MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017459	TCGAA	2	10	270271	270280	40 %	20 %	20 %	20 %	385802589
4502	NC_017459	TCA	2	6	270288	270293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802589
4503	NC_017459	TGT	2	6	270322	270327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802589
4504	NC_017459	TCAG	2	8	270329	270336	25 %	25 %	25 %	25 %	385802589
4505	NC_017459	GTG	2	6	270363	270368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802589
4506	NC_017459	TTCA	2	8	270412	270419	25 %	50 %	0 %	25 %	385802589
4507	NC_017459	ACA	3	9	270509	270517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802589
4508	NC_017459	CCAG	2	8	270541	270548	25 %	0 %	25 %	50 %	385802589
4509	NC_017459	TTG	2	6	270567	270572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802589
4510	NC_017459	GGT	2	6	270596	270601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802589
4511	NC_017459	ATGCAA	2	12	270654	270665	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385802589
4512	NC_017459	GAT	2	6	270698	270703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802589
4513	NC_017459	GAC	2	6	270733	270738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802589
4514	NC_017459	AAC	2	6	270739	270744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802589
4515	NC_017459	TACGA	2	10	270810	270819	40 %	20 %	20 %	20 %	385802589
4516	NC_017459	AC	3	6	270834	270839	50 %	0 %	0 %	50 %	385802589
4517	NC_017459	GT	3	6	270864	270869	0 %	50 %	50 %	0 %	385802589
4518	NC_017459	CTG	2	6	270876	270881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802589
4519	NC_017459	CGC	2	6	270919	270924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802589
4520	NC_017459	GGC	2	6	270944	270949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802589
4521	NC_017459	TCG	2	6	270989	270994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4522	NC_017459	TTC	2	6	270996	271001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802590
4523	NC_017459	TC	3	6	271000	271005	0 %	50 %	0 %	50 %	385802590
4524	NC_017459	GTT	2	6	271043	271048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802590
4525	NC_017459	TCG	2	6	271078	271083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4526	NC_017459	TTG	2	6	271123	271128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802590
4527	NC_017459	TGA	3	9	271154	271162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802590
4528	NC_017459	ACG	2	6	271215	271220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4529	NC_017459	CTG	2	6	271288	271293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4530	NC_017459	GAA	2	6	271305	271310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802590
4531	NC_017459	ACGG	2	8	271312	271319	25 %	0 %	50 %	25 %	385802590
4532	NC_017459	CTG	2	6	271369	271374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4533	NC_017459	CAA	2	6	271407	271412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802590
4534	NC_017459	CTG	2	6	271468	271473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4535	NC_017459	CTGTGA	2	12	271480	271491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385802590
4536	NC_017459	CTG	2	6	271498	271503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4537	NC_017459	CA	3	6	271541	271546	50 %	0 %	0 %	50 %	385802590
4538	NC_017459	TGA	2	6	271573	271578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802590
4539	NC_017459	TTC	2	6	271590	271595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802590
4540	NC_017459	TTG	2	6	271642	271647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802590
4541	NC_017459	ATT	2	6	271744	271749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802590
4542	NC_017459	GAA	3	9	271773	271781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802590
4543	NC_017459	TCC	2	6	271793	271798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802590
4544	NC_017459	ACC	2	6	271835	271840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802590
4545	NC_017459	TGC	2	6	271850	271855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4546	NC_017459	GCA	2	6	271860	271865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4547	NC_017459	CGG	2	6	271897	271902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802590
4548	NC_017459	ATT	2	6	271971	271976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802590
4549	NC_017459	TTC	3	9	271978	271986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802590
4550	NC_017459	ACGC	2	8	272002	272009	25 %	0 %	25 %	50 %	385802590
4551	NC_017459	GTG	2	6	272014	272019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802590
4552	NC_017459	GA	3	6	272023	272028	50 %	0 %	50 %	0 %	385802590
4553	NC_017459	AAAC	2	8	272065	272072	75 %	0 %	0 %	25 %	385802590
4554	NC_017459	CTG	2	6	272080	272085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4555	NC_017459	GATA	2	8	272093	272100	50 %	25 %	25 %	0 %	385802590
4556	NC_017459	CGA	2	6	272119	272124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4557	NC_017459	TCGG	2	8	272155	272162	0 %	25 %	50 %	25 %	385802590
4558	NC_017459	CGGA	2	8	272168	272175	25 %	0 %	50 %	25 %	385802590
4559	NC_017459	TGT	2	6	272222	272227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802590
4560	NC_017459	CCT	2	6	272228	272233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802590
4561	NC_017459	GCT	2	6	272247	272252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4562	NC_017459	GAA	2	6	272283	272288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802590
4563	NC_017459	GGT	2	6	272346	272351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802590
4564	NC_017459	GATG	2	8	272416	272423	25 %	25 %	50 %	0 %	385802590
4565	NC_017459	GACA	2	8	272444	272451	50 %	0 %	25 %	25 %	385802590
4566	NC_017459	ACA	2	6	272495	272500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802590
4567	NC_017459	GGT	2	6	272505	272510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802590
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4569	NC_017459	ATT	2	6	272610	272615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802590
4570	NC_017459	ACC	2	6	272690	272695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802590
4571	NC_017459	GGCTG	2	10	272696	272705	0 %	20 %	60 %	20 %	385802590
4572	NC_017459	CTG	2	6	272707	272712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
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4579	NC_017459	TTG	2	6	273247	273252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802590
4580	NC_017459	CGT	2	6	273270	273275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802590
4581	NC_017459	TGA	2	6	273314	273319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802590
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4584	NC_017459	AAC	2	6	273483	273488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802591
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4586	NC_017459	ATC	2	6	273576	273581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802591
4587	NC_017459	ATG	2	6	273692	273697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802591
4588	NC_017459	TCG	2	6	273749	273754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802591
4589	NC_017459	GCG	2	6	273779	273784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802591
4590	NC_017459	ATT	2	6	273980	273985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802592
4591	NC_017459	TTCCG	2	10	274136	274145	0 %	40 %	20 %	40 %	385802592
4592	NC_017459	ATC	2	6	274236	274241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802592
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4596	NC_017459	TCGG	2	8	274278	274285	0 %	25 %	50 %	25 %	385802592
4597	NC_017459	CAA	2	6	274286	274291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802592
4598	NC_017459	CT	3	6	274383	274388	0 %	50 %	0 %	50 %	385802592
4599	NC_017459	TGAG	2	8	274421	274428	25 %	25 %	50 %	0 %	385802592
4600	NC_017459	TCA	2	6	274462	274467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802592
4601	NC_017459	AGCC	2	8	274489	274496	25 %	0 %	25 %	50 %	385802592
4602	NC_017459	TTC	2	6	274500	274505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802592
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4604	NC_017459	CAT	2	6	274577	274582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802592
4605	NC_017459	ATC	2	6	274653	274658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802592
4606	NC_017459	CTT	2	6	274664	274669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802592
4607	NC_017459	AAG	2	6	274684	274689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802592
4608	NC_017459	AGA	2	6	274724	274729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802592
4609	NC_017459	ATG	2	6	274750	274755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802592
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4611	NC_017459	ATC	2	6	274875	274880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802592
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4617	NC_017459	CTC	2	6	275229	275234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802592
4618	NC_017459	CGA	2	6	275276	275281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802592
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4621	NC_017459	AATC	2	8	275598	275605	50 %	25 %	0 %	25 %	385802593
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4743	NC_017459	TTA	2	6	281315	281320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529167402
4744	NC_017459	TGA	2	6	281373	281378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529167402
4745	NC_017459	TTA	2	6	281399	281404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529167402
4746	NC_017459	TCA	2	6	281424	281429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529167402
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4982	NC_017459	ATT	2	6	295443	295448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802613
4983	NC_017459	GCG	2	6	295486	295491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802613
4984	NC_017459	ATA	2	6	295578	295583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802613
4985	NC_017459	TGA	3	9	295685	295693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802613
4986	NC_017459	CTGCGT	2	12	295778	295789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802613
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4988	NC_017459	TCA	2	6	295915	295920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802613
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4990	NC_017459	AATGC	2	10	296245	296254	40 %	20 %	20 %	20 %	385802614
4991	NC_017459	CCA	2	6	296272	296277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802614
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