MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 33535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017161	GGT	2	6	172786	172791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128257
3502	NC_017161	AGA	2	6	172822	172827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3503	NC_017161	TGCCA	2	10	172839	172848	20 %	20 %	20 %	40 %	384128257
3504	NC_017161	ATA	2	6	172855	172860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128257
3505	NC_017161	GAA	2	6	172884	172889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3506	NC_017161	GAT	2	6	173194	173199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128257
3507	NC_017161	CT	3	6	173207	173212	0 %	50 %	0 %	50 %	384128257
3508	NC_017161	GAT	2	6	173215	173220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128257
3509	NC_017161	TCA	2	6	173234	173239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128257
3510	NC_017161	AG	3	6	173251	173256	50 %	0 %	50 %	0 %	384128257
3511	NC_017161	AAG	2	6	173314	173319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3512	NC_017161	CCCT	2	8	173334	173341	0 %	25 %	0 %	75 %	384128257
3513	NC_017161	GAA	2	6	173404	173409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3514	NC_017161	TGG	2	6	173417	173422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128257
3515	NC_017161	GGC	2	6	173553	173558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384128257
3516	NC_017161	TCTT	2	8	173559	173566	0 %	75 %	0 %	25 %	384128257
3517	NC_017161	G	7	7	173784	173790	0 %	0 %	100 %	0 %	384128257
3518	NC_017161	GCA	2	6	173809	173814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128257
3519	NC_017161	AG	3	6	173816	173821	50 %	0 %	50 %	0 %	384128257
3520	NC_017161	TA	3	6	173826	173831	50 %	50 %	0 %	0 %	384128257
3521	NC_017161	GAA	2	6	173850	173855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3522	NC_017161	CCTG	2	8	173877	173884	0 %	25 %	25 %	50 %	384128257
3523	NC_017161	GA	3	6	173892	173897	50 %	0 %	50 %	0 %	384128257
3524	NC_017161	TGA	2	6	173928	173933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128257
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3527	NC_017161	TTGG	2	8	173998	174005	0 %	50 %	50 %	0 %	384128258
3528	NC_017161	AGGT	2	8	174015	174022	25 %	25 %	50 %	0 %	384128258
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3530	NC_017161	GAAG	2	8	174073	174080	50 %	0 %	50 %	0 %	384128258
3531	NC_017161	AAG	2	6	174100	174105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128258
3532	NC_017161	GAA	3	9	174130	174138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128258
3533	NC_017161	GAAAG	2	10	174141	174150	60 %	0 %	40 %	0 %	384128258
3534	NC_017161	AAGA	2	8	174157	174164	75 %	0 %	25 %	0 %	384128258
3535	NC_017161	AGA	2	6	174183	174188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128258
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3539	NC_017161	TGT	2	6	174538	174543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128259
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3541	NC_017161	AT	3	6	174753	174758	50 %	50 %	0 %	0 %	384128259
3542	NC_017161	ATA	2	6	174794	174799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128259
3543	NC_017161	AG	3	6	174957	174962	50 %	0 %	50 %	0 %	384128260
3544	NC_017161	GGA	2	6	175044	175049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128260
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3547	NC_017161	CT	3	6	175259	175264	0 %	50 %	0 %	50 %	384128260
3548	NC_017161	ATA	2	6	175302	175307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128260
3549	NC_017161	A	6	6	175312	175317	100 %	0 %	0 %	0 %	384128260
3550	NC_017161	GGTA	2	8	175365	175372	25 %	25 %	50 %	0 %	384128260
3551	NC_017161	AG	3	6	175406	175411	50 %	0 %	50 %	0 %	384128260
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3553	NC_017161	ACT	2	6	175504	175509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128260
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3555	NC_017161	AGG	2	6	175556	175561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128260
3556	NC_017161	AGA	2	6	175640	175645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128260
3557	NC_017161	AC	3	6	175780	175785	50 %	0 %	0 %	50 %	384128260
3558	NC_017161	TGG	2	6	175858	175863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128260
3559	NC_017161	ACC	2	6	175868	175873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128260
3560	NC_017161	AGG	2	6	175876	175881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128260
3561	NC_017161	CCTG	2	8	175937	175944	0 %	25 %	25 %	50 %	384128260
3562	NC_017161	GTG	2	6	175947	175952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128260
3563	NC_017161	ACC	2	6	175957	175962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128260
3564	NC_017161	A	6	6	176006	176011	100 %	0 %	0 %	0 %	384128260
3565	NC_017161	GTG	2	6	176088	176093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128260
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3572	NC_017161	AAAAG	2	10	176324	176333	80 %	0 %	20 %	0 %	384128260
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3574	NC_017161	GGA	2	6	176412	176417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128261
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3580	NC_017161	TGATG	2	10	176799	176808	20 %	40 %	40 %	0 %	384128261
3581	NC_017161	AG	3	6	176821	176826	50 %	0 %	50 %	0 %	384128261
3582	NC_017161	GCT	2	6	176868	176873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128261
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3589	NC_017161	GTG	2	6	177208	177213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128261
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3592	NC_017161	TCT	2	6	177332	177337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128262
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3595	NC_017161	CCT	2	6	177397	177402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128262
3596	NC_017161	CCA	2	6	177490	177495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128262
3597	NC_017161	ATC	2	6	177528	177533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128262
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3599	NC_017161	TTC	2	6	177553	177558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128262
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3601	NC_017161	AATA	2	8	177656	177663	75 %	25 %	0 %	0 %	384128262
3602	NC_017161	CTG	2	6	177687	177692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128262
3603	NC_017161	CT	4	8	177789	177796	0 %	50 %	0 %	50 %	384128262
3604	NC_017161	AAG	2	6	177836	177841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128262
3605	NC_017161	TGTA	2	8	177846	177853	25 %	50 %	25 %	0 %	384128262
3606	NC_017161	CT	3	6	177894	177899	0 %	50 %	0 %	50 %	384128262
3607	NC_017161	CTC	2	6	177926	177931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128262
3608	NC_017161	TTA	2	6	178063	178068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128262
3609	NC_017161	GCTG	2	8	178118	178125	0 %	25 %	50 %	25 %	384128262
3610	NC_017161	A	6	6	178215	178220	100 %	0 %	0 %	0 %	384128263
3611	NC_017161	AAG	2	6	178346	178351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128263
3612	NC_017161	G	6	6	178409	178414	0 %	0 %	100 %	0 %	384128263
3613	NC_017161	GAG	2	6	178425	178430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128263
3614	NC_017161	TGC	2	6	178460	178465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128263
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3617	NC_017161	GGT	2	6	178539	178544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128263
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3620	NC_017161	AGA	2	6	178661	178666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128263
3621	NC_017161	TA	3	6	178689	178694	50 %	50 %	0 %	0 %	384128263
3622	NC_017161	A	6	6	178824	178829	100 %	0 %	0 %	0 %	384128263
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3624	NC_017161	TGA	2	6	178862	178867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128263
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