MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 38109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015964	AATTT	2	10	216858	216867	40 %	60 %	0 %	0 %	345428803
4002	NC_015964	CCG	2	6	216952	216957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345428803
4003	NC_015964	CTGC	2	8	217000	217007	0 %	25 %	25 %	50 %	345428803
4004	NC_015964	AAT	2	6	217036	217041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428803
4005	NC_015964	TCT	2	6	217053	217058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428803
4006	NC_015964	GAA	2	6	217105	217110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428803
4007	NC_015964	GGA	2	6	217124	217129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345428803
4008	NC_015964	CTC	2	6	217135	217140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345428803
4009	NC_015964	T	6	6	217160	217165	0 %	100 %	0 %	0 %	345428803
4010	NC_015964	GTT	2	6	217183	217188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428803
4011	NC_015964	AG	3	6	217193	217198	50 %	0 %	50 %	0 %	345428803
4012	NC_015964	ACC	2	6	217419	217424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428804
4013	NC_015964	TAA	2	6	217460	217465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428804
4014	NC_015964	ACT	2	6	217582	217587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428805
4015	NC_015964	ATC	2	6	217607	217612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428805
4016	NC_015964	TCTT	2	8	217614	217621	0 %	75 %	0 %	25 %	345428805
4017	NC_015964	T	6	6	217766	217771	0 %	100 %	0 %	0 %	345428805
4018	NC_015964	A	6	6	217826	217831	100 %	0 %	0 %	0 %	345428805
4019	NC_015964	ATT	2	6	217845	217850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428806
4020	NC_015964	GAC	2	6	217880	217885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428806
4021	NC_015964	TTTC	2	8	217938	217945	0 %	75 %	0 %	25 %	345428806
4022	NC_015964	CAG	2	6	218004	218009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428806
4023	NC_015964	ATG	2	6	218047	218052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428806
4024	NC_015964	AAAT	2	8	218114	218121	75 %	25 %	0 %	0 %	345428806
4025	NC_015964	TCGCCA	2	12	218139	218150	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345428806
4026	NC_015964	TAT	2	6	218151	218156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428806
4027	NC_015964	CTT	2	6	218169	218174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428806
4028	NC_015964	TAT	2	6	218193	218198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428806
4029	NC_015964	CCA	2	6	218274	218279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428806
4030	NC_015964	GTG	2	6	218293	218298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428806
4031	NC_015964	GAT	2	6	218348	218353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428806
4032	NC_015964	CCCA	2	8	218432	218439	25 %	0 %	0 %	75 %	345428806
4033	NC_015964	TAC	2	6	218515	218520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428806
4034	NC_015964	CTT	2	6	218574	218579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428806
4035	NC_015964	CAG	2	6	218598	218603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428806
4036	NC_015964	T	6	6	218724	218729	0 %	100 %	0 %	0 %	345428806
4037	NC_015964	TCA	2	6	218753	218758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428806
4038	NC_015964	AAT	2	6	218806	218811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428806
4039	NC_015964	T	6	6	218821	218826	0 %	100 %	0 %	0 %	345428806
4040	NC_015964	CAAT	2	8	218859	218866	50 %	25 %	0 %	25 %	345428806
4041	NC_015964	T	7	7	218877	218883	0 %	100 %	0 %	0 %	345428806
4042	NC_015964	ACC	2	6	219022	219027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428807
4043	NC_015964	TAA	2	6	219037	219042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428807
4044	NC_015964	CA	3	6	219111	219116	50 %	0 %	0 %	50 %	345428807
4045	NC_015964	GTA	2	6	219118	219123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428807
4046	NC_015964	TCT	2	6	219131	219136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428807
4047	NC_015964	AGT	2	6	219156	219161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428807
4048	NC_015964	TCT	2	6	219209	219214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428807
4049	NC_015964	TCT	2	6	219281	219286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428807
4050	NC_015964	CAC	3	9	219399	219407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428807
4051	NC_015964	TTTC	2	8	219432	219439	0 %	75 %	0 %	25 %	345428807
4052	NC_015964	GTG	2	6	219540	219545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428807
4053	NC_015964	ATG	2	6	219575	219580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428807
4054	NC_015964	TCT	2	6	219587	219592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428807
4055	NC_015964	ATA	2	6	219620	219625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428807
4056	NC_015964	TTC	2	6	219685	219690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428807
4057	NC_015964	ACC	2	6	219748	219753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428807
4058	NC_015964	CTT	2	6	219768	219773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428807
4059	NC_015964	T	6	6	219850	219855	0 %	100 %	0 %	0 %	345428807
4060	NC_015964	TCT	2	6	219869	219874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428807
4061	NC_015964	CTT	2	6	219930	219935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428807
4062	NC_015964	TTA	2	6	219947	219952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428807
4063	NC_015964	CAC	2	6	219981	219986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428807
4064	NC_015964	TTTCAC	2	12	219994	220005	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	345428807
4065	NC_015964	CCA	4	12	220025	220036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428807
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4067	NC_015964	CCA	2	6	220088	220093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428807
4068	NC_015964	AATAA	2	10	220175	220184	80 %	20 %	0 %	0 %	345428807
4069	NC_015964	TAA	3	9	220228	220236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428807
4070	NC_015964	CCT	2	6	220260	220265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345428808
4071	NC_015964	T	6	6	220372	220377	0 %	100 %	0 %	0 %	345428808
4072	NC_015964	CCAA	2	8	220412	220419	50 %	0 %	0 %	50 %	345428808
4073	NC_015964	ACC	2	6	220487	220492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428808
4074	NC_015964	GGAA	2	8	220521	220528	50 %	0 %	50 %	0 %	345428808
4075	NC_015964	GAA	2	6	220556	220561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428808
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4080	NC_015964	AAG	2	6	220794	220799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428808
4081	NC_015964	AAAG	2	8	220800	220807	75 %	0 %	25 %	0 %	345428808
4082	NC_015964	ATT	2	6	220864	220869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428809
4083	NC_015964	AAT	2	6	220919	220924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428809
4084	NC_015964	AAG	2	6	220943	220948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428809
4085	NC_015964	ACCA	2	8	220969	220976	50 %	0 %	0 %	50 %	345428809
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4088	NC_015964	CAA	2	6	221095	221100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428809
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4092	NC_015964	ATT	2	6	221493	221498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428809
4093	NC_015964	AAT	2	6	221556	221561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428810
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4097	NC_015964	AGTA	2	8	221766	221773	50 %	25 %	25 %	0 %	345428810
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4102	NC_015964	GCA	2	6	222194	222199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428810
4103	NC_015964	AC	3	6	222217	222222	50 %	0 %	0 %	50 %	345428810
4104	NC_015964	CAACA	2	10	222232	222241	60 %	0 %	0 %	40 %	345428810
4105	NC_015964	TTA	2	6	222269	222274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428810
4106	NC_015964	CAT	2	6	222374	222379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428811
4107	NC_015964	ACC	2	6	222445	222450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428811
4108	NC_015964	ACC	2	6	222518	222523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428811
4109	NC_015964	TGCCAA	2	12	222534	222545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345428811
4110	NC_015964	AAG	2	6	222640	222645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428811
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4112	NC_015964	TAA	2	6	222680	222685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428811
4113	NC_015964	CATC	2	8	222736	222743	25 %	25 %	0 %	50 %	345428811
4114	NC_015964	GT	3	6	222768	222773	0 %	50 %	50 %	0 %	345428811
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4118	NC_015964	ACC	2	6	222935	222940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428811
4119	NC_015964	TTTC	2	8	222946	222953	0 %	75 %	0 %	25 %	345428811
4120	NC_015964	TGG	2	6	223007	223012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428811
4121	NC_015964	CAC	2	6	223073	223078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428811
4122	NC_015964	AAT	3	9	223083	223091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428811
4123	NC_015964	AAG	3	9	223134	223142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428811
4124	NC_015964	ATT	2	6	223178	223183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428811
4125	NC_015964	AATT	2	8	223235	223242	50 %	50 %	0 %	0 %	345428811
4126	NC_015964	AAC	2	6	223320	223325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428811
4127	NC_015964	ATC	2	6	223341	223346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428811
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4131	NC_015964	T	6	6	223500	223505	0 %	100 %	0 %	0 %	345428811
4132	NC_015964	CCTT	2	8	223520	223527	0 %	50 %	0 %	50 %	345428812
4133	NC_015964	TCT	2	6	223607	223612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428812
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4136	NC_015964	AGT	2	6	223762	223767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428812
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4138	NC_015964	TACGG	2	10	223801	223810	20 %	20 %	40 %	20 %	345428812
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4142	NC_015964	AAT	2	6	224102	224107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428812
4143	NC_015964	CTA	2	6	224193	224198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428812
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4146	NC_015964	TAGGT	2	10	224236	224245	20 %	40 %	40 %	0 %	345428812
4147	NC_015964	GAC	2	6	224310	224315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428812
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4152	NC_015964	ACGG	2	8	224454	224461	25 %	0 %	50 %	25 %	345428812
4153	NC_015964	AGA	2	6	224515	224520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428812
4154	NC_015964	ATTA	2	8	224620	224627	50 %	50 %	0 %	0 %	345428812
4155	NC_015964	T	6	6	224701	224706	0 %	100 %	0 %	0 %	345428812
4156	NC_015964	T	6	6	224842	224847	0 %	100 %	0 %	0 %	345428812
4157	NC_015964	TACT	2	8	225259	225266	25 %	50 %	0 %	25 %	345428813
4158	NC_015964	T	6	6	225365	225370	0 %	100 %	0 %	0 %	345428813
4159	NC_015964	ATC	2	6	225373	225378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428813
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4162	NC_015964	ATAA	2	8	225572	225579	75 %	25 %	0 %	0 %	345428813
4163	NC_015964	AACA	2	8	225666	225673	75 %	0 %	0 %	25 %	345428814
4164	NC_015964	TAT	2	6	225683	225688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428814
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4230	NC_015964	A	6	6	229444	229449	100 %	0 %	0 %	0 %	345428818
4231	NC_015964	GAA	2	6	229642	229647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428818
4232	NC_015964	G	6	6	229829	229834	0 %	0 %	100 %	0 %	345428818
4233	NC_015964	ATT	2	6	229900	229905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428818
4234	NC_015964	ATGG	2	8	229924	229931	25 %	25 %	50 %	0 %	345428818
4235	NC_015964	ACC	2	6	229972	229977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428818
4236	NC_015964	TCT	2	6	230032	230037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428818
4237	NC_015964	TAC	2	6	230041	230046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428818
4238	NC_015964	AT	3	6	230124	230129	50 %	50 %	0 %	0 %	345428818
4239	NC_015964	CGG	2	6	230130	230135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345428818
4240	NC_015964	TTC	2	6	230173	230178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428818
4241	NC_015964	ATT	2	6	230184	230189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428818
4242	NC_015964	ATT	2	6	230232	230237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428818
4243	NC_015964	CTA	2	6	230268	230273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428818
4244	NC_015964	CCAA	2	8	230281	230288	50 %	0 %	0 %	50 %	345428818
4245	NC_015964	TGA	2	6	230331	230336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428818
4246	NC_015964	ATC	2	6	230347	230352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428818
4247	NC_015964	TCGAAA	2	12	230407	230418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	345428818
4248	NC_015964	AAC	2	6	230419	230424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428818
4249	NC_015964	TGG	2	6	230444	230449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428818
4250	NC_015964	ATG	2	6	230482	230487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428818
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4253	NC_015964	GTC	3	9	230696	230704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428818
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4260	NC_015964	ATG	2	6	231223	231228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428819
4261	NC_015964	ATCA	2	8	231231	231238	50 %	25 %	0 %	25 %	345428819
4262	NC_015964	GCT	2	6	231245	231250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428819
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4265	NC_015964	GTCT	2	8	231477	231484	0 %	50 %	25 %	25 %	345428819
4266	NC_015964	GCGT	2	8	231536	231543	0 %	25 %	50 %	25 %	345428819
4267	NC_015964	CTTT	2	8	231590	231597	0 %	75 %	0 %	25 %	345428819
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4272	NC_015964	T	6	6	231788	231793	0 %	100 %	0 %	0 %	345428820
4273	NC_015964	AGTGAA	2	12	231819	231830	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345428820
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4275	NC_015964	GCC	2	6	231846	231851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345428820
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4279	NC_015964	ACTG	2	8	231900	231907	25 %	25 %	25 %	25 %	345428820
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4285	NC_015964	ATT	2	6	232208	232213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428820
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4321	NC_015964	A	6	6	234441	234446	100 %	0 %	0 %	0 %	345428821
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4353	NC_015964	CAT	2	6	235870	235875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428823
4354	NC_015964	ATTTA	2	10	235876	235885	40 %	60 %	0 %	0 %	345428823
4355	NC_015964	TTCA	2	8	235888	235895	25 %	50 %	0 %	25 %	345428823
4356	NC_015964	AAAG	2	8	235922	235929	75 %	0 %	25 %	0 %	345428823
4357	NC_015964	GAA	2	6	235940	235945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428823
4358	NC_015964	GAC	2	6	235959	235964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428823
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4361	NC_015964	ACC	2	6	236032	236037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428823
4362	NC_015964	ATA	2	6	236150	236155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428823
4363	NC_015964	CTT	2	6	236229	236234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428823
4364	NC_015964	AAT	2	6	236374	236379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428823
4365	NC_015964	TTC	2	6	236395	236400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428823
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4490	NC_015964	GAT	2	6	243436	243441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428830
4491	NC_015964	T	7	7	243441	243447	0 %	100 %	0 %	0 %	345428830
4492	NC_015964	TTC	2	6	243454	243459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428830
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4494	NC_015964	GCC	2	6	243701	243706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345428831
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