MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 32872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017452	ATG	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265030
2	NC_017452	GGT	2	6	37	42	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265030
3	NC_017452	TTA	2	6	100	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265030
4	NC_017452	TGG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265030
5	NC_017452	AAG	2	6	182	187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265030
6	NC_017452	TGC	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265030
7	NC_017452	CAG	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265030
8	NC_017452	CAA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265030
9	NC_017452	ACC	2	6	603	608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386265030
10	NC_017452	ACA	2	6	651	656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265030
11	NC_017452	GAT	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265030
12	NC_017452	CAA	2	6	712	717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265030
13	NC_017452	TAA	2	6	768	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265030
14	NC_017452	ATTT	2	8	883	890	25 %	75 %	0 %	0 %	386265030
15	NC_017452	ATT	2	6	1037	1042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265030
16	NC_017452	GAA	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265030
17	NC_017452	TGG	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265030
18	NC_017452	TTA	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265030
19	NC_017452	TGAT	2	8	1370	1377	25 %	50 %	25 %	0 %	386265030
20	NC_017452	TAA	2	6	1398	1403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265030
21	NC_017452	A	7	7	1402	1408	100 %	0 %	0 %	0 %	386265030
22	NC_017452	AGA	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265030
23	NC_017452	CGT	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265030
24	NC_017452	CTT	2	6	1571	1576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265030
25	NC_017452	CAA	2	6	1663	1668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265030
26	NC_017452	GAA	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265030
27	NC_017452	AAAAAC	2	12	1679	1690	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386265030
28	NC_017452	AAC	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265030
29	NC_017452	CTG	2	6	1826	1831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265030
30	NC_017452	ATT	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265030
31	NC_017452	A	6	6	1858	1863	100 %	0 %	0 %	0 %	386265030
32	NC_017452	GTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265031
33	NC_017452	TA	3	6	2181	2186	50 %	50 %	0 %	0 %	386265031
34	NC_017452	A	6	6	2198	2203	100 %	0 %	0 %	0 %	386265031
35	NC_017452	TAAC	2	8	2241	2248	50 %	25 %	0 %	25 %	386265031
36	NC_017452	CTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265031
37	NC_017452	GGT	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265031
38	NC_017452	GTG	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265031
39	NC_017452	CA	3	6	2357	2362	50 %	0 %	0 %	50 %	386265031
40	NC_017452	CGT	3	9	2610	2618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265032
41	NC_017452	TTC	2	6	2638	2643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265032
42	NC_017452	TTA	2	6	2680	2685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265032
43	NC_017452	A	6	6	2706	2711	100 %	0 %	0 %	0 %	386265032
44	NC_017452	AATC	2	8	2722	2729	50 %	25 %	0 %	25 %	386265032
45	NC_017452	ACGT	2	8	2806	2813	25 %	25 %	25 %	25 %	386265032
46	NC_017452	TCG	2	6	2834	2839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265032
47	NC_017452	TGG	2	6	2843	2848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265032
48	NC_017452	CGT	2	6	2886	2891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265032
49	NC_017452	AGC	2	6	2921	2926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265032
50	NC_017452	GTG	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265032
51	NC_017452	ATA	2	6	2989	2994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265032
52	NC_017452	GCA	2	6	3000	3005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265032
53	NC_017452	A	6	6	3009	3014	100 %	0 %	0 %	0 %	386265032
54	NC_017452	TAA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265032
55	NC_017452	TAA	2	6	3072	3077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265032
56	NC_017452	TAA	2	6	3153	3158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265033
57	NC_017452	ACT	4	12	3227	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265033
58	NC_017452	GCA	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265033
59	NC_017452	TGGA	2	8	3311	3318	25 %	25 %	50 %	0 %	386265033
60	NC_017452	ACAAGA	2	12	3319	3330	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386265033
61	NC_017452	CAA	2	6	3357	3362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265033
62	NC_017452	TCTGG	2	10	3369	3378	0 %	40 %	40 %	20 %	386265033
63	NC_017452	CAA	2	6	3386	3391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265033
64	NC_017452	TGG	2	6	3505	3510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265033
65	NC_017452	CTT	2	6	3607	3612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265033
66	NC_017452	GTT	2	6	3617	3622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265033
67	NC_017452	AGA	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265033
68	NC_017452	TTGAT	2	10	3705	3714	20 %	60 %	20 %	0 %	386265033
69	NC_017452	GAA	2	6	3770	3775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265033
70	NC_017452	GAA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265033
71	NC_017452	TTG	2	6	3822	3827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265033
72	NC_017452	AGA	2	6	3847	3852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265033
73	NC_017452	GAA	3	9	3890	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265033
74	NC_017452	ATT	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265033
75	NC_017452	GTT	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265033
76	NC_017452	TACC	2	8	4010	4017	25 %	25 %	0 %	50 %	386265033
77	NC_017452	TGA	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265033
78	NC_017452	TTC	2	6	4154	4159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265033
79	NC_017452	TCGTA	2	10	4234	4243	20 %	40 %	20 %	20 %	386265033
80	NC_017452	TAA	2	6	4255	4260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265033
81	NC_017452	GAA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265033
82	NC_017452	AAG	2	6	4275	4280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265033
83	NC_017452	GCT	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265033
84	NC_017452	ACT	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265033
85	NC_017452	A	6	6	4437	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	386265033
86	NC_017452	AAG	2	6	4470	4475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265033
87	NC_017452	CA	3	6	4493	4498	50 %	0 %	0 %	50 %	386265033
88	NC_017452	ATT	2	6	4520	4525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265033
89	NC_017452	TTG	2	6	4557	4562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265033
90	NC_017452	ATG	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265033
91	NC_017452	TGG	2	6	4678	4683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265033
92	NC_017452	TGT	2	6	4702	4707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265033
93	NC_017452	GGT	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265033
94	NC_017452	AAC	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265033
95	NC_017452	AGT	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265033
96	NC_017452	ATG	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265033
97	NC_017452	TGC	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265033
98	NC_017452	AGC	2	6	4951	4956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265033
99	NC_017452	AGTTGA	2	12	4999	5010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265033
100	NC_017452	CGT	3	9	5054	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265033
101	NC_017452	AAG	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265033
102	NC_017452	GAAT	2	8	5086	5093	50 %	25 %	25 %	0 %	386265033
103	NC_017452	GTT	2	6	5096	5101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265033
104	NC_017452	CAT	2	6	5178	5183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265033
105	NC_017452	CAA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265033
106	NC_017452	GGC	2	6	5227	5232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386265033
107	NC_017452	A	6	6	5252	5257	100 %	0 %	0 %	0 %	386265033
108	NC_017452	AAC	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265034
109	NC_017452	CAG	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265034
110	NC_017452	GGT	2	6	5445	5450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265034
111	NC_017452	AGA	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265034
112	NC_017452	ATACG	2	10	5531	5540	40 %	20 %	20 %	20 %	386265034
113	NC_017452	ATGG	2	8	5619	5626	25 %	25 %	50 %	0 %	386265034
114	NC_017452	TAG	3	9	5635	5643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265034
115	NC_017452	TTA	2	6	5685	5690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265034
116	NC_017452	CAT	2	6	5714	5719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265034
117	NC_017452	TTA	2	6	5760	5765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265034
118	NC_017452	TAG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265034
119	NC_017452	GAA	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265034
120	NC_017452	A	6	6	5884	5889	100 %	0 %	0 %	0 %	386265034
121	NC_017452	CCAGAA	2	12	5925	5936	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386265034
122	NC_017452	TCT	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265034
123	NC_017452	AGT	2	6	6002	6007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265034
124	NC_017452	ATC	2	6	6030	6035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265034
125	NC_017452	TGA	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265034
126	NC_017452	TCG	2	6	6058	6063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265034
127	NC_017452	ACT	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265034
128	NC_017452	ATT	2	6	6155	6160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265034
129	NC_017452	GAA	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265034
130	NC_017452	CACAC	2	10	6221	6230	40 %	0 %	0 %	60 %	386265034
131	NC_017452	TAT	2	6	6256	6261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265034
132	NC_017452	GGT	2	6	6273	6278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265034
133	NC_017452	TTC	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265034
134	NC_017452	ACA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265034
135	NC_017452	GTT	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265034
136	NC_017452	ATC	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265034
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138	NC_017452	CAA	2	6	6678	6683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265035
139	NC_017452	TTC	2	6	6685	6690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265035
140	NC_017452	AAT	2	6	6795	6800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265035
141	NC_017452	AC	3	6	6822	6827	50 %	0 %	0 %	50 %	386265035
142	NC_017452	TAC	2	6	6841	6846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265035
143	NC_017452	AT	3	6	6863	6868	50 %	50 %	0 %	0 %	386265035
144	NC_017452	ATA	2	6	6926	6931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265035
145	NC_017452	T	6	6	6995	7000	0 %	100 %	0 %	0 %	386265036
146	NC_017452	TAT	2	6	7022	7027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265036
147	NC_017452	GTT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265036
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151	NC_017452	GTT	2	6	7136	7141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265036
152	NC_017452	CAT	2	6	7166	7171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265036
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154	NC_017452	TTA	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265037
155	NC_017452	TGC	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265037
156	NC_017452	AGTTA	2	10	7397	7406	40 %	40 %	20 %	0 %	386265037
157	NC_017452	CAA	2	6	7408	7413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265037
158	NC_017452	TCG	2	6	7418	7423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265037
159	NC_017452	TGC	2	6	7430	7435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265037
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162	NC_017452	GAA	2	6	7553	7558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265037
163	NC_017452	A	7	7	7557	7563	100 %	0 %	0 %	0 %	386265037
164	NC_017452	T	6	6	7583	7588	0 %	100 %	0 %	0 %	386265037
165	NC_017452	ATA	2	6	7659	7664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265037
166	NC_017452	ATT	2	6	7671	7676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265037
167	NC_017452	TTTGA	2	10	7687	7696	20 %	60 %	20 %	0 %	386265038
168	NC_017452	TAT	2	6	7818	7823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265038
169	NC_017452	CTT	2	6	7848	7853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265038
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171	NC_017452	ATTGAT	2	12	7981	7992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386265038
172	NC_017452	GCAAA	2	10	7993	8002	60 %	0 %	20 %	20 %	386265038
173	NC_017452	AAT	2	6	8005	8010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265038
174	NC_017452	TTA	2	6	8021	8026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265038
175	NC_017452	TCA	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265038
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179	NC_017452	TTGAT	2	10	8705	8714	20 %	60 %	20 %	0 %	386265039
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184	NC_017452	T	6	6	8903	8908	0 %	100 %	0 %	0 %	386265039
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220	NC_017452	GAAA	2	8	10645	10652	75 %	0 %	25 %	0 %	386265042
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240	NC_017452	TA	3	6	12027	12032	50 %	50 %	0 %	0 %	386265044
241	NC_017452	TAA	2	6	12038	12043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265044
242	NC_017452	TCG	2	6	12070	12075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265044
243	NC_017452	TCA	2	6	12148	12153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265044
244	NC_017452	CGA	2	6	12158	12163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265044
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246	NC_017452	CCAC	2	8	12203	12210	25 %	0 %	0 %	75 %	386265044
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248	NC_017452	A	6	6	12283	12288	100 %	0 %	0 %	0 %	386265044
249	NC_017452	AT	3	6	12331	12336	50 %	50 %	0 %	0 %	386265044
250	NC_017452	TTC	2	6	12402	12407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265044
251	NC_017452	ATA	2	6	12478	12483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265044
252	NC_017452	CAA	2	6	12583	12588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265045
253	NC_017452	ATT	2	6	12598	12603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265045
254	NC_017452	CAA	2	6	12628	12633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265045
255	NC_017452	ATT	2	6	12651	12656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265045
256	NC_017452	GAT	2	6	12658	12663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265045
257	NC_017452	CCATT	2	10	12671	12680	20 %	40 %	0 %	40 %	386265045
258	NC_017452	AAG	2	6	12698	12703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265045
259	NC_017452	ATTT	2	8	12754	12761	25 %	75 %	0 %	0 %	386265045
260	NC_017452	AGA	2	6	12771	12776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265045
261	NC_017452	TCG	2	6	12777	12782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265045
262	NC_017452	TGA	2	6	12825	12830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265045
263	NC_017452	AGA	2	6	12873	12878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265045
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265	NC_017452	GACA	2	8	13029	13036	50 %	0 %	25 %	25 %	386265045
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290	NC_017452	TGA	2	6	14391	14396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265045
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383	NC_017452	A	6	6	20308	20313	100 %	0 %	0 %	0 %	386265050
384	NC_017452	ATT	2	6	20328	20333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265050
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