MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori ELS37 plasmid pHPELS37

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017064	T	7	7	1419	1425	0 %	100 %	0 %	0 %	383750636
2	NC_017064	GTT	2	6	1438	1443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750636
3	NC_017064	T	6	6	1448	1453	0 %	100 %	0 %	0 %	383750636
4	NC_017064	T	6	6	1459	1464	0 %	100 %	0 %	0 %	383750636
5	NC_017064	CAAC	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	383750636
6	NC_017064	A	6	6	1498	1503	100 %	0 %	0 %	0 %	383750636
7	NC_017064	CTAC	2	8	1515	1522	25 %	25 %	0 %	50 %	383750636
8	NC_017064	A	6	6	1528	1533	100 %	0 %	0 %	0 %	383750636
9	NC_017064	A	6	6	1537	1542	100 %	0 %	0 %	0 %	383750636
10	NC_017064	CA	3	6	1549	1554	50 %	0 %	0 %	50 %	383750636
11	NC_017064	AAGAA	2	10	1578	1587	80 %	0 %	20 %	0 %	383750636
12	NC_017064	TGT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750637
13	NC_017064	ATG	2	6	1706	1711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750637
14	NC_017064	ATT	2	6	1723	1728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750637
15	NC_017064	ATG	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750637
16	NC_017064	TTG	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750637
17	NC_017064	TTG	2	6	1902	1907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750637
18	NC_017064	T	6	6	1936	1941	0 %	100 %	0 %	0 %	383750637
19	NC_017064	ACC	2	6	1945	1950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383750637
20	NC_017064	TCA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750637
21	NC_017064	T	6	6	2020	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	383750637
22	NC_017064	CAAG	2	8	2034	2041	50 %	0 %	25 %	25 %	383750637
23	NC_017064	TGAT	2	8	2060	2067	25 %	50 %	25 %	0 %	383750637
24	NC_017064	ATC	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750637
25	NC_017064	T	7	7	2102	2108	0 %	100 %	0 %	0 %	383750637
26	NC_017064	ATTTG	2	10	2196	2205	20 %	60 %	20 %	0 %	383750637
27	NC_017064	TTCT	2	8	2237	2244	0 %	75 %	0 %	25 %	383750637
28	NC_017064	GCAT	2	8	2277	2284	25 %	25 %	25 %	25 %	383750637
29	NC_017064	GTA	2	6	2299	2304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750638
30	NC_017064	TTC	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750638
31	NC_017064	TTG	2	6	2444	2449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
32	NC_017064	CAA	2	6	2578	2583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750638
33	NC_017064	T	6	6	2590	2595	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
34	NC_017064	T	6	6	2658	2663	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
35	NC_017064	G	6	6	2666	2671	0 %	0 %	100 %	0 %	383750638
36	NC_017064	T	6	6	2672	2677	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
37	NC_017064	CATG	2	8	2694	2701	25 %	25 %	25 %	25 %	383750638
38	NC_017064	T	7	7	2711	2717	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
39	NC_017064	TTGTTT	2	12	2899	2910	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383750638
40	NC_017064	T	6	6	2989	2994	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
41	NC_017064	CT	3	6	3103	3108	0 %	50 %	0 %	50 %	383750638
42	NC_017064	AAG	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750638
43	NC_017064	TTG	2	6	3248	3253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
44	NC_017064	CT	3	6	3391	3396	0 %	50 %	0 %	50 %	383750638
45	NC_017064	CAC	2	6	3414	3419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383750638
46	NC_017064	TGT	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
47	NC_017064	T	6	6	3437	3442	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
48	NC_017064	AAT	2	6	3452	3457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750638
49	NC_017064	TTA	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750638
50	NC_017064	GGT	2	6	3628	3633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750638
51	NC_017064	GGT	2	6	3685	3690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750638
52	NC_017064	TTG	2	6	3702	3707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
53	NC_017064	TTTTTC	2	12	3715	3726	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383750638
54	NC_017064	TTTTGT	2	12	3821	3832	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383750638
55	NC_017064	TTC	2	6	3868	3873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750638
56	NC_017064	TAA	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750638
57	NC_017064	T	6	6	4547	4552	0 %	100 %	0 %	0 %	383750639
58	NC_017064	TCTTGT	2	12	4817	4828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383750640
59	NC_017064	ATC	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750640
60	NC_017064	TAAC	2	8	4977	4984	50 %	25 %	0 %	25 %	383750640
61	NC_017064	AC	3	6	5077	5082	50 %	0 %	0 %	50 %	383750640
62	NC_017064	A	6	6	5102	5107	100 %	0 %	0 %	0 %	383750640
63	NC_017064	TTG	2	6	5120	5125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750640
64	NC_017064	A	7	7	5174	5180	100 %	0 %	0 %	0 %	383750640
65	NC_017064	ATC	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750640
66	NC_017064	T	7	7	5211	5217	0 %	100 %	0 %	0 %	383750640

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.