MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 32872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017452	ATC	2	6	26281	26286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265056
502	NC_017452	TGG	2	6	26306	26311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265056
503	NC_017452	TTA	2	6	26325	26330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265056
504	NC_017452	TGG	2	6	26391	26396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265056
505	NC_017452	GAT	2	6	26400	26405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265056
506	NC_017452	GAA	3	9	26544	26552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265056
507	NC_017452	TC	3	6	26625	26630	0 %	50 %	0 %	50 %	386265056
508	NC_017452	TGA	3	9	26651	26659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265056
509	NC_017452	AAAGC	2	10	26767	26776	60 %	0 %	20 %	20 %	386265056
510	NC_017452	CAG	2	6	26806	26811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265056
511	NC_017452	A	6	6	26846	26851	100 %	0 %	0 %	0 %	386265056
512	NC_017452	AGC	2	6	26879	26884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265056
513	NC_017452	TTA	2	6	26892	26897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265056
514	NC_017452	CG	3	6	27111	27116	0 %	0 %	50 %	50 %	386265057
515	NC_017452	TGC	2	6	27129	27134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265057
516	NC_017452	GAC	2	6	27169	27174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265057
517	NC_017452	TGGA	2	8	27194	27201	25 %	25 %	50 %	0 %	386265057
518	NC_017452	ATT	2	6	27255	27260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265057
519	NC_017452	TAA	2	6	27279	27284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265057
520	NC_017452	AGA	2	6	27288	27293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265057
521	NC_017452	CAA	2	6	27322	27327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265057
522	NC_017452	A	6	6	27537	27542	100 %	0 %	0 %	0 %	386265058
523	NC_017452	AAT	2	6	27603	27608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265058
524	NC_017452	TGA	2	6	27663	27668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265058
525	NC_017452	AAG	2	6	27673	27678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265058
526	NC_017452	A	6	6	27679	27684	100 %	0 %	0 %	0 %	386265058
527	NC_017452	GA	3	6	27705	27710	50 %	0 %	50 %	0 %	386265058
528	NC_017452	TAAA	2	8	27824	27831	75 %	25 %	0 %	0 %	386265058
529	NC_017452	A	6	6	27829	27834	100 %	0 %	0 %	0 %	386265058
530	NC_017452	AT	3	6	27905	27910	50 %	50 %	0 %	0 %	386265058
531	NC_017452	A	6	6	27925	27930	100 %	0 %	0 %	0 %	386265058
532	NC_017452	TTA	2	6	27994	27999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265058
533	NC_017452	ATC	2	6	28030	28035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265058
534	NC_017452	GCAA	2	8	28059	28066	50 %	0 %	25 %	25 %	386265058
535	NC_017452	ATT	2	6	28082	28087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265058
536	NC_017452	A	6	6	28138	28143	100 %	0 %	0 %	0 %	386265058
537	NC_017452	CATC	2	8	28207	28214	25 %	25 %	0 %	50 %	386265058
538	NC_017452	TAG	2	6	28215	28220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265058
539	NC_017452	TAAA	2	8	28285	28292	75 %	25 %	0 %	0 %	386265058
540	NC_017452	AGA	2	6	28483	28488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265059
541	NC_017452	GCT	2	6	28493	28498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265059
542	NC_017452	GC	3	6	28534	28539	0 %	0 %	50 %	50 %	386265059
543	NC_017452	TGG	2	6	28548	28553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265059
544	NC_017452	TAC	2	6	28572	28577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265059
545	NC_017452	GAA	2	6	28586	28591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265059
546	NC_017452	CAT	2	6	28597	28602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265059
547	NC_017452	GT	3	6	28689	28694	0 %	50 %	50 %	0 %	386265059
548	NC_017452	TGG	2	6	28696	28701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265059
549	NC_017452	GAA	2	6	28703	28708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265059
550	NC_017452	AAG	2	6	28749	28754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265059
551	NC_017452	TTG	2	6	28816	28821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265059
552	NC_017452	CGG	2	6	28831	28836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386265059
553	NC_017452	AAG	2	6	28926	28931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265059
554	NC_017452	GAA	2	6	28949	28954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265059
555	NC_017452	CAC	2	6	29014	29019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386265059
556	NC_017452	A	6	6	29064	29069	100 %	0 %	0 %	0 %	386265059
557	NC_017452	ATT	2	6	29215	29220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265059
558	NC_017452	A	6	6	29252	29257	100 %	0 %	0 %	0 %	386265059
559	NC_017452	ATT	2	6	29284	29289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265059
560	NC_017452	ATT	2	6	29300	29305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265059
561	NC_017452	TTGG	2	8	29352	29359	0 %	50 %	50 %	0 %	386265059
562	NC_017452	GTT	2	6	29383	29388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265059
563	NC_017452	CAAATC	2	12	29451	29462	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386265059
564	NC_017452	GTG	2	6	29531	29536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265059
565	NC_017452	ACT	2	6	29649	29654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265059
566	NC_017452	ACTGG	2	10	29712	29721	20 %	20 %	40 %	20 %	386265059
567	NC_017452	ACT	2	6	29744	29749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265059
568	NC_017452	ATG	2	6	29751	29756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265059
569	NC_017452	TTG	2	6	29920	29925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265060
570	NC_017452	GT	4	8	29930	29937	0 %	50 %	50 %	0 %	386265060
571	NC_017452	AATA	2	8	29938	29945	75 %	25 %	0 %	0 %	386265060
572	NC_017452	T	7	7	30029	30035	0 %	100 %	0 %	0 %	386265060
573	NC_017452	ATC	2	6	30061	30066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265060
574	NC_017452	TTG	2	6	30145	30150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265060
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576	NC_017452	CGA	2	6	30212	30217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265060
577	NC_017452	GAA	2	6	30277	30282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265060
578	NC_017452	TCT	2	6	30425	30430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265060
579	NC_017452	T	6	6	30439	30444	0 %	100 %	0 %	0 %	386265060
580	NC_017452	TG	3	6	30551	30556	0 %	50 %	50 %	0 %	386265061
581	NC_017452	ATT	2	6	30595	30600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265061
582	NC_017452	CA	4	8	30602	30609	50 %	0 %	0 %	50 %	386265061
583	NC_017452	GAT	2	6	30777	30782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265061
584	NC_017452	TAA	2	6	30816	30821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265061
585	NC_017452	GCT	2	6	30870	30875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265061
586	NC_017452	TGA	2	6	31034	31039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265061
587	NC_017452	TCA	2	6	31058	31063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265061
588	NC_017452	T	6	6	31111	31116	0 %	100 %	0 %	0 %	386265061
589	NC_017452	TAA	2	6	31288	31293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265061
590	NC_017452	TCA	2	6	31304	31309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265061
591	NC_017452	CGA	2	6	31329	31334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265061
592	NC_017452	TGG	2	6	32463	32468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265062
593	NC_017452	ACG	2	6	32604	32609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265062
594	NC_017452	AAC	2	6	32694	32699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265062
595	NC_017452	GGT	2	6	32737	32742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265062
596	NC_017452	CTT	2	6	32840	32845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265062
597	NC_017452	GCA	2	6	32849	32854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265062
598	NC_017452	CAT	2	6	32876	32881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265062
599	NC_017452	TGT	2	6	32918	32923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265062
600	NC_017452	AC	3	6	32939	32944	50 %	0 %	0 %	50 %	386265062
601	NC_017452	GCATC	2	10	33005	33014	20 %	20 %	20 %	40 %	386265062
602	NC_017452	ATGG	2	8	33047	33054	25 %	25 %	50 %	0 %	386265062
603	NC_017452	GAT	2	6	33101	33106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265062
604	NC_017452	CGC	2	6	33189	33194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386265062
605	NC_017452	T	7	7	33270	33276	0 %	100 %	0 %	0 %	386265062
606	NC_017452	TTTC	2	8	33351	33358	0 %	75 %	0 %	25 %	386265063
607	NC_017452	GA	3	6	33360	33365	50 %	0 %	50 %	0 %	386265063
608	NC_017452	ATA	2	6	33385	33390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265063
609	NC_017452	TTTA	2	8	33472	33479	25 %	75 %	0 %	0 %	386265063
610	NC_017452	TCAAT	2	10	33540	33549	40 %	40 %	0 %	20 %	386265063
611	NC_017452	TG	3	6	33565	33570	0 %	50 %	50 %	0 %	386265063
612	NC_017452	CAT	2	6	33591	33596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265063
613	NC_017452	ATG	2	6	33667	33672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265063
614	NC_017452	AT	3	6	33680	33685	50 %	50 %	0 %	0 %	386265063
615	NC_017452	TAA	2	6	33753	33758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265063
616	NC_017452	TAA	2	6	33780	33785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265063
617	NC_017452	TCT	2	6	33797	33802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265063
618	NC_017452	ATC	2	6	33835	33840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265063
619	NC_017452	TC	3	6	34033	34038	0 %	50 %	0 %	50 %	386265063
620	NC_017452	TTTCT	2	10	34079	34088	0 %	80 %	0 %	20 %	386265063
621	NC_017452	TCA	2	6	34103	34108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265063
622	NC_017452	TGA	2	6	34297	34302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265063
623	NC_017452	TGG	2	6	34412	34417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265064
624	NC_017452	T	6	6	34444	34449	0 %	100 %	0 %	0 %	386265064
625	NC_017452	CAG	2	6	34471	34476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265064
626	NC_017452	T	6	6	34508	34513	0 %	100 %	0 %	0 %	386265064
627	NC_017452	ATA	2	6	34551	34556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265064
628	NC_017452	TCT	2	6	34559	34564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265064
629	NC_017452	TGGA	2	8	34573	34580	25 %	25 %	50 %	0 %	386265064
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631	NC_017452	T	8	8	34674	34681	0 %	100 %	0 %	0 %	386265064
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745	NC_017452	A	6	6	41631	41636	100 %	0 %	0 %	0 %	386265074
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