MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae 10810

Total Repeats: 35906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016809	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	378696080
2	NC_016809	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378696080
3	NC_016809	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696080
4	NC_016809	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696080
5	NC_016809	A	6	6	344	349	100 %	0 %	0 %	0 %	378696080
6	NC_016809	GTTC	2	8	388	395	0 %	50 %	25 %	25 %	378696080
7	NC_016809	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378696080
8	NC_016809	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696080
9	NC_016809	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696080
10	NC_016809	CAA	2	6	534	539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696080
11	NC_016809	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	378696080
12	NC_016809	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378696080
13	NC_016809	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696080
14	NC_016809	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696080
15	NC_016809	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696080
16	NC_016809	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696080
17	NC_016809	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696080
18	NC_016809	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	378696080
19	NC_016809	CAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696081
20	NC_016809	GA	3	6	1310	1315	50 %	0 %	50 %	0 %	378696081
21	NC_016809	TCAA	2	8	1345	1352	50 %	25 %	0 %	25 %	378696081
22	NC_016809	TTGC	2	8	1365	1372	0 %	50 %	25 %	25 %	378696081
23	NC_016809	ATA	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696081
24	NC_016809	AGCA	2	8	1501	1508	50 %	0 %	25 %	25 %	378696081
25	NC_016809	TCG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378696081
26	NC_016809	TCA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696081
27	NC_016809	A	6	6	1609	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
28	NC_016809	CCA	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378696081
29	NC_016809	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696081
30	NC_016809	TTA	2	6	1678	1683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696081
31	NC_016809	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696081
32	NC_016809	ATTT	2	8	1747	1754	25 %	75 %	0 %	0 %	378696081
33	NC_016809	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696081
34	NC_016809	TC	4	8	1817	1824	0 %	50 %	0 %	50 %	378696081
35	NC_016809	CTTT	2	8	1878	1885	0 %	75 %	0 %	25 %	378696081
36	NC_016809	T	6	6	1883	1888	0 %	100 %	0 %	0 %	378696081
37	NC_016809	TC	3	6	1894	1899	0 %	50 %	0 %	50 %	378696081
38	NC_016809	GGC	2	6	1919	1924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378696081
39	NC_016809	TTC	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696081
40	NC_016809	AGA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696081
41	NC_016809	A	6	6	2038	2043	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
42	NC_016809	TGC	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378696081
43	NC_016809	A	6	6	2175	2180	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
44	NC_016809	ATT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696081
45	NC_016809	GGT	2	6	2232	2237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378696081
46	NC_016809	ATG	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696081
47	NC_016809	GGA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378696081
48	NC_016809	AAC	2	6	2342	2347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696081
49	NC_016809	AAT	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696081
50	NC_016809	GTG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378696081
51	NC_016809	TGA	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696081
52	NC_016809	AGA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696081
53	NC_016809	ATTT	2	8	2569	2576	25 %	75 %	0 %	0 %	378696081
54	NC_016809	AT	3	6	2621	2626	50 %	50 %	0 %	0 %	378696081
55	NC_016809	CAC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378696081
56	NC_016809	AT	3	6	2636	2641	50 %	50 %	0 %	0 %	378696081
57	NC_016809	ATC	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696081
58	NC_016809	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
59	NC_016809	GAA	2	6	2745	2750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696081
60	NC_016809	ACT	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696081
61	NC_016809	A	6	6	2798	2803	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
62	NC_016809	AGC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378696081
63	NC_016809	A	7	7	2876	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
64	NC_016809	GCAA	2	8	2974	2981	50 %	0 %	25 %	25 %	378696081
65	NC_016809	AAG	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696081
66	NC_016809	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696082
67	NC_016809	TCT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696082
68	NC_016809	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696082
69	NC_016809	TCA	2	6	3136	3141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696082
70	NC_016809	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696082
71	NC_016809	A	6	6	3253	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	378696082
72	NC_016809	CGCAC	2	10	3259	3268	20 %	0 %	20 %	60 %	378696082
73	NC_016809	A	6	6	3301	3306	100 %	0 %	0 %	0 %	378696082
74	NC_016809	T	6	6	3342	3347	0 %	100 %	0 %	0 %	378696082
75	NC_016809	TCT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696082
76	NC_016809	AAT	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696082
77	NC_016809	TCA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696082
78	NC_016809	ATTT	2	8	3479	3486	25 %	75 %	0 %	0 %	378696082
79	NC_016809	ATT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696082
80	NC_016809	TAA	2	6	3520	3525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696082
81	NC_016809	GAT	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696082
82	NC_016809	GC	3	6	3632	3637	0 %	0 %	50 %	50 %	378696082
83	NC_016809	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696082
84	NC_016809	ATT	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696082
85	NC_016809	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696082
86	NC_016809	CAT	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696082
87	NC_016809	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696083
88	NC_016809	ATC	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696083
89	NC_016809	TTC	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696083
90	NC_016809	AAC	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696083
91	NC_016809	GAC	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378696083
92	NC_016809	ATTCT	2	10	4318	4327	20 %	60 %	0 %	20 %	378696083
93	NC_016809	TTTCCT	2	12	4606	4617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696084
94	NC_016809	T	6	6	4724	4729	0 %	100 %	0 %	0 %	378696084
95	NC_016809	CTCG	2	8	4744	4751	0 %	25 %	25 %	50 %	378696084
96	NC_016809	TAAAA	2	10	4761	4770	80 %	20 %	0 %	0 %	378696084
97	NC_016809	CCAA	2	8	4797	4804	50 %	0 %	0 %	50 %	378696084
98	NC_016809	T	7	7	4921	4927	0 %	100 %	0 %	0 %	378696084
99	NC_016809	TA	3	6	5000	5005	50 %	50 %	0 %	0 %	378696084
100	NC_016809	ACG	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378696084
101	NC_016809	ACA	2	6	5137	5142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696084
102	NC_016809	TCT	2	6	5158	5163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696084
103	NC_016809	CAT	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696084
104	NC_016809	TA	3	6	5258	5263	50 %	50 %	0 %	0 %	378696084
105	NC_016809	TTG	2	6	5304	5309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696084
106	NC_016809	T	6	6	5335	5340	0 %	100 %	0 %	0 %	378696084
107	NC_016809	A	6	6	5349	5354	100 %	0 %	0 %	0 %	378696084
108	NC_016809	ATA	2	6	8738	8743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696085
109	NC_016809	TTA	2	6	8780	8785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696085
110	NC_016809	CAC	2	6	8816	8821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378696085
111	NC_016809	GA	3	6	8826	8831	50 %	0 %	50 %	0 %	378696085
112	NC_016809	AATT	2	8	8852	8859	50 %	50 %	0 %	0 %	378696085
113	NC_016809	GTT	2	6	8900	8905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696085
114	NC_016809	GAA	2	6	9016	9021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696085
115	NC_016809	TGCAC	2	10	9062	9071	20 %	20 %	20 %	40 %	378696085
116	NC_016809	GTT	2	6	9080	9085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696085
117	NC_016809	TATTG	2	10	9172	9181	20 %	60 %	20 %	0 %	378696085
118	NC_016809	GAAT	2	8	9206	9213	50 %	25 %	25 %	0 %	378696085
119	NC_016809	TG	3	6	9247	9252	0 %	50 %	50 %	0 %	378696085
120	NC_016809	AGA	2	6	9327	9332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696085
121	NC_016809	AAC	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696085
122	NC_016809	TCC	2	6	9405	9410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378696085
123	NC_016809	AC	3	6	9424	9429	50 %	0 %	0 %	50 %	378696085
124	NC_016809	ATGT	2	8	9433	9440	25 %	50 %	25 %	0 %	378696085
125	NC_016809	TCTAGC	2	12	9561	9572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378696085
126	NC_016809	ACT	2	6	9584	9589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696085
127	NC_016809	AGA	3	9	9609	9617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696085
128	NC_016809	ATC	3	9	9626	9634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696085
129	NC_016809	GAA	2	6	9643	9648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696085
130	NC_016809	ATC	2	6	9654	9659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696085
131	NC_016809	AAT	2	6	9670	9675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696085
132	NC_016809	T	6	6	9761	9766	0 %	100 %	0 %	0 %	378696086
133	NC_016809	TTC	2	6	9794	9799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696086
134	NC_016809	GC	4	8	9845	9852	0 %	0 %	50 %	50 %	378696086
135	NC_016809	TTC	2	6	9881	9886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696086
136	NC_016809	A	7	7	9933	9939	100 %	0 %	0 %	0 %	378696086
137	NC_016809	A	6	6	10026	10031	100 %	0 %	0 %	0 %	378696086
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268	NC_016809	TTAT	2	8	16064	16071	25 %	75 %	0 %	0 %	378696094
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