300840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802619
5060	NC_017459	TGC	2	6	300913	300918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802619
5061	NC_017459	TTC	2	6	300919	300924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802619
5062	NC_017459	CAA	2	6	301005	301010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802619
5063	NC_017459	GCA	2	6	301031	301036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802619
5064	NC_017459	CTT	2	6	301059	301064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802619
5065	NC_017459	TCC	2	6	301087	301092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802619
5066	NC_017459	CGA	2	6	301107	301112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802619
5067	NC_017459	TCA	3	9	301154	301162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802619
5068	NC_017459	CAT	2	6	301188	301193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802619
5069	NC_017459	CCT	2	6	301268	301273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802619
5070	NC_017459	CGT	2	6	301296	301301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802619
5071	NC_017459	CGA	2	6	301302	301307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802619
5072	NC_017459	ATG	3	9	301553	301561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802620
5073	NC_017459	AGGATG	2	12	301562	301573	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385802620
5074	NC_017459	GTCC	2	8	301645	301652	0 %	25 %	25 %	50 %	385802620
5075	NC_017459	GAC	2	6	301682	301687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802620
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5079	NC_017459	TGT	2	6	301929	301934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802620
5080	NC_017459	TC	3	6	302052	302057	0 %	50 %	0 %	50 %	385802620
5081	NC_017459	TG	3	6	302106	302111	0 %	50 %	50 %	0 %	385802620
5082	NC_017459	TG	3	6	302136	302141	0 %	50 %	50 %	0 %	385802620
5083	NC_017459	TCA	2	6	302161	302166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802620
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5085	NC_017459	GA	3	6	302261	302266	50 %	0 %	50 %	0 %	385802620
5086	NC_017459	TC	3	6	302276	302281	0 %	50 %	0 %	50 %	385802620
5087	NC_017459	TC	3	6	302289	302294	0 %	50 %	0 %	50 %	385802620
5088	NC_017459	ATC	2	6	302346	302351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802620
5089	NC_017459	CAA	2	6	302354	302359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802620
5090	NC_017459	CATCTG	2	12	302366	302377	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385802620
5091	NC_017459	TGAT	2	8	302392	302399	25 %	50 %	25 %	0 %	385802620
5092	NC_017459	GCT	2	6	302413	302418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802620
5093	NC_017459	AAT	2	6	302484	302489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802620
5094	NC_017459	ACT	2	6	302637	302642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802620
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5096	NC_017459	GC	3	6	302666	302671	0 %	0 %	50 %	50 %	385802620
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5100	NC_017459	ATC	2	6	302764	302769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802620
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5102	NC_017459	CCG	2	6	302810	302815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802620
5103	NC_017459	TG	3	6	302836	302841	0 %	50 %	50 %	0 %	385802620
5104	NC_017459	GA	3	6	302875	302880	50 %	0 %	50 %	0 %	385802620
5105	NC_017459	AAT	2	6	302886	302891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802620
5106	NC_017459	GTC	2	6	302899	302904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802620
5107	NC_017459	AAT	2	6	302908	302913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802620
5108	NC_017459	TCA	2	6	302944	302949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802620
5109	NC_017459	ATC	2	6	302967	302972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802620
5110	NC_017459	TCG	2	6	302986	302991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802620
5111	NC_017459	CAG	2	6	302993	302998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802620
5112	NC_017459	GCA	2	6	303058	303063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802620
5113	NC_017459	CAC	2	6	303442	303447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802621
5114	NC_017459	GCA	2	6	303459	303464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802621
5115	NC_017459	ACGC	2	8	303469	303476	25 %	0 %	25 %	50 %	385802621
5116	NC_017459	CGA	2	6	303508	303513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802621
5117	NC_017459	ATCAT	2	10	303604	303613	40 %	40 %	0 %	20 %	385802621
5118	NC_017459	GAT	2	6	303618	303623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802621
5119	NC_017459	ATA	2	6	303688	303693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802621
5120	NC_017459	CAT	2	6	303726	303731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802621
5121	NC_017459	GTC	2	6	303759	303764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802621
5122	NC_017459	GGGC	2	8	303783	303790	0 %	0 %	75 %	25 %	385802621
5123	NC_017459	TGC	2	6	303791	303796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802621
5124	NC_017459	TGG	2	6	303878	303883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802621
5125	NC_017459	GCAA	2	8	303884	303891	50 %	0 %	25 %	25 %	385802621
5126	NC_017459	CTG	2	6	303892	303897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802621
5127	NC_017459	TGA	2	6	303914	303919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802621
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5129	NC_017459	GGAT	2	8	303961	303968	25 %	25 %	50 %	0 %	385802621
5130	NC_017459	TA	3	6	304036	304041	50 %	50 %	0 %	0 %	385802621
5131	NC_017459	GCA	2	6	304077	304082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802621
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5134	NC_017459	TGA	2	6	304212	304217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802621
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5137	NC_017459	CAG	3	9	304604	304612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802622
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5140	NC_017459	TGA	2	6	304743	304748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802622
5141	NC_017459	TAT	2	6	304749	304754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802622
5142	NC_017459	GATACC	2	12	304852	304863	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385802622
5143	NC_017459	TGA	2	6	304869	304874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802622
5144	NC_017459	TTG	2	6	304934	304939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802622
5145	NC_017459	CTA	2	6	304982	304987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802622
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5147	NC_017459	GGAA	2	8	305114	305121	50 %	0 %	50 %	0 %	385802622
5148	NC_017459	AAC	2	6	305148	305153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802622
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5152	NC_017459	GAA	2	6	305230	305235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802622
5153	NC_017459	TGC	2	6	305274	305279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802622
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5155	NC_017459	GAGT	2	8	305371	305378	25 %	25 %	50 %	0 %	385802622
5156	NC_017459	TATG	2	8	305477	305484	25 %	50 %	25 %	0 %	385802623
5157	NC_017459	TGG	2	6	305516	305521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802623
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5160	NC_017459	TGA	2	6	305651	305656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802623
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5162	NC_017459	GTT	2	6	305733	305738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802623
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5222	NC_017459	TCA	2	6	308666	308671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802626
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5233	NC_017459	TAT	2	6	309471	309476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802627
5234	NC_017459	CAA	2	6	309490	309495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802627
5235	NC_017459	CTT	2	6	309498	309503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802627
5236	NC_017459	ACC	2	6	309521	309526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802627
5237	NC_017459	GTG	2	6	309595	309600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802627
5238	NC_017459	CG	3	6	309623	309628	0 %	0 %	50 %	50 %	385802627
5239	NC_017459	CTTT	2	8	309652	309659	0 %	75 %	0 %	25 %	385802627
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5482	NC_017459	TGG	2	6	323244	323249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802640
5483	NC_017459	TGC	2	6	323293	323298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802640
5484	NC_017459	AT	3	6	323316	323321	50 %	50 %	0 %	0 %	385802640
5485	NC_017459	CAT	2	6	323322	323327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802640
5486	NC_017459	GAC	2	6	323358	323363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802640
5487	NC_017459	TCT	2	6	323382	323387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802640
5488	NC_017459	ACC	3	9	323407	323415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802640
5489	NC_017459	CCA	3	9	323441	323449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802640
5490	NC_017459	CGA	2	6	323478	323483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802640
5491	NC_017459	ATC	2	6	323596	323601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802640
5492	NC_017459	TGA	2	6	323639	323644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802640
5493	NC_017459	CAA	3	9	323760	323768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802640
5494	NC_017459	T	7	7	323816	323822	0 %	100 %	0 %	0 %	385802640
5495	NC_017459	TTG	2	6	324042	324047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802640
5496	NC_017459	ATTC	2	8	324048	324055	25 %	50 %	0 %	25 %	385802640
5497	NC_017459	AG	3	6	324088	324093	50 %	0 %	50 %	0 %	385802640
5498	NC_017459	CTT	2	6	324138	324143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802640
5499	NC_017459	CGC	2	6	324167	324172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802640
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