MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015955	CGA	2	6	77261	77266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006895
1502	NC_015955	GC	3	6	77408	77413	0 %	0 %	50 %	50 %	345006895
1503	NC_015955	GC	4	8	77415	77422	0 %	0 %	50 %	50 %	345006895
1504	NC_015955	CCG	2	6	77447	77452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006895
1505	NC_015955	GTT	2	6	77472	77477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006895
1506	NC_015955	CGA	2	6	77483	77488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006895
1507	NC_015955	CAC	2	6	77534	77539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006895
1508	NC_015955	AG	4	8	77565	77572	50 %	0 %	50 %	0 %	345006895
1509	NC_015955	GTC	2	6	77625	77630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006895
1510	NC_015955	GACC	2	8	77792	77799	25 %	0 %	25 %	50 %	345006895
1511	NC_015955	GAGC	2	8	77811	77818	25 %	0 %	50 %	25 %	345006895
1512	NC_015955	CGA	2	6	77876	77881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006895
1513	NC_015955	AGG	2	6	77912	77917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006895
1514	NC_015955	CAG	2	6	77950	77955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006895
1515	NC_015955	AAC	2	6	77967	77972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006895
1516	NC_015955	GTT	2	6	78000	78005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006895
1517	NC_015955	ATC	2	6	78015	78020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006895
1518	NC_015955	GTTC	2	8	78047	78054	0 %	50 %	25 %	25 %	345006895
1519	NC_015955	CTG	2	6	78072	78077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006895
1520	NC_015955	CAG	2	6	78090	78095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006895
1521	NC_015955	GAT	2	6	78143	78148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006895
1522	NC_015955	CTC	2	6	79279	79284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006896
1523	NC_015955	CGCT	2	8	79289	79296	0 %	25 %	25 %	50 %	345006896
1524	NC_015955	CCT	2	6	79317	79322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006896
1525	NC_015955	TCG	2	6	79330	79335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006896
1526	NC_015955	GGTG	2	8	79391	79398	0 %	25 %	75 %	0 %	345006896
1527	NC_015955	CCCAGT	2	12	79403	79414	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345006896
1528	NC_015955	CTATA	2	10	79428	79437	40 %	40 %	0 %	20 %	345006896
1529	NC_015955	AAT	2	6	79486	79491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006896
1530	NC_015955	GTA	2	6	79506	79511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006896
1531	NC_015955	GAT	2	6	79615	79620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006896
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1533	NC_015955	GGAA	2	8	79679	79686	50 %	0 %	50 %	0 %	345006896
1534	NC_015955	TCG	3	9	79697	79705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006896
1535	NC_015955	TGT	2	6	79802	79807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006896
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1537	NC_015955	GAGTA	2	10	79860	79869	40 %	20 %	40 %	0 %	345006896
1538	NC_015955	GCACG	2	10	79913	79922	20 %	0 %	40 %	40 %	345006896
1539	NC_015955	TCC	2	6	79952	79957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006896
1540	NC_015955	CGT	3	9	79971	79979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006896
1541	NC_015955	CCA	2	6	80047	80052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006896
1542	NC_015955	GTC	2	6	80403	80408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006897
1543	NC_015955	TCG	2	6	80463	80468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006897
1544	NC_015955	CCA	3	9	80496	80504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006897
1545	NC_015955	CGCC	2	8	80512	80519	0 %	0 %	25 %	75 %	345006897
1546	NC_015955	CGG	2	6	80521	80526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006897
1547	NC_015955	CAC	3	9	80583	80591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006897
1548	NC_015955	CAG	2	6	80595	80600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006897
1549	NC_015955	GTTGTC	2	12	80620	80631	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345006897
1550	NC_015955	AGT	2	6	80684	80689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006897
1551	NC_015955	GTG	2	6	80705	80710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006897
1552	NC_015955	GCG	2	6	80731	80736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006897
1553	NC_015955	GTAC	2	8	80781	80788	25 %	25 %	25 %	25 %	345006897
1554	NC_015955	GAT	2	6	80910	80915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006897
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1559	NC_015955	CG	3	6	81112	81117	0 %	0 %	50 %	50 %	345006897
1560	NC_015955	GTC	2	6	81186	81191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006897
1561	NC_015955	GTA	2	6	81201	81206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006897
1562	NC_015955	CGA	2	6	81410	81415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006897
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1583	NC_015955	CGA	2	6	82990	82995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006898
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1598	NC_015955	AGA	2	6	83814	83819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006898
1599	NC_015955	TGA	2	6	83827	83832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006898
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1604	NC_015955	TGG	2	6	84055	84060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006898
1605	NC_015955	A	6	6	84116	84121	100 %	0 %	0 %	0 %	345006898
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1607	NC_015955	TAA	2	6	84243	84248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006898
1608	NC_015955	TGA	2	6	84261	84266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006898
1609	NC_015955	GAC	2	6	84319	84324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006898
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1623	NC_015955	TGA	2	6	85027	85032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006898
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1746	NC_015955	ATTCA	2	10	93262	93271	40 %	40 %	0 %	20 %	345006903
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1751	NC_015955	GA	4	8	93549	93556	50 %	0 %	50 %	0 %	345006903
1752	NC_015955	TAC	2	6	93613	93618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006903
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1872	NC_015955	GTACT	2	10	102329	102338	20 %	40 %	20 %	20 %	345006908
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1990	NC_015955	CGC	2	6	109027	109032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006913
1991	NC_015955	GGT	2	6	109063	109068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006913
1992	NC_015955	CGT	3	9	109084	109092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006913
1993	NC_015955	GGT	2	6	109094	109099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006913
1994	NC_015955	GTC	3	9	109130	109138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006913
1995	NC_015955	GCG	2	6	109152	109157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006913
1996	NC_015955	TGG	2	6	109196	109201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006913
1997	NC_015955	CGTGT	2	10	109202	109211	0 %	40 %	40 %	20 %	345006913
1998	NC_015955	ATC	2	6	109411	109416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006914
1999	NC_015955	TGC	2	6	109438	109443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006914
2000	NC_015955	CGA	2	6	109513	109518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006914

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