MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Sat464 plasmid pHPSAT464

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017356	AAC	2	6	63	68	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
2	NC_017356	A	6	6	84	89	100 %	0 %	0 %	0 %	384893582
3	NC_017356	AGA	2	6	175	180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893582
4	NC_017356	A	6	6	203	208	100 %	0 %	0 %	0 %	384893582
5	NC_017356	AACC	2	8	217	224	50 %	0 %	0 %	50 %	384893582
6	NC_017356	ACAA	2	8	251	258	75 %	0 %	0 %	25 %	384893582
7	NC_017356	AAC	2	6	284	289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
8	NC_017356	CAA	2	6	292	297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
9	NC_017356	GTG	2	6	452	457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893582
10	NC_017356	ATTGA	2	10	560	569	40 %	40 %	20 %	0 %	384893582
11	NC_017356	CTAC	2	8	625	632	25 %	25 %	0 %	50 %	384893582
12	NC_017356	CTT	2	6	660	665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893582
13	NC_017356	AAC	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
14	NC_017356	AAG	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893582
15	NC_017356	CTT	2	6	1088	1093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893582
16	NC_017356	CAA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
17	NC_017356	TGTT	2	8	1269	1276	0 %	75 %	25 %	0 %	384893582
18	NC_017356	A	6	6	1292	1297	100 %	0 %	0 %	0 %	384893582
19	NC_017356	AGA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893582
20	NC_017356	CATG	2	8	1610	1617	25 %	25 %	25 %	25 %	384893583
21	NC_017356	A	7	7	1661	1667	100 %	0 %	0 %	0 %	384893583
22	NC_017356	CAAAT	2	10	1702	1711	60 %	20 %	0 %	20 %	384893583
23	NC_017356	A	7	7	1799	1805	100 %	0 %	0 %	0 %	384893583
24	NC_017356	TGA	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893583
25	NC_017356	ATCA	2	8	1840	1847	50 %	25 %	0 %	25 %	384893583
26	NC_017356	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893583
27	NC_017356	GAA	2	6	1882	1887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893583
28	NC_017356	AAT	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893583
29	NC_017356	ATT	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893583
30	NC_017356	A	6	6	1966	1971	100 %	0 %	0 %	0 %	384893583
31	NC_017356	GGT	2	6	1987	1992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893583
32	NC_017356	CAC	2	6	1995	2000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384893583
33	NC_017356	CAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893583
34	NC_017356	TTTCT	2	10	2319	2328	0 %	80 %	0 %	20 %	384893583
35	NC_017356	TCT	3	9	2326	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893583
36	NC_017356	T	6	6	3295	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	384893584
37	NC_017356	GAT	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893584
38	NC_017356	AGCGAT	2	12	3338	3349	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893584
39	NC_017356	TCAA	2	8	3378	3385	50 %	25 %	0 %	25 %	384893584
40	NC_017356	TTTGA	2	10	3590	3599	20 %	60 %	20 %	0 %	384893584
41	NC_017356	T	6	6	3630	3635	0 %	100 %	0 %	0 %	384893584
42	NC_017356	GAG	2	6	3656	3661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384893584
43	NC_017356	AC	3	6	3743	3748	50 %	0 %	0 %	50 %	384893584
44	NC_017356	TCA	2	6	3774	3779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
45	NC_017356	GAA	2	6	3801	3806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
46	NC_017356	TTA	2	6	3890	3895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893584
47	NC_017356	GAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
48	NC_017356	AGA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
49	NC_017356	AAC	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893584
50	NC_017356	GAT	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893584
51	NC_017356	AAAG	2	8	4184	4191	75 %	0 %	25 %	0 %	384893584
52	NC_017356	AAAG	2	8	4215	4222	75 %	0 %	25 %	0 %	384893584
53	NC_017356	A	6	6	4240	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	384893584
54	NC_017356	A	6	6	4301	4306	100 %	0 %	0 %	0 %	384893584
55	NC_017356	AG	3	6	4367	4372	50 %	0 %	50 %	0 %	384893584
56	NC_017356	A	6	6	4397	4402	100 %	0 %	0 %	0 %	384893584
57	NC_017356	CTA	2	6	4409	4414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
58	NC_017356	CTA	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
59	NC_017356	ACA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893584
60	NC_017356	CA	3	6	4507	4512	50 %	0 %	0 %	50 %	384893584
61	NC_017356	AAT	2	6	4517	4522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893584
62	NC_017356	T	7	7	4536	4542	0 %	100 %	0 %	0 %	384893584
63	NC_017356	CCTA	2	8	4664	4671	25 %	25 %	0 %	50 %	384893584
64	NC_017356	AAAG	2	8	4748	4755	75 %	0 %	25 %	0 %	384893584
65	NC_017356	ACT	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
66	NC_017356	AGA	3	9	4789	4797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
67	NC_017356	AG	3	6	4813	4818	50 %	0 %	50 %	0 %	384893584
68	NC_017356	CAAA	2	8	4888	4895	75 %	0 %	0 %	25 %	384893584
69	NC_017356	AAC	2	6	5066	5071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893584
70	NC_017356	CAAA	2	8	5095	5102	75 %	0 %	0 %	25 %	384893584
71	NC_017356	AAAGCC	2	12	5111	5122	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384893584
72	NC_017356	AGAAAA	2	12	5140	5151	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893584
73	NC_017356	GAAA	2	8	5233	5240	75 %	0 %	25 %	0 %	384893584
74	NC_017356	T	6	6	6402	6407	0 %	100 %	0 %	0 %	384893585
75	NC_017356	TA	3	6	6418	6423	50 %	50 %	0 %	0 %	384893585
76	NC_017356	T	7	7	6432	6438	0 %	100 %	0 %	0 %	384893585
77	NC_017356	A	6	6	6483	6488	100 %	0 %	0 %	0 %	384893585
78	NC_017356	A	8	8	6496	6503	100 %	0 %	0 %	0 %	384893585
79	NC_017356	T	6	6	6607	6612	0 %	100 %	0 %	0 %	384893586
80	NC_017356	TA	3	6	6623	6628	50 %	50 %	0 %	0 %	384893586
81	NC_017356	T	7	7	6637	6643	0 %	100 %	0 %	0 %	384893586
82	NC_017356	A	6	6	6688	6693	100 %	0 %	0 %	0 %	384893586
83	NC_017356	A	8	8	6701	6708	100 %	0 %	0 %	0 %	384893586
84	NC_017356	T	6	6	6812	6817	0 %	100 %	0 %	0 %	384893587
85	NC_017356	TA	3	6	6828	6833	50 %	50 %	0 %	0 %	384893587
86	NC_017356	T	7	7	6842	6848	0 %	100 %	0 %	0 %	384893587
87	NC_017356	A	6	6	6893	6898	100 %	0 %	0 %	0 %	384893587
88	NC_017356	A	8	8	6906	6913	100 %	0 %	0 %	0 %	384893587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.