MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 plasmid unnamed

Total Repeats: 481

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017373	CAA	2	6	210	215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
2	NC_017373	A	6	6	262	267	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
3	NC_017373	GAA	2	6	268	273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221475
4	NC_017373	AGA	2	6	291	296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221475
5	NC_017373	CAA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
6	NC_017373	ACC	2	6	322	327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221475
7	NC_017373	ATT	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221475
8	NC_017373	A	6	6	570	575	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
9	NC_017373	ACA	2	6	584	589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
10	NC_017373	AG	3	6	616	621	50 %	0 %	50 %	0 %	385221475
11	NC_017373	CTT	2	6	785	790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221475
12	NC_017373	CAA	2	6	808	813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
13	NC_017373	A	6	6	1015	1020	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
14	NC_017373	ACAA	2	8	1115	1122	75 %	0 %	0 %	25 %	385221475
15	NC_017373	TTGAA	2	10	1214	1223	40 %	40 %	20 %	0 %	385221475
16	NC_017373	CAA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
17	NC_017373	AAC	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
18	NC_017373	CAAC	2	8	1319	1326	50 %	0 %	0 %	50 %	385221475
19	NC_017373	CAA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
20	NC_017373	A	6	6	1402	1407	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
21	NC_017373	AGA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221475
22	NC_017373	C	6	6	1432	1437	0 %	0 %	0 %	100 %	385221475
23	NC_017373	TGA	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221475
24	NC_017373	CAA	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
25	NC_017373	TTG	3	9	1881	1889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221476
26	NC_017373	AT	3	6	1891	1896	50 %	50 %	0 %	0 %	385221476
27	NC_017373	ATC	2	6	1903	1908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221476
28	NC_017373	AC	3	6	2139	2144	50 %	0 %	0 %	50 %	385221476
29	NC_017373	A	6	6	2164	2169	100 %	0 %	0 %	0 %	385221476
30	NC_017373	TTG	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221476
31	NC_017373	AACA	2	8	2211	2218	75 %	0 %	0 %	25 %	385221476
32	NC_017373	A	7	7	2236	2242	100 %	0 %	0 %	0 %	385221476
33	NC_017373	TCA	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221476
34	NC_017373	T	7	7	2273	2279	0 %	100 %	0 %	0 %	385221476
35	NC_017373	CTA	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221477
36	NC_017373	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221477
37	NC_017373	T	7	7	2390	2396	0 %	100 %	0 %	0 %	385221477
38	NC_017373	CAA	2	6	2433	2438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221477
39	NC_017373	ACC	2	6	2465	2470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221477
40	NC_017373	AAAG	2	8	2472	2479	75 %	0 %	25 %	0 %	385221477
41	NC_017373	A	6	6	2487	2492	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
42	NC_017373	CAA	2	6	2565	2570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221477
43	NC_017373	AG	3	6	2699	2704	50 %	0 %	50 %	0 %	385221477
44	NC_017373	TGA	3	9	2705	2713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221477
45	NC_017373	TGA	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221477
46	NC_017373	ATG	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221477
47	NC_017373	C	6	6	2774	2779	0 %	0 %	0 %	100 %	385221477
48	NC_017373	TG	3	6	2889	2894	0 %	50 %	50 %	0 %	385221477
49	NC_017373	A	6	6	3016	3021	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
50	NC_017373	A	7	7	3068	3074	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
51	NC_017373	CAAA	2	8	3131	3138	75 %	0 %	0 %	25 %	385221477
52	NC_017373	AGG	2	6	3152	3157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385221477
53	NC_017373	TCA	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221477
54	NC_017373	A	6	6	3214	3219	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
55	NC_017373	TAA	2	6	3347	3352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221477
56	NC_017373	ATC	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221477
57	NC_017373	ACAA	2	8	3400	3407	75 %	0 %	0 %	25 %	385221477
58	NC_017373	A	6	6	3795	3800	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
59	NC_017373	AAAAT	2	10	3894	3903	80 %	20 %	0 %	0 %	385221478
60	NC_017373	AGAA	2	8	3943	3950	75 %	0 %	25 %	0 %	385221478
61	NC_017373	AG	4	8	3996	4003	50 %	0 %	50 %	0 %	385221478
62	NC_017373	AGAA	2	8	4044	4051	75 %	0 %	25 %	0 %	385221478
63	NC_017373	AG	3	6	4060	4065	50 %	0 %	50 %	0 %	385221478
64	NC_017373	AAC	2	6	4072	4077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221478
65	NC_017373	AG	3	6	4100	4105	50 %	0 %	50 %	0 %	385221478
66	NC_017373	A	6	6	4140	4145	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
67	NC_017373	A	7	7	4148	4154	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
68	NC_017373	TAT	2	6	4195	4200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221478
69	NC_017373	GA	3	6	4217	4222	50 %	0 %	50 %	0 %	385221478
70	NC_017373	AGAA	2	8	4257	4264	75 %	0 %	25 %	0 %	385221478
71	NC_017373	A	6	6	4263	4268	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
72	NC_017373	CAA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221478
73	NC_017373	A	6	6	4275	4280	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
74	NC_017373	A	7	7	4306	4312	100 %	0 %	0 %	0 %	385221479
75	NC_017373	TAT	2	6	4364	4369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221479
76	NC_017373	TACA	2	8	4381	4388	50 %	25 %	0 %	25 %	385221479
77	NC_017373	ATT	2	6	4431	4436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221479
78	NC_017373	AGA	2	6	4449	4454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221479
79	NC_017373	AT	3	6	4470	4475	50 %	50 %	0 %	0 %	385221479
80	NC_017373	A	6	6	4480	4485	100 %	0 %	0 %	0 %	385221479
81	NC_017373	CGT	2	6	4486	4491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221479
82	NC_017373	AGA	2	6	4521	4526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221479
83	NC_017373	A	7	7	4535	4541	100 %	0 %	0 %	0 %	385221479
84	NC_017373	ACAA	2	8	4589	4596	75 %	0 %	0 %	25 %	385221479
85	NC_017373	GAA	2	6	4597	4602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221479
86	NC_017373	AATC	2	8	4614	4621	50 %	25 %	0 %	25 %	385221479
87	NC_017373	TGA	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221480
88	NC_017373	CAC	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221480
89	NC_017373	CAA	2	6	4761	4766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221480
90	NC_017373	AG	4	8	4893	4900	50 %	0 %	50 %	0 %	385221480
91	NC_017373	CCTG	2	8	4959	4966	0 %	25 %	25 %	50 %	385221480
92	NC_017373	A	6	6	5011	5016	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
93	NC_017373	AAT	2	6	5031	5036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221480
94	NC_017373	GAA	2	6	5104	5109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221480
95	NC_017373	A	6	6	5108	5113	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
96	NC_017373	A	6	6	5115	5120	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
97	NC_017373	TAG	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221480
98	NC_017373	CATG	2	8	5265	5272	25 %	25 %	25 %	25 %	385221480
99	NC_017373	ATT	2	6	5308	5313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221480
100	NC_017373	A	6	6	5324	5329	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
101	NC_017373	GAAA	2	8	5367	5374	75 %	0 %	25 %	0 %	385221480
102	NC_017373	A	6	6	5398	5403	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
103	NC_017373	GAAA	2	8	5491	5498	75 %	0 %	25 %	0 %	385221481
104	NC_017373	A	6	6	5496	5501	100 %	0 %	0 %	0 %	385221481
105	NC_017373	CAAAT	2	10	5533	5542	60 %	20 %	0 %	20 %	385221481
106	NC_017373	A	7	7	5630	5636	100 %	0 %	0 %	0 %	385221481
107	NC_017373	TGA	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221481
108	NC_017373	ATCA	2	8	5671	5678	50 %	25 %	0 %	25 %	385221481
109	NC_017373	CTTG	2	8	5697	5704	0 %	50 %	25 %	25 %	385221481
110	NC_017373	TGA	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221481
111	NC_017373	A	6	6	5797	5802	100 %	0 %	0 %	0 %	385221481
112	NC_017373	CAA	2	6	5831	5836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221481
113	NC_017373	CAT	2	6	5913	5918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221481
114	NC_017373	TCA	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221481
115	NC_017373	TAC	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221481
116	NC_017373	A	6	6	6370	6375	100 %	0 %	0 %	0 %	385221482
117	NC_017373	ATA	2	6	6405	6410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221482
118	NC_017373	TATG	2	8	6509	6516	25 %	50 %	25 %	0 %	385221482
119	NC_017373	TA	3	6	6536	6541	50 %	50 %	0 %	0 %	385221482
120	NC_017373	AT	3	6	6621	6626	50 %	50 %	0 %	0 %	385221482
121	NC_017373	AGT	2	6	6700	6705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221482
122	NC_017373	TTTG	2	8	6715	6722	0 %	75 %	25 %	0 %	385221482
123	NC_017373	A	6	6	6761	6766	100 %	0 %	0 %	0 %	385221482
124	NC_017373	AAG	2	6	6803	6808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221482
125	NC_017373	CT	3	6	6824	6829	0 %	50 %	0 %	50 %	385221482
126	NC_017373	TGT	2	6	6846	6851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221482
127	NC_017373	T	7	7	6873	6879	0 %	100 %	0 %	0 %	385221482
128	NC_017373	GAA	2	6	6891	6896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221482
129	NC_017373	A	6	6	6905	6910	100 %	0 %	0 %	0 %	385221482
130	NC_017373	AAT	2	6	6914	6919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221482
131	NC_017373	GTAA	2	8	6939	6946	50 %	25 %	25 %	0 %	385221482
132	NC_017373	GTA	2	6	6956	6961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221482
133	NC_017373	AAC	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221482
134	NC_017373	TCT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221482
135	NC_017373	A	7	7	7192	7198	100 %	0 %	0 %	0 %	385221482
136	NC_017373	AC	3	6	7202	7207	50 %	0 %	0 %	50 %	385221482
137	NC_017373	TATT	2	8	7243	7250	25 %	75 %	0 %	0 %	385221482
138	NC_017373	AC	3	6	7261	7266	50 %	0 %	0 %	50 %	385221482
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140	NC_017373	AAT	2	6	7353	7358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221482
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